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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 170754972

GI number: 170754972

Start: 1555927

End: 1557816

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CLD_3146

Alternate gene names: 170754972

Gene position: 1555927-1557816 (Clockwise)

Preceding gene: 170757622

Following gene: 170754480

Centisome position: 39.31

GC content: 24.02

Gene sequence:

>1890_bases
ATGGGCTTATTTAGTATAGCTTTTAAAAATGTAAAAAGAAATTTTAAAAATTATGCTATGTATTTTATATCTATGATATT
TTCGGTACTTGTATATTTTATGTTTAAATCCATTGAATATAATGATCAAATTGCTAATGTAGCAAATGGTATGAAAACTG
TAAGTAAAGCTTTTTCTGGAGCATCAGTTATAATTGCGTTGTTTGTCTTTATGTTTATATGGTACTCAAATTCCTTTTTT
ATTAAAAAGAGAAAAAGAGAAATAGGTTTATATTCTATGTTAGGTGTAAAAAAGAAAAATATAGCAGCTATGATGTTTTA
TGAAACTATGACTATGGGAATTATAGCTTTAGTTATAGGTGCTTTCCTAGGAACTTTTTTCTCTAAAGGTTTTATATTAA
TTTTTTTAAAGCTTATAGATGCAGAGAATATTATAAAAACTACATTTTCAATTAAAGCTTTAGTTTCTACAATAAGAACT
TTTATATTAATATATTTTATAGTGTCTATAAGTGGAGCTAGCATTATATATAGATATGAATTAATGGATTTATTTATGGC
AGAAAGTAAGAGGGAAAAAGAACCTAAAGCTTCTAAGATAAAAGCTATTTTATCTTTAATATTATTATTAGGTGGATATA
TTATATATATTTCTAGTAAAGGCAGTAGTTTAGGATCAGTTGCTATGGTTACATTAATTACAGTAGTAATAGGAACTTAT
TTATTTTTTAGTTCTTTTACAGTATATTATTTAAAAATAAAAAGAAATAATAAAAAATTTCATTTTAAAGGACTAAATAT
GATTTCAAATTCTCAACTTTTATATAGAATAAAAGGGAATGCTAGAGCTTTAGCTACTATAGCTATACTTATAGCAGCAA
CCCTTACAGCTTCAGGAGCTAGCATAAGTTTTTACAAATTTTTTTCACAGAATATGGACAAAGCTAATCCTTTTGATTAT
GTTATAAAAGCAGAAGATAATAAAATTAAGAATGATATAGACAAGCTTATAAAAAATAATACTAAAAATAAATTAAAAGA
AAAAATAGATATTACGGTGCTACAATACAAAAATGACGGTAGTGATATTTATGATGGAAAATCTATTTTATCAGAAAAGG
ATTTTAATAAAATAGCTAAAGCTAAGAATATTGAAGTTAAAAATAAAATAAATGAGGAAAAAGATGTTTATTATTTTCCA
ACTTATGCTGATAAAAATCACAAGATTAATGGCATTAGGATAAAAAGTGAATACTTTAAAATAGTACATTCAGAAGAAAG
ATCATTAGTTAATATGATGGTTTTAGACAATACATTAATAGTTAAAGATGAAGAATTTATAAAATTAGAAAAACAATTAA
AGAAAGAAAAATATGCACTTTATTTAGTAGAAAATCATAATAGAAGTGGAGAGTTAACAAAGGATTTTAATAACATAATA
AAAAATTATGAAAAATCTAAAAATTATCCAGATCATAAATTAGTTAAATCTAATTACTATGAAAATTATAGGGAAAATGT
ATCTTCAGCTGGTACTATGTTATTTATAGGATGCTTTGTAGGATTAGTTTTCTTAGTATGTACAGCAAGTATAATATTTT
TCAAACAACTTTCAGAAGCCATGGAGGAAAGACACAGATATAAAATATTAAGAAATATAGGAGTAAGAAATAAGGAACTT
AAAGCTTCTATATATAAGCAAATGACATTTATATTCTTTGCTCCATTAATAGTAGGTATAGCCCATGGAGGAGTAGCCTT
ATCAATATTTGGAGAATTATTAAACTTAGGTATACTGGCTCCAATAATAATTGTAGCTATACCATATACAATAGTATATT
TAATCTATTATTTCTTAACAGCACAATTTTATTACAAAGCAATATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATGGAAAATTGTACAAAGAAATAGAAAATAATTTAAGTAGGAAAGATTTTTTTAGAGAAATATTGGATGTAACATC
TATGCTAGGGGGAGAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATAGAAATTAGATTTCGGAATATGCTTATTTTCTTAAAACTATTTATTACTAAAAGAAGAGATATAAATATAAAAAT
TCCAAATAAATAAATATAAG

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 629; Mature: 628

Protein sequence:

>629_residues
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFF
IKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIRT
FILIYFIVSISGASIIYRYELMDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSVAMVTLITVVIGTY
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIAATLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDY
VIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITVLQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDVYYFP
TYADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMVLDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYALYLVENHNRSGELTKDFNNII
KNYEKSKNYPDHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKEL
KASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALSIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS

Sequences:

>Translated_629_residues
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFF
IKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIRT
FILIYFIVSISGASIIYRYELMDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSVAMVTLITVVIGTY
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIAATLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDY
VIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITVLQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDVYYFP
TYADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMVLDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYALYLVENHNRSGELTKDFNNII
KNYEKSKNYPDHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKEL
KASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALSIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
>Mature_628_residues
GLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFFI
KKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIRTF
ILIYFIVSISGASIIYRYELMDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSVAMVTLITVVIGTYL
FFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIAATLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDYV
IKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITVLQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDVYYFPT
YADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMVLDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYALYLVENHNRSGELTKDFNNIIK
NYEKSKNYPDHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKELK
ASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALSIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72147; Mature: 72016

Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16

Prosite motif: PS00599 AA_TRANSFER_CLASS_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ASVIIALFVFMFIWYSNSFFIKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIRTFILIYFIVSISGASIIYRYE
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
LMDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSVAMVTLITVVIGTY
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIAATLTASGA
HHHHCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SISFYKFFSQNMDKANPFDYVIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITVLQYKNDG
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCEEEEEEECCC
SDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDVYYFPTYADKNHKINGIRIKSEYFK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEHHHHHH
IVHSEERSLVNMMVLDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYALYLVENHNRSGELTKDFNNII
HHHHHHHHHHHHHEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KNYEKSKNYPDHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEA
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEERHRYKILRNIGVRNKELKASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALSIFGELLNLGILA
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ASVIIALFVFMFIWYSNSFFIKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIRTFILIYFIVSISGASIIYRYE
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
LMDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSVAMVTLITVVIGTY
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIAATLTASGA
HHHHCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SISFYKFFSQNMDKANPFDYVIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITVLQYKNDG
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCEEEEEEECCC
SDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDVYYFPTYADKNHKINGIRIKSEYFK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEHHHHHH
IVHSEERSLVNMMVLDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYALYLVENHNRSGELTKDFNNII
HHHHHHHHHHHHHEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KNYEKSKNYPDHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEA
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEERHRYKILRNIGVRNKELKASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALSIFGELLNLGILA
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]