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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 195977164

GI number: 195977164

Start: 9030

End: 10541

Strand: Direct

Name: yabM [H]

Synonym: Sez_0008

Alternate gene names: 195977164

Gene position: 9030-10541 (Clockwise)

Preceding gene: 195977163

Following gene: 195977165

Centisome position: 0.45

GC content: 37.37

Gene sequence:

>1512_bases
GTGAGATTAAATCTAGAAAAGCTTCCTCATAAAACTAAGCAATCAAGCCTTTTGATTGTTATCAGTAGCTTTATGTCAAA
ATTATTAGCAGCTAGTTACCGTATCCCTTATCAAAATTTGGTAGGGGATAGGGGCTTTTATGCTTACCAACAAATTTACC
CTTTGCTAGGTATTATTTCAGCTTTAGGTCTAACTGCCTTACCCAATGTGATTGCCAGTATGGCTCAGAAAAAAAAACAG
CTACAGCTAGCAGCTCTATTTAAATTGCAATGTTGTACGAGCTTCCTATTATCAGGAATATTGGTGCTGAGTCATAAGGC
ATTGGCTAGCTGGATGGGGGCACAGCAGCTAGCACCATCAATTATCATAACAGCAATGGTTTTGTTAACAATCCCCTTTA
TATCCTTTTATAGAGGTTTAGCCCAGGCTGATATGAATATGGCTCCAACAGCTCTGAGTCAAGTTCTTGAGCAGATCATA
AGAGTTGCTATAATCATTGCTGCTGCTCTATGCTACAGCGTGTTTGGTTGGACGGTTTATGTAACAGCAAATGTTGCTGC
TTTTGGCAATTTAGTGGCGAGCTTAGTTATTTTAGCTTATTTGAAGCGTCATAGTGCTTATTCATTAAAAAGCTTTTTAT
CAGGAGAAGTCATTGCTATTAAGGATTTAACCAGCTTAGGCTTGCCGACCTTAGTTTTTTTACTTTTTTCAGTTTACCTG
CTTGTTTTTCAATTGGTAGATTCTCTTTTGGTGAAAAATATTTTGGTTAATTCAGGCTTATCAGAGCTAACAGCTGAAAT
GACTAAGGGTGTTTACGATAGGGGACAGCCCTTGCTGCAATTTGGTCTCATTTTTTCGACAGCCTTATTTACAGCCTATT
TACCGAATTTAACAGCCTTGTTTCATATTAAAAGGGAGTCCTATAGAGAGCAAAGTCAATGTTTCTTTGAGTTTATCTTT
TATTTTAGTTTAACACTGACTGTTGGTTTTATTAGTATTCTCCATCTGATGAATCGAGCCTTATTTGAGGACAATAAGGG
CTGGCTGGCCTTAGTGGTTTACCTGATGATTATAGCAGTATCAAGCATGATTCAATTCTTTCATCAAAAATGCTTCATTG
AGGATCACATCAAGCAATCTTTGCTTATTTTGCTGTTTGGCTTTTTATTAAAATTAGGCTTAACACCTATATTAACCTAC
TATTACGCTATTGTTGGAAGCTCCTTATCCACCCTAATCCCCTTGCTGGTCGTTTTACTCTTGTATGCTGTGCTGGCTGA
TATTGATTTTAAAGCGATAGTGAATGCTAAATATGGGCTTGCTTTAGTGATCATGCTCATGTGTGTGCTTACAAGTCAGT
ATTGCTTGCCATTATCAGGTCGACTTGGTGCGCTGATTAGTCTTTTGGTGTCATCTGCTGTTGGTTTATCCTCTTTTTTA
ATAGCTTGCAAAAAGCTAGGTGTCTTTAAAGAGAAATTGTGGTCTTTTCTACCATTTGTCAAAGAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAGTGAGCATCAGGGTAAAATTGAAATTATCTTTGATGTTAGACGTCAGAAAGACCATGTCATTTTAGAAGAATTGAT
ACTTTTTGGAGAGACACTTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAATGAAAGGGATTGTGAGGCAAAAGATATGAGATTAGATAAATATTTAAAGGTATCAAGATTGATTAAGCGTCGATC
AGTGGCCAAAGAAGTTGCAG

Product: polysaccharide biosynthesis family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 503; Mature: 503

Protein sequence:

>503_residues
MRLNLEKLPHKTKQSSLLIVISSFMSKLLAASYRIPYQNLVGDRGFYAYQQIYPLLGIISALGLTALPNVIASMAQKKKQ
LQLAALFKLQCCTSFLLSGILVLSHKALASWMGAQQLAPSIIITAMVLLTIPFISFYRGLAQADMNMAPTALSQVLEQII
RVAIIIAAALCYSVFGWTVYVTANVAAFGNLVASLVILAYLKRHSAYSLKSFLSGEVIAIKDLTSLGLPTLVFLLFSVYL
LVFQLVDSLLVKNILVNSGLSELTAEMTKGVYDRGQPLLQFGLIFSTALFTAYLPNLTALFHIKRESYREQSQCFFEFIF
YFSLTLTVGFISILHLMNRALFEDNKGWLALVVYLMIIAVSSMIQFFHQKCFIEDHIKQSLLILLFGFLLKLGLTPILTY
YYAIVGSSLSTLIPLLVVLLLYAVLADIDFKAIVNAKYGLALVIMLMCVLTSQYCLPLSGRLGALISLLVSSAVGLSSFL
IACKKLGVFKEKLWSFLPFVKEK

Sequences:

>Translated_503_residues
MRLNLEKLPHKTKQSSLLIVISSFMSKLLAASYRIPYQNLVGDRGFYAYQQIYPLLGIISALGLTALPNVIASMAQKKKQ
LQLAALFKLQCCTSFLLSGILVLSHKALASWMGAQQLAPSIIITAMVLLTIPFISFYRGLAQADMNMAPTALSQVLEQII
RVAIIIAAALCYSVFGWTVYVTANVAAFGNLVASLVILAYLKRHSAYSLKSFLSGEVIAIKDLTSLGLPTLVFLLFSVYL
LVFQLVDSLLVKNILVNSGLSELTAEMTKGVYDRGQPLLQFGLIFSTALFTAYLPNLTALFHIKRESYREQSQCFFEFIF
YFSLTLTVGFISILHLMNRALFEDNKGWLALVVYLMIIAVSSMIQFFHQKCFIEDHIKQSLLILLFGFLLKLGLTPILTY
YYAIVGSSLSTLIPLLVVLLLYAVLADIDFKAIVNAKYGLALVIMLMCVLTSQYCLPLSGRLGALISLLVSSAVGLSSFL
IACKKLGVFKEKLWSFLPFVKEK
>Mature_503_residues
MRLNLEKLPHKTKQSSLLIVISSFMSKLLAASYRIPYQNLVGDRGFYAYQQIYPLLGIISALGLTALPNVIASMAQKKKQ
LQLAALFKLQCCTSFLLSGILVLSHKALASWMGAQQLAPSIIITAMVLLTIPFISFYRGLAQADMNMAPTALSQVLEQII
RVAIIIAAALCYSVFGWTVYVTANVAAFGNLVASLVILAYLKRHSAYSLKSFLSGEVIAIKDLTSLGLPTLVFLLFSVYL
LVFQLVDSLLVKNILVNSGLSELTAEMTKGVYDRGQPLLQFGLIFSTALFTAYLPNLTALFHIKRESYREQSQCFFEFIF
YFSLTLTVGFISILHLMNRALFEDNKGWLALVVYLMIIAVSSMIQFFHQKCFIEDHIKQSLLILLFGFLLKLGLTPILTY
YYAIVGSSLSTLIPLLVVLLLYAVLADIDFKAIVNAKYGLALVIMLMCVLTSQYCLPLSGRLGALISLLVSSAVGLSSFL
IACKKLGVFKEKLWSFLPFVKEK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55751; Mature: 55751

Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]