| Definition | Escherichia coli ED1a chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011745 |
| Length | 5,209,548 |
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The map label for this gene is 218691101
Identifier: 218691101
GI number: 218691101
Start: 3386302
End: 3387837
Strand: Reverse
Name: 218691101
Synonym: ECED1_3442
Alternate gene names: NA
Gene position: 3387837-3386302 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218691102
Following gene: 218691096
Centisome position: 65.03
GC content: 39.0
Gene sequence:
>1536_bases GTGACAATAGCAAGAGATTCTGTTAGTGGTGAAATTGTTCATGGTCATGATCTTCGGGAAATGGATGATCTTTATATACG AACAACCACTTTTGAATGCCTGTATGACAAATGTAGGATACCCGCTACTCCATGTAGCTTCAAAGAAATAAATTTAAATC AATCATACTTTCGATATAAAGAGACTCATAGGCCGGGATGTAAGATTCATGATCCTAAGAGTAAAAATAAGTGTAACTCA AAGAATAATAAAAAGCATAATTCACCACCGGCATTAGCTATATCTCTTCTGAAACTTGATGTGTCTGAAAGATATTACGA CTCTTCTGGCAGAAGAATTATCAAACAGACGCGAAATGATGAAAAAGATTTGGGAGGTAAAGTACACCCTGTGTCATCTT CAAGCATCAAACCGGTAGTAGACTACTACATTAATGGAGATAATCTCTATGAACCATTATCAATTCCCCCTTATGGAGTT AGAACTTATAAAGATACTTTTCAACTAATCATCTATAAAGAAGGAATTAGATATAATAAGCCAGCAATTTATTTTGGTAA AATTCAATCTAATATACGGCTGGAGATAAATTCGAATAGATATTACCTTACTTTTTTAGCCAGAAAGAAAGGTACCAAAC AAGCATATAAACTTGAAATTGATGCTTCAGAATGGGATGAAAGTAAAAAGAGTTTTTTCTGTAGTGAGTATGAAAAACAA AGAGCAGAAGCAAATAAGTATTATAATGGACTAAAAGACAAGCGCAAAGCAACCAAATATCTTAATGTTTTCTTTTTTGG TTTTCCTGATGAGTGCGATAGTTTTTTATTTAAGACTAGTTGTTTTAAATTGATTTATATCGTTTTCTTAGATGATTTTG ATGTGACTTATAATGACAAAAACTACAGCATAGAAAAAGAACAGCTAATTAGAGATGAAATTAACAAAGAACATTTGACA GATCATCAAAATAGAATAAACCTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGC TGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTG CTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTT GCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGT TGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGG TTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAGGTTGCTGAG GTTGCTGATTTTGACAAGAGCGAATTTAACCCTTCGGATTCTGATAGGAAAATATGGACTGGGATAAGAAAGCTTATTTC ATTCTTTAAAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGTCTGTCAGGCTGACTTGTTTTTCTCTTAAATAGCCTTTATTTAAATTAGCCTTGGTATGAAATTAGAATCTATTAA TTTTTATCAAAGGAGATTGT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCTATAGCAGTCATCATATTGGATTATTGGTGAAGTGGTACACTGAATTTGCCCACCTGAACAGAGTTGGTTTTATCAA ACTTGTAGTTTACTCAATGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 511; Mature: 510
Protein sequence:
>511_residues MTIARDSVSGEIVHGHDLREMDDLYIRTTTFECLYDKCRIPATPCSFKEINLNQSYFRYKETHRPGCKIHDPKSKNKCNS KNNKKHNSPPALAISLLKLDVSERYYDSSGRRIIKQTRNDEKDLGGKVHPVSSSSIKPVVDYYINGDNLYEPLSIPPYGV RTYKDTFQLIIYKEGIRYNKPAIYFGKIQSNIRLEINSNRYYLTFLARKKGTKQAYKLEIDASEWDESKKSFFCSEYEKQ RAEANKYYNGLKDKRKATKYLNVFFFGFPDECDSFLFKTSCFKLIYIVFLDDFDVTYNDKNYSIEKEQLIRDEINKEHLT DHQNRINLAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEV AEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE VADFDKSEFNPSDSDRKIWTGIRKLISFFKK
Sequences:
>Translated_511_residues MTIARDSVSGEIVHGHDLREMDDLYIRTTTFECLYDKCRIPATPCSFKEINLNQSYFRYKETHRPGCKIHDPKSKNKCNS KNNKKHNSPPALAISLLKLDVSERYYDSSGRRIIKQTRNDEKDLGGKVHPVSSSSIKPVVDYYINGDNLYEPLSIPPYGV RTYKDTFQLIIYKEGIRYNKPAIYFGKIQSNIRLEINSNRYYLTFLARKKGTKQAYKLEIDASEWDESKKSFFCSEYEKQ RAEANKYYNGLKDKRKATKYLNVFFFGFPDECDSFLFKTSCFKLIYIVFLDDFDVTYNDKNYSIEKEQLIRDEINKEHLT DHQNRINLAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEV AEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE VADFDKSEFNPSDSDRKIWTGIRKLISFFKK >Mature_510_residues TIARDSVSGEIVHGHDLREMDDLYIRTTTFECLYDKCRIPATPCSFKEINLNQSYFRYKETHRPGCKIHDPKSKNKCNSK NNKKHNSPPALAISLLKLDVSERYYDSSGRRIIKQTRNDEKDLGGKVHPVSSSSIKPVVDYYINGDNLYEPLSIPPYGVR TYKDTFQLIIYKEGIRYNKPAIYFGKIQSNIRLEINSNRYYLTFLARKKGTKQAYKLEIDASEWDESKKSFFCSEYEKQR AEANKYYNGLKDKRKATKYLNVFFFGFPDECDSFLFKTSCFKLIYIVFLDDFDVTYNDKNYSIEKEQLIRDEINKEHLTD HQNRINLAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVA EVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEV ADFDKSEFNPSDSDRKIWTGIRKLISFFKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57451; Mature: 57320
Theoretical pI: Translated: 4.40; Mature: 4.40
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 0.2 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTIARDSVSGEIVHGHDLREMDDLYIRTTTFECLYDKCRIPATPCSFKEINLNQSYFRYK CCCCCCCCCCCEEECCCCHHHCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH ETHRPGCKIHDPKSKNKCNSKNNKKHNSPPALAISLLKLDVSERYYDSSGRRIIKQTRND HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCC EKDLGGKVHPVSSSSIKPVVDYYINGDNLYEPLSIPPYGVRTYKDTFQLIIYKEGIRYNK HHHCCCEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHEEEEEECCCCCCC PAIYFGKIQSNIRLEINSNRYYLTFLARKKGTKQAYKLEIDASEWDESKKSFFCSEYEKQ CEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHH RAEANKYYNGLKDKRKATKYLNVFFFGFPDECDSFLFKTSCFKLIYIVFLDDFDVTYNDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEECCC NYSIEKEQLIRDEINKEHLTDHQNRINLAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE CCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VADFDKSEFNPSDSDRKIWTGIRKLISFFKK HHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TIARDSVSGEIVHGHDLREMDDLYIRTTTFECLYDKCRIPATPCSFKEINLNQSYFRYK CCCCCCCCCCEEECCCCHHHCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH ETHRPGCKIHDPKSKNKCNSKNNKKHNSPPALAISLLKLDVSERYYDSSGRRIIKQTRND HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCC EKDLGGKVHPVSSSSIKPVVDYYINGDNLYEPLSIPPYGVRTYKDTFQLIIYKEGIRYNK HHHCCCEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHEEEEEECCCCCCC PAIYFGKIQSNIRLEINSNRYYLTFLARKKGTKQAYKLEIDASEWDESKKSFFCSEYEKQ CEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHH RAEANKYYNGLKDKRKATKYLNVFFFGFPDECDSFLFKTSCFKLIYIVFLDDFDVTYNDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEECCC NYSIEKEQLIRDEINKEHLTDHQNRINLAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE CCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAEVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VADFDKSEFNPSDSDRKIWTGIRKLISFFKK HHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA