Definition Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome.
Accession NC_010334
Length 5,226,917

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The map label for this gene is bvgS [H]

Identifier: 167625660

GI number: 167625660

Start: 4557722

End: 4560958

Strand: Reverse

Name: bvgS [H]

Synonym: Shal_3755

Alternate gene names: 167625660

Gene position: 4560958-4557722 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167625662

Following gene: 167625659

Centisome position: 87.26

GC content: 45.6

Gene sequence:

>3237_bases
ATGGGCGGCTTGGAAAAAATCAACAATAAGCGATTTACCATTCGCGTTACTGTGGTGGGGATCTTTATTTTAGCCACTAT
CTTAACCGCCGCGATTGCCATTAGCTTGCAATATTACTTTAGTAAAAATATGGCAACCGATGCCGCCGTTAAGCTCTATA
ACCTTACCGCTAAAAATACCAGTAGTTACCTTACCCAAGTCGATAGTCGCGCGATTAATACGACTCAGTTACTTTCAAAT
TTTGATGTTCTTGTGATCGATAGAGCCTTTAATCCCGAGGTCAGGCAAGCATTTGCCGATGTGATGCAAATCAACCCATT
GTTTTATGGTATCTATGTGGGGATGCCTAATGGTGACTTCTATGAGCTGATTAATTTGAATGCTCACCCGATAATAAGAA
AGCAGCTTAATGCATCCCATCTTGATCGTTGGGTGCTTATTAGCATCAGTGGTGAGGGAGAGTTACGTCAGAAGCAACAA
TCTTATCTTGATGAGCAGTTTAATCTGCGTGTTACTCATATAGAGCCTAGTGAGTATGACGCCAGAGCCAGACCTTGGTT
TGTTGATGCTAAGCCCCATGTGGTTTCTAAAACAGAGCCTTACCTATTCCAGCACCTGCAATCACCGGGTCAAACCTATT
CGATAAAACTCGCTGACTCAGGAGTGGTTCTCGCCTTAGATATTGCACTATCAACCTTGTCGGATTATCTAGTTATGCAA
GGGGAAGATGAACAGGGCATCAATGAGAAAAAAATCTATCTCTATAAGCAAAGCGGCGAGCTGATCGCATCTAATCAAGA
TAGAAAAATAGGTGTTGAAGTACCCGATTCTAAAGAACTAGTGTTAACTGCCAAACAGCGGGCTCTGGTAGCCAATACTG
AGCCCTTGTTAGTCTCTAATGAAACCGACTGGGCCCCCATCGACTTTGCTATATCAGGCATGCCGCAAGGCTATAGTGTC
GACCTATTGAACCTTGTTGCCGATATGACCGGTTTAGAATTGCATTATATCAATGGTTTTAGCTGGAGTGAGCTGACCGA
AAACTATAAAGCCGACGAGCTAGACATGCTGCACTCTGTGATTAAAACCGATGAGACGCGTCTATTAGGTGAATTTAGTG
AGCCGTTTCTTGAGCTGCCTTACGCGCTTGTTACCCAACAGGGGACGCCTGAAATCACCCATATCGAGCAGTTGAACGGT
AAACACGTTGCGATCCCAACTGGCTGGTCCATTGTCGAGGTGATTCGAAAAAACTATCCGCAGATTGAGATCGTTGAGAT
GGCTTCAACCTATGCCATATTACATGCGGTTGAACAGGGCGAGGTTTTTGCGGCGCTTGATAACAGCATCATATTGCATT
ACACGGCGAAGCAGTTTTTTGTGGAGCAGATTCAATATCATGAGCAGCTGGACTTCTCACCGATAAAACTTAATACCGGT
TTGCATGTTGTGATGCCTGCAGAGAGAGCAGAGCTTATCGCGGTGATCAATTTGGCGCTTGCCAATATTACCCCTGAGCA
AACTCAAGCATTGAGGGCTAAGTGGTTTGGTGAGGGAGTAAAACAGACCCTATCGACACAGGGAACCGTGCCTTTTGAGG
CGCTTATCGAGCTGGCTCGCGAGCCAAAAAACCAGAAAAGGCTGATTCGTCGTGAGTTAAATGGAGTTGAAGAATTTCTC
TATGTGACACCTTTTGGGGGGAGCTCATCTGGCAGTGAAGAGCCTTCGGCTGGGAGTCGGGAGTACTTTGCTATTGTGGT
GCCAACGGAGCAGTTGCTTACGACCAGTGTTGAGAAAGTGCAGCAATCTATTCTACTTACCAGTCTCTGCTTATTGATCA
TCTTACCGGTTTCATGGCTGTTTTCATCACCTATTATTCGTCCTATCAAGTTACTGGCCATCGAAAACGATAAGATAAAG
CATCGCCGATATGATGAGGTAGAGAGAGTTCAGACCAGTATCACAGAGCTTGATGAGCTGGCGCAGTCTATGATGGATAT
GTCTAGCGCCATTAAGACTCATGAAGAGAATCAAAAGGAGTTAATGGAATCGTTTATCAAGCTCATCGCCCAAGCGATCG
ATGACAAGTCCCCCTATACTGCAGGCCACTGTAATCGGGTGCCGGAGCTTGGCTTGATGTTGGCTCATGCTGCAGAAAAC
TCTGATCTTGCCCCCTTTAAGGATTTTAAATTTAACACCGATGATGAGCAGCGAGAGTTTCGCATCGCTGCCTGGCTGCA
TGATTGCGGTAAGATCACCACTCCAGAATATATTGTCGATAAAGGCACTAAGCTCGAAGCCGTCTACAATCGTATCCATG
AAGTTCGGATGCGCTTTGAGGTATTGTGGCGTGACGCCGAGATTGACTATTTAAAGCAGACCCTCTTAGCTAAAGAGTCT
GGCGAGCAGTCGGCACAATTAGTGACTGAGTTAACGAATGGGTTAACCAATGAGCTTGCTCAGAAGCGCAAGCAATTAAA
AGCAGACTTTGAGTTTATCGCCAAGGCTAATGTAGGTGGTGAATTTATGGTTCAAGAGGCGAAAGATCGCCTCTCACAGC
TTGCTAAAATTAGCTGGCAGCGTCACTTTGACGACAGGCTAGGTCTCTCACCTGTCGAAGAGCTTAACCTCAGTGAGCGA
GTAGCCGAGCTAAGCTATCCAGTTACAGAGCCACTACTAAGAGATAAGCCTGAGCATATTATCAAGCGCATCAATAAGGT
GGAGTTTGATCCTAAGTTTGGTATTAAGATGGCTATTCCTGAGTATCAATATAACTTAGGTGAGCTCTATAACCTTTCTA
TCTCCCGCGGCACCTTAACCGCAGAAGACAGGTTTAAGATTAACGAGCATGTCACCAGTACCATTAAGATGCTGGAGAAT
CTGCCATTTCCACCTGAGCTGGCAAAGGTGCCGCGTTATGCCTCTACTCACCACGAAACCTTAAAAGGCAGCGGCTACCC
ACGCAAACTCAGCGCCGATGAGCTGTCGATCCCTGAGCGTATCTTGGTGGTTGCCGATATTTTTGAGGCGCTAACCGCGG
CAGATAGGCCTTATAAGAAGGCCAAGCCTCTCAGTGTTGCCATCGATATATTGTATAAGATGGCACTGGATGAACACCTT
GATATGGATATCTTCAAGCTATTCCTCTCTAGTGGGATCTACCTAGATTATGCGCATAAATTCTTGGATTCGGCTCAGAT
AAACGAGGTCGATACCGCTAAGTATTTACACCCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACTGAGCACAAATTTTGTTTTTAATTCAGGTTGTTGATTTGTTGCGCCCCTGTTGTAAAATGCTCATTTCAAGGATTG
AATAACAGAGTTGGAGTACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCGATGGATAAAAGTGCTTAAAAGAATATCGCAGCTACGGCAGCCAAGTTCTATCTGTTACAGAATTTGGCTGCTTTTAT
AACTCAGTGAATAAGTTATC

Product: metal dependent phosphohydrolase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1078; Mature: 1077

Protein sequence:

>1078_residues
MGGLEKINNKRFTIRVTVVGIFILATILTAAIAISLQYYFSKNMATDAAVKLYNLTAKNTSSYLTQVDSRAINTTQLLSN
FDVLVIDRAFNPEVRQAFADVMQINPLFYGIYVGMPNGDFYELINLNAHPIIRKQLNASHLDRWVLISISGEGELRQKQQ
SYLDEQFNLRVTHIEPSEYDARARPWFVDAKPHVVSKTEPYLFQHLQSPGQTYSIKLADSGVVLALDIALSTLSDYLVMQ
GEDEQGINEKKIYLYKQSGELIASNQDRKIGVEVPDSKELVLTAKQRALVANTEPLLVSNETDWAPIDFAISGMPQGYSV
DLLNLVADMTGLELHYINGFSWSELTENYKADELDMLHSVIKTDETRLLGEFSEPFLELPYALVTQQGTPEITHIEQLNG
KHVAIPTGWSIVEVIRKNYPQIEIVEMASTYAILHAVEQGEVFAALDNSIILHYTAKQFFVEQIQYHEQLDFSPIKLNTG
LHVVMPAERAELIAVINLALANITPEQTQALRAKWFGEGVKQTLSTQGTVPFEALIELAREPKNQKRLIRRELNGVEEFL
YVTPFGGSSSGSEEPSAGSREYFAIVVPTEQLLTTSVEKVQQSILLTSLCLLIILPVSWLFSSPIIRPIKLLAIENDKIK
HRRYDEVERVQTSITELDELAQSMMDMSSAIKTHEENQKELMESFIKLIAQAIDDKSPYTAGHCNRVPELGLMLAHAAEN
SDLAPFKDFKFNTDDEQREFRIAAWLHDCGKITTPEYIVDKGTKLEAVYNRIHEVRMRFEVLWRDAEIDYLKQTLLAKES
GEQSAQLVTELTNGLTNELAQKRKQLKADFEFIAKANVGGEFMVQEAKDRLSQLAKISWQRHFDDRLGLSPVEELNLSER
VAELSYPVTEPLLRDKPEHIIKRINKVEFDPKFGIKMAIPEYQYNLGELYNLSISRGTLTAEDRFKINEHVTSTIKMLEN
LPFPPELAKVPRYASTHHETLKGSGYPRKLSADELSIPERILVVADIFEALTAADRPYKKAKPLSVAIDILYKMALDEHL
DMDIFKLFLSSGIYLDYAHKFLDSAQINEVDTAKYLHP

Sequences:

>Translated_1078_residues
MGGLEKINNKRFTIRVTVVGIFILATILTAAIAISLQYYFSKNMATDAAVKLYNLTAKNTSSYLTQVDSRAINTTQLLSN
FDVLVIDRAFNPEVRQAFADVMQINPLFYGIYVGMPNGDFYELINLNAHPIIRKQLNASHLDRWVLISISGEGELRQKQQ
SYLDEQFNLRVTHIEPSEYDARARPWFVDAKPHVVSKTEPYLFQHLQSPGQTYSIKLADSGVVLALDIALSTLSDYLVMQ
GEDEQGINEKKIYLYKQSGELIASNQDRKIGVEVPDSKELVLTAKQRALVANTEPLLVSNETDWAPIDFAISGMPQGYSV
DLLNLVADMTGLELHYINGFSWSELTENYKADELDMLHSVIKTDETRLLGEFSEPFLELPYALVTQQGTPEITHIEQLNG
KHVAIPTGWSIVEVIRKNYPQIEIVEMASTYAILHAVEQGEVFAALDNSIILHYTAKQFFVEQIQYHEQLDFSPIKLNTG
LHVVMPAERAELIAVINLALANITPEQTQALRAKWFGEGVKQTLSTQGTVPFEALIELAREPKNQKRLIRRELNGVEEFL
YVTPFGGSSSGSEEPSAGSREYFAIVVPTEQLLTTSVEKVQQSILLTSLCLLIILPVSWLFSSPIIRPIKLLAIENDKIK
HRRYDEVERVQTSITELDELAQSMMDMSSAIKTHEENQKELMESFIKLIAQAIDDKSPYTAGHCNRVPELGLMLAHAAEN
SDLAPFKDFKFNTDDEQREFRIAAWLHDCGKITTPEYIVDKGTKLEAVYNRIHEVRMRFEVLWRDAEIDYLKQTLLAKES
GEQSAQLVTELTNGLTNELAQKRKQLKADFEFIAKANVGGEFMVQEAKDRLSQLAKISWQRHFDDRLGLSPVEELNLSER
VAELSYPVTEPLLRDKPEHIIKRINKVEFDPKFGIKMAIPEYQYNLGELYNLSISRGTLTAEDRFKINEHVTSTIKMLEN
LPFPPELAKVPRYASTHHETLKGSGYPRKLSADELSIPERILVVADIFEALTAADRPYKKAKPLSVAIDILYKMALDEHL
DMDIFKLFLSSGIYLDYAHKFLDSAQINEVDTAKYLHP
>Mature_1077_residues
GGLEKINNKRFTIRVTVVGIFILATILTAAIAISLQYYFSKNMATDAAVKLYNLTAKNTSSYLTQVDSRAINTTQLLSNF
DVLVIDRAFNPEVRQAFADVMQINPLFYGIYVGMPNGDFYELINLNAHPIIRKQLNASHLDRWVLISISGEGELRQKQQS
YLDEQFNLRVTHIEPSEYDARARPWFVDAKPHVVSKTEPYLFQHLQSPGQTYSIKLADSGVVLALDIALSTLSDYLVMQG
EDEQGINEKKIYLYKQSGELIASNQDRKIGVEVPDSKELVLTAKQRALVANTEPLLVSNETDWAPIDFAISGMPQGYSVD
LLNLVADMTGLELHYINGFSWSELTENYKADELDMLHSVIKTDETRLLGEFSEPFLELPYALVTQQGTPEITHIEQLNGK
HVAIPTGWSIVEVIRKNYPQIEIVEMASTYAILHAVEQGEVFAALDNSIILHYTAKQFFVEQIQYHEQLDFSPIKLNTGL
HVVMPAERAELIAVINLALANITPEQTQALRAKWFGEGVKQTLSTQGTVPFEALIELAREPKNQKRLIRRELNGVEEFLY
VTPFGGSSSGSEEPSAGSREYFAIVVPTEQLLTTSVEKVQQSILLTSLCLLIILPVSWLFSSPIIRPIKLLAIENDKIKH
RRYDEVERVQTSITELDELAQSMMDMSSAIKTHEENQKELMESFIKLIAQAIDDKSPYTAGHCNRVPELGLMLAHAAENS
DLAPFKDFKFNTDDEQREFRIAAWLHDCGKITTPEYIVDKGTKLEAVYNRIHEVRMRFEVLWRDAEIDYLKQTLLAKESG
EQSAQLVTELTNGLTNELAQKRKQLKADFEFIAKANVGGEFMVQEAKDRLSQLAKISWQRHFDDRLGLSPVEELNLSERV
AELSYPVTEPLLRDKPEHIIKRINKVEFDPKFGIKMAIPEYQYNLGELYNLSISRGTLTAEDRFKINEHVTSTIKMLENL
PFPPELAKVPRYASTHHETLKGSGYPRKLSADELSIPERILVVADIFEALTAADRPYKKAKPLSVAIDILYKMALDEHLD
MDIFKLFLSSGIYLDYAHKFLDSAQINEVDTAKYLHP

Specific function: Member of the two-component regulatory system BvgS/BvgA. Phosphorylates BvgA via a four-step phosphorelay in response to environmental signals [H]

COG id: COG2206

COG function: function code T; HD-GYP domain

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 response regulatory domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR011006
- InterPro:   IPR000014
- InterPro:   IPR000700
- InterPro:   IPR013767
- InterPro:   IPR001638
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR008207
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082
- InterPro:   IPR001789 [H]

Pfam domain/function: PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA; PF01627 Hpt; PF00989 PAS; PF00072 Response_reg; PF00497 SBP_bac_3 [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 122113; Mature: 121982

Theoretical pI: Translated: 5.06; Mature: 5.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGGLEKINNKRFTIRVTVVGIFILATILTAAIAISLQYYFSKNMATDAAVKLYNLTAKNT
CCCCHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEEECCCH
SSYLTQVDSRAINTTQLLSNFDVLVIDRAFNPEVRQAFADVMQINPLFYGIYVGMPNGDF
HHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCE
YELINLNAHPIIRKQLNASHLDRWVLISISGEGELRQKQQSYLDEQFNLRVTHIEPSEYD
EEEECCCCCHHHHHHCCHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHCEEEEEECCCCCC
ARARPWFVDAKPHVVSKTEPYLFQHLQSPGQTYSIKLADSGVVLALDIALSTLSDYLVMQ
CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHEEE
GEDEQGINEKKIYLYKQSGELIASNQDRKIGVEVPDSKELVLTAKQRALVANTEPLLVSN
CCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCEEEECCCCEEEEC
ETDWAPIDFAISGMPQGYSVDLLNLVADMTGLELHYINGFSWSELTENYKADELDMLHSV
CCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
IKTDETRLLGEFSEPFLELPYALVTQQGTPEITHIEQLNGKHVAIPTGWSIVEVIRKNYP
HHCCHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHCCCC
QIEIVEMASTYAILHAVEQGEVFAALDNSIILHYTAKQFFVEQIQYHEQLDFSPIKLNTG
CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCC
LHVVMPAERAELIAVINLALANITPEQTQALRAKWFGEGVKQTLSTQGTVPFEALIELAR
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
EPKNQKRLIRRELNGVEEFLYVTPFGGSSSGSEEPSAGSREYFAIVVPTEQLLTTSVEKV
CCCHHHHHHHHHHCCHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHH
QQSILLTSLCLLIILPVSWLFSSPIIRPIKLLAIENDKIKHRRYDEVERVQTSITELDEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQSMMDMSSAIKTHEENQKELMESFIKLIAQAIDDKSPYTAGHCNRVPELGLMLAHAAEN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCCHHHHHCCCHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
AKPLSVAIDILYKMALDEHLDMDIFKLFLSSGIYLDYAHKFLDSAQINEVDTAKYLHP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
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CCCHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEEECCCH
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CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHEEE
GEDEQGINEKKIYLYKQSGELIASNQDRKIGVEVPDSKELVLTAKQRALVANTEPLLVSN
CCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCEEEECCCCEEEEC
ETDWAPIDFAISGMPQGYSVDLLNLVADMTGLELHYINGFSWSELTENYKADELDMLHSV
CCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
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CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCC
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EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
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AQSMMDMSSAIKTHEENQKELMESFIKLIAQAIDDKSPYTAGHCNRVPELGLMLAHAAEN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
EFMVQEAKDRLSQLAKISWQRHFDDRLGLSPVEELNLSERVAELSYPVTEPLLRDKPEHI
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IKRINKVEFDPKFGIKMAIPEYQYNLGELYNLSISRGTLTAEDRFKINEHVTSTIKMLEN
HHHHHHCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEEECCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
LPFPPELAKVPRYASTHHETLKGSGYPRKLSADELSIPERILVVADIFEALTAADRPYKK
CCCCHHHHHCCCHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
AKPLSVAIDILYKMALDEHLDMDIFKLFLSSGIYLDYAHKFLDSAQINEVDTAKYLHP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1791760; 12910271 [H]