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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 213157815

GI number: 213157815

Start: 3398467

End: 3400641

Strand: Direct

Name: yccS [H]

Synonym: AB57_3299

Alternate gene names: 213157815

Gene position: 3398467-3400641 (Clockwise)

Preceding gene: 213157813

Following gene: 213157816

Centisome position: 83.9

GC content: 38.57

Gene sequence:

>2175_bases
TTGAAATCTTGGTTTAAACGCCTAAAAAGAGCGACTTATAACACATCATTTATGTATAACGTGCGGATGCTGATTGCCTT
TTCAGGAACTGCGTTCGTGCCTTATTTTCTAGGACATCAATTAGCAACAATTCCTCTCACTTTAGGTGTGGTCGCAGCTG
GTTTAAGTGATATTGATGATCGCTTTTCAGTGCGAATCATGAATTTGATTTACACCTATATTGGTTTCTTCATTACCGCA
GCTTCCGTGCAATTACTTTTCCCTTATCCAATGCTTTTTGCGCTAGGGCTGATTGCCTCTTGTATTGGCTGGATTTTACT
CGGGTCATTAGGTCGCCGTTACGCAACAATTTCTTATGGATGTCTGGTTGTTTCAGTTTATACCATGTTGGGAGTTCATT
TATTTGACCAGTGGTATATTCAGCCAGCGCTTTTGGTTGCAGGAGCAGCATGGTACGGACTTATTGCAACCATTAGCTTT
TTATTATTTCCGGTTCGCCAACTTCAAGATAAACTTGCGGCCTCTTATGCTTCATTAGGCGACTTTTTATTTGCCAAATC
CAATTTGTTTGATGTCGATATGACTCCTGCGAGTTATCAGCAAAGCATGATTGATCTTTCATTAGAAAATGGCAAATTAA
TAACGATTTTTAATGATCTTAAAACCGCCCTTTTAACCCGTTTAAAGGGTGACCGTGGACAAAAAGGTACTCGCCGTAGC
CTACATTATTACTTTGTCGCACAAGACATTCATGAACGTGCAGACTCTGCCCATATCGACTATCAAAAATTAGCTAAAAT
TTTCCAGCACAGTGATATTTTATTTAGGTTTCAGCGCATTTTGGCAATTCAGGGTAAAGCTTGCCAAGAGCTAAATGAAT
GTATTTTACAGCGTAAACCCTATATCCATAACAAACGCTTTAAGCAGAGTTTCGAGAATTTACGCTTATCTTTAGTAAAG
TTAAGAGATGATCAGCAGTATGACTTATTGTGGGTAAATGCTCTTTTTGCCTTATACCGAAACTTAAAGTCTATTGACTC
ACAATTACTCAACTTAGAAACGGAACAGCACATTCAGTCTGACAAAGTAAAGCAGGCTGAAAACCAACTTAAAGATGATG
ATCTAAAAGGTTGGAATGATATTGTTGTCCGAATAAAACAAAATCTAACACCTGAATCTGTACTGTTCCGTCATGCCATT
CGTGTTTCGATTGTTCTTTTTATTGGATATGTATTTATTCAAATGACCCATATCGAATATGGGTACTGGATTATGTTGAC
AGCTTTATTTGTTAGCCAACCTAACTTTAACGCAACAAAACGTCGCTTACGTTTACGTATTGTGGGTACATTAGTCGGAA
TTATTGTCGGCCTTAGCATAGTATTTTTAGTACCTTCTGTGGAAGGGCAATTAGTCATGCTAATTTTGAGTGGCGTACTG
TTTTTCGAGTTACGTAGTAAGCAATATGCTCAAGCAACCGCTTTTATTACCATTTTGGCATTAATTAACTTTAATCTGGA
CGGTTCGGCAGTCGCTGCAGCTATTCCTAGGTTTATTGATACCCTAATTGGTTGTGCTTTAGCATGGTTTGGTGTGACCT
TTATTTGGCCTGACTGGAAATTCCGTCGCCTACCGCGCAGCATTCGACGCTCCTTACAAGCACAATGTAATTATTTAGCT
GAAGTGGTAAAACAATATCATGAAGGCCATAATCATGCCCTCAACTACCGTATTGTCCGCCGAGCAGCACATAATACTGA
TGCAGAAGTTGCTTCGCTTATTTCTACTTTAGCAACAGAGCCGGACTTCGACCCTACTCGTAAATCCGATATATTTGAAT
TTTTATGCCTCAATCATACATTTTTAAGTTATATCGCTGCACTTGGAGCACATCGAGAAAAGATTCAGGATCAAGCAGTT
CTTAACGTATTAGATCAAGCATTAGATGATATACAAGGTGCTTTGTTAAGAGATGAAATGCCTGATCTTACGGCACAAAA
TATGCTACAGACGATACGTCAGCGCTTAAGCCAAAATGATGAAGATGACCAAAAATCGCTCATTATTTTACAGCAGTTAT
CGTTGATGCTCAGTGTATTAAATCGATTTAGTATGTTAAAACAACGGCTAAGTCATGATCTGGATAATGATGCTAGCGAA
CTTGCATCATTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATACAGACAAGCTTACACTGTCTATCGTATGATTTGTGCAACATTGGTGTAGAAATACGCAAATCCTTTATCACTCAGG
TTGATCAGCAAGGACTTCAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTGAGTCAGAATTTAGTATGAAATTGGCATAATATCCTTTCCTGACTTATGCCAATTAATGCTAAACTTAAAACAGTT
TACAATTTGTTATTTGCACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 724; Mature: 724

Protein sequence:

>724_residues
MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITA
ASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISF
LLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRS
LHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVK
LRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAI
RVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFIDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLA
EVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAV
LNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASE
LASL

Sequences:

>Translated_724_residues
MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITA
ASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISF
LLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRS
LHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVK
LRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAI
RVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFIDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLA
EVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAV
LNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASE
LASL
>Mature_724_residues
MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITA
ASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISF
LLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRS
LHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVK
LRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAI
RVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFIDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLA
EVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAV
LNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASE
LASL

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=706, Percent_Identity=50.5665722379603, Blast_Score=729, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=466, Percent_Identity=24.2489270386266, Blast_Score=99, Evalue=1e-21,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82683; Mature: 82683

Theoretical pI: Translated: 9.16; Mature: 9.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDD
CCHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
RFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
CLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRS
HHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
LHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKP
EEEEEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
YIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
DKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEY
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVL
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFIDTLIGCALAWFGVTFIWPDWK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
FRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC
PDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASE
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LASL
HHCC
>Mature Secondary Structure
MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDD
CCHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
RFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
CLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRS
HHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
LHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKP
EEEEEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
YIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
DKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEY
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVL
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFIDTLIGCALAWFGVTFIWPDWK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
FRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC
PDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASE
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LASL
HHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]