| Definition | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011134 |
| Length | 2,024,171 |
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The map label for this gene is 195978099
Identifier: 195978099
GI number: 195978099
Start: 1011015
End: 1013030
Strand: Direct
Name: 195978099
Synonym: Sez_0972
Alternate gene names: NA
Gene position: 1011015-1013030 (Clockwise)
Preceding gene: 195978098
Following gene: 195978100
Centisome position: 49.95
GC content: 40.28
Gene sequence:
>2016_bases ATGAAAAAACTATTTATATTGTTATCCAACTTGCTTGCTAGTTTGTTCTTTGTTTGGGTGTTTACCATTTGGAGTGATAC TTATGTTTCTCATTATTACCCTAACATTGCTGTGCATGATTCTTCTCCTGAGACAACCTTTCAGCAAGTTACAGAACGCT TGGAAAAACTAGCAAAAGAGACGGACAGTTTTATTGCGATTCAACATCAAGATCCAACCTCAGAAGGCACTACAGCTTTT TCTTATACGACTTTCGGGGAAGGAAAGTTACCTGATGGGCTTCAGGAAAGAACGCTTAAAGATTCTCAAAATAGTAGTGT TGAAACTAACTATTTTATATTTGATGGACACTTAGATATTCACTTGCTAAGGGATGAACTAAGTCATCTTGGCTTGACAA ACATGCACCTAACGATTCCGTCTAAACTATCTACTTTACTATCTATATTTAGTTTCGGTTTTCAGTTAATAGGCTTATTG ATTTTCTGTTTAACCTTCGGCTCTCTTACTTTAATTAACCAAATCAGCCAATTACGCTCGTCAGGTATTCGTCTTATTTC AGGAGAGCGACGGTGGTCAATTTTTCTTAGACCAGTTGTTGGGGATTTGAAAGGAATAGCTGTCGGTTTCGGTTTGGCTG TCATGCTCACTATTGTTTTGCAAAAGTTACTTTCGCTTCCGAAAGAATCTCTGTTGACCATAGGAGCAGGCTTGCTCAGC TATAACCTAATACTGCTGTTGATTTCCTTGTTTTTTGCTCAACTCTTCGCAGTTGGGATAAAAAAGGTACATCTGATGCA GATTATAAAAGGGCAAGTGCCTGTTAGAGGAATCATTAGTTTGATTTTAATCGGTCAGCTGTTGGCTATTATTATCGTGA CGCTAGGGATAGGGAGTAGTTTAAAGTATTCCCAAGCCTGGCAGCAGCATAGCCTTGGGAAAGAAGCCTGGAGTCAGGAA AGGCAGTTGATTATCTTATCGATCAGCCGAGAAGGGACAGCTCTAGGTTTTGATGAGCAGACTCAAAGGAAACTCACCGT TTGGTATAATTTAATGGATCAGGCTGTTTCAGAACAAAAGGCAATCTTATCCAGACACCAATTGATAGATCGTTTGATGC AAAATGGCATAAGTTCCTCCAAAAACTTGACAACCTCTACAGAATGGCAAGATTACAGCCCGAATGGCAATGTCCTTATT GTAACACCGCAATACTTGGAGCGTCAAAATATCCCTGTAGATACGGCTATTGAACAAAAACTGAATCACCTCGCAGTAGG GGACTTTGTCTTGCTCTTGCCTGAGCATCTCCGTTCAGAGGAAGAACATTACAAATCTGTTTTTGAAGACGACTTAACCA GTCGCATGTCTAGTCAAGATGCTCGACAACAAATGACTGCAACGGTAGCTTATTTGCAATCAGGCCAAGACCGTTTTGTG TATAATACGACACCTATTTCCTATCAACAGTTTCTGAAAGATCCGATTATCATTGTCGTGACACCCCAGTCAACTGGACC TCAGTCCGTCATGTTTTGGTTTGACGCGGTACAGAATTATGTCCTCTTTAATCAGTTGTCCGACGCCCAGGAGCTTATCC AGAGACAGGGCATTGAAAATTGGGTCTCAGAAATGCAATCGGGGTACCAGAACTACATCACATTGTTGAATAATATCCAG AGGGAACGCTGGGTAATGCTTGCGGGAGCTGTGCTTGGGATAGCAACCTCAATCTTGTTGTTTAACACCATGAATAGTCT CTACTTTGAAGAATTTAGACGTGCCATTTTCATCAAACGTATTGCTGGACTAAGATTTTTAGAAATCCATCGGAATTACC TCTTGGCTCAATTGGGTGTCTTTTTACTCGGATTTGTTGCAAGTGTATTCCTTCAGGTAGAGATAGTGATTGCTTTCTTA GTATTGTTACTCTTCACTGGCCTATCTCTTTTACAATTACATGTTCAAATGCAGAAGGAAAACAAGATGTCCATGCTTGT TTTGAAAGGAGGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTCTGAAGTCAGCATTCTTTATCAATAGCTTTAGTAAGCTTGTTAGTCTATAGAGGACAGGATTATTTCTGTCCTCTA TTTTAGAATAGGGGTATACC
Downstream 100 bases:
>100_bases CATGATTGAACTTAAACAGGTGAGTAAGTCTTTTGGAGAACGAGAGCTATTTTCTAATCTTTCAATGACATTTGAGGTTG GAAAAGTCTATGCTTTGATT
Product: putative immunity protein, bacteriocin-associated integral membrane protein subfamily
Products: NA
Alternate protein names: Immunity Protein; Bacteriocine Associated ABC Transporter Permease; Bacteriocin-Associated Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 671
Protein sequence:
>671_residues MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG
Sequences:
>Translated_671_residues MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG >Mature_671_residues MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKETDSFIAIQHQDPTSEGTTAF SYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDIHLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLL IFCLTFGSLTLINQISQLRSSGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSSLKYSQAWQQHSLGKEAWSQE RQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQKAILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLI VTPQYLERQNIPVDTAIEQKLNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIENWVSEMQSGYQNYITLLNNIQ RERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKRIAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFL VLLLFTGLSLLQLHVQMQKENKMSMLVLKGG
Specific function: Unknown
COG id: COG4652
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75966; Mature: 75966
Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94
Prosite motif: PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC TDSFIAIQHQDPTSEGTTAFSYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDI CCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCEEE HLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLLIFCLTFGSLTLINQISQLRS HHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS CCCEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC LKYSQAWQQHSLGKEAWSQERQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQK CCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLIVTPQYLERQNIPVDTAIEQK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCHHHHHH LNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIEN EECCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH WVSEMQSGYQNYITLLNNIQRERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFLVLLLFTGLSLLQLHVQMQKE HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NKMSMLVLKGG CCEEEEEEECC >Mature Secondary Structure MKKLFILLSNLLASLFFVWVFTIWSDTYVSHYYPNIAVHDSSPETTFQQVTERLEKLAKE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC TDSFIAIQHQDPTSEGTTAFSYTTFGEGKLPDGLQERTLKDSQNSSVETNYFIFDGHLDI CCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCEEE HLLRDELSHLGLTNMHLTIPSKLSTLLSIFSFGFQLIGLLIFCLTFGSLTLINQISQLRS HHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIRLISGERRWSIFLRPVVGDLKGIAVGFGLAVMLTIVLQKLLSLPKESLLTIGAGLLS CCCEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH YNLILLLISLFFAQLFAVGIKKVHLMQIIKGQVPVRGIISLILIGQLLAIIIVTLGIGSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC LKYSQAWQQHSLGKEAWSQERQLIILSISREGTALGFDEQTQRKLTVWYNLMDQAVSEQK CCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AILSRHQLIDRLMQNGISSSKNLTTSTEWQDYSPNGNVLIVTPQYLERQNIPVDTAIEQK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCHHHHHH LNHLAVGDFVLLLPEHLRSEEEHYKSVFEDDLTSRMSSQDARQQMTATVAYLQSGQDRFV HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE YNTTPISYQQFLKDPIIIVVTPQSTGPQSVMFWFDAVQNYVLFNQLSDAQELIQRQGIEN EECCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH WVSEMQSGYQNYITLLNNIQRERWVMLAGAVLGIATSILLFNTMNSLYFEEFRRAIFIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAGLRFLEIHRNYLLAQLGVFLLGFVASVFLQVEIVIAFLVLLLFTGLSLLQLHVQMQKE HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NKMSMLVLKGG CCEEEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA