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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 188587458

GI number: 188587458

Start: 3099318

End: 3100928

Strand: Reverse

Name: yjbB [H]

Synonym: Nther_2868

Alternate gene names: 188587458

Gene position: 3100928-3099318 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188587459

Following gene: 188587457

Centisome position: 97.96

GC content: 38.67

Gene sequence:

>1611_bases
GTGGGAACAATTGGAGAGGTATTGGTGGGCCTTTTGGGTGGTTTGGGTCTCTTTATTTATGGCATGCAAATCATGTCTGA
AGGGATGCAAAAGGCTGCGGGAGACAAGCTCAGGAATATACTTGAAGTTCTAACAAAAAACCCTGTCATAGCAATGTTTA
CAGGCGTCATTCTAACTGTACTAGTTCAGAGTAGTAGTACAAGTACAGTCATGATTGTCAGCTTTGTAAATGCAGGCTTA
ATGAGCCTGGGACAGGCTGTTGGAACTATATTTGGAGCAAATATTGGAACGACAATTACCGCCCAGGTAGTTTCTTTTGA
CCTGGGTATGTTTGCTTTACCTGCCATTGCTGTAGGGGTGGCTCTTAATTCTTTTGCAAAGCGACGATTGAAAAAATACG
TGGGAAGATCTATCCTGGGCTTTGGTATCCTTTTTCTAGGATTAACTATGATGAGTGATGCCATGGTGCCCCTAAGAGAA
CAGGAAATGTTTATTAATATGCTGAAACAGTTTGGAGCCTTTCCGGCCTTAGGGGTTCTGGCAGGAGCTATGTTCACTAT
TGCTGTTCAAAGCAGTAGTGCCGCCACAGGTGTAATTATTGCTTTAACATTACAGGATTTGCTCACTTTTGAATCAGGTG
TGGCTTTAATTTTAGGAACCAATATCGGTACTTGCGCTACCACTTTAGTTGCAAGTGTGGGTTCAAATTTAGCTGCCAGG
CGTACAGCTGCTGCGCATATAATTTTTAATACCATTGGAACCTTGTTGATACTAATTATTTTATCACCTTTTTCAGAAAT
TGTACGTATGACAGCAGATACAGTCCCTAGACAGGTGGCAAATGCTCACACAATTTTTAACGTGGGAATGGCCGTTGTTT
TTTTACCTTTTACTAATAAATTTGTCAATTTAGTAATAAAACTTATCCCTGGTGAAGAAACAGGTATCCAGCAGGGAAGT
AAGTATTTGGATAAACGTGTTTTGGCCACCCCAAGTGTGGCCATTTCAAATGCTAGAAAAGAAGTTATTCGTATGGGTAA
GCTAGCTCACGAGATGGTTGATGAAGCTTATGAAAGTTTTTTAGAAAAGGATTTTCGAAAAATGAAGTTAGTAGAGCAAA
AAGAAGATGTGGTAGACCAACTAGAGAAAGAGATTTCAACTTATTTATCGGCTATTTCTTATAGTTCGTTGACTACCAGT
CAAAGTAAACAAGTAACTTCTCTCATGAACGCTATTAACGATATTGAAAGGGTAGGAGACCATAGCGAAAATTTAGTCAA
TCTGACAAAAGCAATTATAGAAGATAATCTTCCGTTTAGTGATACAGCTATCAAAGAACTTTCGGACTTCCACGAAAAAG
TGTCTGGAATGTACCAAAAAGCTATTAATGCCTTTGAAGACGAAGATTACGAAAAAGCAAGAGAAGTTGTTGAATATGAT
GATGTGATTGATGAAATGGAAAAAATATTGAGAAAGCATCACATGATGAGATTGAATGAAAAGCGCTGTCATCCTTCTTC
AGGTGTGGTGTATCTTGATATCTTAAGTAATTTCGAACGAATTGGAGACCATTCAACTAACTTAAGTGAAGCTATCTTTG
GTGATGACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTGTTATCATAAATCAAGATCTTTCCGGTTGCTAAAGTCTGTGTAATAAATTATAATGGCGTAGAGTGATAGTAAACAA
ACTAGCGGGGGGTACCTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTGATTTAGCAAATTACTTTGATTAATTTCTTATTGATTTTATTGGAGTGAGCCCCATGAAAAAAGATGATCATAAA
CTAAAAGAGTACGAGCATAA

Product: Na/Pi-cotransporter II-related protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 536; Mature: 535

Protein sequence:

>536_residues
MGTIGEVLVGLLGGLGLFIYGMQIMSEGMQKAAGDKLRNILEVLTKNPVIAMFTGVILTVLVQSSSTSTVMIVSFVNAGL
MSLGQAVGTIFGANIGTTITAQVVSFDLGMFALPAIAVGVALNSFAKRRLKKYVGRSILGFGILFLGLTMMSDAMVPLRE
QEMFINMLKQFGAFPALGVLAGAMFTIAVQSSSAATGVIIALTLQDLLTFESGVALILGTNIGTCATTLVASVGSNLAAR
RTAAAHIIFNTIGTLLILIILSPFSEIVRMTADTVPRQVANAHTIFNVGMAVVFLPFTNKFVNLVIKLIPGEETGIQQGS
KYLDKRVLATPSVAISNARKEVIRMGKLAHEMVDEAYESFLEKDFRKMKLVEQKEDVVDQLEKEISTYLSAISYSSLTTS
QSKQVTSLMNAINDIERVGDHSENLVNLTKAIIEDNLPFSDTAIKELSDFHEKVSGMYQKAINAFEDEDYEKAREVVEYD
DVIDEMEKILRKHHMMRLNEKRCHPSSGVVYLDILSNFERIGDHSTNLSEAIFGDD

Sequences:

>Translated_536_residues
MGTIGEVLVGLLGGLGLFIYGMQIMSEGMQKAAGDKLRNILEVLTKNPVIAMFTGVILTVLVQSSSTSTVMIVSFVNAGL
MSLGQAVGTIFGANIGTTITAQVVSFDLGMFALPAIAVGVALNSFAKRRLKKYVGRSILGFGILFLGLTMMSDAMVPLRE
QEMFINMLKQFGAFPALGVLAGAMFTIAVQSSSAATGVIIALTLQDLLTFESGVALILGTNIGTCATTLVASVGSNLAAR
RTAAAHIIFNTIGTLLILIILSPFSEIVRMTADTVPRQVANAHTIFNVGMAVVFLPFTNKFVNLVIKLIPGEETGIQQGS
KYLDKRVLATPSVAISNARKEVIRMGKLAHEMVDEAYESFLEKDFRKMKLVEQKEDVVDQLEKEISTYLSAISYSSLTTS
QSKQVTSLMNAINDIERVGDHSENLVNLTKAIIEDNLPFSDTAIKELSDFHEKVSGMYQKAINAFEDEDYEKAREVVEYD
DVIDEMEKILRKHHMMRLNEKRCHPSSGVVYLDILSNFERIGDHSTNLSEAIFGDD
>Mature_535_residues
GTIGEVLVGLLGGLGLFIYGMQIMSEGMQKAAGDKLRNILEVLTKNPVIAMFTGVILTVLVQSSSTSTVMIVSFVNAGLM
SLGQAVGTIFGANIGTTITAQVVSFDLGMFALPAIAVGVALNSFAKRRLKKYVGRSILGFGILFLGLTMMSDAMVPLREQ
EMFINMLKQFGAFPALGVLAGAMFTIAVQSSSAATGVIIALTLQDLLTFESGVALILGTNIGTCATTLVASVGSNLAARR
TAAAHIIFNTIGTLLILIILSPFSEIVRMTADTVPRQVANAHTIFNVGMAVVFLPFTNKFVNLVIKLIPGEETGIQQGSK
YLDKRVLATPSVAISNARKEVIRMGKLAHEMVDEAYESFLEKDFRKMKLVEQKEDVVDQLEKEISTYLSAISYSSLTTSQ
SKQVTSLMNAINDIERVGDHSENLVNLTKAIIEDNLPFSDTAIKELSDFHEKVSGMYQKAINAFEDEDYEKAREVVEYDD
VIDEMEKILRKHHMMRLNEKRCHPSSGVVYLDILSNFERIGDHSTNLSEAIFGDD

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=523, Percent_Identity=25.6214149139579, Blast_Score=159, Evalue=4e-40,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58311; Mature: 58180

Theoretical pI: Translated: 5.35; Mature: 5.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGTIGEVLVGLLGGLGLFIYGMQIMSEGMQKAAGDKLRNILEVLTKNPVIAMFTGVILTV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LVQSSSTSTVMIVSFVNAGLMSLGQAVGTIFGANIGTTITAQVVSFDLGMFALPAIAVGV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALNSFAKRRLKKYVGRSILGFGILFLGLTMMSDAMVPLREQEMFINMLKQFGAFPALGVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
AGAMFTIAVQSSSAATGVIIALTLQDLLTFESGVALILGTNIGTCATTLVASVGSNLAAR
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RTAAAHIIFNTIGTLLILIILSPFSEIVRMTADTVPRQVANAHTIFNVGMAVVFLPFTNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVNLVIKLIPGEETGIQQGSKYLDKRVLATPSVAISNARKEVIRMGKLAHEMVDEAYESF
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEKDFRKMKLVEQKEDVVDQLEKEISTYLSAISYSSLTTSQSKQVTSLMNAINDIERVGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
HSENLVNLTKAIIEDNLPFSDTAIKELSDFHEKVSGMYQKAINAFEDEDYEKAREVVEYD
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
DVIDEMEKILRKHHMMRLNEKRCHPSSGVVYLDILSNFERIGDHSTNLSEAIFGDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
GTIGEVLVGLLGGLGLFIYGMQIMSEGMQKAAGDKLRNILEVLTKNPVIAMFTGVILTV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LVQSSSTSTVMIVSFVNAGLMSLGQAVGTIFGANIGTTITAQVVSFDLGMFALPAIAVGV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALNSFAKRRLKKYVGRSILGFGILFLGLTMMSDAMVPLREQEMFINMLKQFGAFPALGVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
AGAMFTIAVQSSSAATGVIIALTLQDLLTFESGVALILGTNIGTCATTLVASVGSNLAAR
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RTAAAHIIFNTIGTLLILIILSPFSEIVRMTADTVPRQVANAHTIFNVGMAVVFLPFTNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVNLVIKLIPGEETGIQQGSKYLDKRVLATPSVAISNARKEVIRMGKLAHEMVDEAYESF
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEKDFRKMKLVEQKEDVVDQLEKEISTYLSAISYSSLTTSQSKQVTSLMNAINDIERVGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
HSENLVNLTKAIIEDNLPFSDTAIKELSDFHEKVSGMYQKAINAFEDEDYEKAREVVEYD
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
DVIDEMEKILRKHHMMRLNEKRCHPSSGVVYLDILSNFERIGDHSTNLSEAIFGDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]