| Definition | Borrelia duttonii Ly, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011229 |
| Length | 931,674 |
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The map label for this gene is 203284245
Identifier: 203284245
GI number: 203284245
Start: 346616
End: 349471
Strand: Reverse
Name: 203284245
Synonym: BDU_327
Alternate gene names: NA
Gene position: 349471-346616 (Counterclockwise)
Preceding gene: 203284246
Following gene: 203284244
Centisome position: 37.51
GC content: 27.31
Gene sequence:
>2856_bases ATGCCTGATATAGAAAAAATAAATAAGTTTAAGAAGGAAATAATAGATAATATTGCTGATGAGAAAGCTAGAAAAGATAG TTTTGGCATTACAATGGATATTGACCCTCCAAAGGATGGTGAGTCTATTCTTCCTTGGGAAGAACAAGAAGAAGTTGTTG ATTTTGATGAAGAACATGATGAAGGCCCAGATTTAGATGCTATTCTTGGTGTTCTTGATAATGAGGAAGGACAAAAGAGT GAAGCTAGTGAAAATGATATTAATCTTTTAAAAAATTCCGAAAATGTAGAAATTGATTCTGAATTTGATAATTTAAATGA GGATTTTGATGTTTTAGGTTCACATTTTGAGGAAACTTTAGATAAAGTTCTTGATGATAATTCTGTAAGTTTGGATGATG CTATTAATTTGAATTTAGATAATTCTGGTAATAATGTTGATGATGATGATAATGTTCAAAATTCAAATGTAGAGAATGGT TTAAATTCAAATTCTTCTGATTTTGAAAATCCTTTTGAAAATGATGATAGTTCTACTCAGGAATCTCAAGATTATAATAA TGATGATTTTGATCTTGAGTATATGATTAGTAAAATCAAGGAAGCAGATGATGAAATTTCTTCTAATAAGTTTGATTCTA GTGATGATTCTTTAGATCCTAATACTAAAGAGGAGAAAGATTGGTCTAATCTTACAGGTGATTTTCAATCTTTAAAGGAT CAAGAGAACAAAATTTTTGAGGATTCTGATTTTAAAGTTAATTATTCTTTATTTTTTAAACATTTAGATTCTTATCCTAG AAATTTGAGAATTGCTATTGCCGAAGCATTAATGTTAGAAAATGTTTCTAAGTATAAAATTGAGGCATTAGTTGATCTTG TTGAGCAAAATAAAAAAGGGCTCAATTTTATTGCTAAATTTGTTGGAGATATTATTGGCAGATCTGTTAAATTGCCCATT ATGTATTATAAGGCAGAAGAATTTAGCAAACTGGAGAAGCAATTTAGTTATAGACTTTCTAAAGCCTTAACACCAATATT AAAAATTGCCTCTTTTTTTATTGTATTAACCTTTTTGTCGTTTTATTTTTTAGTAGATATTATGTTTTTTTATATTGCAT CTGATAAAAAATATAAAGAAGGAATTTCATATATATATGAAAATAAAAGAGAACTTGCTAAAGCTACTTTTAAGGATGCA TATTATATGCGTCCTAATAGAAAGTGGTTTTTAACTTATGCTAAGGCTTTTGAGAGTATAAAGGATTTTGATAGTGCTGA GGAAAAATATGAAGAATTGTTTACTGTTGACCCATTTTCTGAGGGTGCTTCTAAGAGAAGACGAAAAATTTTTGATAAAG ATGGGTATATATCTTATGCTTTTATGAAGATGAGGCTTGGTGAATATTCTGATGCTAATTCGATTTTGGATGAAGTTATA TCTTACGATATTTATGATTATGAGGCATTAATGGCTAAGGGTGAGAATTATTTTCAGTGGGCTCAAGTGGATCCTATGTA TTATAGAAATAGTATAAATGATTATACCATTTTACTTTCAAAGTATGGACATCATAAGAAGGAAGTTTTATTTAAGCTTT TTGATGCTTATATTGAAGCTGGTGCTGAGAGAGAGGCTGACAATGTAAATGCTTTTATTAAAACAAATCAGGAATTAGAT ATTGATGAGGTAGTTTATACTAAGTATGTTAAGAAATTGATAGATAAATATGTAGAATTTACAGTTTATAATAAGCGAAT AAATGCTCTCTCTAGAAATTTAAAATATTTAAATGCTCAAATGAATTTACTTAATAAAGAGTTTTCTAATTTTAAAATAA ATAGTGGCAAGAGTGTTTCTGATATTTTAAATGATGTTAATCTTAATTCGGAGATTGAATATATTCTTAGGAGAATTTTA TTAAAAAATCCTGATTATAATAAGGCATTATTTGAAAGTGGTAGATATTTTTATTATATGGGAGATTTGAAAAAGTCAGA AGGATATTTATTAACGGCTATAAACGGTTTTAGACAAGAAGATTTAATTAATAATGCTAGTGACAAGATTATTGCTTATA GGATTTTATCAGATATTTATGAGAAGGGAAATGATACACTTAAAGCAAGTAATATTGTCAGTTTGGCTTTAAATGAATAT GATTTTTATAAAAGAAATGGCCTTATTAAAGCTTCGAGAGAACTTGCTTTAATTTATGAAAAGCAAGGAGATATATTTAA AACTTTAAATGGTTTTCAATCAGCCATATCTTCTTATAAAATGGCAATAAATGAAGGGATTAATTCACCAGATGTTTACT ATAAATTAGCATTACTTAGTTATAAGGAAAATAATTATAAGGATGCATTAACTTCGCTATTCAAAGTTGAAAATATGTCT GGATTTGCAAATAGTAATAAAGTTTTAAATTCAATAGCATCTGTTCTTTATAAAATGGGTGATTTTGAAGCTTCTAGGAG TTATTATTTAAGAGTATTGCAAAATTTGGAATCAGAGAAATCCAGTATTTTAAGTTTGAGACCTAAAGGAAATGATCATC ATAAAGCTTTGTTGCTAAGAGAAATTGAAGTTTATAATAATCTTGGAGTTGTTGAGATAATAGCATCTCTTGGCAATAAG GTTAAGTCTGGTGTTATTATAGATCATGATCTTTTTGATTCAGGAATTGCAAATTTAACAGAATCTTCTAGAATATTTGA TCTCTTAAATCGTGATGAGGATATGATGAAAAATGTTAAAAGAGATCTTGCTAGTTTAAATCTTAGAAGCGTATTTAAAA ATGATTTTACAGGTTTAAAGATTTTATTTTATGATAATTTAGCTGATAATCTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGGTTCCAAAATTGCTGATGATTTAGAAAAACGTTTTGAGATTCTTCATAAGGATGGAGCTAAAATATATAATGATTTA ATTTAGGATTTTATTGTAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCTTTATAATTTATCAGCTTAAGGACATTGTAGAATTGTCCGATTAATGTGTAAGGGTTTATATGAGAAAAGCTTGCTT TATTATTTTCTTGTTTATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 951; Mature: 950
Protein sequence:
>951_residues MPDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHDEGPDLDAILGVLDNEEGQKS EASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETLDKVLDDNSVSLDDAINLNLDNSGNNVDDDDNVQNSNVENG LNSNSSDFENPFENDDSSTQESQDYNNDDFDLEYMISKIKEADDEISSNKFDSSDDSLDPNTKEEKDWSNLTGDFQSLKD QENKIFEDSDFKVNYSLFFKHLDSYPRNLRIAIAEALMLENVSKYKIEALVDLVEQNKKGLNFIAKFVGDIIGRSVKLPI MYYKAEEFSKLEKQFSYRLSKALTPILKIASFFIVLTFLSFYFLVDIMFFYIASDKKYKEGISYIYENKRELAKATFKDA YYMRPNRKWFLTYAKAFESIKDFDSAEEKYEELFTVDPFSEGASKRRRKIFDKDGYISYAFMKMRLGEYSDANSILDEVI SYDIYDYEALMAKGENYFQWAQVDPMYYRNSINDYTILLSKYGHHKKEVLFKLFDAYIEAGAEREADNVNAFIKTNQELD IDEVVYTKYVKKLIDKYVEFTVYNKRINALSRNLKYLNAQMNLLNKEFSNFKINSGKSVSDILNDVNLNSEIEYILRRIL LKNPDYNKALFESGRYFYYMGDLKKSEGYLLTAINGFRQEDLINNASDKIIAYRILSDIYEKGNDTLKASNIVSLALNEY DFYKRNGLIKASRELALIYEKQGDIFKTLNGFQSAISSYKMAINEGINSPDVYYKLALLSYKENNYKDALTSLFKVENMS GFANSNKVLNSIASVLYKMGDFEASRSYYLRVLQNLESEKSSILSLRPKGNDHHKALLLREIEVYNNLGVVEIIASLGNK VKSGVIIDHDLFDSGIANLTESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL
Sequences:
>Translated_951_residues MPDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHDEGPDLDAILGVLDNEEGQKS EASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETLDKVLDDNSVSLDDAINLNLDNSGNNVDDDDNVQNSNVENG LNSNSSDFENPFENDDSSTQESQDYNNDDFDLEYMISKIKEADDEISSNKFDSSDDSLDPNTKEEKDWSNLTGDFQSLKD QENKIFEDSDFKVNYSLFFKHLDSYPRNLRIAIAEALMLENVSKYKIEALVDLVEQNKKGLNFIAKFVGDIIGRSVKLPI MYYKAEEFSKLEKQFSYRLSKALTPILKIASFFIVLTFLSFYFLVDIMFFYIASDKKYKEGISYIYENKRELAKATFKDA YYMRPNRKWFLTYAKAFESIKDFDSAEEKYEELFTVDPFSEGASKRRRKIFDKDGYISYAFMKMRLGEYSDANSILDEVI SYDIYDYEALMAKGENYFQWAQVDPMYYRNSINDYTILLSKYGHHKKEVLFKLFDAYIEAGAEREADNVNAFIKTNQELD IDEVVYTKYVKKLIDKYVEFTVYNKRINALSRNLKYLNAQMNLLNKEFSNFKINSGKSVSDILNDVNLNSEIEYILRRIL LKNPDYNKALFESGRYFYYMGDLKKSEGYLLTAINGFRQEDLINNASDKIIAYRILSDIYEKGNDTLKASNIVSLALNEY DFYKRNGLIKASRELALIYEKQGDIFKTLNGFQSAISSYKMAINEGINSPDVYYKLALLSYKENNYKDALTSLFKVENMS GFANSNKVLNSIASVLYKMGDFEASRSYYLRVLQNLESEKSSILSLRPKGNDHHKALLLREIEVYNNLGVVEIIASLGNK VKSGVIIDHDLFDSGIANLTESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL >Mature_950_residues PDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHDEGPDLDAILGVLDNEEGQKSE ASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETLDKVLDDNSVSLDDAINLNLDNSGNNVDDDDNVQNSNVENGL NSNSSDFENPFENDDSSTQESQDYNNDDFDLEYMISKIKEADDEISSNKFDSSDDSLDPNTKEEKDWSNLTGDFQSLKDQ ENKIFEDSDFKVNYSLFFKHLDSYPRNLRIAIAEALMLENVSKYKIEALVDLVEQNKKGLNFIAKFVGDIIGRSVKLPIM YYKAEEFSKLEKQFSYRLSKALTPILKIASFFIVLTFLSFYFLVDIMFFYIASDKKYKEGISYIYENKRELAKATFKDAY YMRPNRKWFLTYAKAFESIKDFDSAEEKYEELFTVDPFSEGASKRRRKIFDKDGYISYAFMKMRLGEYSDANSILDEVIS YDIYDYEALMAKGENYFQWAQVDPMYYRNSINDYTILLSKYGHHKKEVLFKLFDAYIEAGAEREADNVNAFIKTNQELDI DEVVYTKYVKKLIDKYVEFTVYNKRINALSRNLKYLNAQMNLLNKEFSNFKINSGKSVSDILNDVNLNSEIEYILRRILL KNPDYNKALFESGRYFYYMGDLKKSEGYLLTAINGFRQEDLINNASDKIIAYRILSDIYEKGNDTLKASNIVSLALNEYD FYKRNGLIKASRELALIYEKQGDIFKTLNGFQSAISSYKMAINEGINSPDVYYKLALLSYKENNYKDALTSLFKVENMSG FANSNKVLNSIASVLYKMGDFEASRSYYLRVLQNLESEKSSILSLRPKGNDHHKALLLREIEVYNNLGVVEIIASLGNKV KSGVIIDHDLFDSGIANLTESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 109863; Mature: 109732
Theoretical pI: Translated: 4.42; Mature: 4.42
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION L=RR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHD CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCC EGPDLDAILGVLDNEEGQKSEASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETL CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEECCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH DKVLDDNSVSLDDAINLNLDNSGNNVDDDDNVQNSNVENGLNSNSSDFENPFENDDSSTQ HHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC ESQDYNNDDFDLEYMISKIKEADDEISSNKFDSSDDSLDPNTKEEKDWSNLTGDFQSLKD CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHH QENKIFEDSDFKVNYSLFFKHLDSYPRNLRIAIAEALMLENVSKYKIEALVDLVEQNKKG HHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH LNFIAKFVGDIIGRSVKLPIMYYKAEEFSKLEKQFSYRLSKALTPILKIASFFIVLTFLS HHHHHHHHHHHHCCCEECEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYFLVDIMFFYIASDKKYKEGISYIYENKRELAKATFKDAYYMRPNRKWFLTYAKAFESI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHH KDFDSAEEKYEELFTVDPFSEGASKRRRKIFDKDGYISYAFMKMRLGEYSDANSILDEVI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH SYDIYDYEALMAKGENYFQWAQVDPMYYRNSINDYTILLSKYGHHKKEVLFKLFDAYIEA HCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GAEREADNVNAFIKTNQELDIDEVVYTKYVKKLIDKYVEFTVYNKRINALSRNLKYLNAQ CCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MNLLNKEFSNFKINSGKSVSDILNDVNLNSEIEYILRRILLKNPDYNKALFESGRYFYYM HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCEEEEE GDLKKSEGYLLTAINGFRQEDLINNASDKIIAYRILSDIYEKGNDTLKASNIVSLALNEY CCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHEEHHHHH DFYKRNGLIKASRELALIYEKQGDIFKTLNGFQSAISSYKMAINEGINSPDVYYKLALLS HHHHHCCCEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEEEEHE YKENNYKDALTSLFKVENMSGFANSNKVLNSIASVLYKMGDFEASRSYYLRVLQNLESEK ECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SSILSLRPKGNDHHKALLLREIEVYNNLGVVEIIASLGNKVKSGVIIDHDLFDSGIANLT HHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHH ESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure PDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCC EGPDLDAILGVLDNEEGQKSEASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETL CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEECCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH DKVLDDNSVSLDDAINLNLDNSGNNVDDDDNVQNSNVENGLNSNSSDFENPFENDDSSTQ HHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC ESQDYNNDDFDLEYMISKIKEADDEISSNKFDSSDDSLDPNTKEEKDWSNLTGDFQSLKD CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHH QENKIFEDSDFKVNYSLFFKHLDSYPRNLRIAIAEALMLENVSKYKIEALVDLVEQNKKG HHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH LNFIAKFVGDIIGRSVKLPIMYYKAEEFSKLEKQFSYRLSKALTPILKIASFFIVLTFLS HHHHHHHHHHHHCCCEECEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYFLVDIMFFYIASDKKYKEGISYIYENKRELAKATFKDAYYMRPNRKWFLTYAKAFESI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHH KDFDSAEEKYEELFTVDPFSEGASKRRRKIFDKDGYISYAFMKMRLGEYSDANSILDEVI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH SYDIYDYEALMAKGENYFQWAQVDPMYYRNSINDYTILLSKYGHHKKEVLFKLFDAYIEA HCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GAEREADNVNAFIKTNQELDIDEVVYTKYVKKLIDKYVEFTVYNKRINALSRNLKYLNAQ CCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MNLLNKEFSNFKINSGKSVSDILNDVNLNSEIEYILRRILLKNPDYNKALFESGRYFYYM HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCEEEEE GDLKKSEGYLLTAINGFRQEDLINNASDKIIAYRILSDIYEKGNDTLKASNIVSLALNEY CCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHEEHHHHH DFYKRNGLIKASRELALIYEKQGDIFKTLNGFQSAISSYKMAINEGINSPDVYYKLALLS HHHHHCCCEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEEEEHE YKENNYKDALTSLFKVENMSGFANSNKVLNSIASVLYKMGDFEASRSYYLRVLQNLESEK ECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SSILSLRPKGNDHHKALLLREIEVYNNLGVVEIIASLGNKVKSGVIIDHDLFDSGIANLT HHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHH ESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA