| Definition | Escherichia coli O157:H7 str. EC4115, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011353 |
| Length | 5,572,075 |
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The map label for this gene is 209396327
Identifier: 209396327
GI number: 209396327
Start: 5435668
End: 5437320
Strand: Reverse
Name: 209396327
Synonym: ECH74115_5803
Alternate gene names: NA
Gene position: 5437320-5435668 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209398030
Following gene: 209396899
Centisome position: 97.58
GC content: 38.11
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TCGATCATGGATAAGATTATAGGGAAACAATTACCTAAAAAAGATCAAGATAATGAACATTGGGTATCCATGTCGGACCT AATGGCTGGGCTGATGATGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 550; Mature: 550
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61512; Mature: 61512
Theoretical pI: Translated: 4.72; Mature: 4.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLAQLFEQLFQSIDSTLITNIFIWAVIFVFLSAWWCDKKNIHSKFREYAPTLMGALGILG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFIGIIIGLLNFNTESIDTSIPVLLGGLKTAFITSIVGMFFAILFNGMDAFFFANKRSAL HHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHH AENNPESVTPEHIYHELKEQNQTLTKLVSGINGDSEGSLIAQIKLLRTEISDSSQAQLAN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH HTHFSNKLWEQLEQFADLMAKGATEQIIDALRQVIIDFNQNLTEQFGENFKALDASVKKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH VEWQGNYKTQIEQMSEQYQQSVESLVETKTAVAGIWEECKEIPLAMSELREVLQVNQHQI HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SELSRHLETFVAIRDKATTVLPEIQNKMAEVGELLKSGAANVSASLEQTSQQILLNADSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH RVALDEGTEGFRQSVTQTQQAFASMAHDVSNSSETLTSTLGETITEMKQSGEEFLKSLES EEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HSKELHRNMEQNTTNVIDMFSKTGEKINHQLSSNADNMFDSIQTSFDKASAGLTSQVRES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IEKFALSINEQLHAFEQATEREMNREMQSLGNALLSISKGFVGNYEKLIKDYQIVMGQLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALISANKHRG HHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MLAQLFEQLFQSIDSTLITNIFIWAVIFVFLSAWWCDKKNIHSKFREYAPTLMGALGILG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFIGIIIGLLNFNTESIDTSIPVLLGGLKTAFITSIVGMFFAILFNGMDAFFFANKRSAL HHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHH AENNPESVTPEHIYHELKEQNQTLTKLVSGINGDSEGSLIAQIKLLRTEISDSSQAQLAN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH HTHFSNKLWEQLEQFADLMAKGATEQIIDALRQVIIDFNQNLTEQFGENFKALDASVKKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH VEWQGNYKTQIEQMSEQYQQSVESLVETKTAVAGIWEECKEIPLAMSELREVLQVNQHQI HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SELSRHLETFVAIRDKATTVLPEIQNKMAEVGELLKSGAANVSASLEQTSQQILLNADSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH RVALDEGTEGFRQSVTQTQQAFASMAHDVSNSSETLTSTLGETITEMKQSGEEFLKSLES EEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HSKELHRNMEQNTTNVIDMFSKTGEKINHQLSSNADNMFDSIQTSFDKASAGLTSQVRES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IEKFALSINEQLHAFEQATEREMNREMQSLGNALLSISKGFVGNYEKLIKDYQIVMGQLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALISANKHRG HHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA