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Definition Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835, complete genome.
Accession NC_010655
Length 2,664,102

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The map label for this gene is 187734997

Identifier: 187734997

GI number: 187734997

Start: 577803

End: 580061

Strand: Reverse

Name: 187734997

Synonym: Amuc_0490

Alternate gene names: NA

Gene position: 580061-577803 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187735003

Following gene: 187734990

Centisome position: 21.77

GC content: 46.79

Gene sequence:

>2259_bases
ATGAATTGTAAAAAAAATAGAAAAATTCCCTTGTGGTGGGGGATAATAATTTGGGCAGTACTTGTACTGCTTTTTTTTGC
TCCTGCCGTGTTTGGAGGAAAGGTTTTAGCCCCGGTGGATTGTGTGGAATGCCTGTTCAAACCATTCGCAACTCAGCCAA
TGGAGGAAGTCCATAACCAATATAACGTAGATGGGGCTTCTCAATATTTACCTTATAGCTGGGCGATGCAGCAGTCCTGG
CAAAGTGATGGGTATATGGGATGGAACCCTTATACTCACAATGGGACTTCACTGCCGGAAAATACCATGTTAAGCCCGGG
GGATTGGCATCATTGGTTATTTGGTTTTCTTCCTTTCTGGACGGCATGGGATGCGGGAATCTTGCTGCAGTTTTTTATCG
CAGGGCTGGGGATGATCATTCTACTGAAATCCAGGGGAATTCCTATTCCGTACGTATTGCTGGGAGCTGTGAGTTTCAGT
TTTTATTCCCAGTTTATTATGTGGATATATGACCGGTGGCTTGGTGGAATAATCTGGGCGCCGTTGATTGTCTGGTCCCT
GTTGGAAGGGAGAAGGAAAAACAAATGGGTGCATCTTCCCTCTATTCTCTTTATTGTTCTCGGATTCAGAGGAGGCCATT
TGCAAGCGTGTCTCTTTGTTTTTCTTTTGGTGCTGTGCGTGTTTCTTGCGGATTGGTGGAAACGGGCAGACCGCTGGTCC
TGGAAAGTTTTTCTGAAATCATCATCTTTTTATTTGATCTCCGGATTTTTGGCGGCGTTGCTTTCCTTGGATGTTTTTGT
GGACACCCTGCCGCGCATGGAAGGCTGTAAAAGCTTGCCGTTTGTCTGGGGGCTGGAAAATATTCCTTTTCTGGCCACAT
CTGTGATGCCGACGCTCTTCGGCATTCCTCAGACAATCAGTATTTCCAAAGTGATTGGCGCTGATTTATTCGATATCAAA
TTTGGTGGAGGAGTTGTTTTTGTGCTGGCTGTTCTGGCATTGTTTAACCGCCGGGCACCGTTGACCGCCAAGTTTTGTTT
TCTTGTCAGTTTAATTGTTTCATGCACACCTCTTTCCACTTTCCTCTATTCACGTTCCACGGTTGTGATGGCTTTTGGAA
TGAGCTGGCTTGCCGGATGGCAGTTATTTGACCTTAGGCGGCATCCGGTTCTTCCTATCTGGCGCAGACTTGCATGGTGG
GGAATTGGAATTTTGTGTATATGGCTTGCCGTATCGGTGGCAGTTCAGTGTTTCCATGAACCATTGCTGTTAAAATTGCA
TAGCTTTATTGACGGAAACATAACGACTTCTCAGCAAAAATACCGTCATTCCTGGTATTTGCTCAGAAGCGAGCGTCTCC
TGGACCAGCTGATGATTTGGGATTGGCGCAATGCCTTATTGATTTTACTGGTCAGCGTAGGGGGCTGGGCCTGTTCCCGC
CTGAATATATCCAGCCGTTATCCGAAGTGGTGGGCAGGACTTGTGGTATTATGTACCTTTGGGGAACAAATAGTGTTTTC
TTCTTCATGGATTGCCTATTCCGACAAACCGGAAAGCGGCTATCTTTATAAAGAACCGGAATGGATGTCCGAGTTTCGCG
GACATGTGGGGGATGGTGCCGTTGTTATCGTCAATCCTCATAATGACTTGGATTTTTTATGTACTAATCATTTATCCACA
TATGGAATAAGGCTGGCCTCAGGTTATGAAACGGTGCAGCCCAGATATCTGAGACCTTTGTCGGATGGACATTATTATCC
GAAAGATTATGCCATGGCCGGCATTTCTCATTTGTTGTGTGATGCCAAAGCCGGAAGGCCGTCTTTTGACGGGTGGAATC
TGGTTCAGGAAACGGAAGATTTCTTCTTGCTGGAAAATCCCTTGTACCGTGGACGCTATTTTGTCCGAACCCAGGGGGAA
GAGAATCATTTTTCTCCTGTTGTTCCGGATTGGAGAACGAATAATAAGATCCATGTCACCGTGCCGCCAGGAACAAAGGA
ATTGTCTGTTCTTGAGAGCTATTCCAGGGGATGGAGCGCCCGCACCGGGAAGGGGGAAGAGCTTCCTTTATCCAGTACTG
AGCGCTATTCTATTCTTGTTTCTGTTCCGGATTCGGAACAGCAGACGGAAATCCTCCTGCAGTACCATACGCCTTACCGT
GAATGGTATTACAGCATGATGGGGGGAACTGCTCTGTTTCTGCTTGTGGCGGCTCTCTTGCAGCGGCGCGTTAATATCAG
GACGGAAAAGGAGGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGATGCCGGTTTTAACAATTCTGTGGAGAAATTCATTCGTTAATTTACAGGAATTTTCTTTGGGGATGCATGAGGAGCCA
ATGTCAGATTTTTATTATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGACCGTCTCTCCGTCTTTTTGGGTTTCATGAAATAGCGGTCAGGGCAGGATGATGCTTTCTACCGCGGTACGTATGGT
TTCATCGCCGAATTGGTCCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 752; Mature: 752

Protein sequence:

>752_residues
MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW
QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS
FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS
WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK
FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW
GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR
LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGAVVIVNPHNDLDFLCTNHLST
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ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR
EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG

Sequences:

>Translated_752_residues
MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW
QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS
FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS
WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK
FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW
GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR
LNISSRYPKWWAGLVVLCTFGEQIVFSSSWIAYSDKPESGYLYKEPEWMSEFRGHVGDGAVVIVNPHNDLDFLCTNHLST
YGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLCDAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGE
ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR
EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG
>Mature_752_residues
MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQYNVDGASQYLPYSWAMQQSW
QSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFWTAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFS
FYSQFIMWIYDRWLGGIIWAPLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS
WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLFGIPQTISISKVIGADLFDIK
FGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLSTFLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWW
GIGILCIWLAVSVAVQCFHEPLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR
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YGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLCDAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGE
ENHFSPVVPDWRTNNKIHVTVPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR
EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86234; Mature: 86234

Theoretical pI: Translated: 8.39; Mature: 8.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNCKKNRKIPLWWGIIIWAVLVLLFFAPAVFGGKVLAPVDCVECLFKPFATQPMEEVHNQ
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
YNVDGASQYLPYSWAMQQSWQSDGYMGWNPYTHNGTSLPENTMLSPGDWHHWLFGFLPFW
CCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TAWDAGILLQFFIAGLGMIILLKSRGIPIPYVLLGAVSFSFYSQFIMWIYDRWLGGIIWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLIVWSLLEGRRKNKWVHLPSILFIVLGFRGGHLQACLFVFLLVLCVFLADWWKRADRWS
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WKVFLKSSSFYLISGFLAALLSLDVFVDTLPRMEGCKSLPFVWGLENIPFLATSVMPTLF
EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHH
GIPQTISISKVIGADLFDIKFGGGVVFVLAVLALFNRRAPLTAKFCFLVSLIVSCTPLST
CCCCCCCHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
FLYSRSTVVMAFGMSWLAGWQLFDLRRHPVLPIWRRLAWWGIGILCIWLAVSVAVQCFHE
HHHCCCHHEEHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLLLKLHSFIDGNITTSQQKYRHSWYLLRSERLLDQLMIWDWRNALLILLVSVGGWACSR
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
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CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEECCCCCCCCEECCCHHHHHHCCCCCCCE
VVIVNPHNDLDFLCTNHLSTYGIRLASGYETVQPRYLRPLSDGHYYPKDYAMAGISHLLC
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DAKAGRPSFDGWNLVQETEDFFLLENPLYRGRYFVRTQGEENHFSPVVPDWRTNNKIHVT
CCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
VPPGTKELSVLESYSRGWSARTGKGEELPLSSTERYSILVSVPDSEQQTEILLQYHTPYR
ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHH
EWYYSMMGGTALFLLVAALLQRRVNIRTEKEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA