Definition Escherichia coli SMS-3-5 chromosome, complete genome.
Accession NC_010498
Length 5,068,389

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The map label for this gene is 170682228

Identifier: 170682228

GI number: 170682228

Start: 4174246

End: 4176654

Strand: Reverse

Name: 170682228

Synonym: EcSMS35_4083

Alternate gene names: NA

Gene position: 4176654-4174246 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170682949

Following gene: 170683636

Centisome position: 82.41

GC content: 31.22

Gene sequence:

>2409_bases
ATGGTCGCTAAATTAAAACCAGATGTTTTTGTTAATACTAATCCTTTTTTAGAAGCAATGTATAAGGAGAGGCTTAGTCA
TAAAGGCTATTCTGATAAAATTGCTTTAAGTATTAATGATAAGAAATATAATGTAAACTCTAAGGATATTGAAAATATTC
TTGATGGCAAAGGGGATTTATTTAAAAAACGTACACTGTGGGAGTTTGTTCGCGATCTTTTTCCTGGATCTCATATTAAA
GAAGTCAAAGGTTTAATTTACGAATTTGTCACGAAAGTTGATAATAAAGCCGAGGTGTTCGATAAGATTAAATCTCTGGC
AAAAAAAGAACAACAATGGCGATTTAGTACTAAGACAGACTTTACCACAAATGAAAATAATGAAGTTATTGTGAGTAGAT
CCTTTAATCTCTACACGGGGGCTACTTCGAATGATAACGAAAAAAAACAGGTTTCTTCAGAGAGATTAACGCTTGATAAT
TATATTGATGATTTACATTTTGATAATTCTCCCTTGAAGAGATTTACGTTTGATGATTATGCTGTAAAACTTACGACACT
GATTAAAAATAAAATTCCTATTATTAATACAACAATCAATTTATCATCGTTGTCTAAGGATGTTTTAAATTCATTAAAAT
ATTGTAGTTTTAAAAATGTAATTTTTTCAGGAGTGATAAACAGCCCTAACCTTGAAGGTCCGGTTTTTGAAAATTGTTAT
TTCGAGGATTGTAAATTCAACAACATACAGCTTTATGAGACTAATGATGATACTGTGGGGTCAGGAAATAAAAAACCAAT
AAAAGGTATGTTTAAAGGTTGTTTTATTTCTAAATGCAAAATTGAAAATTATAGATGTGAGACGTCTAAAATCTACACCG
TTACACAACCTGATAGTATTCAAGAAAAATTAGGTTCTTATCTCTTTATGCAGTCTTTCGTTCAGGATTGTATAATTCAG
GGAGGACGTTGTCCTGGTTCGAGTATACTTCTGAGTCATTTTTATAACTGTACGATAGCGAAACTTGATGCTCATGGGAT
GGATTTTTTGGCAAACGCATTCAATAAGTCTGGTGATAACGAAACCAGGGCGCAGGATCAGGGAACTGTGTTTGATTGTT
GTAATTTGAATAGTATTAAAATGAACTGTGGTCTTGGTAATGTGAGTTCAGATGAATATAAGTTTAACCCCGAAGAGTAT
TTTTCTGATTACATTGAAAGAAGATCGAGAAATCTTAAGTTGGATGATAATTTTTCTAACTGCGTAGAGAATATCGAGAA
GGCTGTTACAACTTCATTTAGCAAGGAAAATTCAGAGAATGATAATATCTCCTTTAATTGTTGTGATTTGAGGAGGGCCA
ATTTAGACAATTATTACAGAGAAGATTTGTGCAAAGACTGTTCTATTGATCCAGATTCAATTTATTTAGAAGATGGTGTT
ACACCGATAAAATATATTTATATGAATCTGGACGGAGCTATAAGTAAAGACCAAATACCTAATTTCTTAAAAAAGGTAAG
TGCTATCAATAGCGATGTAAAAGATTTTTATAATACTGAGCTAAAGATTAAGGAAGAATATAATAACGCATTTTCAGATT
TAGAGTCGTTTTTGTCTACACTTTATGTTGAAAATAAATCGTACAAAGAGAAATATCATTTTAATAACGGTAGGGCTGAG
TTTTTTATTTTCAAAGATATGCAGTATAAAGCACAAAATATCATTACTAATATGATAGAAAGTGACCGAATTAAGTTTAT
TGAATCTATCATAAAAAAAATCATTCCACCGGCAGATGTAAAAATGCCTACTAAAGATTCAGACAAATTTATTCGACAAA
AACAGCATGAGTCTCATAACCAATTTGATATTGATTATAAATTGAATTATGGTGACCTTGTCCCCCTTTTTGACGGTGTT
GAAGAAAAACAAATTGAAGTGCTAAAAATCCAACTTGAAAATATAAAAAATTTCAAAGCATATTACGACTCAGAACTCAA
TAAGTTTGCTTCCGATTTTCGAAATTTTTCCGGTGCATTTGCAATTAACTGGGAGGATTTACTAAAAAACTATCAGGAAA
TAAGAGCTTCCATTAAAGATTACGATGACTTATTGCGAGAAATTAAAGAGTTAACCATAAGTCGGGATAAATCATTAGAG
GAGAAAAGTACTTTATTTGATAACAAAAGGGACAAGTGGAATAGTCAAGAAGTACAGGATGAAGTAAAGGCATTAAATAA
GAAGATTGCTGACTGTGACAATGAGATACGTTCTAATCTTAATATTGTTCAAAATTTTAGACGCGAGAATCAATATAAAG
CTAATAAAAAAATCAGTAACGCGATGCTTAATATTCTGGATTGGTTCGAACGGTATCCCGATATTGTGAAAAATATAACC
CAGGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGTAACACTTGTTGCTAACCTAACTAGCAGTACAGTTAATTAACAACATAGAAGTTATTGTTTTTCAAACAACTCAA
TATTGCACGCCGGAGGATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCATACAGAGGGTGAGCGACTGGACGATTAACGACATAAATTATTTACAGGGAATAGACGCTTACTCATCAGACACCTGG
TATTTTTTATCTCAAACCAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 802; Mature: 802

Protein sequence:

>802_residues
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK
EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN
YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ
GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY
FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV
TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE
FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV
EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE
EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT
QA

Sequences:

>Translated_802_residues
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK
EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN
YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ
GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY
FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV
TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE
FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV
EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE
EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT
QA
>Mature_802_residues
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDLFKKRTLWEFVRDLFPGSHIK
EVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTDFTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDN
YIDDLHFDNSPLKRFTFDDYAVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSIQEKLGSYLFMQSFVQDCIIQ
GGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDNETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEY
FSDYIERRSRNLKLDDNFSNCVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV
TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLSTLYVENKSYKEKYHFNNGRAE
FFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADVKMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGV
EEKQIEVLKIQLENIKNFKAYYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE
EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISNAMLNILDWFERYPDIVKNIT
QA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93209; Mature: 93209

Theoretical pI: Translated: 5.51; Mature: 5.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDL
CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEECCCHHHHHHHHCCCCHH
FKKRTLWEFVRDLFPGSHIKEVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTD
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
FTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDNYIDDLHFDNSPLKRFTFDDY
CCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCHH
AVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
HHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSI
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCEEECCCEEEEECCCHHH
QEKLGSYLFMQSFVQDCIIQGGRCPGSSILLSHFYNCTIAKLDAHGMDFLANAFNKSGDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCC
ETRAQDQGTVFDCCNLNSIKMNCGLGNVSSDEYKFNPEEYFSDYIERRSRNLKLDDNFSN
CCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
CVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCC
TPIKYIYMNLDGAISKDQIPNFLKKVSAINSDVKDFYNTELKIKEEYNNAFSDLESFLST
CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVENKSYKEKYHFNNGRAEFFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADV
HHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KMPTKDSDKFIRQKQHESHNQFDIDYKLNYGDLVPLFDGVEEKQIEVLKIQLENIKNFKA
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYDSELNKFASDFRNFSGAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELTISRDKSLE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLNILDWFERYPDIVKNITQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDL
CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEECCCHHHHHHHHCCCCHH
FKKRTLWEFVRDLFPGSHIKEVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTD
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
FTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDNYIDDLHFDNSPLKRFTFDDY
CCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCHH
AVKLTTLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
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FEDCKFNNIQLYETNDDTVGSGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSI
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCEEECCCEEEEECCCHHH
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CVENIEKAVTTSFSKENSENDNISFNCCDLRRANLDNYYREDLCKDCSIDPDSIYLEDGV
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CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVENKSYKEKYHFNNGRAEFFIFKDMQYKAQNIITNMIESDRIKFIESIIKKIIPPADV
HHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
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EKSTLFDNKRDKWNSQEVQDEVKALNKKIADCDNEIRSNLNIVQNFRRENQYKANKKISN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLNILDWFERYPDIVKNITQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA