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The map label for this gene is flu [C]

Identifier: 189353792

GI number: 189353792

Start: 2075483

End: 2083000

Strand: Direct

Name: flu [C]

Synonym: BMULJ_05039

Alternate gene names: 189353792

Gene position: 2075483-2083000 (Clockwise)

Preceding gene: 189353791

Following gene: 189353793

Centisome position: 83.92

GC content: 66.27

Gene sequence:

>7518_bases
ATGAACCGCACATACCGCTCGATCTGGAACGAGGCGCTCGGCGCCTGGGTCGCAGCATCCGAACTCGACGCCGCGCGCGG
TAAGCCGAACAAGTCCGCCGTCGCGATCGCCGCCGCCGTCGTGCTGACGGCGCTCCCCGCCCTGGCAAGCGCCAACACGT
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ACGACCACCGGCAACACGAACGCGTATGCATCCGACGGCTCCGGCACGTATTCGACCGTCGCCGGCTGTAACGCGAGCGG
CAACAACAACCTCGCGGCCACCGCCTACGGCGCGTTCGCGCAGATCACCGGCACGGGCGGCACCGCGACGGGCTTCCTGT
CGTCGGCCGCACTGTGGGGCACCGCGGCCGGCCTCGAATCGACCGCGAGCGGCGCCGGTTCGACCGCGCTCGGCTTCGGC
GCAACCGCGAACGCGCTGAACTCGGTGGCGATCGGCGGTGCGGCCGGCAACGGCACGACGCCGCTGTCGTACGCGAACTC
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TCGCGATCGGCGGACAGTCGTCGGTTGCGTCGGCGGCCACGTCGGGCATCGCGGTCGGCCGCGGTGCAACCGTCAACGGC
GCATACGGCATCGCGCAAGGCGACGGTGTCGTGTCGGGTGCGACCGGCCGCAACGTCGCGATCGGCTCGACCGGCACGAC
GGCGAACGGCAGTACGGCAGGCGGCGGCGCGGTCGCGATCGGCCGCGGTCAGACGGCGACCGGCGACGGCGCAGTGGCGA
TCGGCGACCCGAACAGCGCGACCGGCACCGGCGCGCTCGCGGTCGGCGCGAACAACACGTCCAACGGCCAAGGCGCGGTG
GCGCTCGGCAACGCGAACTCGGCGAGCGGTACGGGCTCCGTCGCGATGGGCAACAGCAACACCGCGTCGAACAGCTCGGT
GGCGATCGGCAGCTCGGCGAATGCGACGGGCACGAACGGCTCGGTCGCGATCGGCAACTCCGCGACGGCGAACGGTACGG
GCGCGATTGCGCTCGGCAATGTCGGCAGCTTCGCGGCCAATACGCAGGCGACCGGCGCAGACGCGCTCGCACTCGGCAAC
GGCGCGACGGCGAGCGGCAACGCGGGCGCGGTGGCCGTCGGTGCGGCCGCGGTCGCGTCGAACTCGTACGCGACCGCGTT
CGGTTCGAACTCGACCGCGTCGGGCGCGGGTTCGGTCGCGTTCGCGCAAAACGCGACGGCGTCGGTGACGAACGCGATCG
CGCTCGGCGTCGGGTCGACCGCGAACGTCGCCAATTCGGTCGCGCTCGGCAGCAGCTCGGTGACGAGCAGTGCGCTGACG
TCGACGTCCGGCGGCACCACGTCGGTCAGCAACACGACGATCGGCGGCCAGACCTTCGGCAACTATGCGGGCGCGGCCGC
GGCAGGCGGCGTCGTCAGCGTCGGCCAGCCGAACGCGGAGCGCCGCGTGCAGAACGTCGCCGCGGGCCTCGTCAGCGCGA
CCAGCACGGATGCGATCAACGGCAGCCAGCTCTATGCTGTGGCGAGCACGACGACGTCGAGCATCGCGAGCCTGTCGACC
TCGGCTTCGACGGGGATTTCGTCGGCGAATAGTTCGATTGGGTCGCTGTCGACGGCGACGTCGAGCAGCATCGCTTCGCT
GTCGACTTCGACTTCGACGGGGATCTCGTCGGCGAATAGCTCGATCGGGTCGTTGTCGACGGGTCTCAGTTCGACCAATA
GCTCCGTTACGTCGCTTTCGACTTCGGCTTCGACGGGGATCTCGTCGGCGAATAGCTCGATCGGGTCGCTGTCGACGGGT
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CGATCAAGTCGTTGTCGACGGGGCTGAGTTCGACCAACAGCTCCGTTACGTCGCTGTCCAGCTCCGCTTCGACCGGCATC
TCGTCGGCGAACAGCTCGATTGGCTCGCTGTCGACGGGCCTCAGCTCGACCAACAGCTCCGTCACGTCGCTGTCCACTTC
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ACCAACAGCTCCGTCACGTCGCTGTCCACTTCGGCTTCGACGGGCATCTCGTCGGCAAATAGCTCGATCGGGTCGCTGTC
GACGGGTCTCAGCTCGACCAATAGCTCGGTTACGTCGCTGTCCACCTCGGCATCGACCGGCATCTCGTCGGCGAACAGCT
CGATTGGCTCGCTCTCGACTGCAACGTCGAGCAGCATCTCTTCGCTGTCGACTTCCGCTTCGACGGGTATCTCGTCGGCT
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CCACGTCGGCATCGACTGGCATCTCGTCGGCAAATAGTTCCATCGGCTCGCTGTCGACTGCAACGTCGAGCAGCATCTCT
TCGCTGTCGACTTCCGCTTCGACCGGCCTTTCGTCGGCGAACAGCTCGATCGGGTCGCTGTCGACGGGCCTCAGCTCGAC
CAACAGCTCCGTCACGTCGCTGTCCACGTCGACCTCGACCGGCATCGCGTCGCTGTCGACCTCCACGTCGACCGCAATCG
AAGCGGCGAAAACGCACTACTACAGCGTCAACGACGGCGGTACGCAAAAGGCGAACTACGCCAACGACGGTGCAACGGGC
GTCAACGCGCTGGCCGCGGGCGTCGCGGCGAGCGCCACCGGTGCGAGCAGCGTCGCGGTCGGCGATAGCGCAAACGCGAA
AGCCAACGGTACGGTCGCGATCGGTCAGAACGCGGTCGCGAACAACGTCGGCGACGTCGCGCTCGGCAGCGGCTCCGTGA
CGGCGGCGCCGAACCCGACGCCGACAGGCAGCGTCGGCGGCGTCACCCATACGTTCGCGGGCGGCAACCCGACCAGCGTC
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GTCGACCTCCACCTCGACGGGTTTGTCGTCGGCGAACAGCTCGATCACTTCGTTGTCGACTTCGACCTCGACCGGTCTGT
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CAGCTCGATCACTTCACTCTCGACTTCGACTTCGACGGGTCTGTCGTCCGCTAACAGCTCAATCACGTCCCTGTCGACTT
CGACCTCGACCGGTCTGTCCTCGGCGACCAGCTCGATCACGTCGCTTTCGACGTCGACCTCGACGGGCCTCTCGTCGGCC
AATAGTTCGATCGCTTCGCTCTCGACTTCGACCTCGACAGGCCTGTCATCGGCCAACAGCTCGATCGGTTCTCTGTCGAC
AGGTCTCAGCTCCACCGATAGCTCGGTCGCTTCGCTGTCGACTTCGACTTCGACGGGTCTGTCGTCGGCTAACAGTTCGA
TCGGTTCTCTGTCGACAGGCCTCAGCTCCACCGATAGCTCGGTCGCTTCGCTCTCGACCTCGACTTCGACCGGCCTCTCG
TCGGCGAATAGCTCGATCACGTCCCTGTCGACCTCGACTTCGACGGGTCTGTCGTCGGCTAACAGTTCGATCGGTTCTCT
GTCGACGGGCCTCAGTTCGACCGATAGCTCAGTCGCTTCGCTGTCGACCTCGACTTCGACTGGCCTCTCGTCCGCTAACA
GTTCGATCACTTCGCTGTCGACCTCGACGTCGACGGGTCTGTCGTCGGCTAACAGTGCGATCGGTTCTCTGTCGACCGGC
CTCTCGTCGGCCAACAGCTCGATTACTTCGCTGTCGACGTCGACCTCGACCGGCCTGTCGTCGGCTAACAGCTCGATCGG
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CAAACAGCTCGATCGGATCGCTGTCGACCGGTCTCAGCTCGACCGACAGCTCGGTCGCGTCGCTGTCGACCTCGACTTCG
ACCGGCCTGTCCTCGGCTAACAGTTCGATCACGTCGCTGTCGACCTCGACGTCGACTGGCCTGTCCTCGGCGAACAGCTC
GATCACGTCGTTGTCGACCTCGACTTCGACCGGCCTGTCGTCGGCAAACAGCTCGATCGGCTCTCTGTCGACCGGCCTCA
GCTCGACCGACAGCACGGTCGCTTCGCTGTCGACCTCGACGTCGACCGGCCTCTCGTCGGCGAATAGCTCGATCACGTCC
CTGTCGACCTCGACTTCGACGGGTCTGTCGTCGGCTAACAGTTCGATCGGTTCTCTGTCGACCGGCCTCTCGTCGGCGGA
CAGCTCTATCACGTCGTTGTCGACCTCGACTTCGACCGGCCTGTCGTCGGCAAACAGCTCGATCGCTTCTCTGTCCACCG
GCCTCTCGTCGGCAGACAGCTCTATCACGTCCTTGTCGACCTCGACCTCGACCGGCCTGTCCTCGGCGAACAGTTCGATC
ACGTCGCTGTCGACGTCGACGTCGACCGGCCTTTCGTCGGCCACGAGCTCAATCGGCTCTCTGTCGACGGGCCTTAGCTC
GACCGATAGCTCGGTCGCTTCGCTCTCGACGTCGACCTCTACCGGCCTCTCGTCAGCCACCAGCTCGATCGGCTCTCTGT
CGACGGGCCTCAGCTCGACCGACAGCTCGGTCGCTTCGCTGTCGACCTCGACTTCGACCGGCCTCTCGTCGGCGAATAGC
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AACGCCGCGAGCGGCGACGGCGCGGTCGCGCTCGGCGCAAACAACGCGGCGACCGGCACCGGCGCAGTCGCACTCGGCAA
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ACGCTGAACAACAACACGACGCGCTCGCTCACCACGAACGGCGTTACCGCCGACATGAACGGAACGGGCAACGATCGTCC
GGTCGTCGCGGCCGGCTCGAACTCGGTCGCGATCGGCGCAAATTCGACGGACGGCGGCCGCTCGAACGTCGTGTCGGTCG
GTAACGATACGCAGCAGCGCCAGATCACGAACGTCGCGCCGGGCACGCAAGGCACCGACGCGGTGAACGTGAACCAGCTG
ACGGCCGTGCAGTCGACGCTGTCGACGGCATTGTCGGGCCAGCAGGCGCAGATCAACTCGCTCGGCTCGCAGCTGCAGCA
GACGGACCAGATGGCGAAGCAAGGTATCGCGGCTGTCGGCGCGATGGCGTCGATCCCGCAGCTCGATCGCGACGCCAACT
TCGGCATGGGGATCGGCGCATCGACGTTCCTCGGCCAGAAGGCGATGGCCGTGAACATGCAGGCGCGCATCAGCGAGAAC
CTGAAGGCGTCGATCAACGGCGGCTTCAGCGGCAACCAGAAGGTGATCGGCGCAGGCATGCTGTACCAGTGGAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACTCCGCTCGTCATTTTTGAGATTGGCGCGAGCGCACGGCATATTCGACGACCGAAAAGAGCCAGGTGTGTTGCGTGC
TTATTTGGAGGTAGCAGGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGCGCCGCGCCGCCCGCGCGGTCGGCCAGCGAGGCCGGCCGCGTCGCGGCGGCCGGCTGCACGATGCGCGCGGCACGATC
TGCGGCGCGCTTGTGTCCAT

Product: putative membrane-anchored cell surface protein

Products: NA

Alternate protein names: YadA Domain Protein; Hemagglutinin Family Protein; Hemagluttinin Domain-Containing Protein; Membrane-Anchored Cell Surface Protein; Autotransporter Adhesin; Outer Membrane Protein; Haemagglutinin-Related Autotransporter Protein; Surface-Exposed Protein; Haemagluttinin Family Protein; Hep_Hag Family Protein; Haemagglutinin Family Protein; YadA-Like C-Terminal Region Protein; Haemagluttinin Domain Protein; Hemagglutinin Superfamily; Hep_Hag Family; Hemagglutinin Domain-Containing Protein; Hemagluttinin Motif-Containing Protein; Surface Protein; Surface-Exposed Adhesin Protein; YadA-Like Haemagluttinin; Haemagglutinin; Membrane-Anchored Cell Surface Protein Haemagluttinin; Hemagglutinin; Haemagglutinin And Invasin Like Cell Surface Protein; Intracellular Motility Protein A; Outer Membrane Pathogenesis Protein; Hemagglutinin-Related Protein; Adhesin; YadA-Like C-Terminal Domain-Containing; Extracellular Matrix Protein Adhesin A; Hemagluttinin Family Protein; S-Layer-Like Domain Protein; YadA/Haemagluttinin Like Protein; Hemaglutinin/Autotransporter Like Protein; Hemagluttinin Like Protein; YadA-Like Protein; Hemagluttinin Domain Protein; Outer Membrane Protein Haemagluttinin-Like; AT Family Autotransporter/Adhesin

Number of amino acids: Translated: 2505; Mature: 2505

Protein sequence:

>2505_residues
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Sequences:

>Translated_2505_residues
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Specific function: Controls Colony Form Variation And Autoaggregation. May Function As An Adhesin. [C]

COG id: COG5295

COG function: function code UW; Autotransporter adhesin

Gene ontology:

Cell location: Outer Membrane Associated [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI122937195, Length=434, Percent_Identity=26.4976958525346, Blast_Score=95, Evalue=7e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 232806; Mature: 232806

Theoretical pI: Translated: 4.25; Mature: 4.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
0.4 %Met     (Translated Protein)
0.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
0.4 %Met     (Mature Protein)
0.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRTYRSIWNEALGAWVAASELDAARGKPNKSAVAIAAAVVLTALPALASANTFVPGTTN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
GSQFTVSSCTSSGGNGTVGRTTTGNTNAYASDGSGTYSTVAGCNASGNNNLAATAYGAFA
CCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCEE
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EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHEEECCCCCCCCC
PLSYANSTIASGAGAVAIGSNATKGAQAAASDGIAIGGQSSVASAATSGIAVGRGATVNG
CCHHCCCHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHCCEEECCCCEECC
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CEEEECCCCEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCC
TGTGALAVGANNTSNGQGAVALGNANSASGTGSVAMGNSNTASNSSVAIGSSANATGTNG
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CEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECHHHHHC
NSYATAFGSNSTASGAGSVAFAQNATASVTNAIALGVGSTANVANSVALGSSSVTSSALT
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
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CCEEEEEECCCHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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CHHHHHCCCCCCCCCHHEECCCHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHEECCCHHCCCC
SANSSIGSLSTATSSSISSLSTSASTGISSANSSIKSLSTGLSSTNSSVTSLSSSASTGI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHCCC
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HCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHEECCCHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHEE
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CCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHE
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SLSTSASTGLSSANSSIGSLSTGLSSTNSSVTSLSTSTSTGIASLSTSTSTAIEAAKTHY
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHEE
YSVNDGGTQKANYANDGATGVNALAAGVAASATGASSVAVGDSANAKANGTVAIGQNAVA
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ECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEECCCCCCCCC
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CCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCH
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HHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCC
LSSANSSITSLSTSTSTGLSSATSSITSLSTSTSTGLSSANSSIASLSTSTSTGLSSANS
CCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC
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CHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCC
SANSSITSLSTSTSTGLSSANSSIGSLSTGLSSTDSSVASLSTSTSTGLSSANSSITSLS
CCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEC
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CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHH
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LSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSIGSLSTGLSSTDSTVASLSTSTSTGLSSANSSITS
CCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEE
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ECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCC
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

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Metal ions: NA

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Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA