| Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010981 |
| Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is 190571184
Identifier: 190571184
GI number: 190571184
Start: 855083
End: 858733
Strand: Direct
Name: 190571184
Synonym: WPa_0782
Alternate gene names: NA
Gene position: 855083-858733 (Clockwise)
Preceding gene: 190571180
Following gene: 190571186
Centisome position: 57.68
GC content: 33.83
Gene sequence:
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>100_bases CATATTAATATGATAGTTGAAATCAGCTTTTTGTCTATAGAATTGACAATTTACTGAATTAACATACAATTAATATTGTG ATAATTATAGTGGATAATGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AACTTTTCAGATAAATACTGAGTGAGGATTTCAATGCCTTCATCAATCTCTTTTTCAGTGATAATGAGTGGAGGCAAGAT TCTTAGAACGTTATCTGATG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1216; Mature: 1215
Protein sequence:
>1216_residues MSSISNQEKQSIISGLEEINCKLQGESIKLDDTKESIIVARRKPVVEEALEHLRNPSTTNCNVLIDAETGFGKTYDIGMW SHVLAQAGFHHLVAVPNSDLVNQAKKMMSSAFTVNIRTPKTAEEIKNALQATKPTTIIVTHDLLLQQENDRKFKDQNTKL WISVDEADSINKQQDFENMCKLDEKYPTTYLTATPKRRILNRCGKVISPTRLSRRCIANAIETASVIAKTNRRTNFTLAF VVNIAVTIIPMITLFPVINSNVADVIGLTSDYWLYSALIGNLYYTISMFIFGIVMLPIWWVLTKATGVESKELLSRFLAN VRSLFTREKLSPAHEYVEESEEVFNYNKLVDTDDLLTSIRWNVQSPIGESALLLADDVNSIVNLNFALQGRDNLVYEGST RYEVYNKFQPEGMSYQDYRLKLRETNFISCVKKQHPSLTEEQISELKEKVDFSSTAEYLKYRVMHSMIDLTLSYLMKCDN ITLDKKRREGLSELIEDVKKNVSTTNDNNIISYLERKGFSEQFARDELLLQIKTVIEALSKSDNEQCSLIVDNWRLSKEL HDLMEREEGILHSLIDFCKQNKCIFAGIGKNDLGIGENRPFSAIIRNQIGKYRTIYCDYEKRDFDSLAKYALTTVIDGSK GRGFDSEYNHVASIFADSVSQFNNPSEALQNLGRNRERNESRQSWFFTAAGEEVELFVNKILANFKKEPQKFCQKVLFPA TNKYNKLLKNRMGEELGRKIEIYISKNIDALGNIDDSALKKFSSDLIKETYEKVHDINDFDVKKTEQDLHRILKSTEAYL RSYENRIKNNGKLSCTRSALFSVGSAITKVMYYLWAGFDYLVFLAKAYNIDKSGDTSARAYVHIIRNCHCESSVKAQNVL VHALEIAKEHDSSFKRNSLYEGNEDRCKEKIISYFQSKQYIRALDRTIAQIENEHLAAILKAVGYRGDTDKMAQEIKDFL SDLKKLDCVKFREKYYQGDLYQESKLCKINDRISMVINEVVRCHKWRHGIENLELKLKNGHNIFDVRVNNDFSKLREKNF NKRSKERTYLGRAMLLIGFIISMELIGRISSGQTMQLPLLCGFIVFGPLALLCGALLYEITTYLVRGAFFIFGVPILLGE LSKCVLRNGSMKSLLDMTLSLGNSAFLNIPKDIVQSFIFEDITKFDSLSDINELTLIREQEKAKCTNEVADKVVATALSA ILIQPTTSEQEGLVFN
Sequences:
>Translated_1216_residues MSSISNQEKQSIISGLEEINCKLQGESIKLDDTKESIIVARRKPVVEEALEHLRNPSTTNCNVLIDAETGFGKTYDIGMW SHVLAQAGFHHLVAVPNSDLVNQAKKMMSSAFTVNIRTPKTAEEIKNALQATKPTTIIVTHDLLLQQENDRKFKDQNTKL WISVDEADSINKQQDFENMCKLDEKYPTTYLTATPKRRILNRCGKVISPTRLSRRCIANAIETASVIAKTNRRTNFTLAF VVNIAVTIIPMITLFPVINSNVADVIGLTSDYWLYSALIGNLYYTISMFIFGIVMLPIWWVLTKATGVESKELLSRFLAN VRSLFTREKLSPAHEYVEESEEVFNYNKLVDTDDLLTSIRWNVQSPIGESALLLADDVNSIVNLNFALQGRDNLVYEGST RYEVYNKFQPEGMSYQDYRLKLRETNFISCVKKQHPSLTEEQISELKEKVDFSSTAEYLKYRVMHSMIDLTLSYLMKCDN ITLDKKRREGLSELIEDVKKNVSTTNDNNIISYLERKGFSEQFARDELLLQIKTVIEALSKSDNEQCSLIVDNWRLSKEL HDLMEREEGILHSLIDFCKQNKCIFAGIGKNDLGIGENRPFSAIIRNQIGKYRTIYCDYEKRDFDSLAKYALTTVIDGSK GRGFDSEYNHVASIFADSVSQFNNPSEALQNLGRNRERNESRQSWFFTAAGEEVELFVNKILANFKKEPQKFCQKVLFPA TNKYNKLLKNRMGEELGRKIEIYISKNIDALGNIDDSALKKFSSDLIKETYEKVHDINDFDVKKTEQDLHRILKSTEAYL RSYENRIKNNGKLSCTRSALFSVGSAITKVMYYLWAGFDYLVFLAKAYNIDKSGDTSARAYVHIIRNCHCESSVKAQNVL VHALEIAKEHDSSFKRNSLYEGNEDRCKEKIISYFQSKQYIRALDRTIAQIENEHLAAILKAVGYRGDTDKMAQEIKDFL SDLKKLDCVKFREKYYQGDLYQESKLCKINDRISMVINEVVRCHKWRHGIENLELKLKNGHNIFDVRVNNDFSKLREKNF NKRSKERTYLGRAMLLIGFIISMELIGRISSGQTMQLPLLCGFIVFGPLALLCGALLYEITTYLVRGAFFIFGVPILLGE LSKCVLRNGSMKSLLDMTLSLGNSAFLNIPKDIVQSFIFEDITKFDSLSDINELTLIREQEKAKCTNEVADKVVATALSA ILIQPTTSEQEGLVFN >Mature_1215_residues SSISNQEKQSIISGLEEINCKLQGESIKLDDTKESIIVARRKPVVEEALEHLRNPSTTNCNVLIDAETGFGKTYDIGMWS HVLAQAGFHHLVAVPNSDLVNQAKKMMSSAFTVNIRTPKTAEEIKNALQATKPTTIIVTHDLLLQQENDRKFKDQNTKLW ISVDEADSINKQQDFENMCKLDEKYPTTYLTATPKRRILNRCGKVISPTRLSRRCIANAIETASVIAKTNRRTNFTLAFV VNIAVTIIPMITLFPVINSNVADVIGLTSDYWLYSALIGNLYYTISMFIFGIVMLPIWWVLTKATGVESKELLSRFLANV RSLFTREKLSPAHEYVEESEEVFNYNKLVDTDDLLTSIRWNVQSPIGESALLLADDVNSIVNLNFALQGRDNLVYEGSTR YEVYNKFQPEGMSYQDYRLKLRETNFISCVKKQHPSLTEEQISELKEKVDFSSTAEYLKYRVMHSMIDLTLSYLMKCDNI TLDKKRREGLSELIEDVKKNVSTTNDNNIISYLERKGFSEQFARDELLLQIKTVIEALSKSDNEQCSLIVDNWRLSKELH DLMEREEGILHSLIDFCKQNKCIFAGIGKNDLGIGENRPFSAIIRNQIGKYRTIYCDYEKRDFDSLAKYALTTVIDGSKG RGFDSEYNHVASIFADSVSQFNNPSEALQNLGRNRERNESRQSWFFTAAGEEVELFVNKILANFKKEPQKFCQKVLFPAT NKYNKLLKNRMGEELGRKIEIYISKNIDALGNIDDSALKKFSSDLIKETYEKVHDINDFDVKKTEQDLHRILKSTEAYLR SYENRIKNNGKLSCTRSALFSVGSAITKVMYYLWAGFDYLVFLAKAYNIDKSGDTSARAYVHIIRNCHCESSVKAQNVLV HALEIAKEHDSSFKRNSLYEGNEDRCKEKIISYFQSKQYIRALDRTIAQIENEHLAAILKAVGYRGDTDKMAQEIKDFLS DLKKLDCVKFREKYYQGDLYQESKLCKINDRISMVINEVVRCHKWRHGIENLELKLKNGHNIFDVRVNNDFSKLREKNFN KRSKERTYLGRAMLLIGFIISMELIGRISSGQTMQLPLLCGFIVFGPLALLCGALLYEITTYLVRGAFFIFGVPILLGEL SKCVLRNGSMKSLLDMTLSLGNSAFLNIPKDIVQSFIFEDITKFDSLSDINELTLIREQEKAKCTNEVADKVVATALSAI LIQPTTSEQEGLVFN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 138905; Mature: 138774
Theoretical pI: Translated: 7.78; Mature: 7.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSSISNQEKQSIISGLEEINCKLQGESIKLDDTKESIIVARRKPVVEEALEHLRNPSTTN CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCC CNVLIDAETGFGKTYDIGMWSHVLAQAGFHHLVAVPNSDLVNQAKKMMSSAFTVNIRTPK CEEEEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCC TAEEIKNALQATKPTTIIVTHDLLLQQENDRKFKDQNTKLWISVDEADSINKQQDFENMC HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH KLDEKYPTTYLTATPKRRILNRCGKVISPTRLSRRCIANAIETASVIAKTNRRTNFTLAF HCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHH VVNIAVTIIPMITLFPVINSNVADVIGLTSDYWLYSALIGNLYYTISMFIFGIVMLPIWW HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLTKATGVESKELLSRFLANVRSLFTREKLSPAHEYVEESEEVFNYNKLVDTDDLLTSIR HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH WNVQSPIGESALLLADDVNSIVNLNFALQGRDNLVYEGSTRYEVYNKFQPEGMSYQDYRL HCCCCCCCCCEEEEHHCHHHHEEEEEEEECCCCEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHE KLRETNFISCVKKQHPSLTEEQISELKEKVDFSSTAEYLKYRVMHSMIDLTLSYLMKCDN 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA