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The map label for this gene is nrfI [H]

Identifier: 188527857

GI number: 188527857

Start: 1089900

End: 1092710

Strand: Reverse

Name: nrfI [H]

Synonym: HPSH_05525

Alternate gene names: 188527857

Gene position: 1092710-1089900 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188527858

Following gene: 188527856

Centisome position: 67.93

GC content: 40.34

Gene sequence:

>2811_bases
ATGAAAAGCCTTAAGAGCTTGGTTTATTTTTTGTTCGGTTCTTTTTGGGTCGCTATCCCTTTAATGGCGCTCTATGCATT
AGCGTGCACGATAGCCACTTTTATAGAAAACGATTATGGAACGAGTGCGAGTAAGGCGATTGTGTATAACACCCCTTGGT
TTAATTTCTTGCATGCGTATTTACTGGTGGTTTTAATAGGCACATTCATCAATTCCAAAGCCTTAGAGCGCAAAAGATAC
GCAAGCCTTTTTTTCCACAGCTCCTTGATTTTAATCATTTTAGGGGCAGCCATCACGCGATTTTTTGGCGCAGAAGGGCT
TATGCATGTGCGAGAAAATAGCGCGCAAAGCTCTTTTGAAAGCGCGGACACTTACCTTAATATCACTCTTAATGACACCA
CTAAACTTTCTTTAAAAACGCCTTTAACCTTTTATTATTCCAAACGATTAAGGCCCATTCATGCCACTTTAGATCACAAA
CCTTTAATTTTAGAACCCTTAGAAATTTACAAGCAAAACGCCATTAAAAAAGATGATGCTGCTATTTTAGTGTTAAAAGC
GACTTATAACGGCGTGAGCCACAAATTCAACCTCATCAAAACCAACAGGAATGAAGGCATAGAAGAAAGCGAAATGTTTA
AAGACGACAAACTCTCTTTGAGTTTTGGATCCGCTTACATTGAATTGCCCTTTCAAATCAAACTGAAGCGTTTTGAATTA
GAGCGCTACGCTGGCTCTATGAGCCCTTCATCTTACGCTTCAGAAGTGGAAGTTTTGAAATTGGATAACACTTTGATCAA
ACCTTATAGGATCTTTATGAACCATGTTTTAGATTATGAAGGCTATCGCTTTTTCCAATCTTCCTATGACACGGATGAAA
AAGGCACGATCCTTTCTGTCAATAAAGACCCGGGTAAAATCCCCACTTATTTAGGGTATGCGATGCTTATTTTGGGGGCT
TTGTGGTTGCTTTTGGATAAGAACGGGCGTTTTTTAAAGCTTTCACGCTTTTTAAAATCCCAACAAATCGCTAGTTTCTT
GCTCGCTTTAATTTTAATCAGCCCTTTCACTTCTTCGTTCGCTAGTGAGACTCCAATTGACATGCATGGGGGCAAAAGCG
CTCAAATAGAACGACAAAATGTAGAAAATCCCGCTAATAAAGAGGATTCTAAAAGCGCGATTTTAGAGCGTTTGAAGCAT
TTAAGAGAGTATTCCAAAGACCACTTAAAAGCCTTTCAAAGGCTTCAAGTCCAGGATTTTGACGGGCGTATCAAACCCCT
TGATACCATTAGCATTGAATATATCCATAAGATTTTAAGGAAAGATGATTTTCAAGGGCTAAACGCCATGCAAACGCTTT
TAGGAATCATGTTTTTCCCCAATGATTGGCGCAGTATTAAGATGATTCACACTTCTAATAAAGCCTTAAGAAAGCTTATC
GGCACGCCTTTAGATGAAAGCCGTATCGCTTTTAGAGATGTGTTTGATAGCCGTGGGTATAAATTAAAAAATCTTGTTGA
AGAAGTCAATCAAAAATCCCCCAATGCGCGCAACGAGTTGGATAAAGATGTCTTAAAAGTAGATGAACGAATCAACTTGG
TCTATACGCTTTTTAGCGCTCAATTTTTACGCATTTTCCCTAGCGATAAAACCACCGCTTGGCTCTCGCCCATTGAAGCG
ATCAACAGCCCTAATAAAGAAATTTCAAGCGTGGCAACGGAGTTTTTAAAAAATATTTTTAACGGGTTTGATGACGCTTT
AAAAACCAATCAATGGGATAAAGTAGAAAAAACCCTAAAAGATTTAAGCATTTACCAACAAGAGCATGCCAAAAACCTCT
ATTTACCCTCTTCTAAAGTGGATTCTGAAATTTTTTTAAACCACACCAATTTTTTTAACAGCCTGACTTTGCCTTATGTC
CTTCTAGGGTTATTGCTTTTTATCGTTGTGATCAGCTCTCTTGTTAAAAACACGATTCCAAATATCTGGCTCACTAAAAT
CCTTTATATTGCTATCTTGCTTTGCGCGCTCGCTCATTCTATGGGGCTTGTTTTGCGCTGGTATGTGAGCGGGCATTCGC
CTTGGAGCAACGCTTATGAGTCCATGCTTTATATCGCATGGGCTTCTGTTATCGCAGGGTTTGTTTTACGCTCCAAGCTC
GCGCTATCGGCCTCTAGCTTTTTAGCCGGTATCGCGCTCTTTGTGGCCCATCTAGGCTTTATGGACCCTCAAATTGGCCA
TTTAGTGCCGGTGTTAAAATCCTATTGGCTCAATATCCATGTTTCTGTCATCACCGCTAGTTATGGCTTTTTGGGCTTGT
GTTTTGTGCTAGGGATTTTGAGTTTGGTTTTGTTTATTTTGCGCAAACAAGGGCGTTTCAATTTGGACAAAACCATTCTC
TCCATTAGCGCTATCAATGAAATGAGCATGATTTTAGGCCTGTTCATGCTCACAGCCGGGAATTTCTTAGGCGGGGTGTG
GGCGAATGAATCTTGGGGGCGCTATTGGGGGTGGGACCCTAAAGAAACTTGGGCGTTGATTTCTATTTGCGTCTATGCTT
TAATCTTGCATTTGCGTTTTCTAGGCTCTCAAAATTGGCCCTTTATTTTAGCGAGCAGTAGCGTTCTAGGGTTTTATTCG
GTTTTAATGACTTATTTTGGCGTGAATTACTACCTTTCTGGCTTGCACAGCTATGCCGCAGGCGATCCCTTGCCTATCCC
CACTTTCTTATACTTTTTGGTAGCGATACCTTTTGCTCTTGTGATCTTGGCGTCTTTCAAACGCCATTTGAGTTTGCCTA
AATTAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAGACACAAAAAACGATGAGGATTTCACCAAAAAATTAAAGGCTTACATCAAGTATAAAACCAACCTTTCTAAAAAC
AAATCCAGCTAGGAAAACGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGATAAGAATGTTCCAACCCCTATTAGATGCTTATACAGACAGCACCCATTTAGATGAAACAACCCATAAGCCCCCAAT
TAATATAGCCCTAGCCAATT

Product: cytochrome c-type biogenesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 936; Mature: 936

Protein sequence:

>936_residues
MKSLKSLVYFLFGSFWVAIPLMALYALACTIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALERKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGAEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYYSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDAAILVLKATYNGVSHKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQIASFLLALILISPFTSSFASETPIDMHGGKSAQIERQNVENPANKEDSKSAILERLKH
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILRKDDFQGLNAMQTLLGIMFFPNDWRSIKMIHTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATEFLKNIFNGFDDALKTNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYV
LLGLLLFIVVISSLVKNTIPNIWLTKILYIAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILASFKRHLSLPKLV

Sequences:

>Translated_936_residues
MKSLKSLVYFLFGSFWVAIPLMALYALACTIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALERKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGAEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYYSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDAAILVLKATYNGVSHKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQIASFLLALILISPFTSSFASETPIDMHGGKSAQIERQNVENPANKEDSKSAILERLKH
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILRKDDFQGLNAMQTLLGIMFFPNDWRSIKMIHTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATEFLKNIFNGFDDALKTNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYV
LLGLLLFIVVISSLVKNTIPNIWLTKILYIAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILASFKRHLSLPKLV
>Mature_936_residues
MKSLKSLVYFLFGSFWVAIPLMALYALACTIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALERKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGAEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYYSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDAAILVLKATYNGVSHKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQIASFLLALILISPFTSSFASETPIDMHGGKSAQIERQNVENPANKEDSKSAILERLKH
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILRKDDFQGLNAMQTLLGIMFFPNDWRSIKMIHTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATEFLKNIFNGFDDALKTNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYV
LLGLLLFIVVISSLVKNTIPNIWLTKILYIAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILASFKRHLSLPKLV

Specific function: May play a role in cytochrome c biogenesis and may be required for maturation of the NrfA protein [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR007816 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm; PF05140 ResB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106295; Mature: 106295

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSLKSLVYFLFGSFWVAIPLMALYALACTIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH
LLVVLIGTFINSKALERKRYASLFFHSSLILIILGAAITRFFGAEGLMHVRENSAQSSFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHH
SADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYYSKRLRPIHATLDHKPLILEPLEIYKQNAIKKDDA
CCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCC
AILVLKATYNGVSHKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
EEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCEEEECCEEEECCCEEEHHHHHH
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSV
HHHHCCCCCCHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
NKDPGKIPTYLGYAMLILGALWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQIASFLLALILISPFTSSF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASETPIDMHGGKSAQIERQNVENPANKEDSKSAILERLKHLREYSKDHLKAFQRLQVQDF
CCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCC
DGRIKPLDTISIEYIHKILRKDDFQGLNAMQTLLGIMFFPNDWRSIKMIHTSNKALRKLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSA
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLRIFPSDKTTAWLSPIEAINSPNKEISSVATEFLKNIFNGFDDALKTNQWDKVEKTLK
HHHHCCCCCCCHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
DLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYVLLGLLLFIVVISSLVKNTIP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NIWLTKILYIAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVLFILRKQGRFNLDKTILSISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDP
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCH
KETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYSVLMTYFGVNYYLSGLHSYAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILASFKRHLSLPKLV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSLKSLVYFLFGSFWVAIPLMALYALACTIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH
LLVVLIGTFINSKALERKRYASLFFHSSLILIILGAAITRFFGAEGLMHVRENSAQSSFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHH
SADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYYSKRLRPIHATLDHKPLILEPLEIYKQNAIKKDDA
CCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCC
AILVLKATYNGVSHKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
EEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCEEEECCEEEECCCEEEHHHHHH
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSV
HHHHCCCCCCHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
NKDPGKIPTYLGYAMLILGALWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQIASFLLALILISPFTSSF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASETPIDMHGGKSAQIERQNVENPANKEDSKSAILERLKHLREYSKDHLKAFQRLQVQDF
CCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCC
DGRIKPLDTISIEYIHKILRKDDFQGLNAMQTLLGIMFFPNDWRSIKMIHTSNKALRKLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSA
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLRIFPSDKTTAWLSPIEAINSPNKEISSVATEFLKNIFNGFDDALKTNQWDKVEKTLK
HHHHCCCCCCCHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
DLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYVLLGLLLFIVVISSLVKNTIP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NIWLTKILYIAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVLFILRKQGRFNLDKTILSISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDP
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCH
KETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYSVLMTYFGVNYYLSGLHSYAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILASFKRHLSLPKLV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10672190; 14500908 [H]