| Definition | Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010475 |
| Length | 3,008,047 |
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The map label for this gene is gltS
Identifier: 170077803
GI number: 170077803
Start: 1228209
End: 1229651
Strand: Direct
Name: gltS
Synonym: SYNPCC7002_A1186
Alternate gene names: NA
Gene position: 1228209-1229651 (Clockwise)
Preceding gene: 170077802
Following gene: 170077805
Centisome position: 40.83
GC content: 49.83
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AAATTAAGGAAAAACAGGATGAATTTTGTTGTACTCATGCCTGTTGCACAGTCTATTACTTTCCTGTCCAGGATATTTAT TTAGTGGACGAAACGGGGTC
Downstream 100 bases:
>100_bases GATTGTATTTATTGAGGCGATCGCCCTTTCCACCATTTCACTAAGGCTTCATAAAGAGCACGATCGGCGCGGTCATCGGT ATGTCCATGGTTGGAATACC
Product: Sodium/glutamate symport carrier protein
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Integral Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480
Protein sequence:
>480_residues MFTLRDVFFAFILIALLVLAGRYVKQKVRWIQRLYLPESIVAGVLALLLGPQVLGAIATAISGGTSILSDGLFSEPIRAV WSQSPGIFINIVFAALFLGEAIPRPKDIWTKTAPQVVFGQTLAWGQYVVGILVTLLILMPLFGVNPIAACLIEIGFEGGH GTAGGMAETFTELGFEAGADLALGIATVGIVGGIVAGTALADWGRRKGHVTSFQKAVEDLDGVPELTETESPEVRRRRAQ LMRNLLIDPLSINFGIVGAAIVIGWLILEALVWVESVTWGQTGFEVISYVPLFPMALIGGIIVQLVMERLGLAPLIIRSL MSNIAGLALDVVVVTALASISLSVIGSNLGVFTILSVVGITWNVVMFLYFAPRIFPSHWFEKGIGDMGQSMGVTATGILL LRMVDPENRTGAFESFAYKQLFFEPIVGGGLFTAAAPALVVRFGLVPVLLLTGGLLIFWLAMGFLIIRQNQQQRRRSPSL
Sequences:
>Translated_480_residues MFTLRDVFFAFILIALLVLAGRYVKQKVRWIQRLYLPESIVAGVLALLLGPQVLGAIATAISGGTSILSDGLFSEPIRAV WSQSPGIFINIVFAALFLGEAIPRPKDIWTKTAPQVVFGQTLAWGQYVVGILVTLLILMPLFGVNPIAACLIEIGFEGGH GTAGGMAETFTELGFEAGADLALGIATVGIVGGIVAGTALADWGRRKGHVTSFQKAVEDLDGVPELTETESPEVRRRRAQ LMRNLLIDPLSINFGIVGAAIVIGWLILEALVWVESVTWGQTGFEVISYVPLFPMALIGGIIVQLVMERLGLAPLIIRSL MSNIAGLALDVVVVTALASISLSVIGSNLGVFTILSVVGITWNVVMFLYFAPRIFPSHWFEKGIGDMGQSMGVTATGILL LRMVDPENRTGAFESFAYKQLFFEPIVGGGLFTAAAPALVVRFGLVPVLLLTGGLLIFWLAMGFLIIRQNQQQRRRSPSL >Mature_480_residues MFTLRDVFFAFILIALLVLAGRYVKQKVRWIQRLYLPESIVAGVLALLLGPQVLGAIATAISGGTSILSDGLFSEPIRAV WSQSPGIFINIVFAALFLGEAIPRPKDIWTKTAPQVVFGQTLAWGQYVVGILVTLLILMPLFGVNPIAACLIEIGFEGGH GTAGGMAETFTELGFEAGADLALGIATVGIVGGIVAGTALADWGRRKGHVTSFQKAVEDLDGVPELTETESPEVRRRRAQ LMRNLLIDPLSINFGIVGAAIVIGWLILEALVWVESVTWGQTGFEVISYVPLFPMALIGGIIVQLVMERLGLAPLIIRSL MSNIAGLALDVVVVTALASISLSVIGSNLGVFTILSVVGITWNVVMFLYFAPRIFPSHWFEKGIGDMGQSMGVTATGILL LRMVDPENRTGAFESFAYKQLFFEPIVGGGLFTAAAPALVVRFGLVPVLLLTGGLLIFWLAMGFLIIRQNQQQRRRSPSL
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51590; Mature: 51590
Theoretical pI: Translated: 6.81; Mature: 6.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFTLRDVFFAFILIALLVLAGRYVKQKVRWIQRLYLPESIVAGVLALLLGPQVLGAIATA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISGGTSILSDGLFSEPIRAVWSQSPGIFINIVFAALFLGEAIPRPKDIWTKTAPQVVFGQ HCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH TLAWGQYVVGILVTLLILMPLFGVNPIAACLIEIGFEGGHGTAGGMAETFTELGFEAGAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCH LALGIATVGIVGGIVAGTALADWGRRKGHVTSFQKAVEDLDGVPELTETESPEVRRRRAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LMRNLLIDPLSINFGIVGAAIVIGWLILEALVWVESVTWGQTGFEVISYVPLFPMALIGG HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVQLVMERLGLAPLIIRSLMSNIAGLALDVVVVTALASISLSVIGSNLGVFTILSVVGI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH TWNVVMFLYFAPRIFPSHWFEKGIGDMGQSMGVTATGILLLRMVDPENRTGAFESFAYKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHH LFFEPIVGGGLFTAAAPALVVRFGLVPVLLLTGGLLIFWLAMGFLIIRQNQQQRRRSPSL HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MFTLRDVFFAFILIALLVLAGRYVKQKVRWIQRLYLPESIVAGVLALLLGPQVLGAIATA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISGGTSILSDGLFSEPIRAVWSQSPGIFINIVFAALFLGEAIPRPKDIWTKTAPQVVFGQ HCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH TLAWGQYVVGILVTLLILMPLFGVNPIAACLIEIGFEGGHGTAGGMAETFTELGFEAGAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCH LALGIATVGIVGGIVAGTALADWGRRKGHVTSFQKAVEDLDGVPELTETESPEVRRRRAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LMRNLLIDPLSINFGIVGAAIVIGWLILEALVWVESVTWGQTGFEVISYVPLFPMALIGG HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVQLVMERLGLAPLIIRSLMSNIAGLALDVVVVTALASISLSVIGSNLGVFTILSVVGI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH TWNVVMFLYFAPRIFPSHWFEKGIGDMGQSMGVTATGILLLRMVDPENRTGAFESFAYKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHH LFFEPIVGGGLFTAAAPALVVRFGLVPVLLLTGGLLIFWLAMGFLIIRQNQQQRRRSPSL HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA