Definition Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome.
Accession NC_011134
Length 2,024,171

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The map label for this gene is yfhO [H]

Identifier: 195979046

GI number: 195979046

Start: 2017748

End: 2020333

Strand: Direct

Name: yfhO [H]

Synonym: Sez_1958

Alternate gene names: 195979046

Gene position: 2017748-2020333 (Clockwise)

Preceding gene: 195979045

Following gene: 195979048

Centisome position: 99.68

GC content: 38.13

Gene sequence:

>2586_bases
ATGACAAAACCTAAAGCATGGTATCTTGTTTATGACATTGCTAGCTTCCTCCTTCCCTTTTTGATAATGTTTTTTGTTCT
TTTGTCAATGGGAATTTCATATGGCAGTGAGAAAACCATTTTAGCTAGTGATGGCTTTCATCAATATGTTATTTTTGCGC
AAGCCCTAAGAAATATTCTTCATGGGGCTGATAGTATTTTTTACACCTTTACCAGTGGCCTAGGTGTAAACTTTTTTGCT
CTGGCTAGCTATTATCTAGGCAGCCTTTTGTCTCCTCTTGTCTACTTTTTTAATCTGCAATCCATGCCAGATGCTATCTA
TCTCTTGACACTTATTAAATTTGGTTTGATCGGGCTTGCCGCTTATTTCTCCTTTCATCGTATTTACCCTAAAATCAAAC
CCTTTTTAGTCCTGACATTATCAGTCTCTTACTCCCTAATGAGCTTTCTGACAAGCCAGCTAGAGCTTAACAACTGGTTA
GATGTTTTTATTCTTCTACCAATTGTCTTACTGGGGCTCTATCGGCTGATTACTCAAACCAAGCCCTTGCTTTATTATAG
CTCACTTAGTCTTCTCTTTATCCAGCATTATTATTTTGGATATATGGTTGCTATCTTTATTTTTTTATTATTTCTAGTCA
ACCTTATATCACTAGACACATGGAAAAGACGGTTAAGAGCCTGTTTAAGCTTTACATCAGTGTCAATCTTATCAGCCTTA
ACAAGTGCTTTTATACTCATACCGGCCTATCTAGACCTAGCAGCCTACGGTGAAACACTCTCTCCAATCAATCAGATTAT
CATTAAGCCTATAGGAGCCTTTGATTTATTAGCAAAGCTATCACTTGGTGCCTATGATACGACAAAGTTTAATGCGATTC
CCATGATATTTATTGGTCTGTTGCCTTCATTGTTAAGTATCGTCTTTTTCACCTTAAAATCTATTAGCTGGCGCTTAAGA
CTGGGCTATGGGCTGCTTTTAGGACTCATCATGGCTAGCTTTTATCTTCAGCCCTTAGATTTATTTTGGCAGGGCATGCA
TGCACCCAATATGTTTTTGCACCGCTATTCGTGGTCATTTTCAATCATTATCATTATTTTAGCCTGCGAAGCCCTTTCTA
GACAAAAAGACATTACTAACACTAGAATAATCTTTGCCTTTATATTATTAAGCTGCTTATTAACACTTCCTTATCTGACA
ATGGATCAGTATAGCTTTTTACAGCCTAGCTTATTGATCTTAAGTCTTGCCTTTTTAGCGGCATATCTTATTTTATTGCT
AAGCATGCTAAAAGCCTCTGTACCAATGCCATTTTTAATCTTTTTTACCCTACTGTTTAGCTGTTTAGAAACCAGTTTAA
ATACCTACTATCAGCTTAATGGTATCCATCATGAATGGGTATTTCCATCACGTAAGGGCTATAGCAGAGCTTTACAGGAT
GTTGACAAGCTTGTCAAGAAAGCAGCTACTAACAACGACCAGTTTTTCAGACTGGAGCAGCTCCTGCCACAAACAGGCAA
CGACAGTATGAAATACAACTATAATGGCATTTCTCAATTTTCATCTATCCGAAATCGTCACTCCAGCTCCCTTCTGGATC
GTCTAGGCTATCAGTCTGCTGGAACAAATTTAAACCTTCGCTATCAAAACAACACTCTCATCATGGATAGTCTTTTAGGG
GTAAAATACAATCTTAGCTACCATCAGCTTCATAAATTTGGCTTTTCAAGGATAGCCTCCAGTCATCACACTACACTCTA
TCAAAATCACTATAGCAGCAATCTAGCTATCTTAACAGATAACGTTTACAAAGATGTCAAGTTAACTGTCAACACACTTG
ACAATCAAACCAAGCTGCTGAATCAGCTGAGTGGAAAAAGGCTCACCTATTTTCAGCTAGAGCCTTCTAAGCTAATATCA
AATGCTCAGGCATTTAATGGGAGAATTTCAGGGAGGGCTGCTGAGAATACGTCAACAACCATTGTTCATTATCAGGTTAC
TGTACCAGACCATAGGCAGCTCTACTTAAGCCTTCCAAATATTAGCTTTTCAAATCACAATACAACAGCTGTTAGGATCC
GTATTGATGATCAGACCTACGAGTACACTACTGACAACGCTTTTTCATTCTTTGACTTAGGGTACTTTGAAAAAGGAAGA
ACCTTAACCCTTGCTATTATGTTTCCGAAAAACAAAAATATTTCCTTTGCTACCCCACACTTCTACAGTCTAAATAGTGA
CAACTATCTGGCAGCCATGAATGCGATTAACCAAAAAGAGGTTACTACTTACACCCGTAGCAATCAGGTCATCAGCCATT
ACAAGGCCAAATCAGAAAGCTCTATGATTTTTACCCTTCCCTATGACAAAGGCTGGACAGCAAGACTAAATGGCCGACCA
GTGGCTCTTAAAAAGGCTCAAGGTGGTTTTATTAGGATAGATGTTCCAAAAGGATCTGGTAAATTAGTACTCACCTTTGT
TCCAAATGGCTTTACATTAGGCTTATTGCTCTCATTTATTGGTATCTTGCTTTACAGCTTCTTACATTACTACTTACTCA
GGCAAACAGCCAAGCTAAAAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATCATCATTAAAGTTATAGAGATGATCACTGATGACATCTGAGGGCTGGAAACTATTTCTAGCCCTTTTTTCAAAAA
TATCATAGAAGGGCTTATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAGCAATTTCCATATATAAGCAAAACGCTTGATTTTACAGCCCTTACAGGTATCAAAATCAAGCGTTTTTAGCTGGTCT
ATTGGTTTAAGGATATTAAA

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 861; Mature: 860

Protein sequence:

>861_residues
MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFA
LASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWL
DVFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL
TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLR
LGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLT
MDQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD
VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLG
VKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLIS
NAQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR
TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRP
VALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA

Sequences:

>Translated_861_residues
MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFA
LASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWL
DVFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL
TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLR
LGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLT
MDQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD
VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLG
VKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLIS
NAQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR
TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRP
VALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA
>Mature_860_residues
TKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFAL
ASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLD
VFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSALT
SAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLRL
GYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTM
DQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQDV
DKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLGV
KYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISN
AQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGRT
LTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRPV
ALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018580 [H]

Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98067; Mature: 97936

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNIL
CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
HGADSIFYTFTSGLGVNFFALASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLA
CCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLDVFILLPIVLLGLYRLITQT
HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LPSLLSIVFFTLKSISWRLRLGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSF
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHH
SIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTMDQYSFLQPSLLILSLAFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH
AYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHH
VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSA
HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GTNLNLRYQNNTLIMDSLLGVKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTD
CCEEEEEECCCEEEEEHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEC
NVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISNAQAFNGRISGRAAENTSTT
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEE
IVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR
EEEEEEECCCCCEEEEECCCCEECCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEECCEECCCC
TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSES
EEEEEEEECCCCCCCEECCCEEECCCCCEEHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCC
SMIFTLPYDKGWTARLNGRPVALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFI
CEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
GILLYSFLHYYLLRQTAKLKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNIL
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
HGADSIFYTFTSGLGVNFFALASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLA
CCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLDVFILLPIVLLGLYRLITQT
HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LPSLLSIVFFTLKSISWRLRLGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSF
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHH
SIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTMDQYSFLQPSLLILSLAFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH
AYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCEEEEEECCCEEEEEHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEC
NVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISNAQAFNGRISGRAAENTSTT
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEE
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EEEEEEECCCCCEEEEECCCCEECCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEECCEECCCC
TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSES
EEEEEEEECCCCCCCEECCCEEECCCCCEEHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCC
SMIFTLPYDKGWTARLNGRPVALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFI
CEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
GILLYSFLHYYLLRQTAKLKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]