| Definition | Escherichia coli 55989, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011748 |
| Length | 5,154,862 |
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The map label for this gene is 218696245
Identifier: 218696245
GI number: 218696245
Start: 2980678
End: 2984424
Strand: Reverse
Name: 218696245
Synonym: EC55989_2910
Alternate gene names: NA
Gene position: 2984424-2980678 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218696249
Following gene: 218696242
Centisome position: 57.9
GC content: 39.2
Gene sequence:
>3747_bases ATGAAATGGATAAAAGCACTTAACCTTCAGCAATGGGCAGATTCTATTCCTGCAAAAGTTATTTTTCCAGCACTAATCGC TGATCTTATACGTGCAACGGCTAACAGTATTACTGAAATTAGATTTCCTAATGGTGATAAGGGACAGGTTAGAGGTTATG ACGGTGTACTTAAAGCCGAGGGGGTGGCCCCCTATGTTCCTGATGGCGACTCATTCTGGGAATTTGGTGTTAATGAAAAA TTGCTTGATAAAGCTAACTTTGATTACGAAAAAAGAACACGCGAAGTTGCTCCAGAGATACGTCTAAAGACTACTTTTGT TTTCGCTTCATTAAGAACATGGGATAATCCTAAGGTAAAGCTTGAAGACTGGCTACAAGAGAAACGCAATAGTGGTAAGT GGAAAGACATCAAATTAATTGATGGTTCTATGCTTGAAGATTGGCTCGGTGTTTGCCCTGCTGTAGCTGCTTACTACGCT CGCTACCATCTTGAGCTAATGCCACAGGTTGGTGTTAGAAGCATTAAGGAGTTTTGGGATGAATTTTCCACTAAATTTAA TCCCCCTTTAACTGAAGCAGTCTTGCTGGCGGGGAGAGAAAAGCAAAAAGAGCGTTTTCTGAATGAGTTACGAGAAAATG GTCGAAAAATATCTTTAGCTGCAGATTCTCCGGATGAGGTTATTGCTTTTGCGATTGCAGCTATCAGAACCACTGAAGCG GAACTTCGACATTCCTTTCAAAGTCGAGCACTAATTATTGATACGGATGATGCTGCAAGACAGCTTTCTGGAAAAAGAGG AATGATCTTCTTACCACGTGATCGAGCAAGAGCTTTAGCCGGTTTATTACAGCAAGCATCTATCACAGTAGTAAGTGCCG GAGCCGATGAAACACGAACTGATCACGAACTTCTGATCCGCCCAGATAGTATATCTTTAGGTAAGGCTCTTGAATCTATG GGGTTTGATTCAGATAAAAGTTATCAAATAGCGCGGCAGTGTGGCCGAAGTTTGTCTGTTTTGGCTCGCCAGATATCAAG TAGCACGGCTGAATCACCTGAATGGAAAGACAGCCCTGAGTTGCTCCCTGCTTTATTAGCTGGTGCATGGAGTACATGTT CAGAGAAAGATAAGTTAATTCTCAAGCAACTAGCTGGCTATACAGACTATTCTCAAGTTGAAAATCCATTAAGGCTATTA ACAAAGCGCCGCGATTCTCCAATTGACCGAGTAGATGATATTTGGTCATTGCGTTCGTCGGTAGATGCTTTTGTACATTT AGGCTATTTGCTGGGTGAAGAACACCTGGAGCGTTTTGAGAAGGCCGTAAGAGAGGTTTTTTCCTATATTCCTGAACCAC CAAAGGCCGAAGATCTGTTTGTACCTGACAATGGTATTAAAACGTCTTATAGCTCGTGGTTACGTAATGGAATGACAACA GTTTTGCTACATATGGCAATATTACATGAACAGGCCGAATTCCGGGTTACTGGTATGACACCCCAAGATTTTGTTAACAA AATAGTTCAGAGTATTCCGGGACTTGCTAACGACCATCGACTATTTGTTAGTTTGCGAGATCAACTTCCGCTGCTGGCAG AAGCTGCCCCTGGCCCTTTCCTTGATGCCCTTGAGCAATTGCTTAAGGGCAATGGGGAAATGATTGCTCCAATATTCAAT GAAGATAAAGGGCTGTTAACTCCTCGAAGTCATTATCATGGATTAAAATGGGCATTGGAAGCCTTGGCTTGGGAACAAAC ATATCTATTACGCGCTGCAATCTGTCTTGCAAAACTCGCTGTAATAGATCCCGGAGGAACTTACTCAGATCGCCCTCTTA ATAGTTTAAGAACCATTTTTCTGGCATGGTCTCCTAATACATGGGCACCAGTAAAAGTTAGAAATGCAATTATAAAAAAA ATTATCACTATTGTTCCTAGTATTGGGTGGAGTTTGTTACAAAATCTCCTTCCTCGCTCCCATGATACCTCTGATCAAAA CCAAAAAATGAAGTTCAGAGAGTCGGATAAAGATGTAGAAAAACTAACGTGGGGCGTTGTTTGGGAGGGGCAAATCTTTA TTATCCAAGAAGCAATTAAACTTGCAGGTATACTCCCAACAAGATGGGAAATCCTAATCTCTCATTTAAGCTCATTCCCT GAGAATGCAATAGATGAAACACTTTCTCATCTTGAACTTTGCCTTTCTCAACAAACTGAAGAGGATCAGTTCATCGTATG GGAGGCTTTGCGTCATGAGTATTCTCGCCATAAAAAATATTCAGATGCGAACTGGGCATTTAAATTTGAGTCTATGGAAA AAATAGCGAAAATACTTGATAATTATAAACCAATTGACATGGTTAGAGCCAGTTTATGGATTTTCAATGATTGGGATTCT GATATTGAAGAGTCAATTGAAAATGCTGGCGGAATTTTTTCTTCTGTCGAAGAAATGCGAAGTGAAAAACTTAGGGAAAT ATACTTTACTTTAGGTTTGTCTGGGGTGAAAGACCTTTTTCAACAAGTTAATAATGTTTTTATTGCAGCAAGGCATATAT CAGCACTCTCGTTGGATGAAGAAAAATTAAATGATTTGTTTGTAATGCTTATTAACAACAAAAAAAATATTGATGAAGTT TGTGGGTTGTTAATGCAATATGGTGTTGAATGCTTTGGTGCTGAATGGCTTAATAAAATAAAAGTGTATTTTAAACAGTT TAAAATTACCCCTGATAGGGCTGGGAAAATCTTAGCATCGTTAAGAGACTCACAAGAGATATGGAGCATTATTGAAGGGT TTGAAGATAACATCAACGAAAAATATTGGTTGCAAAAACAACCCATTGCAATGATGGGTAAAACTTCGGATTTATTTGTT CTTATGGATAAATATATAGAAAGGGGCCGGGGTCTTGCTGCTATTATATCAGCAAATCAACGCCTTTCTGAGATTCCATC TACAACACTTTTATATCTTCTAGATATAGTCGTTAAAGAAATAAATAGCCAGGATATCCAATTTGATACAATGCTATCGT ACTATGTAAAAAAAGTTTTTGATGAACTCAAACAACGTAACGATGTTTCTGAAACAGATTTGGCATTTAAAGAAATGACC TACTTGCCTTGTTTTCCGGATAGCGATGAGCCACTTATCCTGCATCGTCTAATGATGAAAAAGCCAGAGGTTTTTATAGA AGCAATATGTATTGTATATCGTAGTGACGAAGATGAACAAACAGAACCATCGGAGTTGGAAGTTAAAAGAGCTACTTCTA TATACAGATTACTTGAAAAATTACGAATACTACCAGGGCAGATAGACAATGAAATTGATCAAGATAAACTTGAAGATTGG TGTGAGAATGTACGCCATTTAGCAAAATTGCATCATCGCCAAGAAATCACTGATCATGTAATAGGAAAAATTCTGGCACA TGCCCCTAATAGCTCAGTAGATAATTCCTGGCCACATGAAGCAATTCGGCACATCATTGAAATATTATCTTCTGATGAGT TAGAGCAAGGTATACAAATTGGTAGGTACAATAAAAGGGGGGTATTTGCTCGTATGCGTTACGAAGGTGGAAACCAAGAA AGGATATTAGCTGAGCAGTACCGAGAATGGGCAAATTCAATGCCCCACTGCGTCCGTACTTCTGCAATGCTATTTAGAAT CGCTGACGAATGGGAATACTCAGCAAAAAACGCAGATATTCGAGCCGCAAAGGCTGATTTAAAATAG
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGATTCAAAACCAAAATTAGAATAAATCATAAAAACCCTGCTTAAGAGCAGGGTTTAACTTCTTTCAGCGTCATTTAA AATTGCAGACCTTCAGGTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1248; Mature: 1248
Protein sequence:
>1248_residues MKWIKALNLQQWADSIPAKVIFPALIADLIRATANSITEIRFPNGDKGQVRGYDGVLKAEGVAPYVPDGDSFWEFGVNEK LLDKANFDYEKRTREVAPEIRLKTTFVFASLRTWDNPKVKLEDWLQEKRNSGKWKDIKLIDGSMLEDWLGVCPAVAAYYA RYHLELMPQVGVRSIKEFWDEFSTKFNPPLTEAVLLAGREKQKERFLNELRENGRKISLAADSPDEVIAFAIAAIRTTEA ELRHSFQSRALIIDTDDAARQLSGKRGMIFLPRDRARALAGLLQQASITVVSAGADETRTDHELLIRPDSISLGKALESM GFDSDKSYQIARQCGRSLSVLARQISSSTAESPEWKDSPELLPALLAGAWSTCSEKDKLILKQLAGYTDYSQVENPLRLL TKRRDSPIDRVDDIWSLRSSVDAFVHLGYLLGEEHLERFEKAVREVFSYIPEPPKAEDLFVPDNGIKTSYSSWLRNGMTT VLLHMAILHEQAEFRVTGMTPQDFVNKIVQSIPGLANDHRLFVSLRDQLPLLAEAAPGPFLDALEQLLKGNGEMIAPIFN EDKGLLTPRSHYHGLKWALEALAWEQTYLLRAAICLAKLAVIDPGGTYSDRPLNSLRTIFLAWSPNTWAPVKVRNAIIKK IITIVPSIGWSLLQNLLPRSHDTSDQNQKMKFRESDKDVEKLTWGVVWEGQIFIIQEAIKLAGILPTRWEILISHLSSFP ENAIDETLSHLELCLSQQTEEDQFIVWEALRHEYSRHKKYSDANWAFKFESMEKIAKILDNYKPIDMVRASLWIFNDWDS DIEESIENAGGIFSSVEEMRSEKLREIYFTLGLSGVKDLFQQVNNVFIAARHISALSLDEEKLNDLFVMLINNKKNIDEV CGLLMQYGVECFGAEWLNKIKVYFKQFKITPDRAGKILASLRDSQEIWSIIEGFEDNINEKYWLQKQPIAMMGKTSDLFV LMDKYIERGRGLAAIISANQRLSEIPSTTLLYLLDIVVKEINSQDIQFDTMLSYYVKKVFDELKQRNDVSETDLAFKEMT YLPCFPDSDEPLILHRLMMKKPEVFIEAICIVYRSDEDEQTEPSELEVKRATSIYRLLEKLRILPGQIDNEIDQDKLEDW CENVRHLAKLHHRQEITDHVIGKILAHAPNSSVDNSWPHEAIRHIIEILSSDELEQGIQIGRYNKRGVFARMRYEGGNQE RILAEQYREWANSMPHCVRTSAMLFRIADEWEYSAKNADIRAAKADLK
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 142816; Mature: 142816
Theoretical pI: Translated: 5.38; Mature: 5.38
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKWIKALNLQQWADSIPAKVIFPALIADLIRATANSITEIRFPNGDKGQVRGYDGVLKAE CCHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECC GVAPYVPDGDSFWEFGVNEKLLDKANFDYEKRTREVAPEIRLKTTFVFASLRTWDNPKVK CCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEEHHEEEEEHHCCCCCCEE LEDWLQEKRNSGKWKDIKLIDGSMLEDWLGVCPAVAAYYARYHLELMPQVGVRSIKEFWD HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH EFSTKFNPPLTEAVLLAGREKQKERFLNELRENGRKISLAADSPDEVIAFAIAAIRTTEA HHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELRHSFQSRALIIDTDDAARQLSGKRGMIFLPRDRARALAGLLQQASITVVSAGADETRT HHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCC DHELLIRPDSISLGKALESMGFDSDKSYQIARQCGRSLSVLARQISSSTAESPEWKDSPE CCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH LLPALLAGAWSTCSEKDKLILKQLAGYTDYSQVENPLRLLTKRRDSPIDRVDDIWSLRSS HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH VDAFVHLGYLLGEEHLERFEKAVREVFSYIPEPPKAEDLFVPDNGIKTSYSSWLRNGMTT 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HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH EFSTKFNPPLTEAVLLAGREKQKERFLNELRENGRKISLAADSPDEVIAFAIAAIRTTEA HHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELRHSFQSRALIIDTDDAARQLSGKRGMIFLPRDRARALAGLLQQASITVVSAGADETRT HHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCC DHELLIRPDSISLGKALESMGFDSDKSYQIARQCGRSLSVLARQISSSTAESPEWKDSPE CCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH LLPALLAGAWSTCSEKDKLILKQLAGYTDYSQVENPLRLLTKRRDSPIDRVDDIWSLRSS HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH VDAFVHLGYLLGEEHLERFEKAVREVFSYIPEPPKAEDLFVPDNGIKTSYSSWLRNGMTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHH VLLHMAILHEQAEFRVTGMTPQDFVNKIVQSIPGLANDHRLFVSLRDQLPLLAEAAPGPF HHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHCCCCHH LDALEQLLKGNGEMIAPIFNEDKGLLTPRSHYHGLKWALEALAWEQTYLLRAAICLAKLA HHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIDPGGTYSDRPLNSLRTIFLAWSPNTWAPVKVRNAIIKKIITIVPSIGWSLLQNLLPRS 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA