| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010503 |
| Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761857
Identifier: 170761857
GI number: 170761857
Start: 670968
End: 677759
Strand: Direct
Name: 170761857
Synonym: UPA3_0580
Alternate gene names: NA
Gene position: 670968-677759 (Clockwise)
Preceding gene: 170762005
Following gene: 170761914
Centisome position: 89.26
GC content: 24.25
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGACGGCCGTAAAGACCGTCTTTTTTTTAATGTTAATTGCTTGTTTTTATTTTTGTAAGATTTTTTTTAAAACATTAA AAGAAATGGTTGGATTCGCT
Product: efflux ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2263; Mature: 2263
Protein sequence:
>2263_residues MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQSDFLIDTKEQDNINFNEIDVS NNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNLFWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDWNKINQLKLQTVFWFENNK ENNQNFANNYDDLVYEYHNSKNQLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGF KNKSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSVNLHVDFNTLSTKYLLFAN YLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDDPKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSAL ENKNKIRDYEMQLKQINIALQNSNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAI YNDVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQWIDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNSNKINNFYDLYSNYIKVI QILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTPWINTSLINIYQLPQFFNILFNQSEWLLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEW IFNLKHKDWQDGEQVVAIYKNADSNSDQKEYYFNGYVKNQRAYINVKYNKNLPTRLKLINIIKQNQINQKNNLVNVLDQD LNDYAKIINFKKGIKDINTNQQSVYDQWALNNPQDYAMFKIWLSKIIKRYYFLRLQQSPYGYTIQAQNVLSKALLLPFTI NIINRSSDLAYVSTSYIKANQRTTKNINNYKEIGNYEDFLQALKLPYRIIDDQPNYREITLPNGRKKRIAKDYYSWINYV VSPANKIEINGQFFFIIGAVDSPEFLFPAINDSDILINKQKSTVLYVNDSGFAKLKTISASVPILEYYTLKVNTNDLNLL QKNNVYNEIKSELLDSKKGNIYKRTDKDNPYPIYVKRTFFLTQLRNLIIAIALSLIVLILLLGIYFVTSSIKNMINKNKV MFGAMQAQGVSRWQVWFSFAPFYTIPSLIVLIIGYSISYEIQPLIMRLFSSYWLIPIPDQFVSVGWIFAIPIALTLILGF ICWVLIYYILKHSTAETMKGDAGFKINKFIIKTKAIFLKFGAIRVLKATYVVANLARMLILLVIASSFSIIASIIATTKN NFSQSASITNAKREYQYAVDLYSPTEQGGFYYISKFDEMGVSNEYAPLKQIVKNVKIVIKIKNLVNKKVNVVYINNQTKQ KVIIEALINDKGIITFKTNQLVKGSFQFEGIYEQETNRVLINSQNLNPSLLNIDNRKIGHFIYSNQKQYIYLLKSYFNDN DVILDYVDANNQHTYLKAKTLGQYLVFDPSQLKQKQKYQLVNVINHKGNTWVDLNNISNDLKNLDYSKNGRYLYDYYGRL PYLYFNHLPQNLINQKVYLTYTINQNDEFRIYGIVNKEKEVVFDLTKLKINTQQSYQLRDMRIANSDLLIYDNKQHEFNN NILYFDNNYYGLNNNNQKQINIDYLTPNRNLYLTLKAMGNEFVNKKKIPFIMTKAMASLVEPDTAILDYNELEKGYVYQI STATLEGSDTNLYLDNVNSIDKTKDNGLPYSSLKYNNAMREIKNLGTDHPVYGKMLSNVYYPSISTQPEILQNIRFFDSK VISKSSLDGNISVKATDVNIEFNPWVFAKTFLPITAIARSELNEKHLLDEAFKTFGYEIINGKKINKLYDVPNFEDNGII HQISLWTKNGLPPKSENDENAFFIKQNGQWKINEKPGVLTEQGAAEFLPEFLRLITQMYTFKTTRYLQYKAGLKFVNIED EKVQQPYTYLLGKMQTKTKRFANEIKILGINYEKNKFINGKPSPTTQLSLINDQGVNLIDLIKNDDPNNEIHNIIINKVV AQKYHLKINDVFEYQINNHIKRLSNKFNNTPENYKTKFKVVGINDSLMDEQLIINQKVANKLIGFDDYRRRIQIENGYPI IEEREFNGFFTKEKEPIFFNNMASFYSPTGLSPAIDSWPQNLLENIGGNVQSINIYWIFYYSWDLANSILNASFDKNKIT WEPFSEINLDKLLKKIGKIFGKEANLPSFKAVDANIENEIFASVVDKTSFTLLLNIITAIIPSLVIIIILVASTLANESR RLIAIMKVLGMRDFRNVNNFMFIYPIVWLLNILIATPLSFGIIHIYKLAIFAAFNIVLVASIPWWIFVISYGFVGIVLLF AWLQMLYKTKKLNLPKALNQFNN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 259023; Mature: 259023
Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQS CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DFLIDTKEQDNINFNEIDVSNNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNL CEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCE FWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDNKINQLKLQTVFFENNKENNQNFANNYDDLVYEYHNSKN EECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCC QLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGFKN CEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC KSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSV CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE NLHVDFNTLSTKYLLFANYLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDD EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC PKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSALENKNKIRDYEMQLKQINIALQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEC SNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAIYN 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