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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 218235123

GI number: 218235123

Start: 901666

End: 903186

Strand: Direct

Name: yabM [H]

Synonym: BCB4264_A0931

Alternate gene names: 218235123

Gene position: 901666-903186 (Clockwise)

Preceding gene: 218231856

Following gene: 218235453

Centisome position: 16.64

GC content: 34.32

Gene sequence:

>1521_bases
ATGAATAAAACATTTGTAAAAGGAGCAGCAATTTTAACCATTACAACTTTTTTGTCGAAATTGCTGGGTAGTTTTTTTCA
AATTCCATTACAAAATATTGCAGGAGATGAAGTGCTCGGTATTTTCCGCCTTGTTTTTCCTGTATATATGATTGCTCTTA
CATTATCGGTAGCCGGAGTTCCACTTGCAATTTCGAAACTAATTGCAGAGTTGAACGAAAAAAATAAGCAAAAGGAAATT
GCGAAATTATTTAAATCAGCGTCAATTATTGGGATAGCATTTGGCGTTTTCGGCTGTTTAGTCATTGTATTATTTTCTAT
TGAAATTGCAAATATGCTTGGTGGACAAGAAACTAGAATGCCGTTGCTTATTACTTCATTAGCGTTACTCATTGCGCCAT
ACATGGCGGTGTATAGAGGGTATTTTCAAGGTTTCGGTGATATGAAACCAACAGGGGTATCACAGGTCATTGAGCAATTT
GTACGTGTGTTTTTTATGTTAATAATTGCTTACATACTAGTATCATGGGATAAGAGTAATACTGTTATTACTAGTGGTGC
GATGGTTGGCTCTTTTCTTGGAGTCATTAGTTCGCTTATATATTTGCGTATAAAATATAATAGAAGTCCATACTACAATA
AAAGCAATTCCTATTCGCTCCGAGATTTAAGAGAAAACGGCAAAAAGATATTGCGGGTATCGATCCCAATCGCTATTGGA
GCTTTATCAATGCCACTTTTAAATTTAGTAGACTCGCTTACAATACCGCATGTATTACAAGGATCATCAACAGAAATTCA
AGAACAATTTGGAATATACAGTCGCGGTTTTGCATTCACGCAAATAATTGTTATTTTTGCAAGCGCAATTGTATTTCCGT
TAATACCACTCTTAACTTCCGCATTGGCCAAAAGAGATATAAATTTGGCGAAAATAACAATTCAAAATACAAATCGACTA
GCGCATGTTTTGACAGCACCGTTAACAATATGGTTGATGGCATTAACAGTACCGTTAAATGTCGGATTGTTCACAGATGT
AAAAGGCAGTAGTATGTTAACAGTGATGATTGGCAGTTCGTATTTTACTGCGGTTATGGTATTATCAATAGGTGTTTTAC
AGGGCATTAACCGTTCTGCACAAGCTGCATGGATTGTTATTGGTGCGAGTTGTGTGAAAGTCGTGTTAAACATAATGTTC
GTGCAGAAGTTTGGCATAGATGGAGCGGCGTATAGTACATTCATTACTTACGTATTGATTTGTATTGTAAATCATTTGTA
TATTCGAAGCTATATTGCCTATTCTATTCATTTAAAAAGCTTTTTTGGCGTGCTAGCAATAGCATGTATTTTGGGACTAG
GATTGTATGAATTATGTAATGTGATAAATATTACATCTTCAAGAATTATGACGTTATTATTCAGTGGTATAGCATTAAGT
ATTACAACCATTTTGTATGGTGTATGTGCTTTGAAATTAAAATGGATATCAATAAACAAAATACCATTTTTAAAAAGATA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATAATAAATTTGTTATGATAACCAATGGGATAAAGTGAATTCCTATCGTTTAAAACAATATGTTTGAGAGTATATGTA
TAAAAGAAAAGAGAAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATAGAAATTTAATTTTTTATTATAATTCATATGAACTGATAAAGAGGAAACTATGTAGGGTATCAAGTGTTTAGGTAA
GGAATGGGTACTAGTTTATG

Product: polysaccharides export protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506

Protein sequence:

>506_residues
MNKTFVKGAAILTITTFLSKLLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELNEKNKQKEI
AKLFKSASIIGIAFGVFGCLVIVLFSIEIANMLGGQETRMPLLITSLALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMKPTGVSQVIEQF
VRVFFMLIIAYILVSWDKSNTVITSGAMVGSFLGVISSLIYLRIKYNRSPYYNKSNSYSLRDLRENGKKILRVSIPIAIG
ALSMPLLNLVDSLTIPHVLQGSSTEIQEQFGIYSRGFAFTQIIVIFASAIVFPLIPLLTSALAKRDINLAKITIQNTNRL
AHVLTAPLTIWLMALTVPLNVGLFTDVKGSSMLTVMIGSSYFTAVMVLSIGVLQGINRSAQAAWIVIGASCVKVVLNIMF
VQKFGIDGAAYSTFITYVLICIVNHLYIRSYIAYSIHLKSFFGVLAIACILGLGLYELCNVINITSSRIMTLLFSGIALS
ITTILYGVCALKLKWISINKIPFLKR

Sequences:

>Translated_506_residues
MNKTFVKGAAILTITTFLSKLLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELNEKNKQKEI
AKLFKSASIIGIAFGVFGCLVIVLFSIEIANMLGGQETRMPLLITSLALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMKPTGVSQVIEQF
VRVFFMLIIAYILVSWDKSNTVITSGAMVGSFLGVISSLIYLRIKYNRSPYYNKSNSYSLRDLRENGKKILRVSIPIAIG
ALSMPLLNLVDSLTIPHVLQGSSTEIQEQFGIYSRGFAFTQIIVIFASAIVFPLIPLLTSALAKRDINLAKITIQNTNRL
AHVLTAPLTIWLMALTVPLNVGLFTDVKGSSMLTVMIGSSYFTAVMVLSIGVLQGINRSAQAAWIVIGASCVKVVLNIMF
VQKFGIDGAAYSTFITYVLICIVNHLYIRSYIAYSIHLKSFFGVLAIACILGLGLYELCNVINITSSRIMTLLFSGIALS
ITTILYGVCALKLKWISINKIPFLKR
>Mature_506_residues
MNKTFVKGAAILTITTFLSKLLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELNEKNKQKEI
AKLFKSASIIGIAFGVFGCLVIVLFSIEIANMLGGQETRMPLLITSLALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMKPTGVSQVIEQF
VRVFFMLIIAYILVSWDKSNTVITSGAMVGSFLGVISSLIYLRIKYNRSPYYNKSNSYSLRDLRENGKKILRVSIPIAIG
ALSMPLLNLVDSLTIPHVLQGSSTEIQEQFGIYSRGFAFTQIIVIFASAIVFPLIPLLTSALAKRDINLAKITIQNTNRL
AHVLTAPLTIWLMALTVPLNVGLFTDVKGSSMLTVMIGSSYFTAVMVLSIGVLQGINRSAQAAWIVIGASCVKVVLNIMF
VQKFGIDGAAYSTFITYVLICIVNHLYIRSYIAYSIHLKSFFGVLAIACILGLGLYELCNVINITSSRIMTLLFSGIALS
ITTILYGVCALKLKWISINKIPFLKR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55466; Mature: 55466

Theoretical pI: Translated: 10.17; Mature: 10.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKTFVKGAAILTITTFLSKLLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLAISKLIAELNEKNKQKEIAKLFKSASIIGIAFGVFGCLVIVLFSIEIANMLGGQETRM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
PLLITSLALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMKPTGVSQVIEQFVRVFFMLIIAYILVSWDKSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TVITSGAMVGSFLGVISSLIYLRIKYNRSPYYNKSNSYSLRDLRENGKKILRVSIPIAIG
CEEECHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHH
ALSMPLLNLVDSLTIPHVLQGSSTEIQEQFGIYSRGFAFTQIIVIFASAIVFPLIPLLTS
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALAKRDINLAKITIQNTNRLAHVLTAPLTIWLMALTVPLNVGLFTDVKGSSMLTVMIGSS
HHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEECCH
YFTAVMVLSIGVLQGINRSAQAAWIVIGASCVKVVLNIMFVQKFGIDGAAYSTFITYVLI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
CIVNHLYIRSYIAYSIHLKSFFGVLAIACILGLGLYELCNVINITSSRIMTLLFSGIALS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITTILYGVCALKLKWISINKIPFLKR
HHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKTFVKGAAILTITTFLSKLLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLAISKLIAELNEKNKQKEIAKLFKSASIIGIAFGVFGCLVIVLFSIEIANMLGGQETRM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
PLLITSLALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMKPTGVSQVIEQFVRVFFMLIIAYILVSWDKSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TVITSGAMVGSFLGVISSLIYLRIKYNRSPYYNKSNSYSLRDLRENGKKILRVSIPIAIG
CEEECHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHH
ALSMPLLNLVDSLTIPHVLQGSSTEIQEQFGIYSRGFAFTQIIVIFASAIVFPLIPLLTS
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALAKRDINLAKITIQNTNRLAHVLTAPLTIWLMALTVPLNVGLFTDVKGSSMLTVMIGSS
HHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEECCH
YFTAVMVLSIGVLQGINRSAQAAWIVIGASCVKVVLNIMFVQKFGIDGAAYSTFITYVLI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
CIVNHLYIRSYIAYSIHLKSFFGVLAIACILGLGLYELCNVINITSSRIMTLLFSGIALS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITTILYGVCALKLKWISINKIPFLKR
HHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]