| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is spoIIE [H]
Identifier: 167039444
GI number: 167039444
Start: 821076
End: 823421
Strand: Direct
Name: spoIIE [H]
Synonym: Teth514_0790
Alternate gene names: 167039444
Gene position: 821076-823421 (Clockwise)
Preceding gene: 167039443
Following gene: 167039445
Centisome position: 33.41
GC content: 31.54
Gene sequence:
>2346_bases ATGCAAAATATAAATATTTTACCTTATAAAAGAGTTATAAAAACTCCCTTGACGGAAAATACACAAAAAAATCTTTATAA AAACATTCAACAGATTATATTATTGTCAATTATAAGCTTTTTTATAGGGCGAGCTGTTATTTTCAATAGTCTTTTGCCTT TCGGCATTGCTTTTTTTGCAACCCTTTTAATGTATAAAAAGCGATATCTTTTAACAGGAATAGGAGTATGGTTGGGAATA TTAACTTTACCCAATGTCAATAGTTTTAAATACCTTTTAGTCCTTATTTTGATCTTTTTATTGGAGGGGCTTTTAAAAGT TAAACCTCAAAATATTATTAAAACCTCTTTCATTACTTTTATTTCTCTTTTTAGCACAGGTCTTATCTTCAGCTATATTT ATGGCTTTTTGCTTTTTGACATCATAATGAGCCTATATGAGTCTGTCACTGCAATGTTAATGGTTTTTATTTTTAATCAC GCTGTTTCATTTATTTTGAATGTAAACAGAAAAATTGTTTCCAATGAAGAGTTGATATCTTTGAGTATATTTATAGGGCT ATTTATTTTAGGAATGAATCATCTGAATGTATGGAAATTTACTCTCAATGGGATATTAGGGATATTTATAATACTTTTAG CCTCTTATATAGGTGGGGTTGGAGTAGGAGCAAGTATCGGCACGACTATGGGACTTATTGGGAGTTTATCTTTTTTCCAA ATGCCAGTCTCCATAGGGCTTTTTGGATTTGCAGGCTTGTTGGCCGGCAGTTTGAAAAAATTGCATAGAATTGGAGTTAT TATAGGCTTTTTAACTGCCATTTTTATTATTACATTTTATGTAACATCAAGTGTGGATATGCTTGTAAATCCTTATGATA TTGTGTTAGCTTCTTTAATGTTTGCAGCGCTTCCTAAGAAGTACATAGTAAAGGCGGAGGAAATAGTAAAAGGAAATAAA AATTTAAACAACAGAAATTACAATGAAAAGCTAAAGGAAGTAGTGACAGATAGATTAAAAGAGTATTCTCAAGTATTTGA AGAGCTCTCTAAAAGTTTTAAACAGGTAAATGAAAAGGTACTAGACCACAAAGATATTTCTTATTTGTTTGAGGAAATTG CCAATAAGACTTGTACTCAATGTGTTATGTATAAAACTTGTTGGGACAAGGAATTTTACAATACTTATAAAAGCATGTTT GAATTGATAGAACATCTTGAAAGAAATAGCAGTATTGAAGACAATAAACTTTATAGAAAATGTATAAGATTTTCTGAGCT TATAAGTACAACTAAATATTATTTAGGCATTTATAAAATAAGCATGCAGTGGAGAGAGAGGTTAAAAGATGCAAAAGGGC TGATTGCTACTCAGTTGAAGGGAGTTGCTGATGCAATATCTAATATGGCTAGTGATATTAGCATGAATGTCACTTTTAAA GATGAATTAGAACAGATGATGATGATAGAATTGGATAAAAAGGGCATACCTGTAGAGGATGTGTTAATTTATGACACAGG AGATGGAAATGTTAACGTAAAAATATACAAAAAGGTATGTTTTGCTAAGGAATGTGACAAAAAGATTGCCCCAATTGTGT CTGAAATTATGGGGGAAAGATATGAGAGAAAAAATAGGTTATGCTCTATAGACCACAATGGAAGGTGCGTACTTACTCTT ACAAAAGCAGAGAGTTTGCAAGTTTTGACAGGTATAAGCAGAGTTAGCAAGTCAAAAAACAAGATTTCTGGAGATACTTA TTCTTTTATGGATTTAGAAGATGGAAAATACATGGCAGCTTTAAGCGATGGAATGGGGATTGGATATAAAGCGGCTGCAG AGAGCAGTACTACCATTTCTTTGCTGGAGAAATTTATAGAAGCAGGTTTTGATAAATATTTAGTTATTCAAACATTAAAC TCTATTTTGGCTTTGCGATCTGCAGAAGAAATGTTTTCTACTGTGGATATAATGTTTCTGGACAAATTTACTGGAGAAAC AGAATTTATCAAAATTGGTTCTTGTGCTACTTTTATAAAGAGGGGAAATGAGGTTGAAATTATAGAATCTAGTTCTTTGC CCATTGGCATTTTGGAAGATATAGAGGCAGATATACATGAAAGAAAATTAAAAGATGGAGATTTTGTGATTTTAGTTACT GATGGAGTGTTGGAGTGTTTTGAGAAAGATAAAGAAGTAGAATTTTCAAGGTTAATCAGTGAAATTAACACGAGGAATCC TCAGGATATGGCGGAGGTGTTGATGAAAAAATGTTTGGAATTGTGTAATAATACTCCAAAGGACGATATGACAATTTTGG TTTCAAAGGTATGGAAGAAAATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTATGTCGAAAGAAAAATTACATATATAACAAAAATTAACAAATAAAACCATCACCTTAATGGTATAATTTAGAAAAAA CAAGAGGTGGTGGTTTTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTAATAAATTGGAATAACCCTTCCACAATGTGGAGACAATATATCGAGGCGATTAAAGGAATACTTTTGTGGAGGGGT TTTTTAGGTTTGATTTAGAA
Product: phosphoprotein phosphatase
Products: NA
Alternate protein names: Stage II sporulation protein H [H]
Number of amino acids: Translated: 781; Mature: 781
Protein sequence:
>781_residues MQNINILPYKRVIKTPLTENTQKNLYKNIQQIILLSIISFFIGRAVIFNSLLPFGIAFFATLLMYKKRYLLTGIGVWLGI LTLPNVNSFKYLLVLILIFLLEGLLKVKPQNIIKTSFITFISLFSTGLIFSYIYGFLLFDIIMSLYESVTAMLMVFIFNH AVSFILNVNRKIVSNEELISLSIFIGLFILGMNHLNVWKFTLNGILGIFIILLASYIGGVGVGASIGTTMGLIGSLSFFQ MPVSIGLFGFAGLLAGSLKKLHRIGVIIGFLTAIFIITFYVTSSVDMLVNPYDIVLASLMFAALPKKYIVKAEEIVKGNK NLNNRNYNEKLKEVVTDRLKEYSQVFEELSKSFKQVNEKVLDHKDISYLFEEIANKTCTQCVMYKTCWDKEFYNTYKSMF ELIEHLERNSSIEDNKLYRKCIRFSELISTTKYYLGIYKISMQWRERLKDAKGLIATQLKGVADAISNMASDISMNVTFK DELEQMMMIELDKKGIPVEDVLIYDTGDGNVNVKIYKKVCFAKECDKKIAPIVSEIMGERYERKNRLCSIDHNGRCVLTL TKAESLQVLTGISRVSKSKNKISGDTYSFMDLEDGKYMAALSDGMGIGYKAAAESSTTISLLEKFIEAGFDKYLVIQTLN SILALRSAEEMFSTVDIMFLDKFTGETEFIKIGSCATFIKRGNEVEIIESSSLPIGILEDIEADIHERKLKDGDFVILVT DGVLECFEKDKEVEFSRLISEINTRNPQDMAEVLMKKCLELCNNTPKDDMTILVSKVWKKI
Sequences:
>Translated_781_residues MQNINILPYKRVIKTPLTENTQKNLYKNIQQIILLSIISFFIGRAVIFNSLLPFGIAFFATLLMYKKRYLLTGIGVWLGI LTLPNVNSFKYLLVLILIFLLEGLLKVKPQNIIKTSFITFISLFSTGLIFSYIYGFLLFDIIMSLYESVTAMLMVFIFNH AVSFILNVNRKIVSNEELISLSIFIGLFILGMNHLNVWKFTLNGILGIFIILLASYIGGVGVGASIGTTMGLIGSLSFFQ MPVSIGLFGFAGLLAGSLKKLHRIGVIIGFLTAIFIITFYVTSSVDMLVNPYDIVLASLMFAALPKKYIVKAEEIVKGNK NLNNRNYNEKLKEVVTDRLKEYSQVFEELSKSFKQVNEKVLDHKDISYLFEEIANKTCTQCVMYKTCWDKEFYNTYKSMF ELIEHLERNSSIEDNKLYRKCIRFSELISTTKYYLGIYKISMQWRERLKDAKGLIATQLKGVADAISNMASDISMNVTFK DELEQMMMIELDKKGIPVEDVLIYDTGDGNVNVKIYKKVCFAKECDKKIAPIVSEIMGERYERKNRLCSIDHNGRCVLTL TKAESLQVLTGISRVSKSKNKISGDTYSFMDLEDGKYMAALSDGMGIGYKAAAESSTTISLLEKFIEAGFDKYLVIQTLN SILALRSAEEMFSTVDIMFLDKFTGETEFIKIGSCATFIKRGNEVEIIESSSLPIGILEDIEADIHERKLKDGDFVILVT DGVLECFEKDKEVEFSRLISEINTRNPQDMAEVLMKKCLELCNNTPKDDMTILVSKVWKKI >Mature_781_residues MQNINILPYKRVIKTPLTENTQKNLYKNIQQIILLSIISFFIGRAVIFNSLLPFGIAFFATLLMYKKRYLLTGIGVWLGI LTLPNVNSFKYLLVLILIFLLEGLLKVKPQNIIKTSFITFISLFSTGLIFSYIYGFLLFDIIMSLYESVTAMLMVFIFNH AVSFILNVNRKIVSNEELISLSIFIGLFILGMNHLNVWKFTLNGILGIFIILLASYIGGVGVGASIGTTMGLIGSLSFFQ MPVSIGLFGFAGLLAGSLKKLHRIGVIIGFLTAIFIITFYVTSSVDMLVNPYDIVLASLMFAALPKKYIVKAEEIVKGNK NLNNRNYNEKLKEVVTDRLKEYSQVFEELSKSFKQVNEKVLDHKDISYLFEEIANKTCTQCVMYKTCWDKEFYNTYKSMF ELIEHLERNSSIEDNKLYRKCIRFSELISTTKYYLGIYKISMQWRERLKDAKGLIATQLKGVADAISNMASDISMNVTFK DELEQMMMIELDKKGIPVEDVLIYDTGDGNVNVKIYKKVCFAKECDKKIAPIVSEIMGERYERKNRLCSIDHNGRCVLTL TKAESLQVLTGISRVSKSKNKISGDTYSFMDLEDGKYMAALSDGMGIGYKAAAESSTTISLLEKFIEAGFDKYLVIQTLN SILALRSAEEMFSTVDIMFLDKFTGETEFIKIGSCATFIKRGNEVEIIESSSLPIGILEDIEADIHERKLKDGDFVILVT DGVLECFEKDKEVEFSRLISEINTRNPQDMAEVLMKKCLELCNNTPKDDMTILVSKVWKKI
Specific function: Normally needed for pro-sigma E processing during sporulation but can be bypassed in vegetative cells. Activates spoIIAA by dephosphorylation [H]
COG id: COG2208
COG function: function code TK; Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Polar septum [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 PP2C-like domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001932 - InterPro: IPR014221 - InterPro: IPR010822 [H]
Pfam domain/function: PF07228 SpoIIE [H]
EC number: =3.1.3.16 [H]
Molecular weight: Translated: 88536; Mature: 88536
Theoretical pI: Translated: 8.11; Mature: 8.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQNINILPYKRVIKTPLTENTQKNLYKNIQQIILLSIISFFIGRAVIFNSLLPFGIAFFA CCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLMYKKRYLLTGIGVWLGILTLPNVNSFKYLLVLILIFLLEGLLKVKPQNIIKTSFITF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ISLFSTGLIFSYIYGFLLFDIIMSLYESVTAMLMVFIFNHAVSFILNVNRKIVSNEELIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHH LSIFIGLFILGMNHLNVWKFTLNGILGIFIILLASYIGGVGVGASIGTTMGLIGSLSFFQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MPVSIGLFGFAGLLAGSLKKLHRIGVIIGFLTAIFIITFYVTSSVDMLVNPYDIVLASLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHH FAALPKKYIVKAEEIVKGNKNLNNRNYNEKLKEVVTDRLKEYSQVFEELSKSFKQVNEKV HHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDHKDISYLFEEIANKTCTQCVMYKTCWDKEFYNTYKSMFELIEHLERNSSIEDNKLYRK HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH CIRFSELISTTKYYLGIYKISMQWRERLKDAKGLIATQLKGVADAISNMASDISMNVTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEH DELEQMMMIELDKKGIPVEDVLIYDTGDGNVNVKIYKKVCFAKECDKKIAPIVSEIMGER HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YERKNRLCSIDHNGRCVLTLTKAESLQVLTGISRVSKSKNKISGDTYSFMDLEDGKYMAA HHHHCCEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEE LSDGMGIGYKAAAESSTTISLLEKFIEAGFDKYLVIQTLNSILALRSAEEMFSTVDIMFL ECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DKFTGETEFIKIGSCATFIKRGNEVEIIESSSLPIGILEDIEADIHERKLKDGDFVILVT HHCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEC DGVLECFEKDKEVEFSRLISEINTRNPQDMAEVLMKKCLELCNNTPKDDMTILVSKVWKK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC I C >Mature Secondary Structure MQNINILPYKRVIKTPLTENTQKNLYKNIQQIILLSIISFFIGRAVIFNSLLPFGIAFFA CCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLMYKKRYLLTGIGVWLGILTLPNVNSFKYLLVLILIFLLEGLLKVKPQNIIKTSFITF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ISLFSTGLIFSYIYGFLLFDIIMSLYESVTAMLMVFIFNHAVSFILNVNRKIVSNEELIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHH LSIFIGLFILGMNHLNVWKFTLNGILGIFIILLASYIGGVGVGASIGTTMGLIGSLSFFQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MPVSIGLFGFAGLLAGSLKKLHRIGVIIGFLTAIFIITFYVTSSVDMLVNPYDIVLASLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHH FAALPKKYIVKAEEIVKGNKNLNNRNYNEKLKEVVTDRLKEYSQVFEELSKSFKQVNEKV HHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDHKDISYLFEEIANKTCTQCVMYKTCWDKEFYNTYKSMFELIEHLERNSSIEDNKLYRK HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH CIRFSELISTTKYYLGIYKISMQWRERLKDAKGLIATQLKGVADAISNMASDISMNVTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEH DELEQMMMIELDKKGIPVEDVLIYDTGDGNVNVKIYKKVCFAKECDKKIAPIVSEIMGER HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YERKNRLCSIDHNGRCVLTLTKAESLQVLTGISRVSKSKNKISGDTYSFMDLEDGKYMAA HHHHCCEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEE LSDGMGIGYKAAAESSTTISLLEKFIEAGFDKYLVIQTLNSILALRSAEEMFSTVDIMFL ECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DKFTGETEFIKIGSCATFIKRGNEVEIIESSSLPIGILEDIEADIHERKLKDGDFVILVT HHCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEC DGVLECFEKDKEVEFSRLISEINTRNPQDMAEVLMKKCLELCNNTPKDDMTILVSKVWKK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC I C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7584024; 8830262; 9384377; 2832371; 8113187; 7570023 [H]