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The map label for this gene is 209694459

Identifier: 209694459

GI number: 209694459

Start: 984783

End: 987374

Strand: Reverse

Name: 209694459

Synonym: VSAL_I0883

Alternate gene names: NA

Gene position: 987374-984783 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209694460

Following gene: 209694458

Centisome position: 29.69

GC content: 40.97

Gene sequence:

>2592_bases
ATGAAATTAAATAATTTGATGCTTGTTTGTTCCTTGCTCTCAACGGGCGCTTCCGCTTTAGAACTGTGCCGGGTAGGCGA
TGAAATCAATGTTCTCGATAAAGAGTCGTTTAATAATTTAAGTAAGAAAAATTACCGTTCTTTTAGTGATGAAATTATGC
CAGAGGATCTTTTCCCAAAAGTACCAGACCATTTCTCAAGTTTAAAACCGAATCTAAGCGAAGCCACCCACGTTTACAGC
GACACTTCTTCTTTACTCGAAACCGGTCCTGCAAGCTCTTTTGCTGTAGAAACAGAAGAAGCTTCGCGCTTATTGTCTAC
TATTGGACGATCTGCATCTGAAGCAGGCAGTGCTGCACTTGAGGCGTTAGGACCAATTGGAGAAGCCGCTGCAGTAGGCC
TTTGGGCGCGTGATGTCGCGGATACATTTGAAGATGAATCTCGGACATCCTACGATCGTTTTGCAACCGTTATGGGGTTG
GTGGATTGGTTTGGGGTTCTCAAACTTCCTGAGCGTGCTGTTGATCGTTATATTATTAGTAATCGTTGGGACAGCATGGC
TTCTGGTAATCATTACAGTTTTACTATTTATGATGATATTGTGACGCAGCAAGATTTAAGGGATAAGAAACACTGGGCGG
AATTGGCGAGTAATCAGCACAGAACCCTTGAATCAATAGTAAAAAGCTATGCTTCTGATGTCGCATTAAAATACCAACTG
CATTATCAAGAAACGGTCAAGGCACAAGCATTACTTGCCAATGAATTGATAAGTGCTGTAGATCAGGAATTGGAAAAGAC
ACTTCATTTTCAATTAGGAATAAATAAAGAGGGGTCACGATTATTTTCGTCGGATATAGCAAGTACGTGCCGAACAGAAA
CTGACGCTTTATTTGCTCTTTATCCTAACCAACAAGAAAATAATAATCGTCCACCTTCGGTTCCTTCAGCTCGTGTCGCA
AATCGTACGTTAGCCGCGCTGCAACATTGTCAGCAATACATTCTTGATCAAGCGGTGACTAAGCTGGATGAAATACGTAA
TGGGCAGTTGAATGGTTTGAACCATCTTGCGCTAACTCAACTTTATACACGTACATTGAACGCAAAGAAGAAGATTGCTG
AAACGGCCGATAATCATGTTCGTATTACGAGTATGAAATTACAAAACTCAATGAAAAATGATGGTTTAGCGCTAATTAAT
CGGCTTTTTGATTCGGGTTCGGTAGAAAAAGCGAATGCATTTTTTAAAGAGCAAGCAAGTCGCTATGCGGTTGATGAGAT
GGCGAGAAGTTTGCTGTATCGACCTGCAACTTCAAGAGAGCTTTCTTCTAAGGTTTTAGTACTGAAAGAGACTTATAAGT
ATTGTTCTAGTGTTGGCGTTTTAGCGGGAGATCCTAATTTTAGGGGGTGTCTAAAATATACATGGGAGCCAGCAGAAACG
CGTCGATTTGACTCTTCTCAAGATGATGTGACTAGCCAAATAAAAATGCCGTTACGTGAAACGTATTACGAGGTATTTGC
TACCACGCTTAACCTATTGATTAAAGAGGGTTGGAATTCAGAAGTCGAAGAACAATGGCTTGAGCAACAAATTCTCGATT
ATTCAGAACAACAAAATCAGATGGTTCAGAGCCGAGAAAATAAAGCTGAAATCTATCGTTGGTTGTTTGATTCACGCGCC
CAACTGGGGAGTGAATGCATCGGTGAGCGAGAATGTTCAGGATGGAGTTCGTCATATTTAGCCAAAGAAAATCTGTCTCG
AACTTCTTCTCTTGCTCATATTGCTCGTTGGTTGGCGGATTACTCGGGTCGAGGAGCGTACATTCATCGTAAACGATTGG
AAAAACTGGATGAATTAATTAAACCCGCTTTAGAAAGCGATTGGAAAGCCACGCAAGGCAGTCAGTTTTATAGTTACGCT
TATCCGAGCAGTTTTGATATGGAAAAATACGCGCCATTGATTGCCTCTGCATTGAAAAGCTCAACCCTTGATGTGACTAA
TTTATCAGGTAATGCACTCCCATTAGCAAAAGGGATTGTAAAATCGCGCTTGATTGAAGCGGTTGAATTAGGTGAACAAA
ATGGATCTGATTGGTTACTTTCTCAGGTTGGTGACTTTCAACGTTATGCCGCAATTGTTCATTCACAACATACCAGTGTT
GGGCGTCACGCGCCTGAAATGGAAGAAACCCCCGTTTTATTTTCAGAGATGCTGCCTGCTTATATTTTACGTTATTTAGT
GTCTGATTTAATTCCAGACAGTTACGATGCTCGTTTGGTTAATTCTATTAATGCTTTGTATGACCCTTCTTCAGAGTTAG
GCCAAAAGATCACACAACTTGTAGACGTTAATCAAACACTTAATGACCGTTCAAATAGAACGTGTGACATCAACTTTATG
CCTCTAAAAGAAACCTTACTTGCTATTTCAGGTGATGAATCATTGTATTGGCTATCACCTATATCGAGTTGGTTGGATAA
TTTAACGCGTCAACAATTAACGAGCCAGGCGGTGATTGGATGGGGATCGAGAAAACAAACTGAGTTTGGGATTGAATGTG
GTATCAGTCCCAATAGCCTCTCTTACCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTCATTTTTAATTCACTCAATAAGCTTGAAGTCCATTTTCTAGTTTTTTAGTTTGCCTATTGAGTGTTTTTTCAAAA
ATATAAGAATAATTAATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTCAGGAGAATAGGCAATGAAAAAATATATTCTTTTGATTTTATGGGCGTGGGCAGCGTTTACCTTTGCGTCTCCTTTT
GAGGTTTTCAAACAACCCAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 863; Mature: 863

Protein sequence:

>863_residues
MKLNNLMLVCSLLSTGASALELCRVGDEINVLDKESFNNLSKKNYRSFSDEIMPEDLFPKVPDHFSSLKPNLSEATHVYS
DTSSLLETGPASSFAVETEEASRLLSTIGRSASEAGSAALEALGPIGEAAAVGLWARDVADTFEDESRTSYDRFATVMGL
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PLKETLLAISGDESLYWLSPISSWLDNLTRQQLTSQAVIGWGSRKQTEFGIECGISPNSLSYQ

Sequences:

>Translated_863_residues
MKLNNLMLVCSLLSTGASALELCRVGDEINVLDKESFNNLSKKNYRSFSDEIMPEDLFPKVPDHFSSLKPNLSEATHVYS
DTSSLLETGPASSFAVETEEASRLLSTIGRSASEAGSAALEALGPIGEAAAVGLWARDVADTFEDESRTSYDRFATVMGL
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PLKETLLAISGDESLYWLSPISSWLDNLTRQQLTSQAVIGWGSRKQTEFGIECGISPNSLSYQ
>Mature_863_residues
MKLNNLMLVCSLLSTGASALELCRVGDEINVLDKESFNNLSKKNYRSFSDEIMPEDLFPKVPDHFSSLKPNLSEATHVYS
DTSSLLETGPASSFAVETEEASRLLSTIGRSASEAGSAALEALGPIGEAAAVGLWARDVADTFEDESRTSYDRFATVMGL
VDWFGVLKLPERAVDRYIISNRWDSMASGNHYSFTIYDDIVTQQDLRDKKHWAELASNQHRTLESIVKSYASDVALKYQL
HYQETVKAQALLANELISAVDQELEKTLHFQLGINKEGSRLFSSDIASTCRTETDALFALYPNQQENNNRPPSVPSARVA
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YPSSFDMEKYAPLIASALKSSTLDVTNLSGNALPLAKGIVKSRLIEAVELGEQNGSDWLLSQVGDFQRYAAIVHSQHTSV
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PLKETLLAISGDESLYWLSPISSWLDNLTRQQLTSQAVIGWGSRKQTEFGIECGISPNSLSYQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96991; Mature: 96991

Theoretical pI: Translated: 5.01; Mature: 5.01

Prosite motif: PS00334 MYB_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLNNLMLVCSLLSTGASALELCRVGDEINVLDKESFNNLSKKNYRSFSDEIMPEDLFPK
CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
VPDHFSSLKPNLSEATHVYSDTSSLLETGPASSFAVETEEASRLLSTIGRSASEAGSAAL
CCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
EALGPIGEAAAVGLWARDVADTFEDESRTSYDRFATVMGLVDWFGVLKLPERAVDRYIIS
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CCCHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE
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YPNQQENNNRPPSVPSARVANRTLAALQHCQQYILDQAVTKLDEIRNGQLNGLNHLALTQ
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
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HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
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WGSRKQTEFGIECGISPNSLSYQ
CCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKLNNLMLVCSLLSTGASALELCRVGDEINVLDKESFNNLSKKNYRSFSDEIMPEDLFPK
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HHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
WGSRKQTEFGIECGISPNSLSYQ
CCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA