| Definition | Escherichia coli SMS-3-5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010498 |
| Length | 5,068,389 |
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The map label for this gene is 170682228
Identifier: 170682228
GI number: 170682228
Start: 4174246
End: 4176654
Strand: Reverse
Name: 170682228
Synonym: EcSMS35_4083
Alternate gene names: NA
Gene position: 4176654-4174246 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170682949
Following gene: 170683636
Centisome position: 82.41
GC content: 31.22
Gene sequence:
>2409_bases ATGGTCGCTAAATTAAAACCAGATGTTTTTGTTAATACTAATCCTTTTTTAGAAGCAATGTATAAGGAGAGGCTTAGTCA TAAAGGCTATTCTGATAAAATTGCTTTAAGTATTAATGATAAGAAATATAATGTAAACTCTAAGGATATTGAAAATATTC TTGATGGCAAAGGGGATTTATTTAAAAAACGTACACTGTGGGAGTTTGTTCGCGATCTTTTTCCTGGATCTCATATTAAA GAAGTCAAAGGTTTAATTTACGAATTTGTCACGAAAGTTGATAATAAAGCCGAGGTGTTCGATAAGATTAAATCTCTGGC AAAAAAAGAACAACAATGGCGATTTAGTACTAAGACAGACTTTACCACAAATGAAAATAATGAAGTTATTGTGAGTAGAT CCTTTAATCTCTACACGGGGGCTACTTCGAATGATAACGAAAAAAAACAGGTTTCTTCAGAGAGATTAACGCTTGATAAT TATATTGATGATTTACATTTTGATAATTCTCCCTTGAAGAGATTTACGTTTGATGATTATGCTGTAAAACTTACGACACT GATTAAAAATAAAATTCCTATTATTAATACAACAATCAATTTATCATCGTTGTCTAAGGATGTTTTAAATTCATTAAAAT ATTGTAGTTTTAAAAATGTAATTTTTTCAGGAGTGATAAACAGCCCTAACCTTGAAGGTCCGGTTTTTGAAAATTGTTAT TTCGAGGATTGTAAATTCAACAACATACAGCTTTATGAGACTAATGATGATACTGTGGGGTCAGGAAATAAAAAACCAAT AAAAGGTATGTTTAAAGGTTGTTTTATTTCTAAATGCAAAATTGAAAATTATAGATGTGAGACGTCTAAAATCTACACCG TTACACAACCTGATAGTATTCAAGAAAAATTAGGTTCTTATCTCTTTATGCAGTCTTTCGTTCAGGATTGTATAATTCAG GGAGGACGTTGTCCTGGTTCGAGTATACTTCTGAGTCATTTTTATAACTGTACGATAGCGAAACTTGATGCTCATGGGAT GGATTTTTTGGCAAACGCATTCAATAAGTCTGGTGATAACGAAACCAGGGCGCAGGATCAGGGAACTGTGTTTGATTGTT GTAATTTGAATAGTATTAAAATGAACTGTGGTCTTGGTAATGTGAGTTCAGATGAATATAAGTTTAACCCCGAAGAGTAT TTTTCTGATTACATTGAAAGAAGATCGAGAAATCTTAAGTTGGATGATAATTTTTCTAACTGCGTAGAGAATATCGAGAA GGCTGTTACAACTTCATTTAGCAAGGAAAATTCAGAGAATGATAATATCTCCTTTAATTGTTGTGATTTGAGGAGGGCCA ATTTAGACAATTATTACAGAGAAGATTTGTGCAAAGACTGTTCTATTGATCCAGATTCAATTTATTTAGAAGATGGTGTT ACACCGATAAAATATATTTATATGAATCTGGACGGAGCTATAAGTAAAGACCAAATACCTAATTTCTTAAAAAAGGTAAG TGCTATCAATAGCGATGTAAAAGATTTTTATAATACTGAGCTAAAGATTAAGGAAGAATATAATAACGCATTTTCAGATT TAGAGTCGTTTTTGTCTACACTTTATGTTGAAAATAAATCGTACAAAGAGAAATATCATTTTAATAACGGTAGGGCTGAG TTTTTTATTTTCAAAGATATGCAGTATAAAGCACAAAATATCATTACTAATATGATAGAAAGTGACCGAATTAAGTTTAT TGAATCTATCATAAAAAAAATCATTCCACCGGCAGATGTAAAAATGCCTACTAAAGATTCAGACAAATTTATTCGACAAA AACAGCATGAGTCTCATAACCAATTTGATATTGATTATAAATTGAATTATGGTGACCTTGTCCCCCTTTTTGACGGTGTT GAAGAAAAACAAATTGAAGTGCTAAAAATCCAACTTGAAAATATAAAAAATTTCAAAGCATATTACGACTCAGAACTCAA TAAGTTTGCTTCCGATTTTCGAAATTTTTCCGGTGCATTTGCAATTAACTGGGAGGATTTACTAAAAAACTATCAGGAAA TAAGAGCTTCCATTAAAGATTACGATGACTTATTGCGAGAAATTAAAGAGTTAACCATAAGTCGGGATAAATCATTAGAG GAGAAAAGTACTTTATTTGATAACAAAAGGGACAAGTGGAATAGTCAAGAAGTACAGGATGAAGTAAAGGCATTAAATAA GAAGATTGCTGACTGTGACAATGAGATACGTTCTAATCTTAATATTGTTCAAAATTTTAGACGCGAGAATCAATATAAAG CTAATAAAAAAATCAGTAACGCGATGCTTAATATTCTGGATTGGTTCGAACGGTATCCCGATATTGTGAAAAATATAACC CAGGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAAGTAACACTTGTTGCTAACCTAACTAGCAGTACAGTTAATTAACAACATAGAAGTTATTGTTTTTCAAACAACTCAA TATTGCACGCCGGAGGATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CCATACAGAGGGTGAGCGACTGGACGATTAACGACATAAATTATTTACAGGGAATAGACGCTTACTCATCAGACACCTGG TATTTTTTATCTCAAACCAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 802; Mature: 802
Protein sequence:
>802_residues MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT QA
Sequences:
>Translated_802_residues MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT QA >Mature_802_residues MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT QA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93209; Mature: 93209
Theoretical pI: Translated: 5.51; Mature: 5.51
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDL CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEECCCHHHHHHHHCCCCHH FKKRTLWEFVRDLFPGSHIKEVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTD HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC FTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDNYIDDLHFDNSPLKRFTFDDY CCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCHH AVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY HHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSI CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCEEECCCEEEEECCCHHH QEKLGSYLFMQSFVQDCIIQGGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCC ETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEYFSDYIERRSRNLKLDDNFSN CCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH CVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCC TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLST CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVENKSYKEKYHFNNGRAEFFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADV HHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGVEEKQIEVLKIQLENIKNFKA CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISN HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMLNILDWFERYPDIVKNITQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDL CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEECCCHHHHHHHHCCCCHH FKKRTLWEFVRDLFPGSHIKEVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTD HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC FTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDNYIDDLHFDNSPLKRFTFDDY CCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCHH AVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY HHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSI CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCEEECCCEEEEECCCHHH QEKLGSYLFMQSFVQDCIIQGGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCC ETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEYFSDYIERRSRNLKLDDNFSN CCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH CVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCC TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLST CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVENKSYKEKYHFNNGRAEFFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADV HHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGVEEKQIEVLKIQLENIKNFKA CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISN HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMLNILDWFERYPDIVKNITQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA