| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294772
Identifier: 197294772
GI number: 197294772
Start: 762246
End: 765239
Strand: Direct
Name: 197294772
Synonym: PAa_0752
Alternate gene names: NA
Gene position: 762246-765239 (Clockwise)
Preceding gene: 197294771
Following gene: 197294773
Centisome position: 86.62
GC content: 22.11
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AACAATTTGGTTTTTCAAAAAATCATATTTTTTTTGGAAAAAAATGTTGTTCTCAAATGGTGCCATTTTTGTGGAGCTTA CCAAGATTAGAGGAAAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATGTTTTAAAGTTGATGGGTTCCAAAACTTATGGCCTGTTTTTTGTTTTTAAAAAATTAAAAAATCTTTGAAACTAAA AAAAAATAATTTTCCAATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 997; Mature: 997
Protein sequence:
>997_residues MFFYNKFISLFKKKQEENDFFALFLEEFEKMIIDIKNVPIASWTNNNLPIFKNEYELNKRGIQEKYFQTCTILNKKIQNL LEQRRLILEKKSLKEAKIQDFFNKEVILQKNKNTNQTHYLIKNFHKEIEYKKNRNQKKKIFFLSRLNDTTNHLNNLLIHL EQQKKQAEKKKNVDNELLKKNFYTTDFKLNQKNKNLKQQLDLELKDLETEKINILSQFAKIYHYKMDLYQKNINKSNNIY QIKLDNHNKFFDVIKDNYEKNKIKHQTQKESFFRLERSIPFLNVPFNFAFQKRKNALYAEKLKNELSYLQEITLWKKKYN FINMNHHKTINYLNLEKEKQNEIYQKYRKNVIQKYQEQEQKTKNLFAQKINDVKLQIQVIRNLHLRDIAVWENEKDYQET FFSYRKAILTLKLKKNLLQKNYYFDFFHNKAVFGFKNKSIILQLKLEKIRNSFYDFIKIVELKKEISFLENQRHNYQLLQ QDNLHLHQLQEEKKKNFFLKDISLHKTDINQLWQKQFFEKTQLLSSLSNSLEQTQKTNNHNILILKTLKQKITSFQKLFH NKMCLLEENTLNYFQKVIQKDFMKVAANQFKNFCLLHEKKYLFQEQQIKDKIQMIEQMILFSEKQLSFISEKLDKNFQIL TDRKKTTPLEQIYHQINFQKKKLSQQSDYLKKKIIKMQKDYEQKRSQYNPQYQKKIHEIKELQQKLFFFWQCCNFEPQTK QIHPLSIVKKKSSAAFFHIWQKTFKKSLQVIWVYYCYQKSFIKRNSLFVDSEKQKLAQNKETKAILLQQDKLTNNILEVL DPFVEKIFFQKEKELFQEIRKKQLQKQKELKQSSQLVKQKITLLNENLKDVLNNLKDSWQNQQKELKNQLLFLEKKDFFQ PYQKKQVFLENKKKHIKNKNNLIFKNFALNKKNIFKIFYQKKREIQKKIVKIDQKLKVNQFCWQRIKTSSWKEKFKKIRS KFSLLWKKYKKTREINSRYQKIKKEIKQKIQFEKSIS
Sequences:
>Translated_997_residues MFFYNKFISLFKKKQEENDFFALFLEEFEKMIIDIKNVPIASWTNNNLPIFKNEYELNKRGIQEKYFQTCTILNKKIQNL LEQRRLILEKKSLKEAKIQDFFNKEVILQKNKNTNQTHYLIKNFHKEIEYKKNRNQKKKIFFLSRLNDTTNHLNNLLIHL EQQKKQAEKKKNVDNELLKKNFYTTDFKLNQKNKNLKQQLDLELKDLETEKINILSQFAKIYHYKMDLYQKNINKSNNIY QIKLDNHNKFFDVIKDNYEKNKIKHQTQKESFFRLERSIPFLNVPFNFAFQKRKNALYAEKLKNELSYLQEITLWKKKYN FINMNHHKTINYLNLEKEKQNEIYQKYRKNVIQKYQEQEQKTKNLFAQKINDVKLQIQVIRNLHLRDIAVWENEKDYQET FFSYRKAILTLKLKKNLLQKNYYFDFFHNKAVFGFKNKSIILQLKLEKIRNSFYDFIKIVELKKEISFLENQRHNYQLLQ QDNLHLHQLQEEKKKNFFLKDISLHKTDINQLWQKQFFEKTQLLSSLSNSLEQTQKTNNHNILILKTLKQKITSFQKLFH NKMCLLEENTLNYFQKVIQKDFMKVAANQFKNFCLLHEKKYLFQEQQIKDKIQMIEQMILFSEKQLSFISEKLDKNFQIL TDRKKTTPLEQIYHQINFQKKKLSQQSDYLKKKIIKMQKDYEQKRSQYNPQYQKKIHEIKELQQKLFFFWQCCNFEPQTK QIHPLSIVKKKSSAAFFHIWQKTFKKSLQVIWVYYCYQKSFIKRNSLFVDSEKQKLAQNKETKAILLQQDKLTNNILEVL DPFVEKIFFQKEKELFQEIRKKQLQKQKELKQSSQLVKQKITLLNENLKDVLNNLKDSWQNQQKELKNQLLFLEKKDFFQ PYQKKQVFLENKKKHIKNKNNLIFKNFALNKKNIFKIFYQKKREIQKKIVKIDQKLKVNQFCWQRIKTSSWKEKFKKIRS KFSLLWKKYKKTREINSRYQKIKKEIKQKIQFEKSIS >Mature_997_residues MFFYNKFISLFKKKQEENDFFALFLEEFEKMIIDIKNVPIASWTNNNLPIFKNEYELNKRGIQEKYFQTCTILNKKIQNL LEQRRLILEKKSLKEAKIQDFFNKEVILQKNKNTNQTHYLIKNFHKEIEYKKNRNQKKKIFFLSRLNDTTNHLNNLLIHL EQQKKQAEKKKNVDNELLKKNFYTTDFKLNQKNKNLKQQLDLELKDLETEKINILSQFAKIYHYKMDLYQKNINKSNNIY QIKLDNHNKFFDVIKDNYEKNKIKHQTQKESFFRLERSIPFLNVPFNFAFQKRKNALYAEKLKNELSYLQEITLWKKKYN FINMNHHKTINYLNLEKEKQNEIYQKYRKNVIQKYQEQEQKTKNLFAQKINDVKLQIQVIRNLHLRDIAVWENEKDYQET FFSYRKAILTLKLKKNLLQKNYYFDFFHNKAVFGFKNKSIILQLKLEKIRNSFYDFIKIVELKKEISFLENQRHNYQLLQ QDNLHLHQLQEEKKKNFFLKDISLHKTDINQLWQKQFFEKTQLLSSLSNSLEQTQKTNNHNILILKTLKQKITSFQKLFH NKMCLLEENTLNYFQKVIQKDFMKVAANQFKNFCLLHEKKYLFQEQQIKDKIQMIEQMILFSEKQLSFISEKLDKNFQIL TDRKKTTPLEQIYHQINFQKKKLSQQSDYLKKKIIKMQKDYEQKRSQYNPQYQKKIHEIKELQQKLFFFWQCCNFEPQTK QIHPLSIVKKKSSAAFFHIWQKTFKKSLQVIWVYYCYQKSFIKRNSLFVDSEKQKLAQNKETKAILLQQDKLTNNILEVL DPFVEKIFFQKEKELFQEIRKKQLQKQKELKQSSQLVKQKITLLNENLKDVLNNLKDSWQNQQKELKNQLLFLEKKDFFQ PYQKKQVFLENKKKHIKNKNNLIFKNFALNKKNIFKIFYQKKREIQKKIVKIDQKLKVNQFCWQRIKTSSWKEKFKKIRS KFSLLWKKYKKTREINSRYQKIKKEIKQKIQFEKSIS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 122503; Mature: 122503
Theoretical pI: Translated: 10.55; Mature: 10.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFFYNKFISLFKKKQEENDFFALFLEEFEKMIIDIKNVPIASWTNNNLPIFKNEYELNKR CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHH GIQEKYFQTCTILNKKIQNLLEQRRLILEKKSLKEAKIQDFFNKEVILQKNKNTNQTHYL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHH IKNFHKEIEYKKNRNQKKKIFFLSRLNDTTNHLNNLLIHLEQQKKQAEKKKNVDNELLKK HHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHC NFYTTDFKLNQKNKNLKQQLDLELKDLETEKINILSQFAKIYHYKMDLYQKNINKSNNIY CCCCCCEEECCCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE QIKLDNHNKFFDVIKDNYEKNKIKHQTQKESFFRLERSIPFLNVPFNFAFQKRKNALYAE EEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH KLKNELSYLQEITLWKKKYNFINMNHHKTINYLNLEKEKQNEIYQKYRKNVIQKYQEQEQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTKNLFAQKINDVKLQIQVIRNLHLRDIAVWENEKDYQETFFSYRKAILTLKLKKNLLQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYYFDFFHNKAVFGFKNKSIILQLKLEKIRNSFYDFIKIVELKKEISFLENQRHNYQLLQ CCCEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH QDNLHLHQLQEEKKKNFFLKDISLHKTDINQLWQKQFFEKTQLLSSLSNSLEQTQKTNNH CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NILILKTLKQKITSFQKLFHNKMCLLEENTLNYFQKVIQKDFMKVAANQFKNFCLLHEKK CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLFQEQQIKDKIQMIEQMILFSEKQLSFISEKLDKNFQILTDRKKTTPLEQIYHQINFQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCHHH KKLSQQSDYLKKKIIKMQKDYEQKRSQYNPQYQKKIHEIKELQQKLFFFWQCCNFEPQTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QIHPLSIVKKKSSAAFFHIWQKTFKKSLQVIWVYYCYQKSFIKRNSLFVDSEKQKLAQNK CCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHCCC ETKAILLQQDKLTNNILEVLDPFVEKIFFQKEKELFQEIRKKQLQKQKELKQSSQLVKQK CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITLLNENLKDVLNNLKDSWQNQQKELKNQLLFLEKKDFFQPYQKKQVFLENKKKHIKNKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NLIFKNFALNKKNIFKIFYQKKREIQKKIVKIDQKLKVNQFCWQRIKTSSWKEKFKKIRS CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH KFSLLWKKYKKTREINSRYQKIKKEIKQKIQFEKSIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MFFYNKFISLFKKKQEENDFFALFLEEFEKMIIDIKNVPIASWTNNNLPIFKNEYELNKR CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHH GIQEKYFQTCTILNKKIQNLLEQRRLILEKKSLKEAKIQDFFNKEVILQKNKNTNQTHYL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHH IKNFHKEIEYKKNRNQKKKIFFLSRLNDTTNHLNNLLIHLEQQKKQAEKKKNVDNELLKK HHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHC NFYTTDFKLNQKNKNLKQQLDLELKDLETEKINILSQFAKIYHYKMDLYQKNINKSNNIY CCCCCCEEECCCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE QIKLDNHNKFFDVIKDNYEKNKIKHQTQKESFFRLERSIPFLNVPFNFAFQKRKNALYAE EEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH KLKNELSYLQEITLWKKKYNFINMNHHKTINYLNLEKEKQNEIYQKYRKNVIQKYQEQEQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTKNLFAQKINDVKLQIQVIRNLHLRDIAVWENEKDYQETFFSYRKAILTLKLKKNLLQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYYFDFFHNKAVFGFKNKSIILQLKLEKIRNSFYDFIKIVELKKEISFLENQRHNYQLLQ CCCEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH QDNLHLHQLQEEKKKNFFLKDISLHKTDINQLWQKQFFEKTQLLSSLSNSLEQTQKTNNH CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NILILKTLKQKITSFQKLFHNKMCLLEENTLNYFQKVIQKDFMKVAANQFKNFCLLHEKK CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLFQEQQIKDKIQMIEQMILFSEKQLSFISEKLDKNFQILTDRKKTTPLEQIYHQINFQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCHHH KKLSQQSDYLKKKIIKMQKDYEQKRSQYNPQYQKKIHEIKELQQKLFFFWQCCNFEPQTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QIHPLSIVKKKSSAAFFHIWQKTFKKSLQVIWVYYCYQKSFIKRNSLFVDSEKQKLAQNK CCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHCCC ETKAILLQQDKLTNNILEVLDPFVEKIFFQKEKELFQEIRKKQLQKQKELKQSSQLVKQK CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITLLNENLKDVLNNLKDSWQNQQKELKNQLLFLEKKDFFQPYQKKQVFLENKKKHIKNKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NLIFKNFALNKKNIFKIFYQKKREIQKKIVKIDQKLKVNQFCWQRIKTSSWKEKFKKIRS CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH KFSLLWKKYKKTREINSRYQKIKKEIKQKIQFEKSIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
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Structure class: Unstructured
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Metal ions: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA