| Definition | Borrelia duttonii Ly, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011229 |
| Length | 931,674 |
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The map label for this gene is atpI [H]
Identifier: 203284016
GI number: 203284016
Start: 98353
End: 100188
Strand: Reverse
Name: atpI [H]
Synonym: BDU_94
Alternate gene names: 203284016
Gene position: 100188-98353 (Counterclockwise)
Preceding gene: 203284017
Following gene: 203284015
Centisome position: 10.75
GC content: 28.43
Gene sequence:
>1836_bases GTGTTAATGATTGTTAAAATGAAGAAGGTTTTGCTTTTAACTTTATTAAAATATAAAAGAGACTCACTTGAGATCTTAAG AGAATTGGGAGTTGTTCATATCAATTTTTGCAATAAAGTTTCAGAATCTTTACAAAAAGTTATTGAGGAGAGGAGTATTT TAAATCATGCTTTGTCTTTGCTTGGTGATGATTCTGAAGTGCAAATTTTAAGTTCTTCAAATGAGAATTTTTTAGATATT GCAAAACGTATCGTTGACTTAGGTTCTGAGATTAAAGATTTAAGAGAAATGCGTCAATCATTACTTCGTAATAGAGATAT TATATCTTGTTGGGGATATTTTTCTGTTGATTTAGTCAATAAATTAAGGGGATGTAATATTCATGTGCAATTTTTTAAGT CTGGAATGTCTGAATATAAAAAATTGTTGTTATTTTCGCAGGTTAAAGTTGCTCTTATTAATAATTATAAAGGTACAGCC TATTTTGTAGCTATTAATGACTCTAAACAGAATATAGATGTAGCTGAAGAATATGAATTTGAATTTGATCTAGATTCTAT TGAAACCAAGTTAAAAATGATTGATGAGGTTTTAGAGCAAAAATTAACTCAGTTGTCAGTTTTAAATAAATATAGAAATA TTTTAAAAGATGCAATAAAAGAGTATGAACAAATTATTGAATTTGAACAGGTTATGGCTGATATGAATGTGGAGTGTGAT GAGTTTGTATATATTACAGGATTTATTCCTGAAGATAAGCAAAAATATCTTCAAAATGCGACTCTTAATGGTAAGTTTGT GGTGCAATTTGCGGAGCCAGATGATAATGATTTTATTCCTACTTATGTAAAAAGAAAAGGAATTGCTAAGCTTGCTAAAC CTATTTTCGATGTTTTAGATACAATTCCTGGATATAAAGAGAGAGATGTTAGTTGTGTTTTTATGTTGTTTTTCTTTGTG TTTTTTGGAATGATAATTGGTGATGCAGCTTATGGTGTTATATTTTTGTTAATAGGCATTATTATTAGTTTGATTAGTGT TTTAAAAAATAAACCATTAACTTCTGCTCATGCTTTAATATTTTATTTAAGTACGTCAGCAATAATATATGGTTCTATGA CTGGTACTTGGTTTGGTAGTGGTCATTTTGTTCTTGATTTATTTCCTATTTTGAAATCTCTTAAGGTTGAGTATTTGACA GGAAATAATGGTATGCAAAATGTTATGTTTATATGTTTTACAATAGGGGTTTTACAGCTGTCTTTGGCTCATGTATGGAA TTTTGTTCAAAAAGTGAAAGAAAAGCCACATATACATGCAATTGCTCAAATTGGTTGGCTTGTTTTAATGCCTGGGCTTT ATTATTTTGTTCTTAATTTAATACTTGGAAGTGATAATTTTCCTATGCATAGTATGATTCTTAATATGATATATTTTGGA GTTATGCTTATTTTTGTTTTTGACAAACAGGATGGTTCAAACTTTTTTGTGTGTGTGTTAAAAAGTTTTGGAGGACTTAT AGAGCAATTTTTAGCTACTGTTTCAGGATTTGCAGATATAATATCTTATATTAGGCTTTTTGCTGTTGGACTTGCAGGAC TTGCAATTTCTGATAGTTTTAATAGCATGTCAGTGTCTTTATTAAAATCATCTAATATTGGTCTTATAATAGGAGGTGTT ATTGTGATACTTTTTGGACACATTTTAAATATAATGTTATCTTTATTATCTGTTGTTGTTCATGGAGTAAGACTTAATAT GCTTGAGTTTTCAAATCATTTGGGTCAAGAATGGAATGGATATTCTTATAGACCTTTTAAAAAAATTAAAGATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATATAAAAAAGATTAATGTTTATCTTGGAGATCAACAGACTGCAGCTGTTGTAAGAGGTAAAATGGCGAAAGCCAGCTT AATTAAAAATAGATGAGGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAGGAGAGAATAAAATTATGGATATAGGTTTAGTAGGAGTTAATTCAGCTTTAACAGTTTCTGCGATAGGTTCAGCTT TGGGAATGGGAGCTGCCGGG
Product: V-type ATP synthase subunit I
Products: ADP; phosphate; H+
Alternate protein names: V-ATPase subunit I [H]
Number of amino acids: Translated: 611; Mature: 611
Protein sequence:
>611_residues MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD
Sequences:
>Translated_611_residues MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD >Mature_611_residues MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD
Specific function: Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane [H]
COG id: COG1269
COG function: function code C; Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the V-ATPase 116 kDa subunit family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002490 [H]
Pfam domain/function: PF01496 V_ATPase_I [H]
EC number: 3.6.3.14
Molecular weight: Translated: 69416; Mature: 69416
Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79
Prosite motif: PS00639 THIOL_PROTEASE_HIS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 4.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSL CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGDDSEVQILSSSNENFLDIAKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVN HCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHH KLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTAYFVAINDSKQNIDVAEEYEF HHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCC EFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLD CEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIPGYKERDVSCVFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH FYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLTGNNGMQNVMFICFTIGVLQL HEEECCCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSF HHHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC NSMSVSLLKSSNIGLIIGGVIVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNG CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YSYRPFKKIKD CCCCCHHHCCC >Mature Secondary Structure MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSL CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGDDSEVQILSSSNENFLDIAKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVN HCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHH KLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTAYFVAINDSKQNIDVAEEYEF HHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCC EFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLD CEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIPGYKERDVSCVFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH FYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLTGNNGMQNVMFICFTIGVLQL HEEECCCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSF HHHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC NSMSVSLLKSSNIGLIIGGVIVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNG CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YSYRPFKKIKD CCCCCHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; H2O; H+
Specific reaction: ATP + H2O + H+(in) = ADP + phosphate + H+(out)
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9403685 [H]