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Definition Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome.
Accession NC_011740
Length 4,588,711

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The map label for this gene is 218549453

Identifier: 218549453

GI number: 218549453

Start: 2150311

End: 2151474

Strand: Reverse

Name: 218549453

Synonym: EFER_2122

Alternate gene names: NA

Gene position: 2151474-2150311 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218549454

Following gene: 218549452

Centisome position: 46.89

GC content: 28.44

Gene sequence:

>1164_bases
ATGCAAACAGTGAATAATCATTTTTATAAAACTTTACTTCTATTAAGTTTTTTCTCTGCAGGGTTTAGTCTGTATTACGT
ATTTATACCGTTATTAATAATTTCATTAATTCTATCAATGATTAAAAATAGAACATTATACGCAGGATGTACTGCTGCAA
GTTATAATGTGTTATTTATTGTTTTATTTGTATTTAGTGTGTTTTCTATAGGTTCAGAACTATTAATACTTGAATCCCCT
GTCAAGTATGCAATGTATATGATATTTTTGATAGTATGTTTACCATTACTCTTAATTAATAATTTTGAATATGCTTGGTA
CATGCTTTTCTTTTTTATATTAGGTGTCTTTTTTAGAGCTGAATCCATAGTTGTTTATAGCTTCCTAGATCCTTCCGGCG
TTTATGGATATGGTAAATTGCTAGATCCATTTAATCACGAGGAAATAAATTCTCCAGGCATTAGTAACTCACTCGCAATT
GTTTTTATGTTTTTCTTCGTTGCATATAAAAATACATTGAGCTTGAAGTACTTACTTATATTTATATATCCATTAATTTT
ATTATCATCAATATTTTTGGGGGGGCGAGCATTCTTTATTATTGCATTAGTATGTATAACTTATAAATATAGTCGTAACT
TTAAAATAAAAACGCTCATAGGATTAACTATATTAATATGCCTTGGTTGCATTTTTTCTTTATTAGTTAAAGAAATTCCT
TTTTTTGATAAATATTTTGATTTAATATTTGAGCGATTTGGAAGTGAAGGATTGAAATCGGCTAGATTTGAACTTATACA
GGATGGTATTACAAAATTTCTAATTCATCCACTGGGGGGGTTTACTCCAAATGCAAGCGAATATAGTGGGTATTGGTATC
ATAATATTTATCTTGATAGCGCCAGAGTCGCTGGGGTTATATCGCTTATCCCATTTATACTTTCAAATTTAATTGTGTTA
ATTAGCTATTTAGGATATAGGAATTATAGAAAAAGAATAAAAAATCCATATTTTTTTATATCACTTATAACTTTAATTAT
CATGTGTCAGGATGTTGTACTTGAAGGTAATATGATGTTACTAATCAGCTATGCCTTATTTACAACAATGGCTATTCAAT
CCAGGAGGTATAAAAAGAGTGAAACTCTTCTACAGAGTAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACAAGACCTAAAAAAAAATTCATTCCTATTTCGAGAGGATTTTAATGAAAGTATCTGTGAGTTAGCTAAATTATATAAT
AAAGTTAAAAGGCTAGATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATCATCCTTTTGACATAAAGGATAGTTCTGCAGCTAGTTCAGTTCGACACAGAGTCGACCGAGTTTGCAGATGTCTTC
CGGATGCCACCAAATCAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 387; Mature: 387

Protein sequence:

>387_residues
MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP
VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI
VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP
FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL
ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK

Sequences:

>Translated_387_residues
MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP
VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI
VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP
FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL
ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK
>Mature_387_residues
MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP
VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI
VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP
FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL
ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44597; Mature: 44597

Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHH
VLFVFSVFSIGSELLILESPVKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRA
HHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAIVFMFFFVAYKNTLSLKYLLI
CCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDS
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECC
ARVAGVISLIPFILSNLIVLISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHH
VLFVFSVFSIGSELLILESPVKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRA
HHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAIVFMFFFVAYKNTLSLKYLLI
CCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDS
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECC
ARVAGVISLIPFILSNLIVLISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA