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Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is 170755363

Identifier: 170755363

GI number: 170755363

Start: 3343043

End: 3344275

Strand: Reverse

Name: 170755363

Synonym: CLD_1442

Alternate gene names: NA

Gene position: 3344275-3343043 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755005

Following gene: 170756673

Centisome position: 84.49

GC content: 24.9

Gene sequence:

>1233_bases
ATGGAAAGTTTAAGTAATATTATTACATATTTAATTTGTTCTTATATATTTATTTTGCCTATTTTACCAAGTAAGTATAA
ATATAAGAATATTCCTTTTAATGGGGATGTTGTGTTGCTATTAATCATAATTTCGTTTATTATATTTATATTTATAAATG
GTGAATGGAGAAAAAATTTTTTTAATGGTATGAAAGATTTTTTTTGTAAAGCAAATACTATATTTATTTTTATGTGGGTA
GGCATGATGGTTGTATCCATTTCTTATTCACCTGATAAGAAATTAGCTTTACAAGAAACCATAAGAACTAGTACGTATAT
AGTATTATTTTTTATAATAAAATATGAAGTTTATAAAAAGAAATATTTAGATAAAATTATTTATTCATATATATTTACTT
CAATTATTGTAGGATTTATAGGAATATACGAATATTTAAAAGGGATTGGATTGACTCATAAAGGTGAGTTTAGTACAGTA
GTAAGATGCGTATCTACCTTAGAGAATTCTAATAATTTGGGAGGGTTTTTTATAATGATAGTATTTCCTATGATGGTACT
ATCATTTAAAGAAAAACAAAAATGCAAAAGAAATGTATATATTCTATGCTCAATTATAGCTATTATAAATATAATAATAT
CTTTTTCACGAAATGCTTGGTTAGCATTTGTAATAGGATACATGGTATTAATAATTGTATTTAATTTTAAGCTAATATAT
GGAGCTATACTGGGAGCTGGAGTGTCCTTATTTATACCTAAAATATCTAATAGATTAAGAGAAATTGGAGATGTAAGTCA
GAATTTATCTAGAATTAGTTTATGGAAAATAGCTTGGGAAATGGTAAAAGACAAGCCATTATTAGGTGTAGGAAATGGGA
ATTATAGAACCTTATACCCGCAATACTATAAAAAAGTTAAATATTTAGGATATACAGCTCAAGCAAAATTTCATCCACAT
AATGCTTATCTAAAAGCTCAATGTGAATTAGGGATAATGGGATTAATATCGTTGCTTGGTATTTTTGTAAGTTCCGTATG
GAAGGTAAGTGAATTATCTAAGAAATCAAATAATACATTTTATAAATATTTTTACAAAGGTTTTATTGCTTCTTTAATAG
CTTTTATGTTCATGAATTTTATAGATAATTTCTTTTCAGCACCTAAAGTTATAGCCTTTTTTTGGATAAGTTTAGCTGTA
GCTGATTCTTTTGAGTATAATTGTAAAATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAAAATTAAAGAATAGTTAATACCTCTATATAAATAGATTGAATATAATTGTTCACTGTTGTTATTTCTATAATCTT
TAGTTTAAGGGGACATACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTGTAAAAAGGAGTTATAAAAACTCCTTTTTTAATGTAATAGGTGAGTCGGTACAAGCAAAAGATTATTTCGTTATT
AATTAAGATTTTATGGCTGA

Product: exopolysaccharide biosynthesis family protein

Products: NA

Alternate protein names: ExoQ Family Exopolysaccharide Biosynthesis Membrane Protein; Exopolysaccharide Biosynthesis Family Protein

Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410

Protein sequence:

>410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI

Sequences:

>Translated_410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI
>Mature_410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47419; Mature: 47419

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA