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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 189184016

GI number: 189184016

Start: 1141655

End: 1143169

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: OTT_1109

Alternate gene names: 189184016

Gene position: 1141655-1143169 (Clockwise)

Preceding gene: 189184013

Following gene: 189184022

Centisome position: 56.83

GC content: 27.85

Gene sequence:

>1515_bases
TTGAGATTATTAAAATCTGGTATCATAGTAGCAATTTTAACCATTTTTTCAAGGATTTCAGGTTTTCTGCGAGAACTTTT
TATTGCTTCATTATTTGGTGTTAGTGAATTATCTGATAGTATTTTTTTTGCTTTAAAGTTTCCTAACTTGATACGTATTG
CTTTAGGAGAAAAGGCATTCTTTTACAATTTTGTGCCGTTTTTTAGCACAAAATTAATAGATTCAAAAAAATCAGCAGAG
CAATTCGCCAGCGGTATTTTTACTATACTTATTATTTTGCTGATTGTACTTGTTATATTTATTCAGCTTATCATGCCGTA
TATTATGTTTGTATTTGTTCCTGGTTTTTATACTGTAGAAAATAAGCTAAAGGTTACAATATTATTATGTAGGATAACTA
TTTTTTATGTTATTTTAGCTTCAATAGTCGTTTTCATTGGAGAAATGTTAAATTCAGTAGGTAAATTTGCAGTTTTAGCA
TTTTCCCCAATTTTATTAAACATACTTATTATAGCCGGTACATATCTTAGCAGTAACTTTGCTTCCTCTAAAGTAGCAAT
TTGCTGTTCGCTAATTATAGCTGGCCTTATACAAGTATTGTTTGTGTATATTAATTTAAAAAAAGCTGGCATTAGATTGT
TTTTTAGGATTGATAGGTCAGATAAAAATATAAAATCTTTTGGTAGCAACTTAGTATATTCAATGTTAAGTTCTGGAGCA
TCGCAAATTAGTAATCTGATTTCTCAGATTATATCTAGTTTTTTTTCAGGAGGAATATCAATTTTATCATATGCAGATAG
AATATATCAGCTACCTTTAGCAATAATAGGAATAAGTCTTAATACAGTTTTACTGCCTGAATTATCAAAATTATATAAAC
AAGGGTTAGTTGATAAAGCTATTATATTACAAAAAAAAACAATCAATATTAGTTGTTTTTTAGCATTACCTGCTGCTGTT
GTAATTGGAATGTTATCGTATCCAATCGCTGAATTAGTTTATCAACATGGAGCTTTTACACAAGAAAATACTCAAAAGAC
ATCGTTAGTAATTGCTATTTCAGCATTTGGATTACCAACGTATATTCTAGCTAAGGTTATAACTCCAGCATTCTATGCAA
ATTGTGATACTAAAACACCTATGAAAATTGCTGTATGTTCATCTTTATTAAATATAACTCTTAGCATATTCTTTGCGCAG
TTTTTTGATTATATTAGCATTGTCTTAAGCAATGCAATATCGCTATTAGCTAATATTATATTTGTATTAATTGCTGCTAA
TAAGTTTAGCTATTACAAGTTTACAAAAGCAACAGCTGTCTTTATTTTAAAGTTATTAGTATCTTGTGTAATTATGGCTA
TAACTATTTATTACTTAAATAATGTTGTATTGTATAATAAAACAACTCTTCTATTTAAGATATTTTCATTGTTAATATGT
ATTGCTGCTGGAGGGTTGGTATACCTTGTATCTTGCTTTGCATTAAGAGTACACCATATTTTATATAAAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTGATATTATGAAGTTGTTTTAATTTTTAAAAATTAAAAATTAAGTTTGCTATTTTAATTTAAATAGTTGTTTATCAAA
TCATAATTCATGGTTGAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTAAGTATAATTTATATAATAGCAAGTGTGGCTACTAATTTTGCTTTGTATATTTTCTCAAAAGCTTTTTGTAAAACT
TATATTCTCCATCAATTGTT

Product: virulence factor MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 504; Mature: 504

Protein sequence:

>504_residues
MRLLKSGIIVAILTIFSRISGFLRELFIASLFGVSELSDSIFFALKFPNLIRIALGEKAFFYNFVPFFSTKLIDSKKSAE
QFASGIFTILIILLIVLVIFIQLIMPYIMFVFVPGFYTVENKLKVTILLCRITIFYVILASIVVFIGEMLNSVGKFAVLA
FSPILLNILIIAGTYLSSNFASSKVAICCSLIIAGLIQVLFVYINLKKAGIRLFFRIDRSDKNIKSFGSNLVYSMLSSGA
SQISNLISQIISSFFSGGISILSYADRIYQLPLAIIGISLNTVLLPELSKLYKQGLVDKAIILQKKTINISCFLALPAAV
VIGMLSYPIAELVYQHGAFTQENTQKTSLVIAISAFGLPTYILAKVITPAFYANCDTKTPMKIAVCSSLLNITLSIFFAQ
FFDYISIVLSNAISLLANIIFVLIAANKFSYYKFTKATAVFILKLLVSCVIMAITIYYLNNVVLYNKTTLLFKIFSLLIC
IAAGGLVYLVSCFALRVHHILYKA

Sequences:

>Translated_504_residues
MRLLKSGIIVAILTIFSRISGFLRELFIASLFGVSELSDSIFFALKFPNLIRIALGEKAFFYNFVPFFSTKLIDSKKSAE
QFASGIFTILIILLIVLVIFIQLIMPYIMFVFVPGFYTVENKLKVTILLCRITIFYVILASIVVFIGEMLNSVGKFAVLA
FSPILLNILIIAGTYLSSNFASSKVAICCSLIIAGLIQVLFVYINLKKAGIRLFFRIDRSDKNIKSFGSNLVYSMLSSGA
SQISNLISQIISSFFSGGISILSYADRIYQLPLAIIGISLNTVLLPELSKLYKQGLVDKAIILQKKTINISCFLALPAAV
VIGMLSYPIAELVYQHGAFTQENTQKTSLVIAISAFGLPTYILAKVITPAFYANCDTKTPMKIAVCSSLLNITLSIFFAQ
FFDYISIVLSNAISLLANIIFVLIAANKFSYYKFTKATAVFILKLLVSCVIMAITIYYLNNVVLYNKTTLLFKIFSLLIC
IAAGGLVYLVSCFALRVHHILYKA
>Mature_504_residues
MRLLKSGIIVAILTIFSRISGFLRELFIASLFGVSELSDSIFFALKFPNLIRIALGEKAFFYNFVPFFSTKLIDSKKSAE
QFASGIFTILIILLIVLVIFIQLIMPYIMFVFVPGFYTVENKLKVTILLCRITIFYVILASIVVFIGEMLNSVGKFAVLA
FSPILLNILIIAGTYLSSNFASSKVAICCSLIIAGLIQVLFVYINLKKAGIRLFFRIDRSDKNIKSFGSNLVYSMLSSGA
SQISNLISQIISSFFSGGISILSYADRIYQLPLAIIGISLNTVLLPELSKLYKQGLVDKAIILQKKTINISCFLALPAAV
VIGMLSYPIAELVYQHGAFTQENTQKTSLVIAISAFGLPTYILAKVITPAFYANCDTKTPMKIAVCSSLLNITLSIFFAQ
FFDYISIVLSNAISLLANIIFVLIAANKFSYYKFTKATAVFILKLLVSCVIMAITIYYLNNVVLYNKTTLLFKIFSLLIC
IAAGGLVYLVSCFALRVHHILYKA

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=413, Percent_Identity=32.9297820823245, Blast_Score=219, Evalue=4e-58,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55771; Mature: 55771

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLLKSGIIVAILTIFSRISGFLRELFIASLFGVSELSDSIFFALKFPNLIRIALGEKAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEECCCHHHHHHCCHHH
FYNFVPFFSTKLIDSKKSAEQFASGIFTILIILLIVLVIFIQLIMPYIMFVFVPGFYTVE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
NKLKVTILLCRITIFYVILASIVVFIGEMLNSVGKFAVLAFSPILLNILIIAGTYLSSNF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ASSKVAICCSLIIAGLIQVLFVYINLKKAGIRLFFRIDRSDKNIKSFGSNLVYSMLSSGA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQISNLISQIISSFFSGGISILSYADRIYQLPLAIIGISLNTVLLPELSKLYKQGLVDKA
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
IILQKKTINISCFLALPAAVVIGMLSYPIAELVYQHGAFTQENTQKTSLVIAISAFGLPT
HHEEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHEEEEEEEHHCCHH
YILAKVITPAFYANCDTKTPMKIAVCSSLLNITLSIFFAQFFDYISIVLSNAISLLANII
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLIAANKFSYYKFTKATAVFILKLLVSCVIMAITIYYLNNVVLYNKTTLLFKIFSLLIC
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECHHHHHHHHHHHHHH
IAAGGLVYLVSCFALRVHHILYKA
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRLLKSGIIVAILTIFSRISGFLRELFIASLFGVSELSDSIFFALKFPNLIRIALGEKAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEECCCHHHHHHCCHHH
FYNFVPFFSTKLIDSKKSAEQFASGIFTILIILLIVLVIFIQLIMPYIMFVFVPGFYTVE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
NKLKVTILLCRITIFYVILASIVVFIGEMLNSVGKFAVLAFSPILLNILIIAGTYLSSNF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ASSKVAICCSLIIAGLIQVLFVYINLKKAGIRLFFRIDRSDKNIKSFGSNLVYSMLSSGA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQISNLISQIISSFFSGGISILSYADRIYQLPLAIIGISLNTVLLPELSKLYKQGLVDKA
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
IILQKKTINISCFLALPAAVVIGMLSYPIAELVYQHGAFTQENTQKTSLVIAISAFGLPT
HHEEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHEEEEEEEHHCCHH
YILAKVITPAFYANCDTKTPMKIAVCSSLLNITLSIFFAQFFDYISIVLSNAISLLANII
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLIAANKFSYYKFTKATAVFILKLLVSCVIMAITIYYLNNVVLYNKTTLLFKIFSLLIC
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECHHHHHHHHHHHHHH
IAAGGLVYLVSCFALRVHHILYKA
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]