| Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010793 |
| Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is 189182976
Identifier: 189182976
GI number: 189182976
Start: 72798
End: 73718
Strand: Direct
Name: 189182976
Synonym: OTT_0069
Alternate gene names: NA
Gene position: 72798-73718 (Clockwise)
Preceding gene: 189182970
Following gene: 189182980
Centisome position: 3.62
GC content: 28.45
Gene sequence:
>921_bases ATGGATTTTACTATCAAATCTGATATCAAAATCATCTCTATTATTTTAGCAACATTGAGTGCTTTGTTGTTAAGTATTGC AATGATGTTAGCTAAAAATCTTCCCTCTGATATTTCAACATTACTTATAGTGTTTGTTAAGAGTTGTTGTGGTTTGATTT TATTCATACCATTTTTAGCAAAGCATAAAACACGATCATTAAGTACTAATAAAGGTTATATTCATTTTTTAAGAATTATT TTGTTAGTTGGTGCAATGTTTGCTACTTATTATGCATACCGTAACTTATCGGTAGTGCTAGCTACATCTATTGGCATGAC AGAAGCGTTATTTATTACTATTTTTTCTAAAATTATTTTAAAAGAAACTATTGGACCTTTAAAATGGGGATTAATACTTA TAGGATATTTAGGAGTTACATTAGTAATAATAAAATCACCAATATTATCTGAGTCAATTGATAGCACTTCAAAATTAGCT ATAGTTGCTGCTTTGTTAGCCAATATACTGGCAGCGAATTGTACAATTATTACAAAGATTTTGTCTAAGCATGACTCCAC AATGACCATTCTATTATATAGTTATTTAGGTACTTCTATTGTTTCTTTTTTTTTATTGATATTAAATGTTGATAATTTAT CAACATTTGCTTTATTAAGCACACAAGATATGGCAATCTTATTTGGTGCTGCTATACTAGGAATCAGTTCGCAATTATGC AGTGCTACTGCTATTAAATATTCTACACCTGTACTTATTGCTCCATTTCAATATATCAGAATATTATTTGCTGCATTGAT TGGAGTAATAGTGTTTAAAGAACCATTAACTATATCAACAGCCATAGGCAGTATAATAATTATATTCTCTGCTTATTTAA TTAACGTGGCCCCAAATAATTCTAAAGCTAAAGATTTATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTCTAGTTATAGTAACTTTCTTGAATTCTATTAAGAGTTATACTATATCTTATTTACACACCACTTAATTATAATTA ATTTTTCTGAACTATCAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GATAGCTGTTATAATATTAGTATTCTATGTTAGCTGGTCATAAGATATTTTTTAGCTGCTTAATATGTTTAATGTTATAT ATGTTATAATCTGAATTAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 306; Mature: 306
Protein sequence:
>306_residues MDFTIKSDIKIISIILATLSALLLSIAMMLAKNLPSDISTLLIVFVKSCCGLILFIPFLAKHKTRSLSTNKGYIHFLRII LLVGAMFATYYAYRNLSVVLATSIGMTEALFITIFSKIILKETIGPLKWGLILIGYLGVTLVIIKSPILSESIDSTSKLA IVAALLANILAANCTIITKILSKHDSTMTILLYSYLGTSIVSFFLLILNVDNLSTFALLSTQDMAILFGAAILGISSQLC SATAIKYSTPVLIAPFQYIRILFAALIGVIVFKEPLTISTAIGSIIIIFSAYLINVAPNNSKAKDL
Sequences:
>Translated_306_residues MDFTIKSDIKIISIILATLSALLLSIAMMLAKNLPSDISTLLIVFVKSCCGLILFIPFLAKHKTRSLSTNKGYIHFLRII LLVGAMFATYYAYRNLSVVLATSIGMTEALFITIFSKIILKETIGPLKWGLILIGYLGVTLVIIKSPILSESIDSTSKLA IVAALLANILAANCTIITKILSKHDSTMTILLYSYLGTSIVSFFLLILNVDNLSTFALLSTQDMAILFGAAILGISSQLC SATAIKYSTPVLIAPFQYIRILFAALIGVIVFKEPLTISTAIGSIIIIFSAYLINVAPNNSKAKDL >Mature_306_residues MDFTIKSDIKIISIILATLSALLLSIAMMLAKNLPSDISTLLIVFVKSCCGLILFIPFLAKHKTRSLSTNKGYIHFLRII LLVGAMFATYYAYRNLSVVLATSIGMTEALFITIFSKIILKETIGPLKWGLILIGYLGVTLVIIKSPILSESIDSTSKLA IVAALLANILAANCTIITKILSKHDSTMTILLYSYLGTSIVSFFLLILNVDNLSTFALLSTQDMAILFGAAILGISSQLC SATAIKYSTPVLIAPFQYIRILFAALIGVIVFKEPLTISTAIGSIIIIFSAYLINVAPNNSKAKDL
Specific function: Unknown
COG id: COG0697
COG function: function code GER; Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 33111; Mature: 33111
Theoretical pI: Translated: 9.83; Mature: 9.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDFTIKSDIKIISIILATLSALLLSIAMMLAKNLPSDISTLLIVFVKSCCGLILFIPFLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHKTRSLSTNKGYIHFLRIILLVGAMFATYYAYRNLSVVLATSIGMTEALFITIFSKIIL HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH KETIGPLKWGLILIGYLGVTLVIIKSPILSESIDSTSKLAIVAALLANILAANCTIITKI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSKHDSTMTILLYSYLGTSIVSFFLLILNVDNLSTFALLSTQDMAILFGAAILGISSQLC HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SATAIKYSTPVLIAPFQYIRILFAALIGVIVFKEPLTISTAIGSIIIIFSAYLINVAPNN HHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC SKAKDL CCCCCC >Mature Secondary Structure MDFTIKSDIKIISIILATLSALLLSIAMMLAKNLPSDISTLLIVFVKSCCGLILFIPFLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHKTRSLSTNKGYIHFLRIILLVGAMFATYYAYRNLSVVLATSIGMTEALFITIFSKIIL HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH KETIGPLKWGLILIGYLGVTLVIIKSPILSESIDSTSKLAIVAALLANILAANCTIITKI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSKHDSTMTILLYSYLGTSIVSFFLLILNVDNLSTFALLSTQDMAILFGAAILGISSQLC HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SATAIKYSTPVLIAPFQYIRILFAALIGVIVFKEPLTISTAIGSIIIIFSAYLINVAPNN HHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC SKAKDL CCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA