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The map label for this gene is yhhT [C]

Identifier: 203283936

GI number: 203283936

Start: 18265

End: 19356

Strand: Reverse

Name: yhhT [C]

Synonym: BDU_12

Alternate gene names: 203283936

Gene position: 19356-18265 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203283937

Following gene: 203283935

Centisome position: 2.08

GC content: 25.37

Gene sequence:

>1092_bases
ATGGCTTTAGAAATAAAAACAACTGATAGATTTAAGTTTGTTAGATTACAGTCGATTTTTTATGTTGTAGCTTTAATTAT
AATGTTGATTACTATTTTAAAAGTGGCCCAAACGATATTTAAGCCTTTATCTATTGCAGTATTGCTTGGATTTTTAGTTT
ATCCTATTTATACTTTTCTTAAAAAGTTAAAGATACCAAGAGTTTTAATTATTTTTATAATTTTTTTTGTTCTTTTTTTA
TTTTCTTATTTAGTTTTTAGCTTTGTATATTACAGTGTTACTGTTTTAATTGATCAACTTCCTTATTATCAAAAACAATT
GATTTTTATTATAGTAGATATTCTTGAGAAGTATAAATTAGATAGTGCTATTATTAGTAATATTGATTTTTCTAAATATA
TTTATCCTTTTTTAACTAGGATATCTAATGAAATTATTGGGTTTGCAAGCAGTTTGGTGGTTTTATTTTTATTATTATAT
TTTTTGTTATCAGAAATACATATTTTTGACATAAAAGTTAAAAATGCGTTTAAACGATCTGTTTCAAGTATGTTTATTGA
AGTTTTAAGTACAATCAATAATCAAATTAGTAAATATTTAGGAATTAAGGTGTTTGTTAGCTTTCTTACTGGATTGTTGG
TATTTATAGGTTTAAAGTTGTTTGGGCAGGATTTTCCTCGTGTATGGGCTGTGCTTACATTTGTTTTTAATTTTATTCCA
AGTATAGGTTCGATTTTGGCTGTTTTTTTTATTATGATAGCTGCTTTGGTGCAGTTTTATCCTGATTTAAATTTGGTGCT
TTATATATTTATATATAATACATTTGTTCAGATGTTGATTGGAAATATTCTTGAGCCAAAGATGCAGGGACATAGACTTG
ATCTCTCTCCTTTTTTATTGCTTTGTTTTCTTTTCTTTTGGGGATGGCTTTGGGGCATAGTGGGACTTTTGATAGCTTAT
CCTTTTACAGTTATTATAAAGGTAATAGTAGATAATATAGTATATTTGCGACCTTTTTCTGTATTTTTAAGTGGTTCTAA
GATATTAACCCTTGATAATATTGATAATAATTTTAATAATAAGGAAAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGTATGAGTTTAATTTTAATTAATGAATTTCAGTTTTAGTATTGACTTTACTTTTAAATTATTTTTCATAATAATTTC
AATGGGGAGGGAAATAAGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCAAAAAAAAGTTATTCTTACAGGTGATAGACCTACAGGTTCTCTTCATTTGGGGCATTATGTGGGATCTATTGTTAAC
AGATTAAAGTATCAGGAAGA

Product: predicted permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 363; Mature: 362

Protein sequence:

>363_residues
MALEIKTTDRFKFVRLQSIFYVVALIIMLITILKVAQTIFKPLSIAVLLGFLVYPIYTFLKKLKIPRVLIIFIIFFVLFL
FSYLVFSFVYYSVTVLIDQLPYYQKQLIFIIVDILEKYKLDSAIISNIDFSKYIYPFLTRISNEIIGFASSLVVLFLLLY
FLLSEIHIFDIKVKNAFKRSVSSMFIEVLSTINNQISKYLGIKVFVSFLTGLLVFIGLKLFGQDFPRVWAVLTFVFNFIP
SIGSILAVFFIMIAALVQFYPDLNLVLYIFIYNTFVQMLIGNILEPKMQGHRLDLSPFLLLCFLFFWGWLWGIVGLLIAY
PFTVIIKVIVDNIVYLRPFSVFLSGSKILTLDNIDNNFNNKEN

Sequences:

>Translated_363_residues
MALEIKTTDRFKFVRLQSIFYVVALIIMLITILKVAQTIFKPLSIAVLLGFLVYPIYTFLKKLKIPRVLIIFIIFFVLFL
FSYLVFSFVYYSVTVLIDQLPYYQKQLIFIIVDILEKYKLDSAIISNIDFSKYIYPFLTRISNEIIGFASSLVVLFLLLY
FLLSEIHIFDIKVKNAFKRSVSSMFIEVLSTINNQISKYLGIKVFVSFLTGLLVFIGLKLFGQDFPRVWAVLTFVFNFIP
SIGSILAVFFIMIAALVQFYPDLNLVLYIFIYNTFVQMLIGNILEPKMQGHRLDLSPFLLLCFLFFWGWLWGIVGLLIAY
PFTVIIKVIVDNIVYLRPFSVFLSGSKILTLDNIDNNFNNKEN
>Mature_362_residues
ALEIKTTDRFKFVRLQSIFYVVALIIMLITILKVAQTIFKPLSIAVLLGFLVYPIYTFLKKLKIPRVLIIFIIFFVLFLF
SYLVFSFVYYSVTVLIDQLPYYQKQLIFIIVDILEKYKLDSAIISNIDFSKYIYPFLTRISNEIIGFASSLVVLFLLLYF
LLSEIHIFDIKVKNAFKRSVSSMFIEVLSTINNQISKYLGIKVFVSFLTGLLVFIGLKLFGQDFPRVWAVLTFVFNFIPS
IGSILAVFFIMIAALVQFYPDLNLVLYIFIYNTFVQMLIGNILEPKMQGHRLDLSPFLLLCFLFFWGWLWGIVGLLIAYP
FTVIIKVIVDNIVYLRPFSVFLSGSKILTLDNIDNNFNNKEN

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=338, Percent_Identity=27.810650887574, Blast_Score=122, Evalue=4e-29,
Organism=Escherichia coli, GI1787885, Length=358, Percent_Identity=27.6536312849162, Blast_Score=114, Evalue=1e-26,
Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=313, Percent_Identity=23.0031948881789, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42170; Mature: 42038

Theoretical pI: Translated: 9.81; Mature: 9.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MALEIKTTDRFKFVRLQSIFYVVALIIMLITILKVAQTIFKPLSIAVLLGFLVYPIYTFL
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKLKIPRVLIIFIIFFVLFLFSYLVFSFVYYSVTVLIDQLPYYQKQLIFIIVDILEKYKL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSAIISNIDFSKYIYPFLTRISNEIIGFASSLVVLFLLLYFLLSEIHIFDIKVKNAFKRS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSSMFIEVLSTINNQISKYLGIKVFVSFLTGLLVFIGLKLFGQDFPRVWAVLTFVFNFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SIGSILAVFFIMIAALVQFYPDLNLVLYIFIYNTFVQMLIGNILEPKMQGHRLDLSPFLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCHHHH
LCFLFFWGWLWGIVGLLIAYPFTVIIKVIVDNIVYLRPFSVFLSGSKILTLDNIDNNFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCC
KEN
CCC
>Mature Secondary Structure 
ALEIKTTDRFKFVRLQSIFYVVALIIMLITILKVAQTIFKPLSIAVLLGFLVYPIYTFL
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKLKIPRVLIIFIIFFVLFLFSYLVFSFVYYSVTVLIDQLPYYQKQLIFIIVDILEKYKL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSAIISNIDFSKYIYPFLTRISNEIIGFASSLVVLFLLLYFLLSEIHIFDIKVKNAFKRS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSSMFIEVLSTINNQISKYLGIKVFVSFLTGLLVFIGLKLFGQDFPRVWAVLTFVFNFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SIGSILAVFFIMIAALVQFYPDLNLVLYIFIYNTFVQMLIGNILEPKMQGHRLDLSPFLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCHHHH
LCFLFFWGWLWGIVGLLIAYPFTVIIKVIVDNIVYLRPFSVFLSGSKILTLDNIDNNFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCC
KEN
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]