| Definition | Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010506 |
| Length | 5,935,403 |
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Identifier: 170726031
GI number:
Start: 2074124
End: 2080825
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: Swoo_1677
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 170726028
Following gene: 170726032
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>6702_bases ATGAAATACACCTTCAATAAGTTGAAGTCTCTTTTGGATTGTTCAGCTTTAGTTTTTTGTATGGGAGCCACTTTCTTTGG AAGCCAAACTTTCGCGGCGGGTACTGACTTAACTTTGTCTGGGAGTTTTAGCTCGCCTACCATTGCTTCTGGTCATATTA GTACTTTGACCTACACGTTAACTAATACCTCGGGAGCTTCTGCAAGTGATATTGGATTTACAGCCACATTACCCTCTGGT CATTTGATTGCTGAGCAAACTCAAGCATTTTCGAATTGCTCTGATGGTACATTTGCCGCTGTTGGAGGTGACAGTATTTC TACTGCATCAGGTTACCGACTTGGAGCTGGTCAAAGTTGTTCATTCATGTTTAATGTCACTGCTACTGTTAATGGCGCTG CTGCAACTTTAGTAACAGGTCTAACTTCTAGCTTAGGTGCTGGAAGTGATATTTCAACAACGTTGACGGTTGATGACACT CTGTTTACTGCATCGGCTAGTTTTAGCTCTTCTGTGGTGAATTTAGGTGCTATCAATCGCCTCTCACTCTCTTTTTCAAA TTTAGGGGGAACGGTCACAAACGGGACGACCAGTGTCGATCTTCCAAGTGGTTTAGAGATCGCTCCCATAGCCAATTTTA GCTCTGACTGCTCACTTGCCTCACTTAATGAACCTTCTGGAAGTAGTACTGTTACCATTAACGGGATCTGGTTGAATTCC GAAGCAACATGTACAGCTGAAGTCGATCTGATTGCAAATAGCGCAGGTATGATGGATCTGGTTTGGGATGATATGTTTGG TACAGTGTCATTTGCCCAAGTTTTTTCAGGTAAACTAGGCACATCCTTTGAGGTCCAAAGACCATTTGCGAATATTAACT TTAATCCTATAACCATCATTCCTGGAGCCAGTGGCAGTCTGGATGTTACTTTGACTAATTTTGATCGCAGTAGCAGTGCA 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Upstream 100 bases:
>100_bases ATACATTTCAGGTGTTATCATTGTGTTTAATAAATGTTTCTCGACTTGTTGTTTATATAAGTTAAATGTCGCGATTTAGG TTTTTATAAAAGGAATTGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTAAGTAGCCGACATTACTTGGTAATGTCGGCTTTTTGACTTTATAGGGATTGATGCATATGCAGGCGGTTATCTAGAG CTCCGTTATTGCTGATACCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>2233_residues MKYTFNKLKSLLDCSALVFCMGATFFGSQTFAAGTDLTLSGSFSSPTIASGHISTLTYTLTNTSGASASDIGFTATLPSG HLIAEQTQAFSNCSDGTFAAVGGDSISTASGYRLGAGQSCSFMFNVTATVNGAAATLVTGLTSSLGAGSDISTTLTVDDT LFTASASFSSSVVNLGAINRLSLSFSNLGGTVTNGTTSVDLPSGLEIAPIANFSSDCSLASLNEPSGSSTVTINGIWLNS EATCTAEVDLIANSAGMMDLVWDDMFGTVSFAQVFSGKLGTSFEVQRPFANINFNPITIIPGASGSLDVTLTNFDRSSSA TDITFSSDLDSALSGLIATGGTQVDVCGAGSSVTVGSSINFSGGSVSSASSCSFSIPILVPNGAAQGAYTLTTTAISASL NGGTTNYSDTSNALIVSNTPGLTITVLESGVTSGDDVTLRHTVTNIDNTYTATGIEFETDFVNLTGAVIKTLPATNDCGS GSAFSSVYKFDAFTAMSMTAGELAPGASCTFDLVLTLPSGITAGEYNVSAGAISATINSQAVESGTPSASETFIVDTAPS LVFTFNDESLLPGSSTSIDFSLSHAFASSADATGVSFTLDLDGVLSGLVASNLPSEPCGAGSTLTGSGLLTFAGGSLSPS SSCDFSVDVTLPASTVGGYTFTSSVVSATVSGNAVTSQINSADITISGLNFSKAFATNPIRVGATGTEVDINYLITNEAG ADDATVIQFTDSYNAMVAGTTITSADQSAFCGASSATSGSGGSFLVVSNVEVANGEQCILTVTINLPNSATSGSYGANTS GLSATVGGNNVAVSPAVASLVINELSVVTSVDVSSPTSESTINYAIEFSNAVNGFDVTDINAVNATLANFSGSGTNYSVE VTPIADGEVILQIASGVAVDANDATVPNQAAIDISFDYQSTPLVPTPSLSISAPSAVLANSGPVTYTVSYLDVEQVNLTA SDITLNKTGSANADVTIINGDMSTATVSLDNLSGEGSLGITIAEGSARFSTNIAPAAGPSNIVVVDAVAPNVVITGPNGN QTSSFVVNIDFDENMSGFTVDDIVASNGTLSDFQTINAASYTVQVDVTGETSVSIDIAAGVATDSAGNGNTQSNSFNVSY DDVQPSVTIGGPSGTTATAFTATISFSEHVSGFDVGDITVSNAGLSNFVTIDAANYSVLVTPVVQANVSLDIANSVANDL SGNANLAASNFSLTYDFNDAPIISGAPVTSVNEDSSYSFSPTFSDADVGDTLTFSIVNKPSWATFSSVNGTLAGTPTNDD VGSTSDIVISVSDGALSASLAAFNLEVINTNDAPLILGTPTTSVNEDASFSFTPTASDVDTGDSLSFSIVNKPSWATFSA TDGTLAGTPTNDDVGSTSDIVISVSDGALSASLAAFNLEVINTNDAPTVSGIPAASVDEDVSYSFTPTVVDVDSGDSLSF SIVNQPSWAIFSSTDGTLAGTPTNDDVGSTSDIVISVSDGALSASLTAFNLEVINTNDAPVFESSPVLEVPAGGLYSYPL SASDIDPTYHISFELMSGPEWLSINSEFTLEGIAPEESAGEQFNIVVALSDGDVESPVLQEYLLTIVEPSVTELSSRFYF TPAPATAQQEVSLVLEITNSGLTAAEDVIFEIAISDELSINTIPAACSESESNKLACQLDIEIEAGGATTTLVALSVGEV ESGFTSADVSISGANLGGVVIEESAQLLLANVLSVLPGDSVISTPSSVGFTVDINGDSFVDLLSFDAMAMKTSILTNDGN GQLVISSSLDMIQDVKSMLVADINGDGALDLLTAGGSDADSVAYLLNGEQELSSYVVMDAVSADFILVADLLNDTAVEVV LAGLSQADVAIYSGFGTDTQDSLSITVSNLFNLPQPNALVASAQNGQELKEIDSNKISVSASNSSLDTAVTSLSVVQISE GVRLLASGDVSAPILVNLGDWTTDTVPAITTPVEKMQLVDVNGDDIADAFIYNDKGWSLITSVFETDAMASDVQLPDAKY IVVSDLNNDGVSEILFIMPQGVSIWHYYGLNDIRVDAAAIVTEELGQLALMDIDNDGDLDIVTFDGQKGVSLWYMNLAGG FGEQEIDLTVFAQAPNFPQVDQAGPISFSILNQSSGDATDVRLVITPSSGVNLSQLARGCSAEGDKVLCLVGGLAAGERA ELTVWVSANSAGEYSVDGLVSATQFDVNEENDKVTVMLNLPEPASSSSDAGATSIMCTIWLLMLLAYRRRQFS
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: COG2931
COG function: function code Q; RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
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NA
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NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
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Availability: NA
References: NA