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The map label for this gene is 218234139

Identifier: 218234139

GI number: 218234139

Start: 3776560

End: 3779343

Strand: Reverse

Name: 218234139

Synonym: BCB4264_A3865

Alternate gene names: NA

Gene position: 3779343-3776560 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218231496

Following gene: 218231877

Centisome position: 69.74

GC content: 31.03

Gene sequence:

>2784_bases
ATGAGATTAGAAAAACAATTAATAAAAAAGATGTATTATGAAACATTCCTAATGGAGAATGAAACAAAACCAACTCTTGA
CGTACTTGGACAAGCTTATGTAAACGAAGAAAAAAATGAGATTTCTGATGGGTCTTATATTCGTTTTGCACAAGGTGAAT
TTTATTATCGTCATCAAGATTTTGAAGCAGCTATTTTTAAATGGGAGAAGGTTAGTAATGAATTAGCACCATGGGCACAA
AAAAATATTGCGGATGCTTATTTCGAACTGAATCAGTTATCATTTGCTGAAAATATTTATACTTCTATTACTACTGATAA
TAAAATATTGATGACCGAAATTAGACTACAATTACTTTCTCTTTACATTGAGCAAAATAATTTTGACTCAGCTTTCGGTG
TTATTAAAGAAGCAGTTTCTTTAAATCCTGATTATCCGAATGTCACAAAAATTGCCCGTTCCTTTTATGAGGAACAGCAA
GATTTTGATAGTGCAGTAGAGCTTGCTGTGAATGAGTTAATTCGCATAGAATCGTATCCTTGGTTTGAGGTGTTAAAAGG
ATATATCGATAAAGGGTTTACTAAACATATTTCACCAGACTATTTTTATGATGCATTAGCTACATTAAATAATGTAGATC
AAGTACAATTTACGCAAATGGTTTCATCACTCTGGAACAGTTATAAAAATGAAAAAAATTACTTATTGTGGCTTAACACA
ATAAATGAATTTTTCTTACATATTGAAATACATTCGTCCGATATATGGAACAAAGTTTCTGCTCTTTACGAAGAAACGTA
CTTTGCATTAATTCAAGGTCAATATACGCTTAGACAATTAAACGATATCATACCAAATCTGTTAGCAAATTGGTTAAAGG
TAGTCAATCCATCTTATGCTGTATTTCCATCTGCAGCTGTATTGGCATGGGATGAGATTTTCCCTTCCAAAATAGATTCA
GCAAATATAGAACATGCGGAAAACTTACTGTCACATTCTATTAATGATGTAAATGGCTTAGAGTACAGCTTACACCTTTT
TGAATCTATTACACAGTGGGCACAAAAGCAGAATATAGAAATAGGTCACCGATTTAAATGGTTAGTTGACGAGCTCGCAG
ATTTAAGAACAAATCGTATTTTAGTAACGGGAACTTCAGGGAACGGAAAAACTACATTTATTAACTCTATATTAGGAGAA
AATATATTAGAAAAATCAATTTCAAATGTAGTAGTTTTAAAAAATGATGCTCATATAGAAATAAACGCTATAACAGACTC
AGCAATTACAACAACGGAAGATGTCTCTGATTACCATAATATGATGTCTCAGCACCATCAAACATATAGAGATAGAGCGT
GTGTTGAATTTAAATTACCATGCAGATTTTTAAATGAAAATAAACTTACATTTGTAGTGACACCTGGCTTTAATAGGAAT
AACGACACTAGAGATGAGATATTCGAATATTTAAATTCTGTAGACGAATTACTGTTCGTATTGAATGCGGATTCACCTTT
TACTGATAAAGAACGTGACATTCTATTAAGTATTCAAGAGCATACGCCAAATTTACAAATTCATTTCTTATTAAATAAAA
TCGATAACATTTACAGTGAAGCAGAAGTGAAAAGGGTATTACATGATACGGCAACGAGAATAAACACATATTTCCCGTAT
GCGAGAATTTTCCCTTATTCCTCGTTATATACAAGTAGTCAACAATTAAATGATTTAACTGAGTTTATTCATTTTAACTT
TAATCATAAAAATATCGATGCAGAACGTACTGAAAAGTTATTATTTTTCATTCGAAAAACAATTACATATCTTTTGGATA
AACGTGTTGAGAAAGAAAATAATCTGGTGGATGCTATTAATTGGAATGAAGATATGCTAGTGAAACTAAACGGTAGCATT
AATAACCTTACTACATTTGAGAGGGAAAAAATTCATTTCATTACACAATCATATCGTTCAATGAAGACTGAAATTACAAA
TGATCTTACTGAAAATATTCCGAAGATATTAAAGAGCTGTTCTAATTTAATTAGTGAAGAAAGTGATTTCGGGCACATGG
ATACGGAACTAAATAAAGCAATGAATGAAAGAGTGCATAAATATTTAGAACAAACTGTGTTACCTAATCTGGCTCTTTCT
ATGCAAAATTGGATTGCAACTTCTAATAATGAGCTTCTTCAAAGTCAAACGTATTTAGAAGAACTTAGTGAAGGGCTTAA
TTCACTATTTGGAGAAAATAGAATACAGTTAGAATGTGACTTTAAAGTACTTGATGACTGGCGCAGAGATACTGACAGGA
TGACGACTAGAATACAAATGGATGAAGTAAATATTTTACGTCGATTTACGCCAGCACAATTTTTACTGAAAAGTGCCGGT
AAATTATTTGGAGTTCTTCCTAAAAATAAATCTATGCTATATAACAAATACAAACAGTATGTAGAAAATGAAGATTATAC
TGAAGTAACGGCTTCTATTATGAAGAAATTTTTCTTGCAATTTGAGCTGTTTGAAAACACACAAGAGCGAGATATTAATA
TATTCTTTAGGAATCCATTTAACTCCTTAAAGCAAGCTGTAGAAAACACGCATTTAGAAATACAAGAAAAACAAGAGATA
TTACATAAGATGAAATCAAATCCTGAAATCTATCACGATTCTATCATGCTCTTTGAATTGAGATTGCGTCAATGTGAAGT
GATTTTAAATATAGATGATAATAATACTTTTGCGGATGTAGTTTTAGAAACAAGCGTAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTTCCAAAAGATATTCTTTGTTAAGATAAAAAGCATACATACAAAAAGTATTGACATATCTTAAAAATGTATTTTC
AAGATATAGTGGGGGAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATCTGATGTGTTATAAGAAAGTAAAAAGGAGCAACTGTAATAAGTTGCTCCTTTTTCATATAGATTATTTTTCTGTT
TCTTTAATTTTAGTTTGTAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Tetratricopeptide Repeat Family Protein; Dynamin Family Protein

Number of amino acids: Translated: 927; Mature: 927

Protein sequence:

>927_residues
MRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQDFEAAIFKWEKVSNELAPWAQ
KNIADAYFELNQLSFAENIYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFGVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQ
DFDSAVELAVNELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALATLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYKNEKNYLLWLNT
INEFFLHIEIHSSDIWNKVSALYEETYFALIQGQYTLRQLNDIIPNLLANWLKVVNPSYAVFPSAAVLAWDEIFPSKIDS
ANIEHAENLLSHSINDVNGLEYSLHLFESITQWAQKQNIEIGHRFKWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGE
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NDTRDEIFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSEAEVKRVLHDTATRINTYFPY
ARIFPYSSLYTSSQQLNDLTEFIHFNFNHKNIDAERTEKLLFFIRKTITYLLDKRVEKENNLVDAINWNEDMLVKLNGSI
NNLTTFEREKIHFITQSYRSMKTEITNDLTENIPKILKSCSNLISEESDFGHMDTELNKAMNERVHKYLEQTVLPNLALS
MQNWIATSNNELLQSQTYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRDTDRMTTRIQMDEVNILRRFTPAQFLLKSAG
KLFGVLPKNKSMLYNKYKQYVENEDYTEVTASIMKKFFLQFELFENTQERDINIFFRNPFNSLKQAVENTHLEIQEKQEI
LHKMKSNPEIYHDSIMLFELRLRQCEVILNIDDNNTFADVVLETSVE

Sequences:

>Translated_927_residues
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KNIADAYFELNQLSFAENIYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFGVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQ
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INEFFLHIEIHSSDIWNKVSALYEETYFALIQGQYTLRQLNDIIPNLLANWLKVVNPSYAVFPSAAVLAWDEIFPSKIDS
ANIEHAENLLSHSINDVNGLEYSLHLFESITQWAQKQNIEIGHRFKWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGE
NILEKSISNVVVLKNDAHIEINAITDSAITTTEDVSDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLTFVVTPGFNRN
NDTRDEIFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSEAEVKRVLHDTATRINTYFPY
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NNLTTFEREKIHFITQSYRSMKTEITNDLTENIPKILKSCSNLISEESDFGHMDTELNKAMNERVHKYLEQTVLPNLALS
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KLFGVLPKNKSMLYNKYKQYVENEDYTEVTASIMKKFFLQFELFENTQERDINIFFRNPFNSLKQAVENTHLEIQEKQEI
LHKMKSNPEIYHDSIMLFELRLRQCEVILNIDDNNTFADVVLETSVE
>Mature_927_residues
MRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQDFEAAIFKWEKVSNELAPWAQ
KNIADAYFELNQLSFAENIYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFGVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQ
DFDSAVELAVNELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALATLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYKNEKNYLLWLNT
INEFFLHIEIHSSDIWNKVSALYEETYFALIQGQYTLRQLNDIIPNLLANWLKVVNPSYAVFPSAAVLAWDEIFPSKIDS
ANIEHAENLLSHSINDVNGLEYSLHLFESITQWAQKQNIEIGHRFKWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGE
NILEKSISNVVVLKNDAHIEINAITDSAITTTEDVSDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLTFVVTPGFNRN
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NNLTTFEREKIHFITQSYRSMKTEITNDLTENIPKILKSCSNLISEESDFGHMDTELNKAMNERVHKYLEQTVLPNLALS
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KLFGVLPKNKSMLYNKYKQYVENEDYTEVTASIMKKFFLQFELFENTQERDINIFFRNPFNSLKQAVENTHLEIQEKQEI
LHKMKSNPEIYHDSIMLFELRLRQCEVILNIDDNNTFADVVLETSVE

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108718; Mature: 108718

Theoretical pI: Translated: 4.70; Mature: 4.70

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEECC
FEAAIFKWEKVSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSFAENIYTSITTDNKILMTEIRLQLLS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHH
LYIEQNNFDSAFGVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQDFDSAVELAVNELIRIESYP
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
WFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALATLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYKNEKNYLLWLNT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEC
INEFFLHIEIHSSDIWNKVSALYEETYFALIQGQYTLRQLNDIIPNLLANWLKVVNPSYA
CCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE
VFPSAAVLAWDEIFPSKIDSANIEHAENLLSHSINDVNGLEYSLHLFESITQWAQKQNIE
ECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IGHRFKWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGENILEKSISNVVVLKNDAHIE
CCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEE
INAITDSAITTTEDVSDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLTFVVTPGFNRN
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEECCCCCEEEEECCCCCCC
NDTRDEIFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSE
CCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
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HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHCCHHHHHHEEEH
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HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FELFENTQERDINIFFRNPFNSLKQAVENTHLEIQEKQEILHKMKSNPEIYHDSIMLFEL
HHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHH
RLRQCEVILNIDDNNTFADVVLETSVE
HHCCEEEEEEECCCCCEEHEEEECCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEECC
FEAAIFKWEKVSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSFAENIYTSITTDNKILMTEIRLQLLS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHH
LYIEQNNFDSAFGVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQDFDSAVELAVNELIRIESYP
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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INEFFLHIEIHSSDIWNKVSALYEETYFALIQGQYTLRQLNDIIPNLLANWLKVVNPSYA
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VFPSAAVLAWDEIFPSKIDSANIEHAENLLSHSINDVNGLEYSLHLFESITQWAQKQNIE
ECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IGHRFKWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGENILEKSISNVVVLKNDAHIE
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RLRQCEVILNIDDNNTFADVVLETSVE
HHCCEEEEEEECCCCCEEHEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA