| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294482
Identifier: 197294482
GI number: 197294482
Start: 416053
End: 419547
Strand: Reverse
Name: 197294482
Synonym: PAa_0416
Alternate gene names: NA
Gene position: 419547-416053 (Counterclockwise)
Preceding gene: 197294483
Following gene: 197294480
Centisome position: 47.68
GC content: 28.53
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCAATTTTTTTGCATTACCAGATTGGATTATGATACAATGATGATAAGTTATAAAAATAAAAAAGGAAGTTAATTATAG GATGGAGTTATTTAAAGTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1164; Mature: 1163
Protein sequence:
>1164_residues MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKL IKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLW VGGGCLLATTCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANL QAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKEN LEQKTKQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEK QQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAE LENETQKLKDQIAKNNENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS SKEIQFPRFWNDKPFTHKIVPKIDFYKTGFTENARGYRVYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGAN LIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKSLKNEMQQ LEIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELVKNGNADATLVKQLNHKETQIK ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIILTAEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGANGAMG GNNKELLHEINKLKAQLKEEQDAHKATKERLEEEIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEDAVKNVGTAINIGVFTKAGV MTGAAWGSAAGPLGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR
Sequences:
>Translated_1164_residues MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKL IKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLW VGGGCLLATTCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANL QAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKEN LEQKTKQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEK QQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAE LENETQKLKDQIAKNNENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS SKEIQFPRFWNDKPFTHKIVPKIDFYKTGFTENARGYRVYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGAN LIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKSLKNEMQQ LEIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELVKNGNADATLVKQLNHKETQIK ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIILTAEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGANGAMG GNNKELLHEINKLKAQLKEEQDAHKATKERLEEEIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEDAVKNVGTAINIGVFTKAGV MTGAAWGSAAGPLGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR >Mature_1163_residues AKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKLI KSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWV GGGCLLATTCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSET LETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANLQ AQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENL EQKTKQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQE LNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEKQ QLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAEL ENETQKLKDQIAKNNENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSSS KEIQFPRFWNDKPFTHKIVPKIDFYKTGFTENARGYRVYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGANL IFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKSLKNEMQQL EIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELVKNGNADATLVKQLNHKETQIKE LKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIILTAEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGANGAMGG NNKELLHEINKLKAQLKEEQDAHKATKERLEEEIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEDAVKNVGTAINIGVFTKAGVM TGAAWGSAAGPLGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 133365; Mature: 133234
Theoretical pI: Translated: 8.25; Mature: 8.25
Prosite motif: PS50010 DH_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKK CCCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH QIQPTKIIVETKKENWFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH DKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWVGGGCLLATTCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHH LGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC VEKEREAQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTKQLEEQKNLSDAEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELEEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELENETQKLKDQIAKNNENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTHKIVPKIDFYKTGFTENARGYRVYREEIDKNTIQGESIELSPGK CCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTHGANLIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKSLKNEMQQLEIKEQSFRSEIDTLKLENK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELVKNGNADATLVKQLNHKETQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIILTAEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAIAGLEGANGAMGGNNKELLHEINKLKAQLKEEQDAHKATKERLEEEIVTLNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KNLNLTNKSTELKEKEKHWEDAVKNVGTAINIGVFTKAGVMTGAAWGSAAGPLGTIAGGV CEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH AGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKK CCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH QIQPTKIIVETKKENWFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH DKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWVGGGCLLATTCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHH LGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC VEKEREAQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTKQLEEQKNLSDAEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELEEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELENETQKLKDQIAKNNENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTHKIVPKIDFYKTGFTENARGYRVYREEIDKNTIQGESIELSPGK CCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTHGANLIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKSLKNEMQQLEIKEQSFRSEIDTLKLENK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELVKNGNADATLVKQLNHKETQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIILTAEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAIAGLEGANGAMGGNNKELLHEINKLKAQLKEEQDAHKATKERLEEEIVTLNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KNLNLTNKSTELKEKEKHWEDAVKNVGTAINIGVFTKAGVMTGAAWGSAAGPLGTIAGGV CEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH AGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA