| Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011374 |
| Length | 874,478 |
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The map label for this gene is 209554052
Identifier: 209554052
GI number: 209554052
Start: 283384
End: 285162
Strand: Reverse
Name: 209554052
Synonym: UUR10_0259
Alternate gene names: NA
Gene position: 285162-283384 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554004
Following gene: 209554618
Centisome position: 32.61
GC content: 22.77
Gene sequence:
>1779_bases ATGAAAACACGGTTTAAAAGAAATATTTTGTTAGCATTTTTAAGTGCTATTGTTACACCGGTTCCCGTTATATTGGCTTG TGTGTTAACAAAAACTAACAACGAAAACAATTCACAATGATTCAAAATTTTTTCAGAAATTAAAAACGAAGCTAATACAA AAATTAGTTATGTTTTTGCAAATAATCATAAATTAAATTATCTTATTGATAAAGCTAAACAAATAGATAATTTTATTAAG ATTTTAAATTTAAATGAAAATAGTGGAAACAATTGACTTATATATGGATTTTCAAAAATATGAAAATTAATACAAGAGTT TGATTTTATTCTAAAACAAAAAACACAAGAATATAATAATTGATTAACTAAAGTAGATGACGTTATTAAATTATTAAAAG ACAAAAAAATAGAACTTTTAAAATTTAAAAACAAAAATAATGTTAATGATGCTAATCTTAATTTAATTCAAAAAAGAATT GATGAAATTTTGGATAATTATACAAAAGCGCCAAATGATGAAAATATTGATGATATTAAAATAAGATATCAAAAAATTGT TGAATCATGTAATTATAACTACCAAAAATCAATTAAAGAAGAAACTAATAAAACTAAAAAAATTAAAGAAGAGATAAAAA ATTTAAAAAAAGATTATTTCAACAAAATTGAAAATGGCAAAGAATATTACAAATTGTACGATGAAGAAATTGCTAAATTG CTTTATGAAGCTAATCAACTTAATGATAATATTCATTCAATTCTTGATCATATATTAAATAGAAAATCGCTTGAAAATAA ATTTAATGATCTTAAAAAGGAAGTTGAAGAACATAAGAAAATATCAAAATATATTAAAGAAAATGCTAATAAAAATAACG AAAACTTTTGAGGTACATGAAGAGAGAATATTTTAGGAAAATATTTTGTATATCAAAATTTTATGGATAACACTAATGTT GCTATTTGGTATGGATTGGCATTAAAAATCGAAAATTTATCAAAACAAAACTTCATAAATAATAAAGTAAATGAATTAAA ACAATTATTAGAAAAATGAAAATTGTATGGTCAAGCACTTATAAGAGATACATTTGACGCAATTGGTATTAGTGGGTTAT TCTTTACTGTCAACACAAAAGTGAGAATGTTAGAAAATTATTCACCACTTATAGATCCAAATCGCCCTTCAAAAAAAGGT GAATATTACATTTTGATTGAAAAATTAAAGAATTTATTAAACGAAATTCAAGAAAGATCAAGAAAAGCGAGCAAAAATCT TCAAAATATTTACGATCAAGTTGTTAAAGATGATGTCGAAAAAATTCTTGAATATGTTAAAGCAAATGGTTATGGTTTTT CTCCGCAAGAAGCTTTTAATGAATTAATGACTTGGTCTAATTATTATTTAAATCAAATGCCAGAAATTTTCCAACATTAT AAAGAAAAAATAATCAAACCTGTTCTTGATCAAATTAAAACAAAAGGTAATTCAGCAAGCGATGTTGTTAAATTAGAAGA ACTATACAATTACAAGTACAATTATACTAATTTTTATGAACCTTATAATTTTGAAAGAGATTCTTTTTACTGAGAAAAAG ATTATAAAAATAATGACAAAAACGAAAAGATTAAAGATGATGAAGGGCGATATATATTAAAAAAACAAATTCCTCACCAC CTGAAAAATGAATACGACACTGCGCGCTTGTTTTTAAAAATAGAAAGAACTATTGATGAAGTATGTAAAAAATACTCAAT AACTAATCCTTTAAACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAATTATACAAATTAATATATTATAAATATGTCTAAATTTTGTACAATTTAAGGTGAGGCTATGCAACTTTTTTTTAC ATTATAAAGATTTTTACTTC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAACAATTAAACTTTTCTTAACCAAAAACGCTAAGAAAAGTTTTTTTATATTTTAATAATCATTTTTAACAAAAACAAA CTGAATATGAGAGGTGTAAA
Product: putative lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 592; Mature: 592
Protein sequence:
>592_residues MKTRFKRNILLAFLSAIVTPVPVILACVLTKTNNENNSQWFKIFSEIKNEANTKISYVFANNHKLNYLIDKAKQIDNFIK ILNLNENSGNNWLIYGFSKIWKLIQEFDFILKQKTQEYNNWLTKVDDVIKLLKDKKIELLKFKNKNNVNDANLNLIQKRI DEILDNYTKAPNDENIDDIKIRYQKIVESCNYNYQKSIKEETNKTKKIKEEIKNLKKDYFNKIENGKEYYKLYDEEIAKL LYEANQLNDNIHSILDHILNRKSLENKFNDLKKEVEEHKKISKYIKENANKNNENFWGTWRENILGKYFVYQNFMDNTNV AIWYGLALKIENLSKQNFINNKVNELKQLLEKWKLYGQALIRDTFDAIGISGLFFTVNTKVRMLENYSPLIDPNRPSKKG EYYILIEKLKNLLNEIQERSRKASKNLQNIYDQVVKDDVEKILEYVKANGYGFSPQEAFNELMTWSNYYLNQMPEIFQHY KEKIIKPVLDQIKTKGNSASDVVKLEELYNYKYNYTNFYEPYNFERDSFYWEKDYKNNDKNEKIKDDEGRYILKKQIPHH LKNEYDTARLFLKIERTIDEVCKKYSITNPLN
Sequences:
>Translated_592_residues MKTRFKRNILLAFLSAIVTPVPVILACVLTKTNNENNSQ*FKIFSEIKNEANTKISYVFANNHKLNYLIDKAKQIDNFIK ILNLNENSGNN*LIYGFSKI*KLIQEFDFILKQKTQEYNN*LTKVDDVIKLLKDKKIELLKFKNKNNVNDANLNLIQKRI DEILDNYTKAPNDENIDDIKIRYQKIVESCNYNYQKSIKEETNKTKKIKEEIKNLKKDYFNKIENGKEYYKLYDEEIAKL LYEANQLNDNIHSILDHILNRKSLENKFNDLKKEVEEHKKISKYIKENANKNNENF*GT*RENILGKYFVYQNFMDNTNV AIWYGLALKIENLSKQNFINNKVNELKQLLEK*KLYGQALIRDTFDAIGISGLFFTVNTKVRMLENYSPLIDPNRPSKKG EYYILIEKLKNLLNEIQERSRKASKNLQNIYDQVVKDDVEKILEYVKANGYGFSPQEAFNELMTWSNYYLNQMPEIFQHY KEKIIKPVLDQIKTKGNSASDVVKLEELYNYKYNYTNFYEPYNFERDSFY*EKDYKNNDKNEKIKDDEGRYILKKQIPHH LKNEYDTARLFLKIERTIDEVCKKYSITNPLN >Mature_592_residues MKTRFKRNILLAFLSAIVTPVPVILACVLTKTNNENNSQ*FKIFSEIKNEANTKISYVFANNHKLNYLIDKAKQIDNFIK ILNLNENSGNN*LIYGFSKI*KLIQEFDFILKQKTQEYNN*LTKVDDVIKLLKDKKIELLKFKNKNNVNDANLNLIQKRI DEILDNYTKAPNDENIDDIKIRYQKIVESCNYNYQKSIKEETNKTKKIKEEIKNLKKDYFNKIENGKEYYKLYDEEIAKL LYEANQLNDNIHSILDHILNRKSLENKFNDLKKEVEEHKKISKYIKENANKNNENF*GT*RENILGKYFVYQNFMDNTNV AIWYGLALKIENLSKQNFINNKVNELKQLLEK*KLYGQALIRDTFDAIGISGLFFTVNTKVRMLENYSPLIDPNRPSKKG EYYILIEKLKNLLNEIQERSRKASKNLQNIYDQVVKDDVEKILEYVKANGYGFSPQEAFNELMTWSNYYLNQMPEIFQHY KEKIIKPVLDQIKTKGNSASDVVKLEELYNYKYNYTNFYEPYNFERDSFY*EKDYKNNDKNEKIKDDEGRYILKKQIPHH LKNEYDTARLFLKIERTIDEVCKKYSITNPLN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69262; Mature: 69262
Theoretical pI: Translated: 9.49; Mature: 9.49
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTRFKRNILLAFLSAIVTPVPVILACVLTKTNNENNSQFKIFSEIKNEANTKISYVFAN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEC NHKLNYLIDKAKQIDNFIKILNLNENSGNNLIYGFSKIKLIQEFDFILKQKTQEYNNLTK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH VDDVIKLLKDKKIELLKFKNKNNVNDANLNLIQKRIDEILDNYTKAPNDENIDDIKIRYQ HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH KIVESCNYNYQKSIKEETNKTKKIKEEIKNLKKDYFNKIENGKEYYKLYDEEIAKLLYEA HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQLNDNIHSILDHILNRKSLENKFNDLKKEVEEHKKISKYIKENANKNNENFGTRENILG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH KYFVYQNFMDNTNVAIWYGLALKIENLSKQNFINNKVNELKQLLEKKLYGQALIRDTFDA HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGISGLFFTVNTKVRMLENYSPLIDPNRPSKKGEYYILIEKLKNLLNEIQERSRKASKNL HCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNIYDQVVKDDVEKILEYVKANGYGFSPQEAFNELMTWSNYYLNQMPEIFQHYKEKIIKP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLDQIKTKGNSASDVVKLEELYNYKYNYTNFYEPYNFERDSFYEKDYKNNDKNEKIKDDE HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC GRYILKKQIPHHLKNEYDTARLFLKIERTIDEVCKKYSITNPLN CCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKTRFKRNILLAFLSAIVTPVPVILACVLTKTNNENNSQFKIFSEIKNEANTKISYVFAN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEC NHKLNYLIDKAKQIDNFIKILNLNENSGNNLIYGFSKIKLIQEFDFILKQKTQEYNNLTK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH VDDVIKLLKDKKIELLKFKNKNNVNDANLNLIQKRIDEILDNYTKAPNDENIDDIKIRYQ HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH KIVESCNYNYQKSIKEETNKTKKIKEEIKNLKKDYFNKIENGKEYYKLYDEEIAKLLYEA HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQLNDNIHSILDHILNRKSLENKFNDLKKEVEEHKKISKYIKENANKNNENFGTRENILG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH KYFVYQNFMDNTNVAIWYGLALKIENLSKQNFINNKVNELKQLLEKKLYGQALIRDTFDA HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGISGLFFTVNTKVRMLENYSPLIDPNRPSKKGEYYILIEKLKNLLNEIQERSRKASKNL HCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNIYDQVVKDDVEKILEYVKANGYGFSPQEAFNELMTWSNYYLNQMPEIFQHYKEKIIKP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLDQIKTKGNSASDVVKLEELYNYKYNYTNFYEPYNFERDSFYEKDYKNNDKNEKIKDDE HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC GRYILKKQIPHHLKNEYDTARLFLKIERTIDEVCKKYSITNPLN CCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA