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The map label for this gene is 188587107

Identifier: 188587107

GI number: 188587107

Start: 2694292

End: 2696646

Strand: Reverse

Name: 188587107

Synonym: Nther_2501

Alternate gene names: NA

Gene position: 2696646-2694292 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188587108

Following gene: 188587106

Centisome position: 85.19

GC content: 38.77

Gene sequence:

>2355_bases
ATGGGACCTAAAAAAACCTTAGCTAATGATAAAAATAACATTGCCTTATATATTTTATTATTTGTTACTGCCATTTTGCT
AGTATATCCCCCATTTTACCGGGGATTATTTTTTGATATGGAGCTACTTTTTTATAATGTTCTGAGCTTTCTCTTTTTTG
GGATTTTCTTAGTCTATAATTTAGCCACTAGAAAAGAAAAACTATTACAATCTCCAGTTGATTTTATATTATTGGCTTTT
TGTTTTATTTATCTCATCAATATTTTTGGAGCAGTAACACCTAGAGAGGCAGTTCTGGAATTGTTTAAAGTAGCCAATTA
TTTTATGATTTATTTAATTGTTTCTCGGCTTCCCACACAAAAAACTATCCAGTGGTTAATGTATGCTTTAGTAGTAGCTG
CCGTTGGAGTATCCTTTGTAGGACTTGGAGCGGGTTTTGAGACTTTTGAATATCCCGGGGCCATGGGAAGGTGGGGTAGA
AGAATTTTTACCAGCCTTCAATACCCCAATACTGCTGCCTCCTTTTTAACAGCCGGTTTTTTTGTAGCTTTATCACGAGT
AATGGATGAAAAACAATCCTTTATAAAATCAATCTTCGGTGGAGCGGCTCATTTCATTCTCATAACCTTTGTATTTACCA
TGTCTCGGGGAGCATGGTTGTTTTTCCCTGTAGTTTTATTACTGTTTTGGGTTCTAAATTTCAGAAGGTTTATTAATGCT
TTTATATATGCACTGATTCCGGGGATCGTTTTTTTAATCACTGCTATTCCTATATGGGATGCTATCCAGGAAGATGTGGC
AGTTGGATGGTTGTATGTGGTTTTAGGTACTCTGGCTTCTATGGCTTTAACCTTTGTCTTTTCCTATTTCTTTGAGGGGA
TTGGCAAGTTAAACAATAAATCGGTTCACTACGGTTTTATTGGTATTTTAGCAGTTATAATTTTAAGTGTTTCCATATAT
GGTGCCACAAATTATGAAAAAGCTATGGATTACATGCCCGAACAAGTACAAAGCAGGGTAGAGGCCATAGACTTTCGAGA
AACAGGTCTTGGCACAAGAGGGGAACTCATGGAAACGGCCTGGGCCATGATAAAGGACAGTCCTATACTTGGTGCCGGTG
GAGGGGGATGGGAACCCCTTTATCACAGATATATGGAACGGGATTACTGGGCTACGGAAGTTCACAGTCATATCTTTCAA
GTTGGTGTGGAAACAGGTATTCCCGGTATGTTGATCTTTAGTGCCATCTGGGTTGGCCTTATATATCAGTTTTACATGAT
ATGGAGAAAGAAACCGGAAAACTACTATCCTGCCAGTGGGATATTTGTAGCTGCTTTTGCCCTGGGTGGACACAGCATGA
TTGATTTTAACCTGTCTCTTCCGGCAGTGGCAGTTTATCTCTGGGCTTTATTCGGCTTATTGACTTTTTATTACAATGAT
GCGGTTGGAAACAGAGTAGGGGATATAGATGAAAGTGTTTCTAAGAAAACAGCTTCCAAGAAAAAGCCCAAAAAATCAAG
GAAAAAACAGGGGATATTCTCCGGTGAGACCAGGCTGGAAGTGGTTAATAATATTGCACCCTATGTGATGCTCTTAGTTA
CAGCTATTATGTTGTTTTATTCCACCATGGTGTATTTCGGATACCGAGATGGTAGGCACGGTGCTGCAGCTTTACAGGAA
GGTGAACTAGATGTAGCCATATCAAGTTTAGAAAGGGCTATTACTAGAGATACCTTGAATTCTGATTTTCACTTTGATTT
AGCAATGGTCTATGAAGGAATGTATCAACATACCGGGGAGATGCAATATCTTGAAAAAGCTGTAGAAACCGCTGAACAAG
GTTATGAACTCAATCCTGAATCAGGAGCTGTTCACAGAGAACTTGGTGAGCTGTTAATCAGAGCAAATCAAATAGATAGA
GGTCTGGAACTTTTAGAGAGAGGTACTCAAGTCCAGCCCTATTACAAAGATGGGTACTTGCTATATGCTGAAGCTCTTTT
GAATCTAGGAGAAAACAGCTTACAGGATGGTAATGTGGAAGAAGGAACGGACTATTTAGAAGAAGTGATAGAGTTTAGAG
ATGTATTCTTAGAGCACAAAGATCAAACAGATGAATTTGATAGCTTTATCTTTAAAGCTTATGTGCTTTTAGAAGAATAT
GAAAGAGCTCTAGATTTCAAAGAGTATATTGAATTGTCCAGGTCAGGGGACAAACTTCCCTACATGGCGATAATGTATCA
TGAGCTAGAAGATGACGAGAGCTATGAAGAAGTCAGAGCGGAAATGGAAGAGGATGAGGATGACCATGAAGAGTATCAAG
AACAATACCAGGAGTTGCAAGAGCTTTTAGACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTATCCTGTTACAGTAGTAGGAGGCCTGGCTTTAGTTTCTAGCTTATTGATATATTCTTCTTATAGAGTTATTCAGG
CGTCTTAGGTGGTGAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTACCACCCAAAATGTGGCCTAAATGGAAGGAAAATCCCGATGCGTGTTGAATAGATGTATGGAAACCAATTTAAACCA
AACAAGAAAGGTGTAGTGCG

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein; O-Antigen Biosynthesis-Related Protein

Number of amino acids: Translated: 784; Mature: 783

Protein sequence:

>784_residues
MGPKKTLANDKNNIALYILLFVTAILLVYPPFYRGLFFDMELLFYNVLSFLFFGIFLVYNLATRKEKLLQSPVDFILLAF
CFIYLINIFGAVTPREAVLELFKVANYFMIYLIVSRLPTQKTIQWLMYALVVAAVGVSFVGLGAGFETFEYPGAMGRWGR
RIFTSLQYPNTAASFLTAGFFVALSRVMDEKQSFIKSIFGGAAHFILITFVFTMSRGAWLFFPVVLLLFWVLNFRRFINA
FIYALIPGIVFLITAIPIWDAIQEDVAVGWLYVVLGTLASMALTFVFSYFFEGIGKLNNKSVHYGFIGILAVIILSVSIY
GATNYEKAMDYMPEQVQSRVEAIDFRETGLGTRGELMETAWAMIKDSPILGAGGGGWEPLYHRYMERDYWATEVHSHIFQ
VGVETGIPGMLIFSAIWVGLIYQFYMIWRKKPENYYPASGIFVAAFALGGHSMIDFNLSLPAVAVYLWALFGLLTFYYND
AVGNRVGDIDESVSKKTASKKKPKKSRKKQGIFSGETRLEVVNNIAPYVMLLVTAIMLFYSTMVYFGYRDGRHGAAALQE
GELDVAISSLERAITRDTLNSDFHFDLAMVYEGMYQHTGEMQYLEKAVETAEQGYELNPESGAVHRELGELLIRANQIDR
GLELLERGTQVQPYYKDGYLLYAEALLNLGENSLQDGNVEEGTDYLEEVIEFRDVFLEHKDQTDEFDSFIFKAYVLLEEY
ERALDFKEYIELSRSGDKLPYMAIMYHELEDDESYEEVRAEMEEDEDDHEEYQEQYQELQELLD

Sequences:

>Translated_784_residues
MGPKKTLANDKNNIALYILLFVTAILLVYPPFYRGLFFDMELLFYNVLSFLFFGIFLVYNLATRKEKLLQSPVDFILLAF
CFIYLINIFGAVTPREAVLELFKVANYFMIYLIVSRLPTQKTIQWLMYALVVAAVGVSFVGLGAGFETFEYPGAMGRWGR
RIFTSLQYPNTAASFLTAGFFVALSRVMDEKQSFIKSIFGGAAHFILITFVFTMSRGAWLFFPVVLLLFWVLNFRRFINA
FIYALIPGIVFLITAIPIWDAIQEDVAVGWLYVVLGTLASMALTFVFSYFFEGIGKLNNKSVHYGFIGILAVIILSVSIY
GATNYEKAMDYMPEQVQSRVEAIDFRETGLGTRGELMETAWAMIKDSPILGAGGGGWEPLYHRYMERDYWATEVHSHIFQ
VGVETGIPGMLIFSAIWVGLIYQFYMIWRKKPENYYPASGIFVAAFALGGHSMIDFNLSLPAVAVYLWALFGLLTFYYND
AVGNRVGDIDESVSKKTASKKKPKKSRKKQGIFSGETRLEVVNNIAPYVMLLVTAIMLFYSTMVYFGYRDGRHGAAALQE
GELDVAISSLERAITRDTLNSDFHFDLAMVYEGMYQHTGEMQYLEKAVETAEQGYELNPESGAVHRELGELLIRANQIDR
GLELLERGTQVQPYYKDGYLLYAEALLNLGENSLQDGNVEEGTDYLEEVIEFRDVFLEHKDQTDEFDSFIFKAYVLLEEY
ERALDFKEYIELSRSGDKLPYMAIMYHELEDDESYEEVRAEMEEDEDDHEEYQEQYQELQELLD
>Mature_783_residues
GPKKTLANDKNNIALYILLFVTAILLVYPPFYRGLFFDMELLFYNVLSFLFFGIFLVYNLATRKEKLLQSPVDFILLAFC
FIYLINIFGAVTPREAVLELFKVANYFMIYLIVSRLPTQKTIQWLMYALVVAAVGVSFVGLGAGFETFEYPGAMGRWGRR
IFTSLQYPNTAASFLTAGFFVALSRVMDEKQSFIKSIFGGAAHFILITFVFTMSRGAWLFFPVVLLLFWVLNFRRFINAF
IYALIPGIVFLITAIPIWDAIQEDVAVGWLYVVLGTLASMALTFVFSYFFEGIGKLNNKSVHYGFIGILAVIILSVSIYG
ATNYEKAMDYMPEQVQSRVEAIDFRETGLGTRGELMETAWAMIKDSPILGAGGGGWEPLYHRYMERDYWATEVHSHIFQV
GVETGIPGMLIFSAIWVGLIYQFYMIWRKKPENYYPASGIFVAAFALGGHSMIDFNLSLPAVAVYLWALFGLLTFYYNDA
VGNRVGDIDESVSKKTASKKKPKKSRKKQGIFSGETRLEVVNNIAPYVMLLVTAIMLFYSTMVYFGYRDGRHGAAALQEG
ELDVAISSLERAITRDTLNSDFHFDLAMVYEGMYQHTGEMQYLEKAVETAEQGYELNPESGAVHRELGELLIRANQIDRG
LELLERGTQVQPYYKDGYLLYAEALLNLGENSLQDGNVEEGTDYLEEVIEFRDVFLEHKDQTDEFDSFIFKAYVLLEEYE
RALDFKEYIELSRSGDKLPYMAIMYHELEDDESYEEVRAEMEEDEDDHEEYQEQYQELQELLD

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89659; Mature: 89528

Theoretical pI: Translated: 4.51; Mature: 4.51

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHC
>Mature Secondary Structure 
GPKKTLANDKNNIALYILLFVTAILLVYPPFYRGLFFDMELLFYNVLSFLFFGIFLVYN
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LATRKEKLLQSPVDFILLAFCFIYLINIFGAVTPREAVLELFKVANYFMIYLIVSRLPTQ
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KTIQWLMYALVVAAVGVSFVGLGAGFETFEYPGAMGRWGRRIFTSLQYPNTAASFLTAGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
FVALSRVMDEKQSFIKSIFGGAAHFILITFVFTMSRGAWLFFPVVLLLFWVLNFRRFINA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIYALIPGIVFLITAIPIWDAIQEDVAVGWLYVVLGTLASMALTFVFSYFFEGIGKLNNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SVHYGFIGILAVIILSVSIYGATNYEKAMDYMPEQVQSRVEAIDFRETGLGTRGELMETA
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WAMIKDSPILGAGGGGWEPLYHRYMERDYWATEVHSHIFQVGVETGIPGMLIFSAIWVGL
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IYQFYMIWRKKPENYYPASGIFVAAFALGGHSMIDFNLSLPAVAVYLWALFGLLTFYYND
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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STMVYFGYRDGRHGAAALQEGELDVAISSLERAITRDTLNSDFHFDLAMVYEGMYQHTGE
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MQYLEKAVETAEQGYELNPESGAVHRELGELLIRANQIDRGLELLERGTQVQPYYKDGYL
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LYAEALLNLGENSLQDGNVEEGTDYLEEVIEFRDVFLEHKDQTDEFDSFIFKAYVLLEEY
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HHHHCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
ELLD
HHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA