| Definition | Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010655 |
| Length | 2,664,102 |
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The map label for this gene is 187734997
Identifier: 187734997
GI number: 187734997
Start: 577803
End: 580061
Strand: Reverse
Name: 187734997
Synonym: Amuc_0490
Alternate gene names: NA
Gene position: 580061-577803 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187735003
Following gene: 187734990
Centisome position: 21.77
GC content: 46.79
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGGACCGTCTCTCCGTCTTTTTGGGTTTCATGAAATAGCGGTCAGGGCAGGATGATGCTTTCTACCGCGGTACGTATGGT TTCATCGCCGAATTGGTCCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 752; Mature: 752
Protein sequence:
>752_residues MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGAVVIVNPHNDLDFLCTNHLST YGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLCDAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGE ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG
Sequences:
>Translated_752_residues MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGAVVIVNPHNDLDFLCTNHLST YGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLCDAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGE ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG >Mature_752_residues MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGAVVIVNPHNDLDFLCTNHLST YGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLCDAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGE ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 86234; Mature: 86234
Theoretical pI: Translated: 8.39; Mature: 8.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQ CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH YNVDGASQYLPYSWAMQQSWQSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFW CCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH TAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFSFYSQFIMWIYDRWLGGIIWA HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS HHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLF EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHH GIPQTISISKVIGADLFDIKFGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLST CCCCCCCHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHH FLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWWGIGILCIWLAVSVAVQCFHE HHHCCCHHEEHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEECCCCCCCCEECCCHHHHHHCCCCCCCE VVIVNPHNDLDFLCTNHLSTYGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLC EEEECCCCCCHHHHHHCHHHHCEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH DAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGEENHFSPVVPDWRTNNKIHVT CCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE VPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHH EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQ CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH YNVDGASQYLPYSWAMQQSWQSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFW CCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH TAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFSFYSQFIMWIYDRWLGGIIWA HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS HHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLF EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHH GIPQTISISKVIGADLFDIKFGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLST CCCCCCCHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHH FLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWWGIGILCIWLAVSVAVQCFHE HHHCCCHHEEHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEECCCCCCCCEECCCHHHHHHCCCCCCCE VVIVNPHNDLDFLCTNHLSTYGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLC EEEECCCCCCHHHHHHCHHHHCEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH DAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGEENHFSPVVPDWRTNNKIHVT CCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE VPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHH EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA