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The map label for this gene is 167625162

Identifier: 167625162

GI number: 167625162

Start: 3963365

End: 3965494

Strand: Reverse

Name: 167625162

Synonym: Shal_3250

Alternate gene names: NA

Gene position: 3965494-3963365 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167625163

Following gene: 167625160

Centisome position: 75.87

GC content: 44.65

Gene sequence:

>2130_bases
ATGTTTATGTTGATCGCAGCCTTGTTGCTGCTCAGTGTGATGGGCTTTGCTCGGCTTAATCTCGAACTGGACTTTAATGA
CTATTTTGCACCATCAGATCCACGCTTTGTGGCGTTTAATAGCATGATGGATAAATTTGAGCGCCATGATCAACTTTGGC
TTCTGTTGGAAACGCCAAAGGATTGGCGAGACAAGGAGTCAAAGGCACAGCTAATAGACTTTCTCGGTAAGATAAAAGCC
AATCAAGATATCAACAGTATTCAGGGTTATAACCAGTTTGTGCAGGGCACGGCCAAGCAAGACAAGATATTAGCCTATAA
AAGCCATCCTCGACTGCCGTCGGTACTCTCCGCAAACGGGCATGCGATGTTGCTAAAATTGCAGTTAAACCGCCATAGAG
CTCAAGAGTTTAACACCCAAAGTTTATGGCTAGATGATGTGCTGCAAAAAGTAGATCGTGATAGTCGTGAGTATTGGCTA
CCTTTAGGGGTCAATACTTATTTTAATGGGACTCATGCTCTTAACTGGCAGTATGCCAAGGTATTAGGTCACGACTTGAG
TTGGTTTGCCCCAGCTCTGTTAGGCATTATCTTCTTAATGGCTGCTCTGTTTATACGGCAAGCGTTGTGGATTTTTGCGA
TCTGCATCAATAGTGGCATTGCTTTAGTGTTAAGTATGGGGCTAGCGGCTTGGTTAAAGCTGACACTTGCGGCGATAACG
GCTTTTGTTCCTGTGATTATTGTGACACTGGGATTGGCTTATGCATCACACCTGTATTTTGGTTGGCGCGCTGAAATTAA
TCGCGGTCAAACTCATCAGCAGGCCTTAAGGTATACGGTTAAGGTTAATCAAGCGCCACTTTTTTATTCTACTATCACCA
CCATATTTGGTTTTAGTCTGCTTATGTTTAGTCCCTCTCCCCCAATCCAAAGCTTTGGTTTGCTCGTGGCTTTTGCAGTG
CTTTGCAACTATGTACTGAGTCTTACGAGTCTTATATTTTTTGCTAAGCACTCAAAGGCTTCGGTTAGCAAGGGATTAGA
TTTTTCAGGGGTCGTCGCGATTGCTCGTTACAATGCCAAGCGACCGCGGGCGGTGATGATGGGAATCGTATTGTTCAGTG
CCTTTGCACTGGTCAGTGTGTCGAAATTAACATTAAATGATGATCCGTTAAGTTACTTTGAGTCGACCAACCCCTTTATT
GTTTCTAGCCAGAAAATGGCGCAATACTTTTCGGGGATTAATCTGCAACATTATGTGGTGGCTAGTGCGGACAATAAGCA
GATCGCCAAAGCAGAGATAAGCTTTGTCTATAGGTTCAGTCGTTTCTTAAAGCGTCAGCCTCAGGTCGTTAAGGTGCAGC
ATATTGGCGACTGGATTAAGAGTGTTGGTGTTGGTCAGAACCAGTTTAAACAGATCTTGGCGAAAAATACGGTGGTGGAG
CTAGGACTAGCAAGCGAGTTGTCCGCCGATAAACAATCGAGTTTAGTGACGCTCTATTTACAGCCTATGACTGCGATGGA
GCTGATAGCCTTTGAACAAAGGGTCGCTGATTGGCTCGCTGAGCATTTACTAGAGCATCCCGCTGAAATACGAGTGAGTC
CTCCGATTGCCAGTAATTTATTATTTGCCCATCTCAGTGTCGATAACGCCAACAATATGCTGTTGTCGTTTGCGATCGCT
CTGGTCGCCCTCGCGATTTTATTGAGCATACTAAAGGGATCGTTACTGTTTGGCTTAATGGGATTACTACTGAATTTTCT
GCCTTTGCTATGGGTATTTGCCTTATGGCAAATAAATGGTGGATTTATTAGTTTAGGTACCGCTGTGGTGCTCGGCATGA
TGCTGGGGATCATTGTCGATGATACATTGCACTTAATGCTCAAGCTACCCGACCAAGTACAATTAAGTGAGACTTGTATG
TGGGACTGCTTGCACAAGGTGTTGCCTGTTATTAGTTTTACGACCCTGACCATCGCTCTGGGGTTTTCTATCGGTCTGCT
ATCGGCATTTTCACCTATTGTGCAGCTTAGCCTTCTATCTTGCCTCGTGGTGATTTTTGCTTGGGGATTCGACGTCTTAA
TGTTGCCAGTGCTTTATCGGCGTTGGATATTGAGAAAAGCTGAGCGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTACTCGTTTCTCTGATTTATTCACTGCTAATTAAAGGGAGAAAGTGATTGGGTTACCAGTATCGTGCTATCTGGAGTA
TTCAAAGACACCCGATAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTGCTTACTGTAATAAATAGTCTTTATGGGGCTTTGTTTATCGAGAAGAGTCAAATTTTGAACAAAAAAATAAGGCCTCA
AAAAGAGGCCTTTATTCATC

Product: exporter of the RND superfamily protein-like protein

Products: NA

Alternate protein names: Exporter Of RND Superfamily; RND Superfamily Exporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Integral Membrane Protein; Patched Family Protein; RND Family Efflux Transporter; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family

Number of amino acids: Translated: 709; Mature: 709

Protein sequence:

>709_residues
MFMLIAALLLLSVMGFARLNLELDFNDYFAPSDPRFVAFNSMMDKFERHDQLWLLLETPKDWRDKESKAQLIDFLGKIKA
NQDINSIQGYNQFVQGTAKQDKILAYKSHPRLPSVLSANGHAMLLKLQLNRHRAQEFNTQSLWLDDVLQKVDRDSREYWL
PLGVNTYFNGTHALNWQYAKVLGHDLSWFAPALLGIIFLMAALFIRQALWIFAICINSGIALVLSMGLAAWLKLTLAAIT
AFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRAEINRGQTHQQALRYTVKVNQAPLFYSTITTIFGFSLLMFSPSPPIQSFGLLVAFAV
LCNYVLSLTSLIFFAKHSKASVSKGLDFSGVVAIARYNAKRPRAVMMGIVLFSAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESTNPFI
VSSQKMAQYFSGINLQHYVVASADNKQIAKAEISFVYRFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSVGVGQNQFKQILAKNTVVE
LGLASELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEQRVADWLAEHLLEHPAEIRVSPPIASNLLFAHLSVDNANNMLLSFAIA
LVALAILLSILKGSLLFGLMGLLLNFLPLLWVFALWQINGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDQVQLSETCM
WDCLHKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFSPIVQLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWILRKAER

Sequences:

>Translated_709_residues
MFMLIAALLLLSVMGFARLNLELDFNDYFAPSDPRFVAFNSMMDKFERHDQLWLLLETPKDWRDKESKAQLIDFLGKIKA
NQDINSIQGYNQFVQGTAKQDKILAYKSHPRLPSVLSANGHAMLLKLQLNRHRAQEFNTQSLWLDDVLQKVDRDSREYWL
PLGVNTYFNGTHALNWQYAKVLGHDLSWFAPALLGIIFLMAALFIRQALWIFAICINSGIALVLSMGLAAWLKLTLAAIT
AFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRAEINRGQTHQQALRYTVKVNQAPLFYSTITTIFGFSLLMFSPSPPIQSFGLLVAFAV
LCNYVLSLTSLIFFAKHSKASVSKGLDFSGVVAIARYNAKRPRAVMMGIVLFSAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESTNPFI
VSSQKMAQYFSGINLQHYVVASADNKQIAKAEISFVYRFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSVGVGQNQFKQILAKNTVVE
LGLASELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEQRVADWLAEHLLEHPAEIRVSPPIASNLLFAHLSVDNANNMLLSFAIA
LVALAILLSILKGSLLFGLMGLLLNFLPLLWVFALWQINGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDQVQLSETCM
WDCLHKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFSPIVQLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWILRKAER
>Mature_709_residues
MFMLIAALLLLSVMGFARLNLELDFNDYFAPSDPRFVAFNSMMDKFERHDQLWLLLETPKDWRDKESKAQLIDFLGKIKA
NQDINSIQGYNQFVQGTAKQDKILAYKSHPRLPSVLSANGHAMLLKLQLNRHRAQEFNTQSLWLDDVLQKVDRDSREYWL
PLGVNTYFNGTHALNWQYAKVLGHDLSWFAPALLGIIFLMAALFIRQALWIFAICINSGIALVLSMGLAAWLKLTLAAIT
AFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRAEINRGQTHQQALRYTVKVNQAPLFYSTITTIFGFSLLMFSPSPPIQSFGLLVAFAV
LCNYVLSLTSLIFFAKHSKASVSKGLDFSGVVAIARYNAKRPRAVMMGIVLFSAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESTNPFI
VSSQKMAQYFSGINLQHYVVASADNKQIAKAEISFVYRFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSVGVGQNQFKQILAKNTVVE
LGLASELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEQRVADWLAEHLLEHPAEIRVSPPIASNLLFAHLSVDNANNMLLSFAIA
LVALAILLSILKGSLLFGLMGLLLNFLPLLWVFALWQINGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDQVQLSETCM
WDCLHKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFSPIVQLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWILRKAER

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79429; Mature: 79429

Theoretical pI: Translated: 9.54; Mature: 9.54

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFMLIAALLLLSVMGFARLNLELDFNDYFAPSDPRFVAFNSMMDKFERHDQLWLLLETPK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC
DWRDKESKAQLIDFLGKIKANQDINSIQGYNQFVQGTAKQDKILAYKSHPRLPSVLSANG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHCCCC
HAMLLKLQLNRHRAQEFNTQSLWLDDVLQKVDRDSREYWLPLGVNTYFNGTHALNWQYAK
CEEEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEECCCEECCHHHHH
VLGHDLSWFAPALLGIIFLMAALFIRQALWIFAICINSGIALVLSMGLAAWLKLTLAAIT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRAEINRGQTHQQALRYTVKVNQAPLFYSTITTIFGFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
LMFSPSPPIQSFGLLVAFAVLCNYVLSLTSLIFFAKHSKASVSKGLDFSGVVAIARYNAK
HEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCC
RPRAVMMGIVLFSAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESTNPFIVSSQKMAQYFSGINLQHYVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEE
ASADNKQIAKAEISFVYRFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSVGVGQNQFKQILAKNTVVE
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCHHHE
LGLASELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEQRVADWLAEHLLEHPAEIRVSPPIASNL
ECCHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHH
LFAHLSVDNANNMLLSFAIALVALAILLSILKGSLLFGLMGLLLNFLPLLWVFALWQING
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDQVQLSETCMWDCLHKVLPVISFTTLTIAL
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFSIGLLSAFSPIVQLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWILRKAER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFMLIAALLLLSVMGFARLNLELDFNDYFAPSDPRFVAFNSMMDKFERHDQLWLLLETPK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC
DWRDKESKAQLIDFLGKIKANQDINSIQGYNQFVQGTAKQDKILAYKSHPRLPSVLSANG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHCCCC
HAMLLKLQLNRHRAQEFNTQSLWLDDVLQKVDRDSREYWLPLGVNTYFNGTHALNWQYAK
CEEEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEECCCEECCHHHHH
VLGHDLSWFAPALLGIIFLMAALFIRQALWIFAICINSGIALVLSMGLAAWLKLTLAAIT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRAEINRGQTHQQALRYTVKVNQAPLFYSTITTIFGFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
LMFSPSPPIQSFGLLVAFAVLCNYVLSLTSLIFFAKHSKASVSKGLDFSGVVAIARYNAK
HEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCC
RPRAVMMGIVLFSAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESTNPFIVSSQKMAQYFSGINLQHYVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEE
ASADNKQIAKAEISFVYRFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSVGVGQNQFKQILAKNTVVE
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCHHHE
LGLASELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEQRVADWLAEHLLEHPAEIRVSPPIASNL
ECCHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHH
LFAHLSVDNANNMLLSFAIALVALAILLSILKGSLLFGLMGLLLNFLPLLWVFALWQING
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDQVQLSETCMWDCLHKVLPVISFTTLTIAL
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFSIGLLSAFSPIVQLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWILRKAER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA