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Definition Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome, complete genome.
Accession NC_010506
Length 5,935,403

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Identifier: 170724568

GI number:

Start: 238795

End: 248796

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: Swoo_0198

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 170724569

Following gene: 170724567

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>10002_bases
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GCCTGAACCACAACCAGTACCAAATATCCCCTACAGTGTTACAGTCCCTTCAATATCACTCAATGGAAGTTATGAAATTA
GCTGGCTATTAACCTCCTCAGGAAGTCCTTCTTTTTTGACCTATAGATTAAAAGAGTCAAAGAATGGAGGGGCATGGAAC
ATTATATATCAGGGTAATTTAAGTCACTACACCGTTGCTAATCGTCAAAGTGGTAAATATCAATACCGAGTTGACGCCAG
AATAGATACAGTCTGGGGAGGATATAAAACTTCTCAGAATACTTATGTAATTCGAACTCCTAGCTCCATTACTGTTCCGC
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GGCTCTGGCAGTTGGACCAGTATCTACAGTGGCACTGCTCGTAGTAGATCCGTATCAGGCCTTGGCACAAATAAATACCA
ATATCGCGTTAAAGCTAAATATGGTTCAATCAGTGGAAATTACCGCACTTCAGCAGTAACCTATGTGGTCAGAACTCCAA
GCTCTATCTCTGTGCCATCAAACGATGGCGATGGTGCTTACTCAATTAGCTGGGCAGCAGTCTCTGGTGCAACAGGTTAC
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ACGTGGTCAAAACACCCAGCTCTATCTCAGCCCCTTCAAACGATGGCGATGGCACTTACTCAATTAGCTGGGCAGCAGTC
TCTGGTGCAACAGGTTACCAGCTAGAGCAAAGAGTTGGTTCAGGCAGTTGGACCAGTATCTACAGCGGCACGGGTCGCAG
TAAATCCGTATCCGGCCTTGGCACAAATACCTACCAATATCGCGTTAAAGCCAAATATGGCTCAGTGAGTGGCAGTTACC
GCACCTCTGCAGCAACCTATGTGGTCAAAACACCCAGCTCTATCTCAGCCCCTTCAAACGATGGCGATGGCACTTACTCA
ATTAGCTGGGCAGCAGTCTCTGGCGCAACAGGTTACCAGCTAGAGCAAAGAGTTGGTTCAGGCAGTTGGACCAGTATCTA
CAGCGGCACGGGTCGCAGTAAATCCGTATCCGGCCTTGGCACAAATACCTACCAATATCGCGTTAAAGCCAAATATGGCT
CAGTGAGTGGTGGATACCGCACCTCTGCAGCAACCTATGTGGTCAAAACACCCAGCTCTATCTCAGTGCCGTCAAATGAC
GGTGATGGCGCTTATTCAATTAGCTGGGCAGCAGTCTCTGGCGCAACAGGTTACCAGCTAGAGCAAAGAGTTGGTTCAGG
CAGTTGGACCAGCATCTACAGTGGCACTGCTCGTAGTAGATCCGTATCAGGCCTTGGCACAAATACCTATCAATATCGCG
TTAAAGCCAAATATGGCTCAGTGAGTGGTGGATACCGCACCTCTGCAGCAACCTATGTGGTCAAAACCCCCAGCTCTATC
TCAGTGCCGTCAAATGACGGTGATGGCGCTTATTCAATCAGTTGGGCTGCCGTCTCTGGTGCAACAGGTTACCAGTTAGA
GCAAAAAACGGGTTCGGGCAGTTGGACCAGTATCTACAGCGGTACGGGTCGCAGTAAATCCGTATCAGGCCTTGGCACAA
ATACCTACCAATATCGCGTTAAAGCCAAATATGGCTCAGTGAGTGGTGGATACCGCACCTCTGCAGCAACCTACGTAGTC
AAAACACCCAGCTCTATCTCAGTGCCATCAAACGATGCCGATGGTGCTTACTCAATTAGTTGGGCTGCAGTATCTGGTGC
AACTAGCTATCAGTTAGAACAAAAGGTTGGCTCAGGAAACTGGGCAAGTATCTATAGCGGCACTTCTGTAGCTAAAAGCG
TTTCGGGGCAAACAAATAATACCTATCAATATCGCGTTAAAGCTAAGTATGGCTCTGTCAGTGGGGGATATCGAACCTCC
TCTGTAGTCACAGTCTTGTTACCCCCTCCAGTTCCAGCCAGTATTGCGACTCCGACCTCAACGGTTGCCAATGGCAGCTA
TACGATTAGCTGGCCAGCAAGCGCTACGGCGACAAGCTATACCTTAGCAGAAAGAGTGAATGGTGGAAGTTGGAGCCATA
CTACGGTTTCAGGTTTAAATAAGTCATATTCAGGCCGAGGAAATGCCTCCTATCAATACGCAGTCAGGGGCTGTAATGCA
TCAGCCTGTGGTGGCTGGAAATATAGTGGCACATTTAACGTGCTCAATAAGCCTGCGGTGCCAAGCTCCATAACCACACC
GTCGACAAACTATACTTCAAGCTTCACAGTCAGTTGGCCAGCGACGAGTACTGCCACTAGCTACACACTCGCTCAAAGTG
TAAATGGTGCAAGCTGGACACACGAAACCGTCAATGGCACCAGTAAAAGTTACACCAACCGCACCAATGCGACATACCGT
TACGCAGTAAGAGCATGTAATTCGAGTGGTTGCAGTAACTACAGATACTCAAACACCTTTACCAATACGCTCCCCCCTTC
ATCAATTAGTGTGCCTTCAAGCAGTACAACGGGTTCATTTACAATTAGCTGGGCTCAAGTGAGTACAGCCACAAGCTATA
GGTTGCAGGAGAGCGTAAGTAATGGCGCTTGGTCAACTATCGCATCACCGACAGCTACAAACTACAATCGAACTGGTCGC
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GGTCTTGATGCCGCCTCCAGTTCCTGCAAGCCTCTCTGTGCCTACGGTAACCAACACCAATGGCATAATAGAGCTTTCAT
GGTCCGCCTCTTCAACCGCAACAGAATATACGCTGCAAGAACAGAAAAATGGCGGCGCTTGGGAGTCGGGTACATTAGCT
GCAACTAGCTATACCCGTGCAGACAGAACCAATGGTAACTACATCTACCGTGTCAGAGCCTGTAATACATCTGGTTGCAG
TGGATGGCGGACATCATCGACTGTCACAGTCTTATTGCCACCTCTAACCCCGAGCAGTGTTTCAGTGCCCAGCTCCACTG
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GGCGCTTGGACAAACTTAGCCTCTCAAGGGGGAACAAGCTTTGCTCAAGTGGTCAATGCCGACGGCAGTTACCAGTACCG
AGTCAATGCATGTAATACATCGGGGTGTAGTGATTGGAAAGTATCATCTGCTGTCACTGTTACCTTACCTCCGGCATGGA
GACAAACAAAACAGACCTCAGTTACTGACGCAGGAGGAAGTGACACCGCCCCATCAGAATCAATCGATTTAACAGCCGCC
GTACTGAAAGGAAAGGCGGGCGTATCTGGTGGTCAAGCCAGCTACCAAATTCCAATCGACTTGCCACCAGGGCGTAACGG
GATTCAACCTAAGGTATCGCTAAGTTACAACTCACAAGGCGGTAACGGCATAGCTGGTGTGGGCTGGTCGCTCAATGCAG
GCTCTGCCATTAGTCGCTGTGGTGCAACCTACGCTCAAGATGGTTTCACCCGTGCCGTCACTTTCAGTGCTGATACCGAC
AGACTCTGTTTCAATGGTCAACGTCTTATCACCTTAAGTAGCAATGACAGTTACGGCACCAGTGGAACCGAATACCGTAC
CGAGATGGACAGTTTTGTCAAAGTGGTACAGTCAGGTGAGATAAACTCAGCTTCAACCAGTTTTACTGTGCATCGCCCCG
ATGGCTCACAAGCCACTTATGGCAGTAACGCCAATAGTCGCTTCACTCCAAGTGGCTTAACCACCACGCTAACGTGGAAA
GTGACGCAAGAATCTTGGGCTAATGGTAACAACACCATAGATTACGAGTATGACACCAGCGTAAGCGGTGAGCACCTGTT
ATCCAAAATTTACTACACAGGCTCAGCGGGAACTGATGGTGATAGAGTCGTCGAGTTTATCTATGAAAACCGAACCGATA
ACCGTAAAAGCTATATGGTAGGCGGTCAGTTAATCATCCAACGTCGTCTGAAAAACATCAGTACTTATTTCGGCTCAACC
AAAGTTGCTAAGTATGAGATGAATTACGGATACAGTAATGCCAGTGCTCGCACCTTACTTAGCTCAGTCCAGCAGTGTGG
CTACAAATCTGGTGCAGAACAATGCGTATCATCTACCCAATTTTCTTGGGCTGATTCTCAATATATAGAGACCACACCTA
AAATTGTGAGTTTTTCAGGACAAACATCAGTTTATGGCGAAGGTGAGCTGCAGCTTATCCAACCACTAGGTGATATCAAT
GGTGACGGCACACTTGATTGGCCGAATGTGCTCGCAAGTGCCGAGATGGAGTTAATATCTGAGCATCAAAAACCTGTAGC
CACTTGTCACTATACTTATCTCAGTGCTTCAAACACCTGTATTGCTGCAGATATTGATGCCGACGGAAAAGTAGACCTCC
ACCAAGTTAGCGCTGGCACTTTACATTTTTATTTAAGTAAAACAAACACCTGGTTTGATACATCAATAGCCATAAACTCA
TTAACACATGGCATTGGTGGGGACAAATACGATCAAGTTCAAGCTGTTAGTGACTACAATGGTGATGGTTATCCCGATCT
TCTCATTTATAGTTTTGGCGATGGTAAAGATAGGTCACTTTATCTCTACCCTCACAGTCAAAATATTGAAACTCCTTTTT
CATTCAATAGCCGATATTTAGTATCTAATGACTTCAATACTTTTCTAGAAAATTACAAATGGCAGCAACGCCGCAATGTA
GAAGCTGTTGGTGATATTGATGGTAACGGTTTGTCTGACTTTATGGTTTCAGATGTCTACAGTTCTGGGCATGGGTATAC
GCCTAATGAACCTAAGTACTTACTATTAAACAAAAGTACCCCGAGTAGTTTTAATTTTGAAAGCAAGCCCTTAGACAGTT
TACCTCAACGTGTTTTTGGTAGTATTTTTATCGATACTAACGGTGATGGATTAAGAGACTGGATACATTACTCAGGTGAT
GCAACCACAAATCAGGGTTGGATGATTAGAGTCAACAAAGGTGGAGGTAGTTTTACTTCAGCAACAAAGTTTGCTTCAAC
AGGCACTATCCCAATCGGGTTAATCATGCAAGGTAATCCACAAGAACCCACGGATGAGTTTTATTATATTGCTCACCAAC
GCGCATTTAAAATTGCAGATATAGATAACGATGGAATAGAAGAGCTGTTATTCCCTCATGATGTTTTAACTAATGGATGC
ATGTCCTTTAATGGTAACTACCAACGTTGTGGTTTAAGTATTCATAGTCCAACAAGTGAGCTAAGTACACCATTGCTGAC
TCAAATGCGTAACAGCGCCCAAGATGATCAGACGTTATATCGATACAAGATGCTAAAATTCTCGCATCAAGATTCAAATA
TATCAGCCGTAAAGCTTAACTCTCCATTTATGGGGACCTATGGCGAATCGGCGCTAATGGATGCTAATGGTAATGGTCTA
TTAGATATGGTATTTGCCTACGGTCCGGACTCAAGTGGTGTATGGCTAGAGTCTCCAGAAGCAGGACCATTAGGAACTGA
GTATGGCTTGTATATTCAACGTGGGTATGGTTCAGGTTCAGGTCAAACTGCAAATGATTATGATGCCATCGATTACTTAC
AATCAGTTACCGATAATTTAGGAAACCAAAGCCAATGGCGTTTCCGCCCCCTATCTACTGGCGAGAACAGTGCTGGCGAG
TTAAAAGTTCATAATCGCGTAGATGACTATGTCGGCAATGGCTACATCCACTTTGGCTCTAGCATGTATGTGGTGCAATC
CTTTGAGCAAAGTAACGGCGTAGGCGGTACCAGCGAGACCGAATACGCCTACAAAGGCGCCATGTATAACCTGCAAGGTC
GAGGCTTTACCGGCTTTAGGGAGATAATCGAAAAAGATGTTGCGCGAAATCGCGTCACTTCAAGCGTCTTTAAGCAAAAA
TTCCCCGAGGTCAGCCTACTCGAATCGCAAACGGTTAACATCGATGGCACCACAGTTGCGACAACAGAGCAAACTTGGGC
CGATAACCCTCAACACACCATTAGCGGTGTCTATCACAACATCAACACCAGCACGGTCACCCATAGCTATGGCCTCAGCG
GGTCTAGCGAGCAACGCTCAAGCGTTGAGCAAACCATTGATACTGCCGATGTCACAGAGCATGGCAATATCAAAAAACGC
ACTAAAGTGGTCACCGACTATATCGATGGTGGCGCTAACCGCTACCAAACAGTAGTTGATACCGTGTTCATCCCCGACAC
CGATAACTGGTTCTTGGGTAAATTTGAGTCTAGAAAAACGACCACTAACGTCATGGCACGTGGCTGGGCGAGTGACCCCT
ATACAAGTACCGACACCGAGCAGTGGCAAACCCTCACTGTCGACAGTTGGGATACCACTCACTATAAACCCACTCAAGTC
ACTCATACCGCCAGTGGCAGCAGTTGTAGTCGGCTAGAGTCGACCACACTCAACAGCTACGGCTTACCAAGTCAGGTCAG
TGTCACAGGTGATAGCAGCAGTTGTAGTGCATTAACGGCGCGTAGCACCTCGTTCACCTATACCAAAAATGGCACTAGCC
AAGCCGATGACGGTTATTTGCCCTATAAAGTCACTAACGCTAAGGGCCATGTGACAACAACCGAGTATGACATGGGCTTA
GGCGTACCGACTAAGGTCACTGCGCCAAATAGCATCATCACTCAAACTCAGTACGATGCCATCGGTCGCCCAGTGCAGAT
GAGCCAAACAGGCAGCCCGACCCAATACCTGCGCTACCTGTTAGCCTCCAGCGGCAGTCATGCACCAACACATGCTAAGT
TGATGACCCGCACCACCTCTGCCGGCATGCCAACGCAAGAGCTCTATCTCGACAGTTTAGGCCGCACGCTGCGTAGTGCC
ACTCAAGGTTTTGATGGCAGCAATTATCAATATCTGGATAAAAAGTACGACAGCCTAGGGCACCTAACCCACGAGTCGCT
GCCTTTTTATGATGGCGATAGCGCTGACTACACGATTTTCAGTGATTTCGACGGCTTCGACAGACCAAAGCAGCGCAGCT
TGCCTAATGGTGAGTCGGGCGGGTTAATCTCCACCTATAGTTACACGGGCCTTAAAACCGATATCACAGTTGATAGTCGC
ACTATGTCCCGTACCTACGGCATGCAGGGGCTGCTCTATGAAACCGTCGATGCCGCAGGTGGCAGTAACCGCTTCGCCTA
TGACGGCGCAGGGCGACCACTGGTTATTCAAGACGCCAACAGTCAACAGATAAAGGCCAGTTACAACGGTTTCGGTCATA
AAACTCAGGTAATCGACCCTAACCAAGGCACCACTACATTTGGCTATAACACCTTAGGCGAGCTCGACAGCCAAACCGAT
GCCAATCAGGTAACCCAGACCTTCGCTTTAGATACCTTAGGGCGTATCACAGCTAAAACCCTCACTGGCAGTAATGCCAA
TGGCAGTGCCAGCTACACTTGGGATACCCTTAAACAGGGCATGCTCAGCAGTGAGACTCAAAACGGCATTACCCGCAGTT
ATAGCTATACAAGTAACCTGCAACTGGCCACAAGTTCGGTTAAGGTAGCAACTAGCGCAGGGGGTGATAATGTCACTCGC
ACCGTCAAGCACCAGTACGATAGCTTCTACGGTCGTCCTAAAGCGTTAACTTACCCCAACAACTTAACGCTGGAATATCG
CTATAACGATACGGGCTACCTCAATCAAACCCGCAATGCGGCATCGGGGTACATCTACCGTACGGTCACCGACATGGACG
CCGCTGGTCACTTAACCGGCAGCCAGATGGCCAATGCGCTGTTAACCCAAAGCAGCAGCTATAACAGCGAAGGCACCATG
GCCAGCACCCAAGTCACTAGCAGTTTAGGCCTGCTGCATCAGCACTATTATGAGCAATACGACAGCTTTATGAACCTCAC
CGCAGAGCGTAATGCGGTCACAGGATTAGAGAAGCGCTACGTTTATGACAACCTCAACCGACTAGAGCAGTACAGCTTTA
GCAACGCAGGGTTTGCGATTTATGACAGTGCAACCCCGTTTGCGGCGACCGTTGATTATGGTTATGACGCCGTGGGTAAT
CTGCTTAAAAAGTCTGATTACAGCCGCAACACCGCCAACGCCTATGAGTACAACAGCAGCTGTACTTCAGACAGCAACGC
GGGGCCAAATGCCGTCTGCGCCATCACGAAACTGAATGGCACTAAGGTCAGCTTTAAGTACGATAAGCGCGGTAACTTGA
TAAGCGGTGACAACCTCACCATGACCTACAATGCGCTGGATAAGCCGTTGACGATTAGTGGTCGAGGCCCTGGCAACAAC
ACCAGCACAGGGTTTGTGTACGGCAGCGACAATATGCGCGCCCTGCAAACTCGCACAGTGAGCGGCACTACGACCAAGAC
TCACTATGTCGATAAGTTGTTTGAAACCGACAACGACGGCAGCTGGCGGGCGTACATCTCTGATATCGCCGTGCTGAGTT
ACACGCCGCAGAAGAGCCATCAACTGCTCTACACCTTGCGAGACCGCTTAGGCAGCGCCACTACGATGGTAGACCATCAA
GGTAATGTGATAAGCCGCCGCTACTTCGACCCCTTCGGCCGTACTTCCACTGCGAGTACAGCAGGTAGTTTAGGGGACCT
ACTCGACACCAACCGTAATCGTCGCGGCTTCACCGACCATGAGCATTTGAATGAGCAGAAGCTTATTCATATGAACGGTC
GAGTGTACGACTATAACCTTGGTCGATTTATGTCGGTGGATCCTTTGATCCAGAGTCCGACATCGACCCAGAGTGTGAAC
CCTTACTCTTATATAATGAATAATCCGCTAGCGGGGACGGATCCGACAGGGTATAAAGCGGAAGTGGATGAGCACAAGAT
AAAGGTTTCAACGATAGGAAGCCGTATTAAACAGACAGTTACTGCGACAGTGAGTAAATCAGGAGGAACAACTAAGGTTC
ATCTTACTGGTGGTAATGGAGCTGCTCAAAATGCAGTTAAAGGTGCTATTACTGGAAAATTAGCAAGTGCTGGATTTAAG
GTTAGTGATATTGGGGGGGCGAAAGAGGTTGCACAGGGAGGGGGGGATAGTGTTCAGAATAAATCTGAAAATGAAAGCTT
AGGCTCCACTTCAAAGTGGAATAAACCTACTGACTCGCAACAATTAACTATTAAGGATAAGGCTAAAAGTGAAATCACTA
AGAATGAAGAGTTTATAGCATCGCTTAGAACCCCAGATAGCAGTGGTTATCGAAGAATTGCTGCTGCATATGGGTACAAT
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AGAGAACCCATTACAAGTTAGCGTTTTTCAAAACTATGGCGAGGATTATGGACAAGAGGTGGGTGGTAGAATTGCAGTAT
CGACTTTGTACTTAAGTAAAAAAAGTGATGTAACTACAATGTCACATGAGTTGATGCATACTCTTGGCTATGGGCATGGA
ATAAAAAACTTTGATACCTTGTCAAGCTATGCAAAATGGGCTCGTAATCCTGTGATTAACCGTTGGCACTCAGATTTGTC
AACTCTTGCTGATAGAAAAAGTTATAGAAAAATATTAAAGGACAATGTATATGTTTATGAGAATTCACTTAATGGAAAAT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTCAAAAACCGCAATAAAACCAATATTCGACTCTGTTGACATTGTGTTTCAAAATGTTTACGTTTTATACAACCTT
CGACCGATAACTGGATTGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATGGTGGTATTTTTACTTTTGGTAATCAGTTTTAATGTTTACACAGAAGAAATTGAAGGGATTCCTAATTTCAATAGAA
TAAGAGTTATATCGGAGTGT

Product: YD repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>3333_residues
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IIYQGNLSHYTVANRQSGKYQYRVDARIDTVWGGYKTSQNTYVIRTPSSITVPLSDTNGAYSVSWAAVSGATGYQLEQRV
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GDGAYSISWAAVSGATGYQLEQRVGSGSWTSIYSGTARSRSVSGLGTNTYQYRVKAKYGSVSGGYRTSAATYVVKTPSSI
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SVVTVLLPPPVPASIATPTSTVANGSYTISWPASATATSYTLAERVNGGSWSHTTVSGLNKSYSGRGNASYQYAVRGCNA
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Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG3209

COG function: function code M; Rhs family protein

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA