| Definition | Acinetobacter baumannii AB0057, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011586 |
| Length | 4,050,513 |
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The map label for this gene is 213158691
Identifier: 213158691
GI number: 213158691
Start: 2736551
End: 2737819
Strand: Direct
Name: 213158691
Synonym: AB57_2647
Alternate gene names: NA
Gene position: 2736551-2737819 (Clockwise)
Preceding gene: 213158686
Following gene: 213158693
Centisome position: 67.56
GC content: 41.21
Gene sequence:
>1269_bases ATGAATCTTCCAATGACAATGTCATTACAAACCGTATCTTTTGAAGAGTTTATTACCACCATTGCGGCTGCATTAGGCTG CGGCTTATTGGTAGGTCTGGAGCGCGAACGAAGTAAGTTAAAACACGAATATAAAACTTTCGCGGGTTTTCGTTCTTTTG CAATTAGTTCCTTACTCGGAGCAGTTTGTTTTTTATTTGGTACCGCAATCGGGATTGTAGGCGCTCTACTTATAGGCGCG ATCAGTATTGTATCTCTTAAAAATCAGCCAAATGACCCCGGTGTCACCACAGAACTTGCCTTTATTATGACTTACTTTAT TGGGGCACTTTGTATCTGGAATATTTCGTTAGCTGCGGGACTCGCCGTCATCATGACAATTATTTTATTAGCAAAACAAT CAATGCACGGCATTGCCAGTCAATGGATTACCGAATCGGAATTGCGCGACGGGATTTTTTTACTTGCTCTACTTCTAATT GCTTTACCTTTAGTTCCCAATAAACCTTTTTGGGGACCCGTTCTAAACCCTCATGTGATTTTAAAGTTACTGACGTTGAT TTTATTTGTACAAGCCCTCGCACATATTGCAAAGCGGCTTTTATCCTCTAAAAATGCCTTATTACTTTCTTCTTTAGCCT CGGGTTTTGTTTCAAGTACTGCCACCATCGCGAGTCTAGGCTTAGAAGTACGCTCTGGTCGCGCGAATGCAAAAACAAAT GCAGGTGCAGCATTAATGTCATGCGTTTCCACATTGGTACAAACCTTAATTATTGTCGTCGGTATAAGTTTGGCATGGTT CAAACTCATTATATTTCCAACACTCATTGCATTGGCTTTTTTAGCGGTATGGGCTTTCATCTTATTACGTAAGGCAGAAC CAAGTACGACTTCATCTGAACTCGATACCAGAATGTTCAGCTTAAAAGAAGCGATTATTATTGCTGGGACACTTACGCTC ATTCAGGCAGGGGTTTATGGTCTAAGCCTATATTTAGGTAATGCAGGCTTAATCGCGGGGACACTACTTGCTTCTTTATT CGAAATACATGCCGCTATTGCAGCAGTGATTGTACAAGGTGAACCAAATAACTCTCAGGCGTCGTTATTAATCGCGTTCA TGGGTGGCTTTGCTGTTCATGCAATTGCCAAGAGCATTAACTCTGCCATTTCTGGTGGACTGCATTATGCCCTTGCTTTC ATACCTGCCCAAATTTTGCATATGACAATATTTATTGGCTTGCTCTGGATGAACATACATTGGTTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGACTAGGCTCAATACAAGAAAAAGCATAAACTGAAATGGAATACATGATTTTTAAATGGCTGACATCTACATATAACAA TAAACCAAAGAGCAAGTATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGCTTTATTACACGAGCGATGTGTCTTTCACCATATCAACAACTGTAATGACATTGCCATTAACTTTAAAATGAATAT CAAAATTCGAAAATTTCATT
Product: hyp
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 422; Mature: 422
Protein sequence:
>422_residues MNLPMTMSLQTVSFEEFITTIAAALGCGLLVGLERERSKLKHEYKTFAGFRSFAISSLLGAVCFLFGTAIGIVGALLIGA ISIVSLKNQPNDPGVTTELAFIMTYFIGALCIWNISLAAGLAVIMTIILLAKQSMHGIASQWITESELRDGIFLLALLLI ALPLVPNKPFWGPVLNPHVILKLLTLILFVQALAHIAKRLLSSKNALLLSSLASGFVSSTATIASLGLEVRSGRANAKTN AGAALMSCVSTLVQTLIIVVGISLAWFKLIIFPTLIALAFLAVWAFILLRKAEPSTTSSELDTRMFSLKEAIIIAGTLTL IQAGVYGLSLYLGNAGLIAGTLLASLFEIHAAIAAVIVQGEPNNSQASLLIAFMGGFAVHAIAKSINSAISGGLHYALAF IPAQILHMTIFIGLLWMNIHWF
Sequences:
>Translated_422_residues MNLPMTMSLQTVSFEEFITTIAAALGCGLLVGLERERSKLKHEYKTFAGFRSFAISSLLGAVCFLFGTAIGIVGALLIGA ISIVSLKNQPNDPGVTTELAFIMTYFIGALCIWNISLAAGLAVIMTIILLAKQSMHGIASQWITESELRDGIFLLALLLI ALPLVPNKPFWGPVLNPHVILKLLTLILFVQALAHIAKRLLSSKNALLLSSLASGFVSSTATIASLGLEVRSGRANAKTN AGAALMSCVSTLVQTLIIVVGISLAWFKLIIFPTLIALAFLAVWAFILLRKAEPSTTSSELDTRMFSLKEAIIIAGTLTL IQAGVYGLSLYLGNAGLIAGTLLASLFEIHAAIAAVIVQGEPNNSQASLLIAFMGGFAVHAIAKSINSAISGGLHYALAF IPAQILHMTIFIGLLWMNIHWF >Mature_422_residues MNLPMTMSLQTVSFEEFITTIAAALGCGLLVGLERERSKLKHEYKTFAGFRSFAISSLLGAVCFLFGTAIGIVGALLIGA ISIVSLKNQPNDPGVTTELAFIMTYFIGALCIWNISLAAGLAVIMTIILLAKQSMHGIASQWITESELRDGIFLLALLLI ALPLVPNKPFWGPVLNPHVILKLLTLILFVQALAHIAKRLLSSKNALLLSSLASGFVSSTATIASLGLEVRSGRANAKTN AGAALMSCVSTLVQTLIIVVGISLAWFKLIIFPTLIALAFLAVWAFILLRKAEPSTTSSELDTRMFSLKEAIIIAGTLTL IQAGVYGLSLYLGNAGLIAGTLLASLFEIHAAIAAVIVQGEPNNSQASLLIAFMGGFAVHAIAKSINSAISGGLHYALAF IPAQILHMTIFIGLLWMNIHWF
Specific function: Unknown
COG id: COG3174
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44888; Mature: 44888
Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLPMTMSLQTVSFEEFITTIAAALGCGLLVGLERERSKLKHEYKTFAGFRSFAISSLLG CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVCFLFGTAIGIVGALLIGAISIVSLKNQPNDPGVTTELAFIMTYFIGALCIWNISLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVIMTIILLAKQSMHGIASQWITESELRDGIFLLALLLIALPLVPNKPFWGPVLNPHVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHH LKLLTLILFVQALAHIAKRLLSSKNALLLSSLASGFVSSTATIASLGLEVRSGRANAKTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC AGAALMSCVSTLVQTLIIVVGISLAWFKLIIFPTLIALAFLAVWAFILLRKAEPSTTSSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH LDTRMFSLKEAIIIAGTLTLIQAGVYGLSLYLGNAGLIAGTLLASLFEIHAAIAAVIVQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EPNNSQASLLIAFMGGFAVHAIAKSINSAISGGLHYALAFIPAQILHMTIFIGLLWMNIH CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC WF CC >Mature Secondary Structure MNLPMTMSLQTVSFEEFITTIAAALGCGLLVGLERERSKLKHEYKTFAGFRSFAISSLLG CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVCFLFGTAIGIVGALLIGAISIVSLKNQPNDPGVTTELAFIMTYFIGALCIWNISLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVIMTIILLAKQSMHGIASQWITESELRDGIFLLALLLIALPLVPNKPFWGPVLNPHVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHH LKLLTLILFVQALAHIAKRLLSSKNALLLSSLASGFVSSTATIASLGLEVRSGRANAKTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC AGAALMSCVSTLVQTLIIVVGISLAWFKLIIFPTLIALAFLAVWAFILLRKAEPSTTSSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH LDTRMFSLKEAIIIAGTLTLIQAGVYGLSLYLGNAGLIAGTLLASLFEIHAAIAAVIVQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EPNNSQASLLIAFMGGFAVHAIAKSINSAISGGLHYALAFIPAQILHMTIFIGLLWMNIH CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC WF CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA