| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is 167039907
Identifier: 167039907
GI number: 167039907
Start: 1298910
End: 1301468
Strand: Direct
Name: 167039907
Synonym: Teth514_1263
Alternate gene names: NA
Gene position: 1298910-1301468 (Clockwise)
Preceding gene: 167039906
Following gene: 167039908
Centisome position: 52.86
GC content: 39.9
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGGAGGGCGATGTATGGGCTTCGTTTATAATGGTATCAATTCAAAAAATATGAAGATAAAAGCAAAACTTACAAGGTGGC AGGCATCGCCCGCTCTACGA
Product: phage tape measure protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 852; Mature: 851
Protein sequence:
>852_residues MADNFGLKIGVEGEKEFKNALRDINQAFKVLGSEMALISSQFDKNDKSIQALTARNEILEKTIDAQKEKIETLRSALDNA STSFGENDRRTQNWQIQLNKALAELNGMERELENNNKSLRDHSDATDESADNMEDAADAADELADNVDDVGNEMDDATKK TSVLGDVLKANLLSDAIIGGVKALGSAIAGIGKAFVGAMKDGVEYNAQMESYTASFTTMLGDEAKAQKLVNDLKKEAAAT PFGMQDLAQSAQTLMSFGMSAEEAQIRMKQLGDISQGDAEKFKSLTLAFAQMSSTGKLTGQDLMQMINAGFNPLEEISRK TGKSIGELKEEMSKGAISADMVAEAFASATSEGGRFYGSMEAQSKTFSGQMATLEDGVASLKGQLAEGLTTMLSGTVLPM VNGWIDELSQAFEKDGVQGLIDAFGGILEEAVQFISEQLPIVVDIASQIIISLVQGLTSALPKITEAAVILLMTLVNGII ETLPALVTAGVQMIGTIVSGIAEALPQLIPAAVSAVIQIVQALLDNLPMLLEAALQLVLGLTQGILDALPVLIAALPVII TGIVDFIIGAIPQIIEAGIQLLTSLISALPEIITVIVEAIPQIVDGLITAILGSIPQLIDAGVQLLVALIQNLPQIISTV ITAIPKIVSSLVNAIIGSIPQIIQAGIMLLVSLIKNLPTIIVEVVKAVPQIITALVKGFTGSIWQMAQIGTNLIKGLWQG ISDAGAWLWDKISGFFGGVVDKIKNFFGIHSPSTLFAGIVENLGEGIGVGFEKAMNSVSQDMQNAIPTDFDINSNLNMNG AGISSSYGTFEGSLITIQQMIVRSEDDIRKISQELYNLMQTGSRAQGRFITA
Sequences:
>Translated_852_residues MADNFGLKIGVEGEKEFKNALRDINQAFKVLGSEMALISSQFDKNDKSIQALTARNEILEKTIDAQKEKIETLRSALDNA STSFGENDRRTQNWQIQLNKALAELNGMERELENNNKSLRDHSDATDESADNMEDAADAADELADNVDDVGNEMDDATKK TSVLGDVLKANLLSDAIIGGVKALGSAIAGIGKAFVGAMKDGVEYNAQMESYTASFTTMLGDEAKAQKLVNDLKKEAAAT PFGMQDLAQSAQTLMSFGMSAEEAQIRMKQLGDISQGDAEKFKSLTLAFAQMSSTGKLTGQDLMQMINAGFNPLEEISRK TGKSIGELKEEMSKGAISADMVAEAFASATSEGGRFYGSMEAQSKTFSGQMATLEDGVASLKGQLAEGLTTMLSGTVLPM VNGWIDELSQAFEKDGVQGLIDAFGGILEEAVQFISEQLPIVVDIASQIIISLVQGLTSALPKITEAAVILLMTLVNGII ETLPALVTAGVQMIGTIVSGIAEALPQLIPAAVSAVIQIVQALLDNLPMLLEAALQLVLGLTQGILDALPVLIAALPVII TGIVDFIIGAIPQIIEAGIQLLTSLISALPEIITVIVEAIPQIVDGLITAILGSIPQLIDAGVQLLVALIQNLPQIISTV ITAIPKIVSSLVNAIIGSIPQIIQAGIMLLVSLIKNLPTIIVEVVKAVPQIITALVKGFTGSIWQMAQIGTNLIKGLWQG ISDAGAWLWDKISGFFGGVVDKIKNFFGIHSPSTLFAGIVENLGEGIGVGFEKAMNSVSQDMQNAIPTDFDINSNLNMNG AGISSSYGTFEGSLITIQQMIVRSEDDIRKISQELYNLMQTGSRAQGRFITA >Mature_851_residues ADNFGLKIGVEGEKEFKNALRDINQAFKVLGSEMALISSQFDKNDKSIQALTARNEILEKTIDAQKEKIETLRSALDNAS TSFGENDRRTQNWQIQLNKALAELNGMERELENNNKSLRDHSDATDESADNMEDAADAADELADNVDDVGNEMDDATKKT SVLGDVLKANLLSDAIIGGVKALGSAIAGIGKAFVGAMKDGVEYNAQMESYTASFTTMLGDEAKAQKLVNDLKKEAAATP FGMQDLAQSAQTLMSFGMSAEEAQIRMKQLGDISQGDAEKFKSLTLAFAQMSSTGKLTGQDLMQMINAGFNPLEEISRKT GKSIGELKEEMSKGAISADMVAEAFASATSEGGRFYGSMEAQSKTFSGQMATLEDGVASLKGQLAEGLTTMLSGTVLPMV NGWIDELSQAFEKDGVQGLIDAFGGILEEAVQFISEQLPIVVDIASQIIISLVQGLTSALPKITEAAVILLMTLVNGIIE TLPALVTAGVQMIGTIVSGIAEALPQLIPAAVSAVIQIVQALLDNLPMLLEAALQLVLGLTQGILDALPVLIAALPVIIT GIVDFIIGAIPQIIEAGIQLLTSLISALPEIITVIVEAIPQIVDGLITAILGSIPQLIDAGVQLLVALIQNLPQIISTVI TAIPKIVSSLVNAIIGSIPQIIQAGIMLLVSLIKNLPTIIVEVVKAVPQIITALVKGFTGSIWQMAQIGTNLIKGLWQGI SDAGAWLWDKISGFFGGVVDKIKNFFGIHSPSTLFAGIVENLGEGIGVGFEKAMNSVSQDMQNAIPTDFDINSNLNMNGA GISSSYGTFEGSLITIQQMIVRSEDDIRKISQELYNLMQTGSRAQGRFITA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 90380; Mature: 90249
Theoretical pI: Translated: 4.17; Mature: 4.17
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADNFGLKIGVEGEKEFKNALRDINQAFKVLGSEMALISSQFDKNDKSIQALTARNEILE CCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KTIDAQKEKIETLRSALDNASTSFGENDRRTQNWQIQLNKALAELNGMERELENNNKSLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH DHSDATDESADNMEDAADAADELADNVDDVGNEMDDATKKTSVLGDVLKANLLSDAIIGG CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKALGSAIAGIGKAFVGAMKDGVEYNAQMESYTASFTTMLGDEAKAQKLVNDLKKEAAAT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC PFGMQDLAQSAQTLMSFGMSAEEAQIRMKQLGDISQGDAEKFKSLTLAFAQMSSTGKLTG CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH QDLMQMINAGFNPLEEISRKTGKSIGELKEEMSKGAISADMVAEAFASATSEGGRFYGSM HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCH EAQSKTFSGQMATLEDGVASLKGQLAEGLTTMLSGTVLPMVNGWIDELSQAFEKDGVQGL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH IDAFGGILEEAVQFISEQLPIVVDIASQIIISLVQGLTSALPKITEAAVILLMTLVNGII HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETLPALVTAGVQMIGTIVSGIAEALPQLIPAAVSAVIQIVQALLDNLPMLLEAALQLVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH LTQGILDALPVLIAALPVIITGIVDFIIGAIPQIIEAGIQLLTSLISALPEIITVIVEAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PQIVDGLITAILGSIPQLIDAGVQLLVALIQNLPQIISTVITAIPKIVSSLVNAIIGSIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QIIQAGIMLLVSLIKNLPTIIVEVVKAVPQIITALVKGFTGSIWQMAQIGTNLIKGLWQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISDAGAWLWDKISGFFGGVVDKIKNFFGIHSPSTLFAGIVENLGEGIGVGFEKAMNSVSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH DMQNAIPTDFDINSNLNMNGAGISSSYGTFEGSLITIQQMIVRSEDDIRKISQELYNLMQ HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH TGSRAQGRFITA CCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure ADNFGLKIGVEGEKEFKNALRDINQAFKVLGSEMALISSQFDKNDKSIQALTARNEILE CCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KTIDAQKEKIETLRSALDNASTSFGENDRRTQNWQIQLNKALAELNGMERELENNNKSLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH DHSDATDESADNMEDAADAADELADNVDDVGNEMDDATKKTSVLGDVLKANLLSDAIIGG CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKALGSAIAGIGKAFVGAMKDGVEYNAQMESYTASFTTMLGDEAKAQKLVNDLKKEAAAT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC PFGMQDLAQSAQTLMSFGMSAEEAQIRMKQLGDISQGDAEKFKSLTLAFAQMSSTGKLTG CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH QDLMQMINAGFNPLEEISRKTGKSIGELKEEMSKGAISADMVAEAFASATSEGGRFYGSM HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCH EAQSKTFSGQMATLEDGVASLKGQLAEGLTTMLSGTVLPMVNGWIDELSQAFEKDGVQGL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH IDAFGGILEEAVQFISEQLPIVVDIASQIIISLVQGLTSALPKITEAAVILLMTLVNGII HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETLPALVTAGVQMIGTIVSGIAEALPQLIPAAVSAVIQIVQALLDNLPMLLEAALQLVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH LTQGILDALPVLIAALPVIITGIVDFIIGAIPQIIEAGIQLLTSLISALPEIITVIVEAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PQIVDGLITAILGSIPQLIDAGVQLLVALIQNLPQIISTVITAIPKIVSSLVNAIIGSIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QIIQAGIMLLVSLIKNLPTIIVEVVKAVPQIITALVKGFTGSIWQMAQIGTNLIKGLWQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISDAGAWLWDKISGFFGGVVDKIKNFFGIHSPSTLFAGIVENLGEGIGVGFEKAMNSVSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH DMQNAIPTDFDINSNLNMNGAGISSSYGTFEGSLITIQQMIVRSEDDIRKISQELYNLMQ HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH TGSRAQGRFITA CCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA