| Definition | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011134 |
| Length | 2,024,171 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is kup [H]
Identifier: 195977783
GI number: 195977783
Start: 669026
End: 671029
Strand: Direct
Name: kup [H]
Synonym: Sez_0647
Alternate gene names: 195977783
Gene position: 669026-671029 (Clockwise)
Preceding gene: 195977782
Following gene: 195977786
Centisome position: 33.05
GC content: 42.76
Gene sequence:
>2004_bases ATGTCTAATGCCCATCATGATGCCTTTGATAAAGCAACAAAGGCAGGTTTTATTATTGCACTAGGAATTGTCTATGGTGA TATTGGCACAAGTCCACTGTATACCATGCAGTCGTTGGTTGACAATCAAGGCGGCCTTTCACAGGTGTCTGAAGCTTTTA TTTTAGGCTCAGTATCCTTGATTATTTGGACCCTGACCCTGATAACGACAATCAAGTACGTTTTGATTGCTTTAAAGGCT GATAATCATCATGAGGGAGGGATTTTTTCACTTTTTACCTTGGTTAGAAGGATGTCAAGGTGGTTAATCATTCCAGCTAT GCTTGGGGGAGCAACGCTCTTATCAGATGGTGCCTTGACACCAGCTGTTACGGTCACATCAGCCATTGAAGGCTTAAAGG CTGTTCCTGAGCTCAGCAGTATTTACCAGAATCAGACCAATGTGATCCTAACGACCTTGCTGATATTGATGGTCTTGTTT GGCCTGCAGCGCTTTGGAACGGGTGTTATTGGTAAATTATTTGGGCCAGTCATGCTGGTTTGGTTTAGCGTTTTGGGGAT CAGTGGTCTCTTGAATAGCTTACAGCATTTGGAAATCCTAAAGGCTATCAATCCCTATTATGCGCTGCACTTATTGGTTA GTCCGGAAAATCATCGGGGTATTTTCATTTTAGGCTCTATTTTTTTAGCGACAACTGGTGCTGAAGCTCTTTATTCTGAT TTAGGTCATGTCGGTCGAGGAAATATTTATGCTAGCTGGCCCTTTGTTAAGGTTTGTATCATCTTATCCTATTGTGGTCA GGCAGCTTGGATTTTAGCGCATAAGGACTCAGGCATTGCGCTTAATCCCTTCTTTGCTAGTGTTCCAGAGGGATTACGGG TTTATCTTGTTATTCTAGCAACTCTAGCAGCCATTATTGCTTCGCAGGCTTTAATCTCAGGTTCCTTTACCTTGGTTTCT GAGGCTATGCGCTTGAAGATTTTTCCGTTGTTTAAGATTACCTATCCAGGTGCCAACCTAGGCCAACTATACATCCCTGT CATTAACTGGAGCTTGTTTGCGGTAACGTCTTGTACGGTGCTGTATTTTAGAACATCAGCGCATATGGAGGCTGCCTATG GCCTTGCCATCACGATTACCATGCTGATGACAACGATTCTCTTAGCCTATTACCTTATTAAGGAGGGGGTAAAGCCGCTC CTAGCTAGTCTGCTCATGGCTTTTTTTGCCTTTATTGAGTTTATTTTCTTTTTAGCATCTGCAGTTAAGTTTATGCATGG GGGCTATGTTGTTGTTGTTTTAGCTCTTGCCATTGTCTTTGTTATGGTGATTTGGCATGCTGGAACCGTGATTGTTGCTA AATATGTTAAGTCCTTGAGCCTAAATGATTACAAGCATCAAATCAAACTCCTTAGAGATGATCTTCGCTTTGATTTGTAT CAGACCAATGTTGTTTACTTGACCAACCGCATGAAAAAAGATCTGATTGATCGTTCAATCCTGTATTCCATTTTAGATAA GCGTCCTAAGCGCGCACAGGTTTATTGGTTTGTTAATGTTCGTGTGACAGATGAGCCTTATACGGCGACCTACAAGGTGG ATATGTTAGGAACAGACTATATCGTTTGTGTAGAGCTCTACCTTGGCTTTAGAATGCCACAGACTGTTCCGCGTTACCTT AGAACGATTGTTCAGGATTTGATGGAGAGTGGCCGTCTGCCTAAGCAGGTTCAGGATTACACGATTACACCAGGTCGAGA GGTTGGTGACTTTAGGTTTGTGATCATTGAGGAGCGTGTGTCACATGCAAGGCAGCTGAGTACTCTGGAACGTTTTGTCA TGCAGACAAAGGCTAGTATCAAGCATGTGACAGCAAGCCCTATGCGTTGGTTTGGCCTGCAATATTCTGAGGCAACAGTT GAGGTTGTTCCTTTACTCTTATCAGATGTCTTAAAGCTTCCAATCAAGGAAATCAAAGCGTGTACAAAAGATGAAAAGGC CTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCTCTTTTTTAATTTTCTGAAAATATTGATTTTGTTATAGATTTTGCTATAATGGTCTCAGTCCATTTGGCATGATTAA GTCTTAGGAGGAACATTGGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GTAAGGCTTGGCTTATTCTGATCGCTTTTTAAGCTAAACTAATAAAAAGACCTCCAAGGGCTTCTACTAGCTAGAAGTTA TGGAGGTTTTGCTGCTTTTT
Product: probable potassium transport system protein Kup
Products: K (I) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 667; Mature: 666
Protein sequence:
>667_residues MSNAHHDAFDKATKAGFIIALGIVYGDIGTSPLYTMQSLVDNQGGLSQVSEAFILGSVSLIIWTLTLITTIKYVLIALKA DNHHEGGIFSLFTLVRRMSRWLIIPAMLGGATLLSDGALTPAVTVTSAIEGLKAVPELSSIYQNQTNVILTTLLILMVLF GLQRFGTGVIGKLFGPVMLVWFSVLGISGLLNSLQHLEILKAINPYYALHLLVSPENHRGIFILGSIFLATTGAEALYSD LGHVGRGNIYASWPFVKVCIILSYCGQAAWILAHKDSGIALNPFFASVPEGLRVYLVILATLAAIIASQALISGSFTLVS EAMRLKIFPLFKITYPGANLGQLYIPVINWSLFAVTSCTVLYFRTSAHMEAAYGLAITITMLMTTILLAYYLIKEGVKPL LASLLMAFFAFIEFIFFLASAVKFMHGGYVVVVLALAIVFVMVIWHAGTVIVAKYVKSLSLNDYKHQIKLLRDDLRFDLY QTNVVYLTNRMKKDLIDRSILYSILDKRPKRAQVYWFVNVRVTDEPYTATYKVDMLGTDYIVCVELYLGFRMPQTVPRYL RTIVQDLMESGRLPKQVQDYTITPGREVGDFRFVIIEERVSHARQLSTLERFVMQTKASIKHVTASPMRWFGLQYSEATV EVVPLLLSDVLKLPIKEIKACTKDEKA
Sequences:
>Translated_667_residues MSNAHHDAFDKATKAGFIIALGIVYGDIGTSPLYTMQSLVDNQGGLSQVSEAFILGSVSLIIWTLTLITTIKYVLIALKA DNHHEGGIFSLFTLVRRMSRWLIIPAMLGGATLLSDGALTPAVTVTSAIEGLKAVPELSSIYQNQTNVILTTLLILMVLF GLQRFGTGVIGKLFGPVMLVWFSVLGISGLLNSLQHLEILKAINPYYALHLLVSPENHRGIFILGSIFLATTGAEALYSD LGHVGRGNIYASWPFVKVCIILSYCGQAAWILAHKDSGIALNPFFASVPEGLRVYLVILATLAAIIASQALISGSFTLVS EAMRLKIFPLFKITYPGANLGQLYIPVINWSLFAVTSCTVLYFRTSAHMEAAYGLAITITMLMTTILLAYYLIKEGVKPL LASLLMAFFAFIEFIFFLASAVKFMHGGYVVVVLALAIVFVMVIWHAGTVIVAKYVKSLSLNDYKHQIKLLRDDLRFDLY QTNVVYLTNRMKKDLIDRSILYSILDKRPKRAQVYWFVNVRVTDEPYTATYKVDMLGTDYIVCVELYLGFRMPQTVPRYL RTIVQDLMESGRLPKQVQDYTITPGREVGDFRFVIIEERVSHARQLSTLERFVMQTKASIKHVTASPMRWFGLQYSEATV EVVPLLLSDVLKLPIKEIKACTKDEKA >Mature_666_residues SNAHHDAFDKATKAGFIIALGIVYGDIGTSPLYTMQSLVDNQGGLSQVSEAFILGSVSLIIWTLTLITTIKYVLIALKAD NHHEGGIFSLFTLVRRMSRWLIIPAMLGGATLLSDGALTPAVTVTSAIEGLKAVPELSSIYQNQTNVILTTLLILMVLFG LQRFGTGVIGKLFGPVMLVWFSVLGISGLLNSLQHLEILKAINPYYALHLLVSPENHRGIFILGSIFLATTGAEALYSDL GHVGRGNIYASWPFVKVCIILSYCGQAAWILAHKDSGIALNPFFASVPEGLRVYLVILATLAAIIASQALISGSFTLVSE AMRLKIFPLFKITYPGANLGQLYIPVINWSLFAVTSCTVLYFRTSAHMEAAYGLAITITMLMTTILLAYYLIKEGVKPLL ASLLMAFFAFIEFIFFLASAVKFMHGGYVVVVLALAIVFVMVIWHAGTVIVAKYVKSLSLNDYKHQIKLLRDDLRFDLYQ TNVVYLTNRMKKDLIDRSILYSILDKRPKRAQVYWFVNVRVTDEPYTATYKVDMLGTDYIVCVELYLGFRMPQTVPRYLR TIVQDLMESGRLPKQVQDYTITPGREVGDFRFVIIEERVSHARQLSTLERFVMQTKASIKHVTASPMRWFGLQYSEATVE VVPLLLSDVLKLPIKEIKACTKDEKA
Specific function: Transport of potassium into the cell [H]
COG id: COG3158
COG function: function code P; K+ transporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the HAK/KUP transporter (TC 2.A.72) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI48994960, Length=440, Percent_Identity=37.0454545454545, Blast_Score=258, Evalue=6e-70,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003855 - InterPro: IPR023051 [H]
Pfam domain/function: PF02705 K_trans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74198; Mature: 74067
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNAHHDAFDKATKAGFIIALGIVYGDIGTSPLYTMQSLVDNQGGLSQVSEAFILGSVSL CCCCCCCHHHHHHHCCHHEEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIWTLTLITTIKYVLIALKADNHHEGGIFSLFTLVRRMSRWLIIPAMLGGATLLSDGALT HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHCCHHHCCCCCCC PAVTVTSAIEGLKAVPELSSIYQNQTNVILTTLLILMVLFGLQRFGTGVIGKLFGPVMLV HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH WFSVLGISGLLNSLQHLEILKAINPYYALHLLVSPENHRGIFILGSIFLATTGAEALYSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHH LGHVGRGNIYASWPFVKVCIILSYCGQAAWILAHKDSGIALNPFFASVPEGLRVYLVILA HCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHH TLAAIIASQALISGSFTLVSEAMRLKIFPLFKITYPGANLGQLYIPVINWSLFAVTSCTV HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH LYFRTSAHMEAAYGLAITITMLMTTILLAYYLIKEGVKPLLASLLMAFFAFIEFIFFLAS EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVKFMHGGYVVVVLALAIVFVMVIWHAGTVIVAKYVKSLSLNDYKHQIKLLRDDLRFDLY HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHE QTNVVYLTNRMKKDLIDRSILYSILDKRPKRAQVYWFVNVRVTDEPYTATYKVDMLGTDY ECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCH IVCVELYLGFRMPQTVPRYLRTIVQDLMESGRLPKQVQDYTITPGREVGDFRFVIIEERV HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHH SHARQLSTLERFVMQTKASIKHVTASPMRWFGLQYSEATVEVVPLLLSDVLKLPIKEIKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH CTKDEKA HCCCCCC >Mature Secondary Structure SNAHHDAFDKATKAGFIIALGIVYGDIGTSPLYTMQSLVDNQGGLSQVSEAFILGSVSL CCCCCCHHHHHHHCCHHEEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIWTLTLITTIKYVLIALKADNHHEGGIFSLFTLVRRMSRWLIIPAMLGGATLLSDGALT HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHCCHHHCCCCCCC PAVTVTSAIEGLKAVPELSSIYQNQTNVILTTLLILMVLFGLQRFGTGVIGKLFGPVMLV HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH WFSVLGISGLLNSLQHLEILKAINPYYALHLLVSPENHRGIFILGSIFLATTGAEALYSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHH LGHVGRGNIYASWPFVKVCIILSYCGQAAWILAHKDSGIALNPFFASVPEGLRVYLVILA HCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHH TLAAIIASQALISGSFTLVSEAMRLKIFPLFKITYPGANLGQLYIPVINWSLFAVTSCTV HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH LYFRTSAHMEAAYGLAITITMLMTTILLAYYLIKEGVKPLLASLLMAFFAFIEFIFFLAS EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVKFMHGGYVVVVLALAIVFVMVIWHAGTVIVAKYVKSLSLNDYKHQIKLLRDDLRFDLY HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHE QTNVVYLTNRMKKDLIDRSILYSILDKRPKRAQVYWFVNVRVTDEPYTATYKVDMLGTDY ECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCH IVCVELYLGFRMPQTVPRYLRTIVQDLMESGRLPKQVQDYTITPGREVGDFRFVIIEERV HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHH SHARQLSTLERFVMQTKASIKHVTASPMRWFGLQYSEATVEVVPLLLSDVLKLPIKEIKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH CTKDEKA HCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: K (I) [Periplasm] [C]
Specific reaction: K (I) [Periplasm] = K (I) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA