| Definition | Treponema pallidum subsp. pallidum SS14, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010741 |
| Length | 1,139,457 |
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The map label for this gene is 189025641
Identifier: 189025641
GI number: 189025641
Start: 432893
End: 436147
Strand: Direct
Name: 189025641
Synonym: TPASS_0408
Alternate gene names: NA
Gene position: 432893-436147 (Clockwise)
Preceding gene: 189025640
Following gene: 189025642
Centisome position: 37.99
GC content: 50.35
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1084; Mature: 1084
Protein sequence:
>1084_residues MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAAIELNVKQEQAIASVKKMDHL YDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVAVAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDM QNAFTRENTALLHRVRDGVLADVHKELAVLQTRLEKAQGESQSLFEVSAVKLRELYEGAFSEATVRAQVLEENGFGQLKV QAENRLLQLQEEFEGSLLSLQQHVMQRVEQTDQHIQDCASQWSVRAQTCESDLSIRLADVTACVDESVAQLKEQITTQER EVRAHLEGIEQSLSGAESGLRERVHKSVTSFHENLNKIAEASDAQLQQYRKEMDGRCSKFDRELEGIDVLESQLQLARER TEQKVREEFEAYAQDRERKQLAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA RFSEWSEGIEGRLTQLALESESARKDLEDTYRKELHTRLKDFVEEYKGQCTKLGEQILAIESNVKQHMRANDDLFQRHTE KFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIETEVRDMNVLVQEIKQEAQGGCGSVKRDIEAWKAHTDKQFA DAKQLFEGKIAHLVNLSERAIENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR RESEALHKTVKEARAQVDRTLQETRDLVQDLRAEFGEAQVGLLTKLQGESDRFSQVLQEIERKQHEFIGQTRIFDRADEL RENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGEEAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVEL TLANDDLQRYQVQIRKVKEGLGDISTRYERLDKKGAVLDQTVQDVDRAFENLKELEKTLKNFRGELETVDPQLQRVRAEI AVLLDNQEKAERVRSRIECADALLGEMESRIEKMQHAREWLAGTETRLQEISKVSEGQLRLLGDLMRQDPANKIPGAGAP PLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPDMDSF
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 124034; Mature: 124034
Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IELNVKQEQAIASVKKMDHLYDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVA HEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH VAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDMQNAFTRENTALLHRVRDGVL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ADVHKELAVLQTRLEKAQGESQSLFEVSAVKLRELYEGAFSEATVRAQVLEENGFGQLKV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE QAENRLLQLQEEFEGSLLSLQQHVMQRVEQTDQHIQDCASQWSVRAQTCESDLSIRLADV HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH TACVDESVAQLKEQITTQEREVRAHLEGIEQSLSGAESGLRERVHKSVTSFHENLNKIAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ASDAQLQQYRKEMDGRCSKFDRELEGIDVLESQLQLARERTEQKVREEFEAYAQDRERKQ CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH RFSEWSEGIEGRLTQLALESESARKDLEDTYRKELHTRLKDFVEEYKGQCTKLGEQILAI HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESNVKQHMRANDDLFQRHTEKFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEVRDMNVLVQEIKQEAQGGCGSVKRDIEAWKAHTDKQFADAKQLFEGKIAHLVNLSERA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR HHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHCCCCC RESEALHKTVKEARAQVDRTLQETRDLVQDLRAEFGEAQVGLLTKLQGESDRFSQVLQEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ERKQHEFIGQTRIFDRADELRENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVELTLANDDLQRYQVQIRKVKEG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHH LGDISTRYERLDKKGAVLDQTVQDVDRAFENLKELEKTLKNFRGELETVDPQLQRVRAEI HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHH AVLLDNQEKAERVRSRIECADALLGEMESRIEKMQHAREWLAGTETRLQEISKVSEGQLR HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHH LLGDLMRQDPANKIPGAGAPPLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPD HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC MDSF CCCC >Mature Secondary Structure MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IELNVKQEQAIASVKKMDHLYDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVA HEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH VAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDMQNAFTRENTALLHRVRDGVL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ADVHKELAVLQTRLEKAQGESQSLFEVSAVKLRELYEGAFSEATVRAQVLEENGFGQLKV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE QAENRLLQLQEEFEGSLLSLQQHVMQRVEQTDQHIQDCASQWSVRAQTCESDLSIRLADV HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH TACVDESVAQLKEQITTQEREVRAHLEGIEQSLSGAESGLRERVHKSVTSFHENLNKIAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ASDAQLQQYRKEMDGRCSKFDRELEGIDVLESQLQLARERTEQKVREEFEAYAQDRERKQ CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH RFSEWSEGIEGRLTQLALESESARKDLEDTYRKELHTRLKDFVEEYKGQCTKLGEQILAI HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESNVKQHMRANDDLFQRHTEKFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEVRDMNVLVQEIKQEAQGGCGSVKRDIEAWKAHTDKQFADAKQLFEGKIAHLVNLSERA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR HHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHCCCCC RESEALHKTVKEARAQVDRTLQETRDLVQDLRAEFGEAQVGLLTKLQGESDRFSQVLQEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ERKQHEFIGQTRIFDRADELRENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVELTLANDDLQRYQVQIRKVKEG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHH LGDISTRYERLDKKGAVLDQTVQDVDRAFENLKELEKTLKNFRGELETVDPQLQRVRAEI HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHH AVLLDNQEKAERVRSRIECADALLGEMESRIEKMQHAREWLAGTETRLQEISKVSEGQLR HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHH LLGDLMRQDPANKIPGAGAPPLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPD HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC MDSF CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA