Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 170761965

Identifier: 170761965

GI number: 170761965

Start: 581592

End: 584333

Strand: Reverse

Name: 170761965

Synonym: UPA3_0505

Alternate gene names: NA

Gene position: 584333-581592 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170762187

Following gene: 170761922

Centisome position: 77.74

GC content: 22.43

Gene sequence:

>2742_bases
ATGAGATTAAAAAATAAAAATAAATACTGAAACTTACTTATTGCTTCATTAATATCAATACCTATTATCAGCACCATTTC
TGCATGTAGTTTTAGTGAAACCAGATATAAATTAAAAGTTTTAGATTATTTTTTAAAAACAGAAAATGACGATTATTATA
TTGCTTATGAATTTAATAAATTAACAAATGAAGATATGCAAAAAATGCCAAAAGTTATTTTTTCAACAAGTATTATTAAT
AGTTCAAACCAAAAAATTGCTTTTTATGTTGATATAAAACCAATTATTATAAATAATCGTATTTATATTCGCTTACCCCA
ACGTCCTAAACCCAATGAAAAAATTATTATAAATTCAAGTCAAGAATTTGTTGGCGTTCAAGTGATTCAAACTAATAAAA
TGTTGACTAGATCCATTAATTTTAATTTTAATAAAGAAGATCATTTAATTAAAGTTGTTGACCAGAGTGCCCGATTTACT
AACATTAAAAAAACAGAAGTTGAATTCGAAATTAAGCTTTTAAATTTAAATCTTAATGATATTAAAGATAAAAATATTGA
AATTGAATTAACAAATAAAAAAACAAATAAAACCTTTAAATTGCATTTTCTAAAATATCAATTTAATCACTTAACACAAC
AAAATAAAAAACCAGTATTAACTATTACTGCTAATTTAAATGCTGATGCAAATAACCAATTAGATGATGGCGAATATTTT
ATTTCTAAATTAGTTTTAGACCAAAAAAAACTTGAAATTAACCAAAGCGTTTATAAACCAAGTGGGTTACAGTTAGATGG
AAGTATTAATAATCAAAGACCAACTTATTTATTAATTCCATCTGTTTTTTCAAAATGAACAAAAATAAATGTTTTAGATA
CTAAAGTGATTAAAAATGATGGAATTCCACAACAATTACAACTTTCATATGATCATTTTATTAACCCATATAATTTTAAA
GATAATATGTTAAGTGCAGATATTGAACTTATATCAACTAAAAATAATAAAACTATTATTTTAAAATCATTAAAGTTTAA
TCACGATAAAAACAATATTGTTTTTGATTTAGTCAATAATTTAGAATTACAAACTCTTATTTTAAAAACTCCTTTTTTTA
AAATTAAATCATTAACAATAATGAATGATAAGCAAACTTTGCCATTAAGTATTAGAGAAAAACAGCTTGATTTAACTAAT
AAACATCTTTCTAAAATCATTAAATTTACATTTGATGATACTGATCCACAAAATATGCTTATGAAATTTCAATTAGATAG
TGATTCGCCAATAGTGCAAAATACTAAAAAAGTTTTATTAACAATTAAAAAAATAAATACAGATCAGCAAGAAGATATAA
AGACCTTTAGTTTTGATATTTTAGAAAACAAAATAACAACAGGTTCTTTTTATGATGTAAAAAATAAGTATTTTCTATTA
AATCTAAATAAAACTTTGAATGCTAAATCGATAGGTCAAATTCTTGAAAATGATTCTAATTATATAATTACTAAATTAAC
TGTGGTTAATAATGAAGCATCAATCAATGAAATACCAATTGAAATTGATGATTTACAAAATAAACAATTTACGTTAAAAT
TTGCTGAATACCAATCAAATGTAATTAAATTTAATGCTAAGAATGATCCTGAATTACATCTTAATATCAAACATTTTAAA
CAACTTAATCTTACAAAAATTAATAAAATTAAATTGACTTTAAAAGACGGTAAGCAAATTATTTTTAATCGTTTAAATAA
TGAATTTAGTTTCCAACAAGCAGGATTTAAATTAAAAATTAACCAAAACACATTTCCAAATTATTTAAAACAACATCAAT
ATGTAATTAAAAGTATTAGTTTAATAAACGATGATCAGTCTGTGATTGAGTTATTATCAAAACACAATCATGAAGCTATT
TTTGAGATTCCTATTACAGCATCTCTTGATACTTGAGAATATGACAAAATCCATAATATATTAAAAATTAAAATGAAATT
AGATAGTTTAAGTTTACATCAAAGCTTAAATCCATCAGATTATGCTTTAAATTTTTATAATCTTGATACTAATATTATTA
ACCGAAAATTTACACTTAGTCCCCAAACTGTTTTATCTTCAAAAGTTAATAATTCAAATGTAATTGAATTAATTTATGAT
TTAGATAATGATGAAAATATTTATGGAGGTTTAGAACCTGAGAGCACTTATCAAATTAGTTCGTTAATGATAAATGCTAA
ACCAGTGATTATTAATACTTCTATAACAATGGTTCAAACTAACGCTTCAGCTTCTAAGGTAGAAAAAATTGTTGCTAGTT
ATGATTCAGTAACCAAAAAAACAAAAATATCATTGCAGTTTTCTAATAATTGATGATATAACAAAAATGCGGATCATAAA
CTGTTTGCCATTATTTCGTCTTTAAAGCCTAAAAATAATAAAAATGCTAATTGAACATTTTCATTATCTAGAACGTTTAG
CAATCCTGAAGCAATTAATTCAAACAAGGACAAAGATTTTGTTTTAGATAAAGCAACTAAAACTTTAACATATGTAATAA
ATTATGCAAATATTGACTATAAAGATCAAAATGATCATGAGTCATTTGATTGGTATTATGATGATTTAGTACTTAATAAA
GTAACAATCATTTATAATGATTTAACAACAAATGATATTAGTCCTTTTTCTAAAGATGATCAAAATTTAACTATTAAACT
ACCAAACAAAATTAATTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTTAACTAAAAATAGCATTAATTTTTATTTAAATTTAACTTAATTACAACCGGTATAAAATATAAATATTTATTTG
TTTAGTGGATTGAATAAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGATAAAATTTTTTTAAAAAAACTTATTTTTTATAAATAAATAAATAAATGAATTCTATATTATTCATTTGCTTTGCCTT
GTTTAAAAGATTAAAAAAGG

Product: putative lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 913; Mature: 913

Protein sequence:

>913_residues
MRLKNKNKYWNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN
SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT
NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF
ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKWTKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK
DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN
KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL
NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK
QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI
FEIPITASLDTWEYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD
LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNNWWYNKNADHK
LFAIISSLKPKNNKNANWTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK
VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS

Sequences:

>Translated_913_residues
MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN
SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT
NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF
ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK
DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN
KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL
NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK
QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI
FEIPITASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD
LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK
LFAIISSLKPKNNKNAN*TFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK
VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS
>Mature_913_residues
MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN
SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT
NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF
ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK
DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN
KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL
NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK
QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI
FEIPITASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD
LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK
LFAIISSLKPKNNKNAN*TFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK
VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104786; Mature: 104786

Theoretical pI: Translated: 9.63; Mature: 9.63

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC
TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ
CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC
EFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI
CEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC
KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI
CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH
SKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI
HHHHHCHHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC
PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLE
CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCE
LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMK
EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE
FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL
EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC
NKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI
CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE
KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ
EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC
NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPITASLDTEYDKIHNILKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE
KMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDN
EEEECCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC
DENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKI
CCCEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNANTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKAT
EEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC
KTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIK
CEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
LPNKINS
CCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC
TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ
CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC
EFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI
CEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC
KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI
CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH
SKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI
HHHHHCHHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC
PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLE
CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCE
LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMK
EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE
FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL
EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC
NKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI
CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE
KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ
EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC
NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPITASLDTEYDKIHNILKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE
KMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDN
EEEECCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC
DENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKI
CCCEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNANTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKAT
EEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC
KTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIK
CEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
LPNKINS
CCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA