Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 189183207

Identifier: 189183207

GI number: 189183207

Start: 310742

End: 312502

Strand: Reverse

Name: 189183207

Synonym: OTT_0300

Alternate gene names: NA

Gene position: 312502-310742 (Counterclockwise)

Preceding gene: 189183208

Following gene: 189183206

Centisome position: 15.56

GC content: 27.03

Gene sequence:

>1761_bases
ATGGTTTTAAAACTGACTAATATAATGATGGTTCTGCTGCTACTAACAGCACACAGAGCTGGTGTTGGCATTATGCCCAA
AAACAAATTACTTACTCCAAAACAAAATGAAGAAATTAGAAAGTATATTGATACTCAAAACGCTAAAAAGGCTCCAATAG
AGCTAAAGAAAAAGTTTGGTACAAATTTACGTGGTTTAAGGTTGATATCATTAGACCTAAGTCATACTGATTTTTCAAAC
GTAGATATTAGCAATGCTCAATTCATAAGAGTAAATTTATCTTACTGCGATCTTACTAATGCAACAGCTAATGGCTCTGT
AATACAGGAATGTAAACTGGAACAATCTATGATGTCTCAGTTTCAAGCTATTAATGCTGATTTTGGAGCATCTAAATTTA
TTAAATCAGAGATTCACAATTCTGATTTTTCTGAGTCAAACTTAGAAGACAGTCGTTTTGATGCATGTAATATACAAAAT
ACAAAATTTGTAAATGTTATAGCTAAATCCATTCATTTTTTAAACAGTACTATTGTTAATTCAAACTTTCAAAGTGCTAG
TATTAGCCTTGGAAAGTTTCATCGTAGTAAACTAATAAACAATAATTTTTTAGGAGCAGATTTAACGCATTCACATTTTT
CTTTTTCTAAAGTTATTGCGAACTACCTTGAATCCAGCGATTTTAATTATAGCACGATTGATAATTCTACTTTTTTTTCT
TCAATTTTATCACATGCTGTTATTGATAATACTAAAATTAACAATTCGAGGTTTAGCCAATCATCTTTAACTAATGTACC
GATATTGTTATCTGTCATAACAAATACAACTTTTGATCACTCCGATCTACAACAAGCATATTTTTCAACAACTACATTAG
ATAAGGTGGTTTTTATTAAAAATCAATTAAATAAAGTAACATTTAGTAAGAGCAACATAAATAATACAGTAATTCATGAA
TGCCAAGCCAACTATGCTATTATTACACAAGGAGCAATTTCTAATACTACTATTAATCAATCGCAGCTAAATAATATAGC
TATTAAGCATAGCGAATCTAGTAAGTTAGTAATTAAAGATTCCTATATGGATGATAGTGAACTTATTAATGTAACTTTTA
AAGAGTCAAACTTTAATAATATTGTTTTAATTAGAACAAGATTTAGAGACAACAAATTTTATCATAGCTATTTAAATTTA
CTAAATTTGCAACAAGCAGCTTTTATTAATAATTTTTTTGACTCAAGCTCATTGAAAAATTCAGTTATGATTGGTGGAAT
AATGAACAATGTTACTCATAAAAATTGTGATTTTAATAAGCTCCAATTAACAAATTGTATTATTCTAAATTCTGATAAAA
TTGAGAATGCAATAACTGCTAACATTGCTTATAGTTTAAACCAAGCATTTAGCTACCAAGATCTATCTTCAATGAATTTT
AGCGAGTTAAAAATATCAGGATATAATTTATCTAATATAAATTTACAAAATAGTATTTTCAGAAGAACTAGCATATCTAA
TACAAGCATTACTGATTCAGACTTTAGCAACTGTAATTTTCATGAAGCAAAAATTAATCAATCAGATTTTAAAAACTCTA
ATTTTACCAATACTAAATTTACATTAGCTAAGATATCAAATTCTAATTTTGATAATGCCAACTTAAATAATACTGACCTA
AATTTAAGTAATATAAAAGATAGCACATTTAATAATACTAATTCAGCGTATAGTACAAATTCTATAGCTAAAGCACTATA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATATATTCTTTTAATGATATATTTTAATGATAGACAGATGATTGTTCTTTAGGTATTTTAAAACACTTAATATCAAAA
AACGTAAATGCATACCGAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAGTTATGTTATATACTTTTCGAATCGAAAATGGTGTCTACGTCATAGTAATATTTGACTCTTCTTAATTTAGCTTAA
AATTATTTTTTCAATAGGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Pentapeptide Repeat Protein; Pentapeptide Repeat Domain Protein; Lipoprotein

Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586

Protein sequence:

>586_residues
MVLKLTNIMMVLLLLTAHRAGVGIMPKNKLLTPKQNEEIRKYIDTQNAKKAPIELKKKFGTNLRGLRLISLDLSHTDFSN
VDISNAQFIRVNLSYCDLTNATANGSVIQECKLEQSMMSQFQAINADFGASKFIKSEIHNSDFSESNLEDSRFDACNIQN
TKFVNVIAKSIHFLNSTIVNSNFQSASISLGKFHRSKLINNNFLGADLTHSHFSFSKVIANYLESSDFNYSTIDNSTFFS
SILSHAVIDNTKINNSRFSQSSLTNVPILLSVITNTTFDHSDLQQAYFSTTTLDKVVFIKNQLNKVTFSKSNINNTVIHE
CQANYAIITQGAISNTTINQSQLNNIAIKHSESSKLVIKDSYMDDSELINVTFKESNFNNIVLIRTRFRDNKFYHSYLNL
LNLQQAAFINNFFDSSSLKNSVMIGGIMNNVTHKNCDFNKLQLTNCIILNSDKIENAITANIAYSLNQAFSYQDLSSMNF
SELKISGYNLSNINLQNSIFRRTSISNTSITDSDFSNCNFHEAKINQSDFKNSNFTNTKFTLAKISNSNFDNANLNNTDL
NLSNIKDSTFNNTNSAYSTNSIAKAL

Sequences:

>Translated_586_residues
MVLKLTNIMMVLLLLTAHRAGVGIMPKNKLLTPKQNEEIRKYIDTQNAKKAPIELKKKFGTNLRGLRLISLDLSHTDFSN
VDISNAQFIRVNLSYCDLTNATANGSVIQECKLEQSMMSQFQAINADFGASKFIKSEIHNSDFSESNLEDSRFDACNIQN
TKFVNVIAKSIHFLNSTIVNSNFQSASISLGKFHRSKLINNNFLGADLTHSHFSFSKVIANYLESSDFNYSTIDNSTFFS
SILSHAVIDNTKINNSRFSQSSLTNVPILLSVITNTTFDHSDLQQAYFSTTTLDKVVFIKNQLNKVTFSKSNINNTVIHE
CQANYAIITQGAISNTTINQSQLNNIAIKHSESSKLVIKDSYMDDSELINVTFKESNFNNIVLIRTRFRDNKFYHSYLNL
LNLQQAAFINNFFDSSSLKNSVMIGGIMNNVTHKNCDFNKLQLTNCIILNSDKIENAITANIAYSLNQAFSYQDLSSMNF
SELKISGYNLSNINLQNSIFRRTSISNTSITDSDFSNCNFHEAKINQSDFKNSNFTNTKFTLAKISNSNFDNANLNNTDL
NLSNIKDSTFNNTNSAYSTNSIAKAL
>Mature_586_residues
MVLKLTNIMMVLLLLTAHRAGVGIMPKNKLLTPKQNEEIRKYIDTQNAKKAPIELKKKFGTNLRGLRLISLDLSHTDFSN
VDISNAQFIRVNLSYCDLTNATANGSVIQECKLEQSMMSQFQAINADFGASKFIKSEIHNSDFSESNLEDSRFDACNIQN
TKFVNVIAKSIHFLNSTIVNSNFQSASISLGKFHRSKLINNNFLGADLTHSHFSFSKVIANYLESSDFNYSTIDNSTFFS
SILSHAVIDNTKINNSRFSQSSLTNVPILLSVITNTTFDHSDLQQAYFSTTTLDKVVFIKNQLNKVTFSKSNINNTVIHE
CQANYAIITQGAISNTTINQSQLNNIAIKHSESSKLVIKDSYMDDSELINVTFKESNFNNIVLIRTRFRDNKFYHSYLNL
LNLQQAAFINNFFDSSSLKNSVMIGGIMNNVTHKNCDFNKLQLTNCIILNSDKIENAITANIAYSLNQAFSYQDLSSMNF
SELKISGYNLSNINLQNSIFRRTSISNTSITDSDFSNCNFHEAKINQSDFKNSNFTNTKFTLAKISNSNFDNANLNNTDL
NLSNIKDSTFNNTNSAYSTNSIAKAL

Specific function: Unknown

COG id: COG1357

COG function: function code S; Uncharacterized low-complexity proteins

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65806; Mature: 65806

Theoretical pI: Translated: 8.77; Mature: 8.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVLKLTNIMMVLLLLTAHRAGVGIMPKNKLLTPKQNEEIRKYIDTQNAKKAPIELKKKFG
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHC
TNLRGLRLISLDLSHTDFSNVDISNAQFIRVNLSYCDLTNATANGSVIQECKLEQSMMSQ
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FQAINADFGASKFIKSEIHNSDFSESNLEDSRFDACNIQNTKFVNVIAKSIHFLNSTIVN
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SNFQSASISLGKFHRSKLINNNFLGADLTHSHFSFSKVIANYLESSDFNYSTIDNSTFFS
CCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHH
SILSHAVIDNTKINNSRFSQSSLTNVPILLSVITNTTFDHSDLQQAYFSTTTLDKVVFIK
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
NQLNKVTFSKSNINNTVIHECQANYAIITQGAISNTTINQSQLNNIAIKHSESSKLVIKD
CCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCEEEEEE
SYMDDSELINVTFKESNFNNIVLIRTRFRDNKFYHSYLNLLNLQQAAFINNFFDSSSLKN
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SVMIGGIMNNVTHKNCDFNKLQLTNCIILNSDKIENAITANIAYSLNQAFSYQDLSSMNF
CEEECHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCHHCCCCC
SELKISGYNLSNINLQNSIFRRTSISNTSITDSDFSNCNFHEAKINQSDFKNSNFTNTKF
CCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCEE
TLAKISNSNFDNANLNNTDLNLSNIKDSTFNNTNSAYSTNSIAKAL
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVLKLTNIMMVLLLLTAHRAGVGIMPKNKLLTPKQNEEIRKYIDTQNAKKAPIELKKKFG
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHC
TNLRGLRLISLDLSHTDFSNVDISNAQFIRVNLSYCDLTNATANGSVIQECKLEQSMMSQ
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FQAINADFGASKFIKSEIHNSDFSESNLEDSRFDACNIQNTKFVNVIAKSIHFLNSTIVN
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SNFQSASISLGKFHRSKLINNNFLGADLTHSHFSFSKVIANYLESSDFNYSTIDNSTFFS
CCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHH
SILSHAVIDNTKINNSRFSQSSLTNVPILLSVITNTTFDHSDLQQAYFSTTTLDKVVFIK
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
NQLNKVTFSKSNINNTVIHECQANYAIITQGAISNTTINQSQLNNIAIKHSESSKLVIKD
CCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCEEEEEE
SYMDDSELINVTFKESNFNNIVLIRTRFRDNKFYHSYLNLLNLQQAAFINNFFDSSSLKN
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SVMIGGIMNNVTHKNCDFNKLQLTNCIILNSDKIENAITANIAYSLNQAFSYQDLSSMNF
CEEECHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCHHCCCCC
SELKISGYNLSNINLQNSIFRRTSISNTSITDSDFSNCNFHEAKINQSDFKNSNFTNTKF
CCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCEE
TLAKISNSNFDNANLNNTDLNLSNIKDSTFNNTNSAYSTNSIAKAL
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA