Definition Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome.
Accession NC_011740
Length 4,588,711

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The map label for this gene is 218549514

Identifier: 218549514

GI number: 218549514

Start: 2225875

End: 2228580

Strand: Reverse

Name: 218549514

Synonym: EFER_2185

Alternate gene names: NA

Gene position: 2228580-2225875 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218549515

Following gene: 218549513

Centisome position: 48.57

GC content: 41.2

Gene sequence:

>2706_bases
TTGATATTCAGGGAAAGAGTAATGGATACGACTCAAGAACAATACAGCAAAATTATTGAATCAGGGAATTCAGAGCAGTT
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GTGCCTATCAATGGTATGAAGTAAGCATCGGCGGTCTTCGTGGAGGAAGTTACAAGCAAAACGGTACAAAAAATCAATTA
CAGATGCTTAGTGTTGCGATCATCAGTTGCTATGCACGAAAAGACTGTAAAAATATTGAACGTAACTTATTGAATTCTAA
TAATGCAGTTAAAGAAACACTCAAATGGCGCTGCCCGGAATGGCTTACTGATTATATTAATGGTGATATTAAAGGTGGAG
ATTTTTCAATAGATTATGCCACTCTCTGCGACTGGATTGCCGAAGGTTATGTTGGCAATATTACACCGCAGGTTATTGTT
AATAAAATTACTTCTGCATCAATTCTTGAAAAACATCGTTTTTCTTTAGACGATCATATTTGGATGGTGTTTAATTATCC
GTGCAGTGTTTCATGGTCAGATCAGTGGTATCCGAAAGAAAGTAAACCTGAGGGTGCCGATGATCATAAATGGATATATT
TCTTCAAAAAATATACTATGGACAAACGCATCGACAGAATAAGAGTATTAAAAGAAAGCTTACTTGCGGTCAATCGTAAC
TTTAATCGTGAACAAACATGTTGGTACGCCACGCTATTTACTTCGCTGCAACCGACAGCGGACGAATGTTTGCAACTTCA
GGAAGCACTTTTTTCGACATTTTATTGCCCGCACAGTAAACCTGGCACTACGGCATTACAGGCAATCAAAAAAATATCCG
AACATCCGGAGTTTCACCGTGATGAGTTTATTTCCTGCCTTCCTCTGTTATTTTCTTTCACCACGAAAGCTATTGTCGAT
AGCGCATTAATGATTGCTGATAAACTGGCGAAACAGCACCCTGATAAAAGATTAGAAATCTGTCAACACCTCACCACGGT
ATTCCTTAACAAAGATATCGCGCTACAAAATAAAACAGCAAAGTTAATTGCAAAATATTCTAGTCCATTAGATCCAGAAA
TAAGTGCGTTATTAAGCAGTTATGCCGATAATCTGCTTACAGGCGCTCGTGATTTATTAACCGACTTTCTTGATATCACA
CCGCTTGCGCCCGATGAATCTGCTGAACTTTCTCCCGTAGTGCCACTGATTCGTGATGATAACCGTATCCCCGCAATTGA
AAACTGGGATGATTTTGTCTTCCTGGCAGGGCAGGCATTTCATAACGTGGAATCATATCACTTTGACCTGTTACCGGCTG
CATTGTTACGTTTTGCTCCTGAAATTAATGAAGAGAATGTGAACCAACTGGAACCCGCGTTTATGCAGGCGCTTGAGGCA
TCTGAACATATTTCTTTTTTTGACGGGATGTTGGGCTTTTTCTTTATGGAATATGCGGCAGAGCTTATCTCACGTTTTCC
ACTACAGACAGCAAAAATTAAAATAATGTATGAAGATTTTCAGGGTTTAAAAAATACAACTGACAAATGGAAAAAGATAG
ACTGGGGGTTTCATTCCTATGATGAAGAGGACAAAAAACGAAGCCGCTCATGGATTGCGTTTTTCAAAAACATTCTGTTG
TTATTAAAAAACAACGTTAATCTGCCTTTGCTTTCAACACCCACGCATCTGCCTTGCTTTATTGACCCTACGGTGTTTGT
AGAGCGTCTTTTACAATACCAAAATGCGGGTGTAGAACCTTGTAGTCAGGATATGCAACTTGCGATTCAACGATGTGTAT
TTATTGACACTCAGCTTGATATTTCACAACTTAACACCGAATATGCCGCATTAGTGCGATATTTGTTTTCCGGCGAGCAG
GATGCATTAGCACAGATCGCGCAGGATGATTGGAAACTGGCGGCCATTATTACCCGCAGTGCGGTTAACCCTGACACGAC
GTCTTTTGATGTCGGGTATGCGTTGCTGGAAAAACATGCGTTACCGATGGAGTTATTAAGCAATTTGTTCCCGTGGTTTA
TCAGGGAAAACAAAACTCGCTTCCCTGCCCGAACATTCAATTTTGACGTCTCGACGGCTGTTCAAAATCTGGAGATAACT
TTGTTCTATGCTGACAGTTTCATGCCTTGCTGTAAATACAGTTACTTTGGCGGAGGGTATAAGCGGCGAACGCTGTATGC
TTTTCCCTGGCAGGGTGATGTCACACTCATGCGTTATATAGAAATGAATTTTCATGATCCAAACATTTCATCAACGAAGT
CTAATCTGGAAATCCTTCAGGCACTTTACGATCTCCCGTTGCCACTTTCACCCATGGGCCATTTACTCACCGCTTTTTGC
ATGCTTCATGCCGACAAAACGGTGCGTGCTCTTGCTGGCGAACTATGGATTGAAAAACTGTGTTATCCACAAGGTGTGAA
TTCTGCCCATATTGGCGACATCCTTGGTCGGCTGGAAAAAGAGGGCTGGTCGCCACTCAAACGCTTTACCGATCTTGCCA
TGCAGGCGCTTATCAATATCAGTTCCCGCCACAATCAGGCATTACTTGAGATGATAAGTGCAATGGACAGCCATTTGAGC
ACGGTAAAAATCACCAATTACAAAAAGCTCAATGAGCTGCAACTCGAACTTACAAGGAAGTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCATTTGAGCACGGTAAAAATCACCAACTACAAAAAGCTGACTGGGCTACGGCAGGAACTTGAAGCAGCATTGTAAAAGC
TAATTTAGCACGTATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGGAAGAGACACTCACTTATAGTTACAACATCCCATCCGCTTTGCACAAAACAAACGGAAAAGATGAATTACGCCTGGC
GAAATACAGCGAGATCCAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 901; Mature: 901

Protein sequence:

>901_residues
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QMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPEWLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIV
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TVKITNYKKLNELQLELTRKS

Sequences:

>Translated_901_residues
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QMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPEWLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIV
NKITSASILEKHRFSLDDHIWMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN
FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHRDEFISCLPLLFSFTTKAIVD
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PLAPDESAELSPVVPLIRDDNRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA
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TVKITNYKKLNELQLELTRKS
>Mature_901_residues
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NKITSASILEKHRFSLDDHIWMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN
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MLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEKEGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLS
TVKITNYKKLNELQLELTRKS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103500; Mature: 103500

Theoretical pI: Translated: 6.11; Mature: 6.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
VSIGGLRGGSYKQNGTKNQLQMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPE
EEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHH
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WMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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S
C
>Mature Secondary Structure
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHEEECC
S
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA