Definition Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome.
Accession NC_011374
Length 874,478

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 209554131

Identifier: 209554131

GI number: 209554131

Start: 793953

End: 795437

Strand: Reverse

Name: 209554131

Synonym: UUR10_0662

Alternate gene names: NA

Gene position: 795437-793953 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554487

Following gene: 209554029

Centisome position: 90.96

GC content: 27.14

Gene sequence:

>1485_bases
TTGAATAATAATGAGGAAAAAACGCATCCTAAAAATAGAATTAAAAAGATTTTTAATTGAAGAAATAAAACTAAAGAAGC
ATTAAGAACCGAAAATAATTTATTAAAGCAAATAAGTAATGAAGCAACAATTCAACAAAGTGTACAAATTGAAAAAATTC
GCTACAAGGCTGGTCTTTTAAAATTTGCTGCTCTTTATTCAACTAAAAAAATCTTTTTACGCTACTTAATCATTGTTATT
TTTTCACTTCTTGCGAGTTTATTGGTTTTATTATTAGTTCATAATACTGGAATTTATTCAGCGGGAATTATGGGAACATC
ACAAGGGATTGCGCGGATTTTGCAATCAATTATGATTTCGAACCATAGTTCGCCAAAAGAAGCAAAATTAGCATATGATA
TTATGTTTTGATTGTTTGCAATTTTTGTAAACATTCCCTTACTAGTTTTTTCATACAAAAAAATTGGTAAACACTTTACA
TTAATGACATTAACATACATTGTTACTGTTCAAGTCTTTGGTTTTGCTTTAAGTCAAATTCCAAATGTTGAAAAAATTAT
GATCTTTGGGAACAATCGTTTAAGTTACCCACCTATTAATTCATTTTTTACTAATAGCATCTTAGATGAAAAAATAGCTC
AAAATATTGAAGCTAATGTTCTAAGCTATGCAAACATCTCTAATTTAGAGATTCGAAATGAATTTATAAATTATGTACAA
GCAAACCCTAATGCAACAATTGGTGATTTATTTCATTTAAATCAAACCACAACTTATCGTCAAGCTTTATATGAGTTTGC
AAAACCTTTATATGTTTTCCATGATCTTATTGTTAATAAAGTGCAAATTTTATCTTGAGTTGATCCAAATCAAGCAAGTA
AAATTCCTTCTATTCTAATTTATGCAGTTATTTATCCGATATTTGATGGTATTTTCTTATCAATTATTTATATTGCTGGA
GGATCATCTGGAGGAACAGATATTATTTCATTCTGATATTCTAAAAAATATGGAAAACCAACTGGTTCAATTCTAACTTA
CTTTAATGTAGCAACATTAATTATTGGGATTGTTTTAGGATCATTTGCACCTGCTGGTATGATTAATCCACGTTATTGAG
ATACTCAATATTTCTTTTCACCAAACATGGTAGCTTCTATTCTTGCTTCAATTGTTTTAGGAATTGTCTTTAATATTTAC
TTCCCAAAACACAAGAGTTTAAAAATTCAAGTTTACTCAAAAAATACGAGTGCAATTATTGAAAATTTACGTGCTAACGA
TTTTAATAATTCTATTACTTTAAATAGTTTAAGTGATTCATTATCATTAAGAACAAATTATTCATTAGAAATTATTTCAC
CATACATTGAATTACCATCCTTAATTCATTTAGTTCGTGATATTGACAAAGACTGCTTAATTGTTATTTATCCAATTATT
GACATTGATGGAGAAATGGTTGTTAGAAAATCAACAATTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATAGTTGTTGCTTTTTTAGTGTTTATATTTAAAATATTATTTTAAGTAGAACAAAAAATTTTTCCTTTTATAAAAAA
ACCAAAAGGAGTTGATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATATTAATTACTAAAATGGTCGTCATTGACCATTTTTTTATTCTATACAAAAAATAAATTAATCTAAAAAACATAA
TAATGTTAAAAAGAAAAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 494; Mature: 494

Protein sequence:

>494_residues
MNNNEEKTHPKNRIKKIFNWRNKTKEALRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVI
FSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMFWLFAIFVNIPLLVFSYKKIGKHFT
LMTLTYIVTVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGNNRLSYPPINSFFTNSILDEKIAQNIEANVLSYANISNLEIRNEFINYVQ
ANPNATIGDLFHLNQTTTYRQALYEFAKPLYVFHDLIVNKVQILSWVDPNQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIIYIAG
GSSGGTDIISFWYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFAPAGMINPRYWDTQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIY
FPKHKSLKIQVYSKNTSAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLSLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKDCLIVIYPII
DIDGEMVVRKSTIS

Sequences:

>Translated_494_residues
MNNNEEKTHPKNRIKKIFN*RNKTKEALRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVI
FSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMF*LFAIFVNIPLLVFSYKKIGKHFT
LMTLTYIVTVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGNNRLSYPPINSFFTNSILDEKIAQNIEANVLSYANISNLEIRNEFINYVQ
ANPNATIGDLFHLNQTTTYRQALYEFAKPLYVFHDLIVNKVQILS*VDPNQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIIYIAG
GSSGGTDIISF*YSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFAPAGMINPRY*DTQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIY
FPKHKSLKIQVYSKNTSAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLSLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKDCLIVIYPII
DIDGEMVVRKSTIS
>Mature_494_residues
MNNNEEKTHPKNRIKKIFN*RNKTKEALRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVI
FSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMF*LFAIFVNIPLLVFSYKKIGKHFT
LMTLTYIVTVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGNNRLSYPPINSFFTNSILDEKIAQNIEANVLSYANISNLEIRNEFINYVQ
ANPNATIGDLFHLNQTTTYRQALYEFAKPLYVFHDLIVNKVQILS*VDPNQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIIYIAG
GSSGGTDIISF*YSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFAPAGMINPRY*DTQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIY
FPKHKSLKIQVYSKNTSAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLSLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKDCLIVIYPII
DIDGEMVVRKSTIS

Specific function: Unknown

COG id: COG1284

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003740
- InterPro:   IPR019264 [H]

Pfam domain/function: PF02588 DUF161; PF10035 DUF2179 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54974; Mature: 54974

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNNEEKTHPKNRIKKIFNRNKTKEALRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLK
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAALYSTKKIFLRYLIIVIFSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
HSSPKEAKLAYDIMFLFAIFVNIPLLVFSYKKIGKHFTLMTLTYIVTVQVFGFALSQIPN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VEKIMIFGNNRLSYPPINSFFTNSILDEKIAQNIEANVLSYANISNLEIRNEFINYVQAN
CEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
PNATIGDLFHLNQTTTYRQALYEFAKPLYVFHDLIVNKVQILSVDPNQASKIPSILIYAV
CCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
IYPIFDGIFLSIIYIAGGSSGGTDIISFYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFAP
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AGMINPRYDTQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIYFPKHKSLKIQVYSKNTSAIIENLRA
CCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHC
NDFNNSITLNSLSDSLSLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKDCLIVIYPIIDIDGE
CCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCC
MVVRKSTIS
EEEEECCCC
>Mature Secondary Structure
MNNNEEKTHPKNRIKKIFNRNKTKEALRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLK
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAALYSTKKIFLRYLIIVIFSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
HSSPKEAKLAYDIMFLFAIFVNIPLLVFSYKKIGKHFTLMTLTYIVTVQVFGFALSQIPN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VEKIMIFGNNRLSYPPINSFFTNSILDEKIAQNIEANVLSYANISNLEIRNEFINYVQAN
CEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
PNATIGDLFHLNQTTTYRQALYEFAKPLYVFHDLIVNKVQILSVDPNQASKIPSILIYAV
CCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
IYPIFDGIFLSIIYIAGGSSGGTDIISFYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFAP
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AGMINPRYDTQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIYFPKHKSLKIQVYSKNTSAIIENLRA
CCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHC
NDFNNSITLNSLSDSLSLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKDCLIVIYPIIDIDGE
CCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCC
MVVRKSTIS
EEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7569993 [H]