| Definition | Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010380 |
| Length | 2,245,615 |
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The map label for this gene is 169832808
Identifier: 169832808
GI number: 169832808
Start: 42417
End: 45155
Strand: Direct
Name: 169832808
Synonym: SPH_0060
Alternate gene names: NA
Gene position: 42417-45155 (Clockwise)
Preceding gene: 169832574
Following gene: 169833417
Centisome position: 1.89
GC content: 40.01
Gene sequence:
>2739_bases ATGGCTGAAACATTTGAAGGCTTATATGTCAAATTTGGTGCTAATACTGTTGAATTTGACAGATCTGTAAAAGGTATCAA TAATGCTTTATCTAGTCTGAAAAAAGATTTCAACAACATCAATAGACAATTGAAGATGGATCCAGACAATGTCGACTTGC TGAATCGTAAGTTGCTCAACTTACAAGAACAAGCTCGTGTTGGTGCTATGAAAATTGCTGAACTCAAAAAGCAACAAAAG GAACTGGGAGAATCTGAAGTTGGGTCAGCACAGTGGAATAAGCTTCAACTTGAAATTTCTAAAGTTGAATCACAGATGAA GGTTGTTGACCAGACAATGAATTCAACCAAAAAACATATCGAAGATGTAGGAAATCCAAAGTCTATTTTAAATCTCAACA AAGAAATCAACAATGTTGCAAAAGAACTTGATATCGTCAACCAGAAGCTTGAATTAGATCCTAAAAATGTAGAGTTGTCC GAAGAAAAAATGAAGTTATTAGGTAAACAATCTTCATTAGCCAAGGATAAGGTCCAGGAGTTGAAACGGAAACAAGAGGA ATTAGGAAAGGAAAAAATCGGAACAGAGGAATGGCGACAACTTCAAAATGAAATTGGGCAAGCAGAAGTCGAGGTGTTAA AGATAGATAAAGCCATGGGGAATCTAGGGGATTCGAGCCGTTCAGCAACAGGAAACATCAAGGAAGCTACAGGATACTTA AAAGCCGATGTAATGATGAACATTGCTGAAAAGGCAGGACAACTAGGTCAAAAAATGGTTGATGCTGGTAAAAAAACAGT AGGTGCATGGTCTGAAATCGACGAAGCGATGGATACTGTTACGACGAAGACTGGACTTACTGGCGAAGCCTTGTTAGGAC TTCAGGAAATTGCAAAAGGAATCGCTACATCCTTACCATCGGCTACATTTCAAGAATCTGCTGACGCAGTTGGTGAGTTA AATACACAATTTGGACTTACTGGTGATACTTTGCAATCTGCAGCAGAGTACCTATTGAAATATTCGAAAATAACTGGAGA AGATATTTCAAATTCCGCAATAAATGCCAAGAAAGCAATTGATGCTTACGGTTTATCTAATGAGGATCTAGCGAGAGTAT TGGACTCAGTAACAAAGGTCGGCCAGGATACTGGTCAATCTTATGACTCCATCTTTCAAAAAGCAATTGATGGAGCTCCA CAGATTAAGATGCTAGGATTATCTTTTAAAGAGGGGGCGACATTAATTGGTAGATTTGAAAAAAGTGGGATTGACTCTTC TGCAGCTTTAGCTTCACTTTCAAAGGCTACAGTAAACTATGCTAAAGACGGAAAGACATTGACTGAGGGGTTGAACGAGA CTGTCAATGCAATTCAGAATGCTACTAGTAAGACAGAAGCAATAAGAATTGCTTCTGAAGTTTTCGGAAATAGAGCCGCT CCTAAAATGGTAGATGCTATCCAACGTGGGGCATTTAGTTTTAATGATTTAGCTGAAGCAGCACAAAACTCATCAGGAAC TGTAGCAACAACATTTGCTGAGACAAAAGATCCATTTGATGACCTAACAACCTATTCCAACAAAGCAAAAGAAGGGCTTG CCGAGATAGGTGGTACACTACTTGAGACTGTTATACCAGCTTTAGAACCTTTGATGGGCATGCTTGAATCTGCTGTTAAT TGGTTTACCAGCTTAAATGAAACTGATCAACAGACTATCGTGATTCTTGGCCTCGTTACAACTGCTGTAATGCTACTGCT TGGTGCAATAGCACCGCTAGTCATTGCTATAGGTGCAATAGGTGCGCCTGTCGGAATTGTCGTAGCGGCAATAGTTGCTG CTATTGCCGCTATTACACTCATCATTCAGGCCATCATGAACTGGGGGACCATATCTGAATGGCTTCAGTCGACGTGGGAT GCTTGCGCCGCTTGGCTTTCTGAATTGTGGACTAATATTGTTACGACTGCTACTACAGCGTGGTCAAGTTTCACTGCTTG GCTTTCTGAAATTTGGTCTTCAGTAGTCTCAACGGGACAGTCTTTGTGGTCTAGCTTTACTAGCACCTTGTCCAATATTT TCTCAAGTTTGATTTCAGGAGCTCAGTCACTGTGGTCAAGTTTTACTTCTACCCTTTCCAATTTATGGTCTGGCCTGGTC TCAACCGGGTCAAATTTGTTTAATAATTTGAGTGGCACGATTTCAGGAATTTTTAATGGTATCTTATCCACTGCTAGCAA TATTTGGAACTCTATCAAATCAACTATTTCAAATGCTATTGATGGTGCTAAAAATGCAGTATCTAACGCTATCCAAGCTA TTAAGAATCTATTTAATTTCAATATCAGTTGGCCGCACATTCCATTACCACACTTCTATGTAAGTGGTTCAGCCAATCCA TTAGACTGGTTAAGTCAGGGCGTTCCAAGCATCGGTATTGAGTGGTATGCGAAGGGTGGTATCATGACCAAACCAACTTT ATTTGGAATGAATGGAAATAGAGCAATGGTTGGTGGAGAAGCTGGTGCAGAAGCAATCCTTCCACTCAATAAGTCAACTC TTGGTGCAATTGGACAAAGCATTGCTAATACGATGAATACATCGAATAGCATCAATGTCAACTTCTCAGGAGTGACCATC CGAGAAGAAGCGGATTTGAATAGACTAGCTGACGTAGTCGGAACACGTATTGCTGAAGAACTACAAAGAAAAACTAATTT GAGAGGAGGTTTCGCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACACTACATCAGATGAGTATCAATGAAAATGAGAAGAAAACTTTATCAAACGCAGAATTACTAAATGTAATGTCTGACTA AAACTGAAAGGAGGAAATCT
Downstream 100 bases:
>100_bases CAAAAATTAATGAGTTAATCATTGATGGAGTGAAAACATCATCATTTAAATGTGAGATTCTGGTTGAAACACGACCACAA ATCATCGTATCCTCCTCAAA
Product: prophage LambdaSa04, tail tape measure family protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Protein; Prophage; Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TP; Phage-Related Protein-Like Protein; Phage Minor Tail Protein; Prophage Pi2 Protein; Phage-Related Tail Protein; Phage Related Protein; Tail Tape Meausure Protein; Endoglucanase Y; Tail Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Immunity-Specific Protein Beta; TMP Repeat-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 912; Mature: 911
Protein sequence:
>912_residues MAETFEGLYVKFGANTVEFDRSVKGINNALSSLKKDFNNINRQLKMDPDNVDLLNRKLLNLQEQARVGAMKIAELKKQQK ELGESEVGSAQWNKLQLEISKVESQMKVVDQTMNSTKKHIEDVGNPKSILNLNKEINNVAKELDIVNQKLELDPKNVELS EEKMKLLGKQSSLAKDKVQELKRKQEELGKEKIGTEEWRQLQNEIGQAEVEVLKIDKAMGNLGDSSRSATGNIKEATGYL KADVMMNIAEKAGQLGQKMVDAGKKTVGAWSEIDEAMDTVTTKTGLTGEALLGLQEIAKGIATSLPSATFQESADAVGEL NTQFGLTGDTLQSAAEYLLKYSKITGEDISNSAINAKKAIDAYGLSNEDLARVLDSVTKVGQDTGQSYDSIFQKAIDGAP QIKMLGLSFKEGATLIGRFEKSGIDSSAALASLSKATVNYAKDGKTLTEGLNETVNAIQNATSKTEAIRIASEVFGNRAA PKMVDAIQRGAFSFNDLAEAAQNSSGTVATTFAETKDPFDDLTTYSNKAKEGLAEIGGTLLETVIPALEPLMGMLESAVN WFTSLNETDQQTIVILGLVTTAVMLLLGAIAPLVIAIGAIGAPVGIVVAAIVAAIAAITLIIQAIMNWGTISEWLQSTWD ACAAWLSELWTNIVTTATTAWSSFTAWLSEIWSSVVSTGQSLWSSFTSTLSNIFSSLISGAQSLWSSFTSTLSNLWSGLV STGSNLFNNLSGTISGIFNGILSTASNIWNSIKSTISNAIDGAKNAVSNAIQAIKNLFNFNISWPHIPLPHFYVSGSANP LDWLSQGVPSIGIEWYAKGGIMTKPTLFGMNGNRAMVGGEAGAEAILPLNKSTLGAIGQSIANTMNTSNSINVNFSGVTI REEADLNRLADVVGTRIAEELQRKTNLRGGFA
Sequences:
>Translated_912_residues MAETFEGLYVKFGANTVEFDRSVKGINNALSSLKKDFNNINRQLKMDPDNVDLLNRKLLNLQEQARVGAMKIAELKKQQK ELGESEVGSAQWNKLQLEISKVESQMKVVDQTMNSTKKHIEDVGNPKSILNLNKEINNVAKELDIVNQKLELDPKNVELS EEKMKLLGKQSSLAKDKVQELKRKQEELGKEKIGTEEWRQLQNEIGQAEVEVLKIDKAMGNLGDSSRSATGNIKEATGYL KADVMMNIAEKAGQLGQKMVDAGKKTVGAWSEIDEAMDTVTTKTGLTGEALLGLQEIAKGIATSLPSATFQESADAVGEL NTQFGLTGDTLQSAAEYLLKYSKITGEDISNSAINAKKAIDAYGLSNEDLARVLDSVTKVGQDTGQSYDSIFQKAIDGAP QIKMLGLSFKEGATLIGRFEKSGIDSSAALASLSKATVNYAKDGKTLTEGLNETVNAIQNATSKTEAIRIASEVFGNRAA PKMVDAIQRGAFSFNDLAEAAQNSSGTVATTFAETKDPFDDLTTYSNKAKEGLAEIGGTLLETVIPALEPLMGMLESAVN WFTSLNETDQQTIVILGLVTTAVMLLLGAIAPLVIAIGAIGAPVGIVVAAIVAAIAAITLIIQAIMNWGTISEWLQSTWD ACAAWLSELWTNIVTTATTAWSSFTAWLSEIWSSVVSTGQSLWSSFTSTLSNIFSSLISGAQSLWSSFTSTLSNLWSGLV STGSNLFNNLSGTISGIFNGILSTASNIWNSIKSTISNAIDGAKNAVSNAIQAIKNLFNFNISWPHIPLPHFYVSGSANP LDWLSQGVPSIGIEWYAKGGIMTKPTLFGMNGNRAMVGGEAGAEAILPLNKSTLGAIGQSIANTMNTSNSINVNFSGVTI REEADLNRLADVVGTRIAEELQRKTNLRGGFA >Mature_911_residues AETFEGLYVKFGANTVEFDRSVKGINNALSSLKKDFNNINRQLKMDPDNVDLLNRKLLNLQEQARVGAMKIAELKKQQKE LGESEVGSAQWNKLQLEISKVESQMKVVDQTMNSTKKHIEDVGNPKSILNLNKEINNVAKELDIVNQKLELDPKNVELSE EKMKLLGKQSSLAKDKVQELKRKQEELGKEKIGTEEWRQLQNEIGQAEVEVLKIDKAMGNLGDSSRSATGNIKEATGYLK ADVMMNIAEKAGQLGQKMVDAGKKTVGAWSEIDEAMDTVTTKTGLTGEALLGLQEIAKGIATSLPSATFQESADAVGELN TQFGLTGDTLQSAAEYLLKYSKITGEDISNSAINAKKAIDAYGLSNEDLARVLDSVTKVGQDTGQSYDSIFQKAIDGAPQ IKMLGLSFKEGATLIGRFEKSGIDSSAALASLSKATVNYAKDGKTLTEGLNETVNAIQNATSKTEAIRIASEVFGNRAAP KMVDAIQRGAFSFNDLAEAAQNSSGTVATTFAETKDPFDDLTTYSNKAKEGLAEIGGTLLETVIPALEPLMGMLESAVNW FTSLNETDQQTIVILGLVTTAVMLLLGAIAPLVIAIGAIGAPVGIVVAAIVAAIAAITLIIQAIMNWGTISEWLQSTWDA CAAWLSELWTNIVTTATTAWSSFTAWLSEIWSSVVSTGQSLWSSFTSTLSNIFSSLISGAQSLWSSFTSTLSNLWSGLVS TGSNLFNNLSGTISGIFNGILSTASNIWNSIKSTISNAIDGAKNAVSNAIQAIKNLFNFNISWPHIPLPHFYVSGSANPL DWLSQGVPSIGIEWYAKGGIMTKPTLFGMNGNRAMVGGEAGAEAILPLNKSTLGAIGQSIANTMNTSNSINVNFSGVTIR EEADLNRLADVVGTRIAEELQRKTNLRGGFA
Specific function: Unknown
COG id: COG5280
COG function: function code S; Phage-related minor tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 97726; Mature: 97595
Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78
Prosite motif: PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAETFEGLYVKFGANTVEFDRSVKGINNALSSLKKDFNNINRQLKMDPDNVDLLNRKLLN CCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHH LQEQARVGAMKIAELKKQQKELGESEVGSAQWNKLQLEISKVESQMKVVDQTMNSTKKHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDVGNPKSILNLNKEINNVAKELDIVNQKLELDPKNVELSEEKMKLLGKQSSLAKDKVQE HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LKRKQEELGKEKIGTEEWRQLQNEIGQAEVEVLKIDKAMGNLGDSSRSATGNIKEATGYL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH KADVMMNIAEKAGQLGQKMVDAGKKTVGAWSEIDEAMDTVTTKTGLTGEALLGLQEIAKG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH IATSLPSATFQESADAVGELNTQFGLTGDTLQSAAEYLLKYSKITGEDISNSAINAKKAI HHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH DAYGLSNEDLARVLDSVTKVGQDTGQSYDSIFQKAIDGAPQIKMLGLSFKEGATLIGRFE HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHCCCHHHHHHH KSGIDSSAALASLSKATVNYAKDGKTLTEGLNETVNAIQNATSKTEAIRIASEVFGNRAA HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PKMVDAIQRGAFSFNDLAEAAQNSSGTVATTFAETKDPFDDLTTYSNKAKEGLAEIGGTL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LETVIPALEPLMGMLESAVNWFTSLNETDQQTIVILGLVTTAVMLLLGAIAPLVIAIGAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAPVGIVVAAIVAAIAAITLIIQAIMNWGTISEWLQSTWDACAAWLSELWTNIVTTATTA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WSSFTAWLSEIWSSVVSTGQSLWSSFTSTLSNIFSSLISGAQSLWSSFTSTLSNLWSGLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STGSNLFNNLSGTISGIFNGILSTASNIWNSIKSTISNAIDGAKNAVSNAIQAIKNLFNF HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NISWPHIPLPHFYVSGSANPLDWLSQGVPSIGIEWYAKGGIMTKPTLFGMNGNRAMVGGE CCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEECCEEECCCCCEEEECCC AGAEAILPLNKSTLGAIGQSIANTMNTSNSINVNFSGVTIREEADLNRLADVVGTRIAEE CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQRKTNLRGGFA HHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure AETFEGLYVKFGANTVEFDRSVKGINNALSSLKKDFNNINRQLKMDPDNVDLLNRKLLN CCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHH LQEQARVGAMKIAELKKQQKELGESEVGSAQWNKLQLEISKVESQMKVVDQTMNSTKKHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDVGNPKSILNLNKEINNVAKELDIVNQKLELDPKNVELSEEKMKLLGKQSSLAKDKVQE HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LKRKQEELGKEKIGTEEWRQLQNEIGQAEVEVLKIDKAMGNLGDSSRSATGNIKEATGYL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH KADVMMNIAEKAGQLGQKMVDAGKKTVGAWSEIDEAMDTVTTKTGLTGEALLGLQEIAKG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH IATSLPSATFQESADAVGELNTQFGLTGDTLQSAAEYLLKYSKITGEDISNSAINAKKAI HHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH DAYGLSNEDLARVLDSVTKVGQDTGQSYDSIFQKAIDGAPQIKMLGLSFKEGATLIGRFE HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHCCCHHHHHHH KSGIDSSAALASLSKATVNYAKDGKTLTEGLNETVNAIQNATSKTEAIRIASEVFGNRAA HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PKMVDAIQRGAFSFNDLAEAAQNSSGTVATTFAETKDPFDDLTTYSNKAKEGLAEIGGTL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LETVIPALEPLMGMLESAVNWFTSLNETDQQTIVILGLVTTAVMLLLGAIAPLVIAIGAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAPVGIVVAAIVAAIAAITLIIQAIMNWGTISEWLQSTWDACAAWLSELWTNIVTTATTA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WSSFTAWLSEIWSSVVSTGQSLWSSFTSTLSNIFSSLISGAQSLWSSFTSTLSNLWSGLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STGSNLFNNLSGTISGIFNGILSTASNIWNSIKSTISNAIDGAKNAVSNAIQAIKNLFNF HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NISWPHIPLPHFYVSGSANPLDWLSQGVPSIGIEWYAKGGIMTKPTLFGMNGNRAMVGGE CCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEECCEEECCCCCEEEECCC AGAEAILPLNKSTLGAIGQSIANTMNTSNSINVNFSGVTIREEADLNRLADVVGTRIAEE CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQRKTNLRGGFA HHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA