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The map label for this gene is norM

Identifier: 197294308

GI number: 197294308

Start: 205945

End: 207435

Strand: Reverse

Name: norM

Synonym: PAa_0171

Alternate gene names: NA

Gene position: 207435-205945 (Counterclockwise)

Preceding gene: 197294309

Following gene: 197294307

Centisome position: 23.57

GC content: 24.88

Gene sequence:

>1491_bases
ATGATATATAAAAAAAATCAAATCAATAAAAAGAAAATTATGATTGCTGAAGAAAAAAAAAGAAAGTTTTTATTAGAAGG
CAATTTGTGGAAAGTTATTTTATACGTCACCTTTCCTATTATTATTTATTTGGTTTTTCAAGTTTTTTTTAATTCTTATG
ATATTTTATTTTACAAATCAAGCAAAGGCGAAGTGGATAAGTGTTTTTTGCCATCAATGAATCGAATTCACTTAGTCAAA
GACATTCTTATCCCTTTTGGTGCATCCATTGCTACTGCTGGTGTAATTTTAGTAGGTCGTAATTACGGCAACAAAAATAT
CGAAAAAATGCGTTCTTATCTTTCGCAAACTTTTATATTAACTGTCATTGTAAGTTTTGTTATTACTATCTTGTTTGGAT
TTTTTTTAAAAACAACTATTTTAAAAAATATTTGTGATATTAAACAAAACAATCCAGCAAATCAAACATCATTGAAGAAT
TATTATTTTGTAATTATTTTGTCCATTTTTTGCATCATTATTAATACAGTTTTTTTAGCCTTAGAAAGAGCTAAAGGAAA
CAATAAAATAATTTTAATCACAACTGCATTAAATGTTTTTATTAAAGTCATTTTATCTAATCTTTTTTGGAATTGGAAAG
AAGACATTACCTCTTTAGGGTATGCAACCCTCTTGGCTCACGCTATTGTTACTGTATTTGCTTTTTGGTTTTTATTTTGG
AACCACAACAACTTTTTGAAAATTATTTTAAAAAAACTTCACTTTGAAAAACGTTTTTTGAAAAAACTTGTCCCCTTAGC
AGTTCCTATTTGTATCAGCAATATAATCTTTATCTTAGGAAAATTAATTATTAGTATAACTTTGACGCGTTATTATGGAA
GCGAACAAGGAAAAGTGATTGATACTCAATTAATTTTGGCAGTATCTATAAATAATATTTTTTCTAATATTATCAATTCT
TTTGCTGATTCTCAAAACGCTATTATTTCTCAAAATTTAGGGCAAAAAAACATGAACCGCGTTTTTCAAATTTTTCAAAA
AATTATGATTTCTATTGTTGTTTTAGCTTTTTTAGGCACTTTGATTCATATTTTTTGTTATCGCAAGATTTTATTCTATT
TCATGAAAGAAACAATAGAAAGAGGATCTACATTTAAAATATTGTTGTTCTATGAAACCACAGGTTTATTTTTAACTTCT
TTTTCTATAGTTTTATGCAATTTTTTAGTTTGTTTTAAAAAAACCAAAATTTATTTAAGTATGAATCTTTTAAGGGTTTT
TGCAGGTGTTTTATTTCTTTTTATTTTAAAGAAAATGGATATTTTTAGTTCTTTTACAGAAGAATTAAGTAATTTTCATA
AAGTCGGTTTAAGTCTTTTGTTAGGTAATTTAATTTCTTTCATTGCTACTTTAACTTTTTTCATTCCTTTTTATCGCAAA
CTTCAAAAAGAAAATCTTGCTAAAATGAAAATTAAACGAAAAATAAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTAAAATATATAGTATTGTTACTGTTCTAGATTATTTTTTAATTTATCATTTTATCATCAAAATAAAAAATTATTGA
TTTATTATATTGGAGGTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATAATTTAGCTTCTTTTTTTATATATTTATGATTTTTCAATTTTTAAAGGTGTGGGGAGATGATGTTTTTTAGACATT
TTTTTGTTTTAAAAAATATT

Product: Na+-driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; Multi Anti Extrusion Protein MatE; MATE Efflux Family Protein

Number of amino acids: Translated: 496; Mature: 496

Protein sequence:

>496_residues
MIYKKNQINKKKIMIAEEKKRKFLLEGNLWKVILYVTFPIIIYLVFQVFFNSYDILFYKSSKGEVDKCFLPSMNRIHLVK
DILIPFGASIATAGVILVGRNYGNKNIEKMRSYLSQTFILTVIVSFVITILFGFFLKTTILKNICDIKQNNPANQTSLKN
YYFVIILSIFCIIINTVFLALERAKGNNKIILITTALNVFIKVILSNLFWNWKEDITSLGYATLLAHAIVTVFAFWFLFW
NHNNFLKIILKKLHFEKRFLKKLVPLAVPICISNIIFILGKLIISITLTRYYGSEQGKVIDTQLILAVSINNIFSNIINS
FADSQNAIISQNLGQKNMNRVFQIFQKIMISIVVLAFLGTLIHIFCYRKILFYFMKETIERGSTFKILLFYETTGLFLTS
FSIVLCNFLVCFKKTKIYLSMNLLRVFAGVLFLFILKKMDIFSSFTEELSNFHKVGLSLLLGNLISFIATLTFFIPFYRK
LQKENLAKMKIKRKIS

Sequences:

>Translated_496_residues
MIYKKNQINKKKIMIAEEKKRKFLLEGNLWKVILYVTFPIIIYLVFQVFFNSYDILFYKSSKGEVDKCFLPSMNRIHLVK
DILIPFGASIATAGVILVGRNYGNKNIEKMRSYLSQTFILTVIVSFVITILFGFFLKTTILKNICDIKQNNPANQTSLKN
YYFVIILSIFCIIINTVFLALERAKGNNKIILITTALNVFIKVILSNLFWNWKEDITSLGYATLLAHAIVTVFAFWFLFW
NHNNFLKIILKKLHFEKRFLKKLVPLAVPICISNIIFILGKLIISITLTRYYGSEQGKVIDTQLILAVSINNIFSNIINS
FADSQNAIISQNLGQKNMNRVFQIFQKIMISIVVLAFLGTLIHIFCYRKILFYFMKETIERGSTFKILLFYETTGLFLTS
FSIVLCNFLVCFKKTKIYLSMNLLRVFAGVLFLFILKKMDIFSSFTEELSNFHKVGLSLLLGNLISFIATLTFFIPFYRK
LQKENLAKMKIKRKIS
>Mature_496_residues
MIYKKNQINKKKIMIAEEKKRKFLLEGNLWKVILYVTFPIIIYLVFQVFFNSYDILFYKSSKGEVDKCFLPSMNRIHLVK
DILIPFGASIATAGVILVGRNYGNKNIEKMRSYLSQTFILTVIVSFVITILFGFFLKTTILKNICDIKQNNPANQTSLKN
YYFVIILSIFCIIINTVFLALERAKGNNKIILITTALNVFIKVILSNLFWNWKEDITSLGYATLLAHAIVTVFAFWFLFW
NHNNFLKIILKKLHFEKRFLKKLVPLAVPICISNIIFILGKLIISITLTRYYGSEQGKVIDTQLILAVSINNIFSNIINS
FADSQNAIISQNLGQKNMNRVFQIFQKIMISIVVLAFLGTLIHIFCYRKILFYFMKETIERGSTFKILLFYETTGLFLTS
FSIVLCNFLVCFKKTKIYLSMNLLRVFAGVLFLFILKKMDIFSSFTEELSNFHKVGLSLLLGNLISFIATLTFFIPFYRK
LQKENLAKMKIKRKIS

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57519; Mature: 57519

Theoretical pI: Translated: 10.55; Mature: 10.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIYKKNQINKKKIMIAEEKKRKFLLEGNLWKVILYVTFPIIIYLVFQVFFNSYDILFYKS
CCCCCCCCCCHHEEEEEHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
SKGEVDKCFLPSMNRIHLVKDILIPFGASIATAGVILVGRNYGNKNIEKMRSYLSQTFIL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TVIVSFVITILFGFFLKTTILKNICDIKQNNPANQTSLKNYYFVIILSIFCIIINTVFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LERAKGNNKIILITTALNVFIKVILSNLFWNWKEDITSLGYATLLAHAIVTVFAFWFLFW
HHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NHNNFLKIILKKLHFEKRFLKKLVPLAVPICISNIIFILGKLIISITLTRYYGSEQGKVI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
DTQLILAVSINNIFSNIINSFADSQNAIISQNLGQKNMNRVFQIFQKIMISIVVLAFLGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIHIFCYRKILFYFMKETIERGSTFKILLFYETTGLFLTSFSIVLCNFLVCFKKTKIYLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MNLLRVFAGVLFLFILKKMDIFSSFTEELSNFHKVGLSLLLGNLISFIATLTFFIPFYRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQKENLAKMKIKRKIS
HHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MIYKKNQINKKKIMIAEEKKRKFLLEGNLWKVILYVTFPIIIYLVFQVFFNSYDILFYKS
CCCCCCCCCCHHEEEEEHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
SKGEVDKCFLPSMNRIHLVKDILIPFGASIATAGVILVGRNYGNKNIEKMRSYLSQTFIL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TVIVSFVITILFGFFLKTTILKNICDIKQNNPANQTSLKNYYFVIILSIFCIIINTVFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LERAKGNNKIILITTALNVFIKVILSNLFWNWKEDITSLGYATLLAHAIVTVFAFWFLFW
HHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NHNNFLKIILKKLHFEKRFLKKLVPLAVPICISNIIFILGKLIISITLTRYYGSEQGKVI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
DTQLILAVSINNIFSNIINSFADSQNAIISQNLGQKNMNRVFQIFQKIMISIVVLAFLGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIHIFCYRKILFYFMKETIERGSTFKILLFYETTGLFLTSFSIVLCNFLVCFKKTKIYLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MNLLRVFAGVLFLFILKKMDIFSSFTEELSNFHKVGLSLLLGNLISFIATLTFFIPFYRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQKENLAKMKIKRKIS
HHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA