| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010503 |
| Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761923
Identifier: 170761923
GI number: 170761923
Start: 515965
End: 519351
Strand: Direct
Name: 170761923
Synonym: UPA3_0474
Alternate gene names: NA
Gene position: 515965-519351 (Clockwise)
Preceding gene: 170762359
Following gene: 170762137
Centisome position: 68.64
GC content: 22.32
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1128; Mature: 1128
Protein sequence:
>1128_residues MKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALKDVLFSKEGQNEFLLSNVKKV VYDWAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPNDWQSVLQSELYDTEGGSEKSWKEAKLIDQAYKSITSSIF DDNDNWISVLNDQNQLIDAYSNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLSFANI EFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPWFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSKDDTNNIDKKFNNNND INKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKKDKTA FLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLRNENSVDLWGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSVKKQG YDIKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNYYDNLIDKLNDKLIK FNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVANNKNS QSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTNNFSN FDNLKKVYEQALKLWNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLKKTANHQPLFIGWK ALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYWNSTVNKDGS VYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYDLNFN AEANAEFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNATPLVNKEDNAN LKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLANNSNL KGWIINNL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 128353; Mature: 128353
Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.3 %Met (Translated Protein) 0.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.3 %Met (Mature Protein) 0.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHH DVLFSKEGQNEFLLSNVKKVVYDAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPN HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DQSVLQSELYDTEGGSEKSKEAKLIDQAYKSITSSIFDDNDNISVLNDQNQLIDAYSNDA HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCHH TKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLSFANIEFKY HHHHCCCCHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEE DDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSK CCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DDTNNIDKKFNNNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNL CCCCCHHHHCCCCCCHHHHEEHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC DENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKKDKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLR CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE NENSVDLGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSVKKQGYDIKAK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCHHHCCCCEEEH IKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNY HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEHH YDNLIDKLNDKLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGN HHHHHHHHHHHHEEECCCEEEECCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEECC KNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVANNKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANII CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTNNFSNFDNLKK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHH VYEQALKLNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLK HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH KTANHQPLFIGKALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQN HCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCCEEEECCC SQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYNSTVNKDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFD CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYDLNFNAEANAEFKT HHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH ILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNA HHCCCCEECCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TPLVNKEDNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALN CCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHEEC DQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLANNSNLKGIINNL CCEEEEEEHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHCCC >Mature Secondary Structure MKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHH DVLFSKEGQNEFLLSNVKKVVYDAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPN HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DQSVLQSELYDTEGGSEKSKEAKLIDQAYKSITSSIFDDNDNISVLNDQNQLIDAYSNDA HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCHH TKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLSFANIEFKY HHHHCCCCHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEE DDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSK CCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DDTNNIDKKFNNNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNL CCCCCHHHHCCCCCCHHHHEEHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC DENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKKDKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLR CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE NENSVDLGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSVKKQGYDIKAK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCHHHCCCCEEEH IKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNY HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEHH YDNLIDKLNDKLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGN HHHHHHHHHHHHEEECCCEEEECCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEECC KNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVANNKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANII CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTNNFSNFDNLKK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHH VYEQALKLNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLK HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH KTANHQPLFIGKALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQN HCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCCEEEECCC SQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYNSTVNKDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFD CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYDLNFNAEANAEFKT HHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH ILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNA HHCCCCEECCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TPLVNKEDNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALN CCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHEEC DQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLANNSNLKGIINNL CCEEEEEEHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA