| Definition | Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010465 |
| Length | 4,689,441 |
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The map label for this gene is 170022730
Identifier: 170022730
GI number: 170022730
Start: 527175
End: 530768
Strand: Reverse
Name: 170022730
Synonym: YPK_0479
Alternate gene names: NA
Gene position: 530768-527175 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170022731
Following gene: 170022729
Centisome position: 11.32
GC content: 41.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAACGCCGTTACCTCAGTCAACAGGCCCCACAGAGGGCCTGATAGGAGAGCCCTTTATGGAAAACAGTAAACAGCAAGTG GCCGTTGCTCCCTTGTCGCT
Product: toxin subunit
Products: NA
Alternate protein names: Insecticidal xin Complex Protein; A Component Of Insecticidal xin Complex; Insecticidal xin Complex Protein TccB; Insecticidal xin Protein; Xin Subunit; Xin Complex Protein; Insecticidal xin Complex Protein TcaB; Partially A Component Of Insecticidal xin Complex; Insecticidal xin Protein C-Terminal; Virulence Plasmid
Number of amino acids: Translated: 1197; Mature: 1196
Protein sequence:
>1197_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSSIAEAISSLQIYINRCVDGEENDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLI SYEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGNQNAKEEVENLFLTNG TSIKKIESRIHGYIKGHIKVLCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGDIKIVENGKNILVINNEKGENKKINLIDKFEIKIFP YNELVASTIAFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLDAFNGSYGIYLWELFFHIP LLASMRFLNEQRFDLAKHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQY KLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLL SYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGIISSEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQ FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAI NIRIASAALNAESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSLALGLETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQ KNQADKDIEQLAHQYTSVREQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM AKAVLEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEI VTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGE NTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Sequences:
>Translated_1197_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSSIAEAISSLQIYINRCVDGEENDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLI SYEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGNQNAKEEVENLFLTNG TSIKKIESRIHGYIKGHIKVLCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGDIKIVENGKNILVINNEKGENKKINLIDKFEIKIFP YNELVASTIAFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLDAFNGSYGIYLWELFFHIP LLASMRFLNEQRFDLAKHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQY KLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLL SYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGIISSEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQ FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAI NIRIASAALNAESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSLALGLETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQ KNQADKDIEQLAHQYTSVREQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM AKAVLEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEI VTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGE NTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS >Mature_1196_residues PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSSIAEAISSLQIYINRCVDGEENDLH EKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLIS YEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSLY IDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGNQNAKEEVENLFLTNGT SIKKIESRIHGYIKGHIKVLCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGDIKIVENGKNILVINNEKGENKKINLIDKFEIKIFPY NELVASTIAFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLDAFNGSYGIYLWELFFHIPL LASMRFLNEQRFDLAKHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQYK LAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLS YWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGIISSEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQF GNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAIN IRIASAALNAESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSLALGLETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQK NQADKDIEQLAHQYTSVREQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMA KAVLEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEIV TGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGEN THLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 136846; Mature: 136715
Theoretical pI: Translated: 5.86; Mature: 5.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSSIAE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH AISSLQIYINRCVDGEENDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLISYEKLAQIDTIKELYVENIK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH THFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL HEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCEE YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFF EEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHEEEEECCCEEEECCCEEEEECCHH VNQGNQNAKEEVENLFLTNGTSIKKIESRIHGYIKGHIKVLCNDDGISFEIAEKLINGDN CCCCCCCHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC GTIGDIKIVENGKNILVINNEKGENKKINLIDKFEIKIFPYNELVASTIAFNRIKPEEKI CCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLDAFNGSYGIYLWELFFHIP HHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH LLASMRFLNEQRFDLAKHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC TLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQ EEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH LLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLD HCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCC GQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGIISSEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQ CCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQR HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH RKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNAESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWG HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCH AISQAVGWGMQSLALGLETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKNQADKDIEQLAHQYTSVRE HHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM HHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHH AKAVLEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERT HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHH VSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHH DYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDS HCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCC GQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC >Mature Secondary Structure PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSSIAE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH AISSLQIYINRCVDGEENDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLISYEKLAQIDTIKELYVENIK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH THFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL HEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCEE YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFF EEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHEEEEECCCEEEECCCEEEEECCHH VNQGNQNAKEEVENLFLTNGTSIKKIESRIHGYIKGHIKVLCNDDGISFEIAEKLINGDN CCCCCCCHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC GTIGDIKIVENGKNILVINNEKGENKKINLIDKFEIKIFPYNELVASTIAFNRIKPEEKI CCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLDAFNGSYGIYLWELFFHIP HHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH LLASMRFLNEQRFDLAKHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC TLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQ EEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH LLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLD HCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCC GQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGIISSEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQ CCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQR HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH RKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNAESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWG HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCH AISQAVGWGMQSLALGLETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKNQADKDIEQLAHQYTSVRE HHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM HHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHH AKAVLEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERT HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHH VSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHH DYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDS HCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCC GQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA