Definition Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome.
Accession NC_011134
Length 2,024,171

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 195978099

Identifier: 195978099

GI number: 195978099

Start: 1011015

End: 1013030

Strand: Direct

Name: 195978099

Synonym: Sez_0972

Alternate gene names: NA

Gene position: 1011015-1013030 (Clockwise)

Preceding gene: 195978098

Following gene: 195978100

Centisome position: 49.95

GC content: 40.28

Gene sequence:

>2016_bases
ATGAAAAAACTATTTATATTGTTATCCAACTTGCTTGCTAGTTTGTTCTTTGTTTGGGTGTTTACCATTTGGAGTGATAC
TTATGTTTCTCATTATTACCCTAACATTGCTGTGCATGATTCTTCTCCTGAGACAACCTTTCAGCAAGTTACAGAACGCT
TGGAAAAACTAGCAAAAGAGACGGACAGTTTTATTGCGATTCAACATCAAGATCCAACCTCAGAAGGCACTACAGCTTTT
TCTTATACGACTTTCGGGGAAGGAAAGTTACCTGATGGGCTTCAGGAAAGAACGCTTAAAGATTCTCAAAATAGTAGTGT
TGAAACTAACTATTTTATATTTGATGGACACTTAGATATTCACTTGCTAAGGGATGAACTAAGTCATCTTGGCTTGACAA
ACATGCACCTAACGATTCCGTCTAAACTATCTACTTTACTATCTATATTTAGTTTCGGTTTTCAGTTAATAGGCTTATTG
ATTTTCTGTTTAACCTTCGGCTCTCTTACTTTAATTAACCAAATCAGCCAATTACGCTCGTCAGGTATTCGTCTTATTTC
AGGAGAGCGACGGTGGTCAATTTTTCTTAGACCAGTTGTTGGGGATTTGAAAGGAATAGCTGTCGGTTTCGGTTTGGCTG
TCATGCTCACTATTGTTTTGCAAAAGTTACTTTCGCTTCCGAAAGAATCTCTGTTGACCATAGGAGCAGGCTTGCTCAGC
TATAACCTAATACTGCTGTTGATTTCCTTGTTTTTTGCTCAACTCTTCGCAGTTGGGATAAAAAAGGTACATCTGATGCA
GATTATAAAAGGGCAAGTGCCTGTTAGAGGAATCATTAGTTTGATTTTAATCGGTCAGCTGTTGGCTATTATTATCGTGA
CGCTAGGGATAGGGAGTAGTTTAAAGTATTCCCAAGCCTGGCAGCAGCATAGCCTTGGGAAAGAAGCCTGGAGTCAGGAA
AGGCAGTTGATTATCTTATCGATCAGCCGAGAAGGGACAGCTCTAGGTTTTGATGAGCAGACTCAAAGGAAACTCACCGT
TTGGTATAATTTAATGGATCAGGCTGTTTCAGAACAAAAGGCAATCTTATCCAGACACCAATTGATAGATCGTTTGATGC
AAAATGGCATAAGTTCCTCCAAAAACTTGACAACCTCTACAGAATGGCAAGATTACAGCCCGAATGGCAATGTCCTTATT
GTAACACCGCAATACTTGGAGCGTCAAAATATCCCTGTAGATACGGCTATTGAACAAAAACTGAATCACCTCGCAGTAGG
GGACTTTGTCTTGCTCTTGCCTGAGCATCTCCGTTCAGAGGAAGAACATTACAAATCTGTTTTTGAAGACGACTTAACCA
GTCGCATGTCTAGTCAAGATGCTCGACAACAAATGACTGCAACGGTAGCTTATTTGCAATCAGGCCAAGACCGTTTTGTG
TATAATACGACACCTATTTCCTATCAACAGTTTCTGAAAGATCCGATTATCATTGTCGTGACACCCCAGTCAACTGGACC
TCAGTCCGTCATGTTTTGGTTTGACGCGGTACAGAATTATGTCCTCTTTAATCAGTTGTCCGACGCCCAGGAGCTTATCC
AGAGACAGGGCATTGAAAATTGGGTCTCAGAAATGCAATCGGGGTACCAGAACTACATCACATTGTTGAATAATATCCAG
AGGGAACGCTGGGTAATGCTTGCGGGAGCTGTGCTTGGGATAGCAACCTCAATCTTGTTGTTTAACACCATGAATAGTCT
CTACTTTGAAGAATTTAGACGTGCCATTTTCATCAAACGTATTGCTGGACTAAGATTTTTAGAAATCCATCGGAATTACC
TCTTGGCTCAATTGGGTGTCTTTTTACTCGGATTTGTTGCAAGTGTATTCCTTCAGGTAGAGATAGTGATTGCTTTCTTA
GTATTGTTACTCTTCACTGGCCTATCTCTTTTACAATTACATGTTCAAATGCAGAAGGAAAACAAGATGTCCATGCTTGT
TTTGAAAGGAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTCTGAAGTCAGCATTCTTTATCAATAGCTTTAGTAAGCTTGTTAGTCTATAGAGGACAGGATTATTTCTGTCCTCTA
TTTTAGAATAGGGGTATACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATGATTGAACTTAAACAGGTGAGTAAGTCTTTTGGAGAACGAGAGCTATTTTCTAATCTTTCAATGACATTTGAGGTTG
GAAAAGTCTATGCTTTGATT

Product: putative immunity protein, bacteriocin-associated integral membrane protein subfamily

Products: NA

Alternate protein names: Immunity Protein; Bacteriocine Associated ABC Transporter Permease; Bacteriocin-Associated Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 671

Protein sequence:

>671_residues
MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF
SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL
IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS
YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE
RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI
VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV
YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ
RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL
VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG

Sequences:

>Translated_671_residues
MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF
SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL
IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS
YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE
RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI
VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV
YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ
RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL
VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG
>Mature_671_residues
MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF
SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL
IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS
YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE
RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI
VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV
YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ
RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL
VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG

Specific function: Unknown

COG id: COG4652

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75966; Mature: 75966

Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94

Prosite motif: PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
TDSFIAIQHQDPTSEGTTAFSYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDI
CCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCEEE
HLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLLIFCLTFGSLTLINQISQLRS
HHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS
CCCEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LKYSQAWQQHSLGKEAWSQERQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQK
CCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLIVTPQYLERQNIPVDTAIEQK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV
HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIEN
EECCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
WVSEMQSGYQNYITLLNNIQRERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFLVLLLFTGLSLLQLHVQMQKE
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKMSMLVLKGG
CCEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
TDSFIAIQHQDPTSEGTTAFSYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDI
CCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCEEE
HLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLLIFCLTFGSLTLINQISQLRS
HHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS
CCCEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LKYSQAWQQHSLGKEAWSQERQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQK
CCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLIVTPQYLERQNIPVDTAIEQK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV
HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIEN
EECCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
WVSEMQSGYQNYITLLNNIQRERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFLVLLLFTGLSLLQLHVQMQKE
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKMSMLVLKGG
CCEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA