Definition Shewanella piezotolerans WP3 chromosome, complete genome.
Accession NC_011566
Length 5,396,476

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 212633886

GI number:

Start: 1026445

End: 1030461

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: swp_1021

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 212633885

Following gene: 212633887

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4017_bases
ATGAATAATGTTTTATCATGGTTGTATAATGGATGGGGGAATTATGAAACAGGGAAAGGTGCTGGAGACTTAATAGATAG
TAGAAATGAATTGATCGAGGCTTGTAAAGAAGGATATTCAAATCCAACTGCTGGGAATGCGCAGAAGATAAGAGATGCTG
CCGATGAGTATCGAAGAAATGCTGCTAAATCTGGAACAGGGCTATTAGTTAGTGATCCAATTCTTGGCAAAGCTCTGGGT
CAGTTAATTGATAATGAAAATCTAAGGGATTATTATCATGGAAATGAACGTGATAATAAAAGGTGGAGTGAAATAGCCCA
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ACGGGAATTGAGTTAGATGACTCGATTAGAAGTATGGCAAATATCATAGGTATGGGACGAGTAGACAGTTTGCAGTATTC
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TTTGTTAGCTCCGTTAGTACAGATCCGGAAACAGGTCGCCGTGTCGAAACCACTTCGGTAGCGTTTATGCCAGAAGTGTT
ATCTGAGGAGTTGAGTTATAAAATAAATATATTATCAGCTTTTTATGGTGATGATAGATTTAAAAATGTAAACGTAATGG
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TCGCAGACTCGCTTAAATAAGTATTTAGATTTAATTGATGTTGATTTTGGTAGCGAGAATATTTTTAATTATGAAGCATT
AAATGAGTATGTTAAACGACAAGTGCAAACAGGGGAAGATAAACTAACGGTATTAGAGGATATATTATTCATTATAGAAA
GGGATCCTGTCTTACTTGCTGATTCAGAACTATACCTTCAATTGAATGATTTAATTGACCTCTTGCCAATTGAAGAGACT
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TTCTGTTAAAGATGGTTACACTGATGCACTAGTAATTAATCGAGATGCCCCAGTTATTTTATTAGCAGGAGATTCGGTGA
CCAATGTTACCATAAATGCGCCAGAAGTAATAGTTACAGCTGGAAGCGGAGATGATCATGTTACCACTGGAAGTGGTGAG
GATTTAATTGAGGCTGGTAACGGTAACGATACTATAAACTCTGGATCTGGTAACGACACTATATATGGTGGTGCAGGTAA
TGACACGATAAATACTGGTGCTGGCGATGATATAGCATACGGTGCAGCAGGTGAAGACGTTATAAATTCAGGTGCTGGTA
ATGACACCATTTATGGTGGTGCGGGTAATGACACGATAAATACTGGTGCTGGCGATGATAAAGCGTACGGTGGTGCGGGT
GACGACATGTTAACCAATACTGGAGCGGGTGATACGGCGCTGTACGGGGAGGAGGGGCATGACACCTTAACCGGGTACTA
CCGTGCGAATAACACGCTAGATGGTGGTGAGGGTAATGACACACTCACCATGAATTCGATATCTTCGAGCTATCGAGATT
CCAGTAACAGTCTGCGTGGTGGTCGAGGTGATGACAGTTTTACCATGGGATATGGCAGTGACACCTACCATTATGATTTA
GGCGATGGTCATGATGTCATTCGAGACAAGGGATATGACTCGAGTCAGGATGAGACGAAACATCGTCGAGACACGTTAGT
ATTGGGTGCCGGTATTACGCGTGAGATGGTGAGCTTCACTCATGACAGTGCGGGTAACATTATTATCACGATAACAGATC
CGGATAATGCGGCCAATAATGGCAGTATTATGGTGATGGGTGCATACACGAGCAGCACGTATCGAATTGAAGGTATCGAG
TTTTCGGGTGATGAAAGTGGCGCCAGTAACTTGGATGAAGCGGCAATATTGGCCGCAGCAGAAGGGATGTTTGGTACTGA
TGGTGATGACGCACTGACGGGCACGTCGATGAGTGAGACGCTTTATGGTGGTGAGGGTAATGACGTTATTCATACTGGGT
CGGGTGAGGATATTGCCTATGGCGGTGCAGATAATGACACGTTAACCAATACTGGAGCGGGTGATACGGCGCTGTACGGG
GAGGAGGGGCATGACACCTTAACCGGGTACTACCGTGCGAATAACACGCTAGATGGTGGTGAGGGTAATGACACACTCAC
CATGAATTCGATATCTTCGAGCTATCGAGATTCCAGTAACAGTCTGCGTGGTGGTCGAGGTGATGACAGTTTTACCATGG
GATATGGCAGTGACACCTACCATTATGATTTAGGCGATGGTCATGATGTCATTCGAGACAAGGGATATGACTCGAGTCAG
GATGAGACGAAACATCGTCGAGACACGTTAGTATTGGGTGCCGGTATTACGCGTGAGATGGTGAGCTTCACTCATGACAG
TGCGGGTAACATTATTATCACGATAACAGATCCGGATAATGCGGCCAATAATGGCAGTATTATGGTGATGGGTGCATACA
CGAGCAGCACGTATCGAATTGAAGGTATCGAGTTTTCGGGTGATGAAAGTGGTGCCAGTAACTTGGATGAAGCGGCAATA
TTGGCGGCATTAGAAGAAATGCATGGCACTGAAGGTAGTGATGTAATTCAGGGAACTTCTACTGCGGATATCATTTACGG
AGAGAATGGGGGAGACACGCTTTACGGCCGAAAGGGGGCTGATAAGCTTTTTGGTGGCTCAGGTGACGATAAGTTAGTAG
GTGGTGGTGGTAAAGACCTACTAATTGGTGGTAGTGGTGATGACCAATTAATTGGTGGTGGTGGTGGTGACACTCTGAAC
GGAGGTGAAGGGAGCGATAACTTAAAAGGTTCTGCAGGTAATGATACTTATTTGTTTTCTTCTGATTTCGGTAACGATGT
TATAAATAATTATGACTCAAACTCTTCCAGTATTGATACAGCTATATTTAACGATGTTTCAATCGAAGAGCTGTGGTTTA
GTCGTGATGGTAATGATCTACAGATCAACGTCATTGGAACTGATAATCAAGTAGAAATATCTGATTGGTACAGTGGTGTT
AATTATCAATTGGATAAAGTTCAAGTCGGTGATTCAGTATTATTAAATACTCAACTCGAACAACTTGTTTCAGCCATGGC
AAGCTTTGATGTACCAGTTGGTACTGGAAGCATTGTTACCGAAGAAGCTCAAGATGCGTTAAGGCCAATATTAGTAGAAA
GTTGGAACACCCTCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTATATATGATGATGCTGAATTGAATAGTAGGCTGTATTTTATTAAAGAAATTAATTCCGGATATTACAATGGTTGTA
TTAATTAAAAAGGAGTTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTAGGCTTGTTATGTAACTAAAAGGTTTTAAATAAGGCATTGCACGTAGATAGTGTAGTGCCTTTCTGTTTTAAAAAA
TTTAGTAATTCAATTACATT

Product: hemolysin-type calcium binding protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1338_residues
MNNVLSWLYNGWGNYETGKGAGDLIDSRNELIEACKEGYSNPTAGNAQKIRDAADEYRRNAAKSGTGLLVSDPILGKALG
QLIDNENLRDYYHGNERDNKRWSEIAQALGHEDWEKDGIREQCTLEGITQLVNEIGNIPPGSSRVIDPLMIDLDGDGLEL
TSSIYFDNDNDGILNRTSWVGSDDGVLVFDINSNGLIENGSEIFGDDFVKSNGEKAIDGFDALRDLDSNNDGQFDSNDSN
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DDMLTNTGAGDTALYGEEGHDTLTGYYRANNTLDGGEGNDTLTMNSISSSYRDSSNSLRGGRGDDSFTMGYGSDTYHYDL
GDGHDVIRDKGYDSSQDETKHRRDTLVLGAGITREMVSFTHDSAGNIIITITDPDNAANNGSIMVMGAYTSSTYRIEGIE
FSGDESGASNLDEAAILAAAEGMFGTDGDDALTGTSMSETLYGGEGNDVIHTGSGEDIAYGGADNDTLTNTGAGDTALYG
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DETKHRRDTLVLGAGITREMVSFTHDSAGNIIITITDPDNAANNGSIMVMGAYTSSTYRIEGIEFSGDESGASNLDEAAI
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NYQLDKVQVGDSVLLNTQLEQLVSAMASFDVPVGTGSIVTEEAQDALRPILVESWNTL

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG2931

COG function: function code Q; RTX toxins and related Ca2+-binding proteins

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA