| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 188586963
GI number: 188586963
Start: 2506780
End: 2508324
Strand: Reverse
Name: mviN [H]
Synonym: Nther_2355
Alternate gene names: 188586963
Gene position: 2508324-2506780 (Counterclockwise)
Preceding gene: 188586964
Following gene: 188586962
Centisome position: 79.24
GC content: 39.61
Gene sequence:
>1545_bases TTGACATTAAATCGAGGCCAAGCTATAAAAGCAGCCGGTGCTATGACTATAGTATCATTACTGAGTAAGGTGTTTGGATT TCTCAGGGAAATGGCCCTGGCCAGAGAATTTGGAGCCACTTTTGAAACTGATGCTTTTTTAATTGCCATTATGATACCGC AGATACTATTTGCTTCCCTGGGAGCATCCATTGCTACGACATTTATACCACTCTATACTGAAGCCAGGTTAGACAACAAA CATGAAGTGAACTCCTTTGTCAGTACTTTTTTCAAAATTATGGTGGGTTTAAGCAGTATCATTGTAACTGTGGCCCTGCT TTTTACTCCTCAGCTAATTTCCGTAATCAGTCCTGGTTTTACAGGGGAAGTGCGTGAATTATCTATTCTGCTAACTAGAA TCATGCTTCCTGTAATAGTCTTTTTAGCTGCTGGTGGTGTCTTAAAGGGGATTTTACATTCACATAATGAATTCTTGATT CCCGTGTCCGTAGGTGTATTTCAAAATGTGATTATTATAGCCTTTATCTTGATATTAGGTCCAACTTACGGGATAGAAAT GGTAACAGTGGGCAGTTTAATCGGTTTTTCCATGAACTTTTTTATCTTGTATCCGAAAGCTCGCAAATTAAAAGTGCCTT TAATTGATAAACTGAAACCTTTTCATCCCCTGGTTAAGCGAAGTTTTTACTTAATGCTTCCCATCCTTTTTGGTAATATG GTTCTTCAGTTAAATAAGTTGGTAGATAGAATGCTGGCTTCTAACTTGGAAGAGGGTAGTATATCTGCTTTAAACTATGC ATCTAAGATATTTACATTACCTCACGGAATTTTTGTCATGGCAGTGGCAACTGTACTGTATCCATCTTTCAGCCAGTTTG CTGCCAAGGGTAATGTAAACAGGGTTAAAGAAACCATGGTAAGCGGTTTATCCAGTCTTGTCTTTTTAATTCTACCTATG ATGATAGGTGCCCTGGTTTTAAGAGAGCCAATTATCAGGGTGTTATTTGAACGGGGAGAATTTGATGCAACAGCGACGGA GCGCACAGCCTTTGCTTTGTTTTTTTACTCTCTGGGAATGCTTTCAATATCATTAAGGGAAATTATCAATCGGGTGTTTT ACTCTTATCAAGATACAAAAACTCCTATCAGGATTGCTACTATCTCGGTTTTTATCAATATCGGATTGAATTTTCTCTTA GTCGGCCCTTTGGGGCACGGAGGACTGGCCTTTGCTACCAGTATATCCATGACCATCGGAGTAGTTTTATTATTTATTAG TGTCCGGCGCTTCCTAGGACCCTTTGGTTTAAGGTCATTTACAGTAAATGGGCTCAAAATGTTACTGGCCGCGGGAACCA TGGGAACTATTCTCTACGGAGTCAATTTAATTTTACCGGAAGGTACAGCAGCTATCTGGAGGCTTGTGATACCGACTATC TTTGGTGGCTCTGCTTATTTAGCGATCTGTAGGGCATTGCAAGTCGAAGAAATGGATATAGCCAAAGATATGTTGATAAA AGCTCTCAACCGATTCCGAAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAAGTTTTATAATAAATTTTATGGCTAATTTCTGTTAACTGAGCAGTTAATATGGTAAGCTATAAGTGTTGCAGTTTA ATCGGGGAGAGTGAGATGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CATTGATAAACATGATGGACATAATTAGAAATAAATGAACATAATTAGACAACACCGATGAATGATTCGAATAAGATAAG GACTTTTAATTTATAGAAAA
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 513
Protein sequence:
>514_residues MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNK HEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLI PVSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPM MIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLL VGPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK
Sequences:
>Translated_514_residues MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNK HEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLI PVSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPM MIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLL VGPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK >Mature_513_residues TLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNKH EVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIP VSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNMV LQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPMM IGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLV GPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTIF GGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=514, Percent_Identity=27.6264591439689, Blast_Score=181, Evalue=1e-46,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56410; Mature: 56279
Theoretical pI: Translated: 10.45; Mature: 10.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GASIATTFIPLYTEARLDNKHEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGF CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIPVSVGVFQNVIIIAFILILG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC PTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM CCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH RVKETMVSGLSSLVFLILPMMIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLVGPLGHGGLAFATSISMTIG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH VVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHH FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GASIATTFIPLYTEARLDNKHEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGF CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIPVSVGVFQNVIIIAFILILG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC PTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM CCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH RVKETMVSGLSSLVFLILPMMIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLVGPLGHGGLAFATSISMTIG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH VVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHH FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8200538; 11677609 [H]