The gene/protein map for NC_009566 is currently unavailable.
Definition Shewanella piezotolerans WP3 chromosome, complete genome.
Accession NC_011566
Length 5,396,476

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 212634232

GI number:

Start: 1409038

End: 1413804

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: swp_1383

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 212634231

Following gene: 212634233

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4767_bases
ATGGATGATACTAATCAAAATGATCTAATAGTTGGTACTGATAGTGATGACCATATTGAAGGACTTACTGGCAACGACAT
AATAGATGGTCGCTCAGGTGATGACTATTTAGTTGGTGGAGAGGGGGACGACACCATCTCTGGTCAGGAGGGGAGAGACT
TTATCTTGGGTGACCAAGGGTTAGGGGAACAGTCGGATACTCCGGTAATCGAAAATGCGGAGACGACCGCTTGGGGCGTC
GAGCAACAGGTGTTTAATGCTGAAGACTCCATTGAGCCTATGGCTGGAAATTGTGCAGCCAGCCAGATTGTGAATATTGG
CGGCTATGTCGGTAATGTCGGTAATACTTTCACCCTCAACGTGGCTCTGCCTAAGGACAGCCCGGTATTACAAGATGGCG
CAGAGCTAACCATAAATATTCTTATTCCCGATGAGAACGGCAATATGGTGATTGCCGCTTCAGGTACTGCTACACAACTC
GCCGATGGAACCATACAGATTAATTTTGAGATCAATAGCGACCAGCTAGACGCAAGCGGCGATATTGAGTTGCAATTTGT
CAGCACTGGTGTTGACGCTGGCACAGAAATCAATATCGATTCTGTAGAACTGCTAGCCCACAACACCTATAACGATGTAT
TGGACGGTGGCGTTGGTGACGACCATCTTATGGGGCAGCAGGGTGAAGATAAATTGTTTGGCGGAGATGGTGATGATCAG
CTCGATGGTGGCATTAATAACGACGAATTGCATGGTGAAGCGGGTGATGATCTATTAATGGGCGGCCAGGGTGATGACCT
GCTTACTGGTGGCGAGGGACAAGACACCCTGATGGGCGGTGATGATAACGATACACTTGCTGGTGGCGCAGGCAATGACA
CCTTGATGGGGGAGCTTGGTGATGACACGCTTGAAGGTGGTGATGGGGACGACTTACTCATTGGTGATGATGGTAACGAT
ACGCTGATTGGTGGTGCGGGTCACGATTCTCTATTAGGTGGAAAAGGCATTGATGAGCTCAGTGGCGGCAGCGGAAATGA
TTACCTACAAGGTGATGAAGGTGACGATGTCTTAGCGGGTGGAGAGGGAAACGATACGCTAATTGCAGGTAGTGGTGCTG
ATGAGCTTGACGGTGGTAGTGGTGCCGATGTCTTACTTGCGGGGAGTGGCGATGATACGTTAACGGGCGGTGAAGGCGAC
GATAAGCTATTTGGTGAAGAGGGCAGCGATACGCTAAGCGGTGGTGCTGGTAACGATGAACTGCACGCAGGTGGTGGTGA
TGATGTGCTTACGGGTGGGGCGGGTGATGATGTGCTGTTTGGTTATGCTGGCGCCAACGTACTCGATGGTGGCAGCGGAA
ATGACACCATCTATGGTGGCAGTGATAGCGACCAAATTAATGCTGGTGAAGGAGATGATCTCGTTTATGCCGAGTCTGGT
GATGATGTCATTGAAGGCGGAGTGGGTAATGATGCGCTGTTTGGTGGCGACGGTAATAATACGATAGATGGTGGCACTGG
CCACGACTCGATATATGCAGGTGACGGTGATGACACTCTTATTGGTGGCAGTGGTGATGACAAGATTTATTCTGGCGCTG
GCAGCAACACCATCGACGCTGGTGATGGTAACGACTTAGTTTATGCGGGCGTTGACGCCGATACCATTGATGCTGGTAGC
GGTGATGATGTTATTTTCTCTGACGCAGGCGATGATACCGTTATAGCAGGTGCGGGTAATGATCAGATATATGCGGGTGC
TGGCGACGACGTTATAACCGGGGGCGAAGGTGACGACACTATCTATGCAGAAGATGGCGATGATTTAGTTATTGGGGGCG
TTGGTAACGATACCCTCTATGGTGGAGCTGGAGCTGATAGGTTAGAAGGTGGCGAAGGTAACGATGCTCTCAGTGGTGGT
GAAGGTAACGATGAGCTGTTATCTGGCAGTGGTGATAATTTTCTCGATGGTGGTAGCGGAGATGACATTATTACTGCACA
AGACGGTGACGATGTGTTGATTGGTGGCGATGGTCACGACAGTATTATAGCGGGAGCTGGTGATGACATTATCGATGCAG
GACTTGGAAATGACACCATTGATGCGGGTGATGGCAATGATACGGTCTATGCCCAAGATGGTAACGATACCATTGAAGGG
GGGTTAGGCAATGACTTGCTTCACGGAGGGCAAGGTATTGACCATCTTGATGGTGGTGAAGGTGATGATACTCTCTATGG
CGGTGGTGGCGCGGATACCTTAATTGGTGGAGCTGGTAATGACTTAGTCGATGGTGGCGAAGGTGATGATGTTATTACCG
GTGGAGAGGGGGATGACACGCTTATCGGTGGCAGTGGTGCGGACCAACTTTCAGGTGGTCTAGGCGATGACGTACTCGTT
GGTGATGCTGGAGATGATACGCTTTTAGGTGAAGCGGGTAATGACACAATTTATGCTGGGGCGGGCAGTGATTCATTGTT
AGGCGGTGCAGGGGATGACAAATTGTATGGCGGTGACGGTGACGACGAGCTTATTGGTGGCGAGGGTTACGATGAGCTTT
ATGGTGGCGCAGGCAATGACACGCTTTATGCCGAGAATGAAGCAGGCTTGCTCGCAGGTGGTGAAGGAGACGATAAGCTT
ATTGGTGGCACGGCAGACGATCAGCTCTACGGCGATGGTGGTAATGATACGATTTTAGCTGCAGAAGGTGATGACTTAGT
TTTTGCTGGTGCGGGTGATGACACCGTTGACACAGGCACTGGTGATGATGTGGTCTTTGCTGGTACTGGTAGCGATAATA
TTGCAACTGGTGCAGGAGATGACCAAGTCTTTGGTGAAGACGGAGATAATACTATCAACACCGGTGAGGGCAAAGATGAG
ATCTACGGTGGAGTCGGTGCTGATACTGTTTACGCCGGAACAGGAGATGACGTCATTTATGGCGGTGATGGTAATGACGC
CTTGCATGGCGAAGAGGGGGATGATTTCATTGATGGTGGCACAGGCTCCGATACCATATCTGGTGGTGTCGGAGCTGATC
TCATATTTGGTGGTGATGGCAGTGACACTATCGCTGGAGATGAAGGTAATGACCTGCTATTTGGGGGAGAAGGGCATGAT
CAAATAGCTGGTGGTGAGGGCGATGACCAACTATTTGGCGAAGCTGGTGATGATAGCTTATCCGGAGGAGCTGGAGCCGA
CTTGTTATTTGGTGGTGCGGGGGATGATACCTTAGATGGTGGTGACGCGGATGATCAACTCTTTGCTGGTGACGGTGATG
ATAATGTTATTGGCGGCTTAGGCAGTGACTTTGTCGATGGAGGCAGTGGTCATGACACTATCGCTGGCGGTGAAGGTGAT
GATGTTCTGCTTGGTGGTGATGGTAACGATACTATCGAAGGTGGCGCTGGAAAGGACAAGCTATTTGCTGGTACTGGTAA
TGATCACTTGATTGGTGGTGAAGGTGATGATGAATTGCATGGAGAGTTTGGTGACAACACCCTTGATGGTGGAGCGGGTG
ACGATGTTATCTATGGTGGTAGCGGTAATGATCGGTTAATTGGCGGCGAAGGTAAGGATCACCTCGAATCGCACCTTGGT
AATAATACTGTTGAAGGCGGCAGTGGTGAGGATACGATAATAACTGGTAGTGGTCATGACACTATTGATGGCGGTGATGA
TAATGACTCCATTGAGGCTGGGGCTGGAGATAATATAGTCTCTGGCGGAGCGGGCGATGACACTATAACAACTGGTAGTG
GTCATGATTTGATCGCTGGTGGTGAAGGAGACGATATCATTCACGCAGGAGAAGGGCACAATCAAGTCAGTGGTGGTGCG
GGTAATGACAGCATTATAGCGGGCATTGGCAGTGACACTATCTCTGGTGGTGAAGGTCATGACATCATTGATGCAGGTAA
CGGCGATAATCAAATTAGTGGCGATGCTGGTAACGATACCTTGATTGCAGGGGCTGGTAGCGATGTGATCTCAGGCGGAG
CGGGGGATGACACTATTCGTGCTGGCGATGGTCACAACACGGTTACAGGCGGTGAAGGTGATGATTCGATCATAGCAGGT
GAAGGACATGACAATCTCTCCGGTGGTGCAGGCAACGATAGGTTAGAAGCGGGTGCAGGTAATAACACAGTAAGTGGTGG
TGATGGCGATGATGTTCTGATTGCAACAGGTGGCGATGATAATCTAAGCGGGGGCGCAGGCTCAGATAACTTAAATGCTG
GCAATGGTAATAACCAACTGTTTGGCGGAGATGGTAATGACAAACTGACAAGTGGTTCAGGCTCTGATCTGCTCGAAGGC
GGCGCGGGTAATGATGCGCTTAGCTCGGGTAGTGGCAATGATCAACTGTTTGGTGGCGAGGGGAATGATAACTTAAGCGG
TGGTTCAGGTGACGACATGCTTTACGGTGAAGCTGGCAATGATAAGTTGACCGGTGGAGGCGGTAATGACCAACTCTTTG
GTGGGGACGGGGATGATAAGCTTGTAGGAAGCGGCGGCAATGACCAGCTTCATGGTGATGTTGGCAACGACCAACTCAGT
GGCGGCAGCGGTAATGACATGCTGTTTGCAGGTGTTGGTGATGACAAGCTCGACGGTGGTAGCGGAAGTGATGAACTGTA
TGGTGGTGATGGCGCGGATACGTTAGCAGGCGGCAGCGGCGATGACATTCTTTTCGGCGACAGCGGTGCCGATACTCTTG
ATGGTGGTACTGGGGTAGATACACTTTTTGGCGGAGCCAGGAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCACTTGGTAGCTCTTTTGAGCTGGCATTTAGAGAAAGTTAATTGGCTCATTTAAGTCAATTAGCTGTAATAACTCCCTA
TTTAATGAAGGAATTTTGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTCTTGTCTTTGATAGAGGTGATTTTGGCAATAACGTTGACGGCAGCATGGATAGTAATAGCTTTAGTTATGATGGTG
GTGACGGTTTCGATGTTCTG

Product: hemolysin-type calcium-binding region

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1588_residues
MDDTNQNDLIVGTDSDDHIEGLTGNDIIDGRSGDDYLVGGEGDDTISGQEGRDFILGDQGLGEQSDTPVIENAETTAWGV
EQQVFNAEDSIEPMAGNCAASQIVNIGGYVGNVGNTFTLNVALPKDSPVLQDGAELTINILIPDENGNMVIAASGTATQL
ADGTIQINFEINSDQLDASGDIELQFVSTGVDAGTEINIDSVELLAHNTYNDVLDGGVGDDHLMGQQGEDKLFGGDGDDQ
LDGGINNDELHGEAGDDLLMGGQGDDLLTGGEGQDTLMGGDDNDTLAGGAGNDTLMGELGDDTLEGGDGDDLLIGDDGND
TLIGGAGHDSLLGGKGIDELSGGSGNDYLQGDEGDDVLAGGEGNDTLIAGSGADELDGGSGADVLLAGSGDDTLTGGEGD
DKLFGEEGSDTLSGGAGNDELHAGGGDDVLTGGAGDDVLFGYAGANVLDGGSGNDTIYGGSDSDQINAGEGDDLVYAESG
DDVIEGGVGNDALFGGDGNNTIDGGTGHDSIYAGDGDDTLIGGSGDDKIYSGAGSNTIDAGDGNDLVYAGVDADTIDAGS
GDDVIFSDAGDDTVIAGAGNDQIYAGAGDDVITGGEGDDTIYAEDGDDLVIGGVGNDTLYGGAGADRLEGGEGNDALSGG
EGNDELLSGSGDNFLDGGSGDDIITAQDGDDVLIGGDGHDSIIAGAGDDIIDAGLGNDTIDAGDGNDTVYAQDGNDTIEG
GLGNDLLHGGQGIDHLDGGEGDDTLYGGGGADTLIGGAGNDLVDGGEGDDVITGGEGDDTLIGGSGADQLSGGLGDDVLV
GDAGDDTLLGEAGNDTIYAGAGSDSLLGGAGDDKLYGGDGDDELIGGEGYDELYGGAGNDTLYAENEAGLLAGGEGDDKL
IGGTADDQLYGDGGNDTILAAEGDDLVFAGAGDDTVDTGTGDDVVFAGTGSDNIATGAGDDQVFGEDGDNTINTGEGKDE
IYGGVGADTVYAGTGDDVIYGGDGNDALHGEEGDDFIDGGTGSDTISGGVGADLIFGGDGSDTIAGDEGNDLLFGGEGHD
QIAGGEGDDQLFGEAGDDSLSGGAGADLLFGGAGDDTLDGGDADDQLFAGDGDDNVIGGLGSDFVDGGSGHDTIAGGEGD
DVLLGGDGNDTIEGGAGKDKLFAGTGNDHLIGGEGDDELHGEFGDNTLDGGAGDDVIYGGSGNDRLIGGEGKDHLESHLG
NNTVEGGSGEDTIITGSGHDTIDGGDDNDSIEAGAGDNIVSGGAGDDTITTGSGHDLIAGGEGDDIIHAGEGHNQVSGGA
GNDSIIAGIGSDTISGGEGHDIIDAGNGDNQISGDAGNDTLIAGAGSDVISGGAGDDTIRAGDGHNTVTGGEGDDSIIAG
EGHDNLSGGAGNDRLEAGAGNNTVSGGDGDDVLIATGGDDNLSGGAGSDNLNAGNGNNQLFGGDGNDKLTSGSGSDLLEG
GAGNDALSSGSGNDQLFGGEGNDNLSGGSGDDMLYGEAGNDKLTGGGGNDQLFGGDGDDKLVGSGGNDQLHGDVGNDQLS
GGSGNDMLFAGVGDDKLDGGSGSDELYGGDGADTLAGGSGDDILFGDSGADTLDGGTGVDTLFGGARR

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG2931

COG function: function code Q; RTX toxins and related Ca2+-binding proteins

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA